236 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3831 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_3831  amine oxidase  100 
 
 		 438 aa  836    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1454  amine oxidase  48.94 
 
 		 456 aa  320  3e-86  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.162575  normal  0.372865 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1666  protoporphyrinogen oxidase  28.05 
 
 		 469 aa  91.3  3e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2286  protoporphyrinogen oxidase  24.94 
 
 		 509 aa  77.8  0.0000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.932472  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2694  protoporphyrinogen oxidase  28.17 
 
 		 467 aa  77.4  0.0000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.083794  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0073  amine oxidase  29.73 
 
 		 474 aa  73.2  0.000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1116  hypothetical protein  28.12 
 
 		 492 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.993784 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1779  amine oxidase  28.44 
 
 		 420 aa  70.9  0.00000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0331909  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0570  protoporphyrinogen oxidase  29.07 
 
 		 446 aa  70.9  0.00000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0724  protoporphyrinogen oxidase  29.07 
 
 		 446 aa  70.9  0.00000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00079892  hitchhiker  0.00000162097 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2285  FAD dependent oxidoreductase  31.37 
 
 		 314 aa  68.2  0.0000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0027  protoporphyrinogen oxidase  24.08 
 
 		 463 aa  67  0.0000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1893  protoporphyrinogen oxidase  28.61 
 
 		 421 aa  66.6  0.0000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0826  protoporphyrinogen oxidase  24.66 
 
 		 473 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.981055  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2159  protoporphyrinogen oxidase  25 
 
 		 465 aa  63.2  0.00000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1105  protoporphyrinogen oxidase  22.93 
 
 		 473 aa  61.6  0.00000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0144  protoporphyrinogen oxidase  25.64 
 
 		 471 aa  60.8  0.00000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000061855  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1113  putative amine oxidase  27.9 
 
 		 503 aa  60.1  0.00000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1232  protoporphyrinogen oxidase  22.99 
 
 		 473 aa  60.1  0.00000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1827  amine oxidase  30.87 
 
 		 433 aa  60.1  0.00000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23230  Flavin containing amine oxidoreductase  56.14 
 
 		 415 aa  59.3  0.0000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.807494  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2186  protoporphyrinogen oxidase  27.54 
 
 		 488 aa  59.3  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.300515  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0129  hypothetical protein  27.86 
 
 		 414 aa  59.3  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2398  FAD dependent oxidoreductase  26.51 
 
 		 434 aa  58.9  0.0000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2971  FAD dependent oxidoreductase  25.84 
 
 		 434 aa  58.5  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.719857  normal  0.440008 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1144  protoporphyrinogen oxidase  19 
 
 		 441 aa  57.8  0.0000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4200  protoporphyrinogen oxidase  22.13 
 
 		 473 aa  57.8  0.0000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1390  amine oxidase  27.09 
 
 		 445 aa  57.4  0.0000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5634  amine oxidase, flavin-containing  31.74 
 
 		 407 aa  56.6  0.0000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0493824  normal  0.227831 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0991  protoporphyrinogen oxidase  20.43 
 
 		 473 aa  56.6  0.0000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0592  protoporphyrinogen oxidase  22.65 
 
 		 472 aa  56.2  0.000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.916026  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1765  protoporphyrinogen oxidase  27.62 
 
 		 493 aa  56.2  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000124321  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1250  amine oxidase  29.45 
 
 		 428 aa  55.5  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00507419  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4724  amine oxidase  26.8 
 
 		 421 aa  55.8  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.519629  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2710  twin-arginine translocation pathway signal  24 
 
 		 469 aa  55.5  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3390  amine oxidase  55.36 
 
 		 448 aa  55.1  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1794  protoporphyrinogen oxidase  26.3 
 
 		 419 aa  55.5  0.000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2837  amine oxidase  26.59 
 
 		 448 aa  55.5  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  hitchhiker  0.00868437  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2098  amine oxidase  27.08 
 
 		 415 aa  55.5  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1449  amine oxidase  27.68 
 
 		 434 aa  55.5  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26240  monoamine oxidase  54.39 
 
 		 418 aa  54.7  0.000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.67782  normal  0.0649912 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2583  squalene synthase  46.15 
 
 		 502 aa  54.3  0.000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.063443  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2637  squalene synthase  46.15 
 
 		 502 aa  54.3  0.000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.359925  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1880  amine oxidase  36.47 
 
 		 490 aa  53.9  0.000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.277928  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1876  amine oxidase flavin-containing  35.29 
 
 		 482 aa  53.5  0.000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1846  amine oxidase, flavin-containing  35.29 
 
 		 485 aa  53.9  0.000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.921085  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1830  amine oxidase, flavin-containing  35.29 
 
 		 482 aa  53.9  0.000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5843  FAD dependent oxidoreductase  46.77 
 
 		 354 aa  53.5  0.000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2018  amine oxidase, flavin-containing  35.29 
 
 		 482 aa  53.5  0.000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0012  protoporphyrinogen oxidase  23.86 
 
 		 469 aa  53.5  0.000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1001  protoporphyrinogen oxidase  22.34 
 
 		 473 aa  53.5  0.000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000915854  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0986  protoporphyrinogen oxidase  22.34 
 
 		 473 aa  53.5  0.000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0988  protoporphyrinogen oxidase  22.34 
 
 		 473 aa  53.5  0.000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000269776  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2131  amine oxidase, flavin-containing  35.29 
 
 		 490 aa  53.5  0.000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.764398  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6583  FAD dependent oxidoreductase  28.76 
 
 		 435 aa  53.5  0.000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2053  amine oxidase, flavin-containing  35.29 
 
 		 487 aa  53.5  0.000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0339  amine oxidase  30.06 
 
 		 423 aa  53.5  0.000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.39474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2202  protoporphyrinogen oxidase  41.05 
 
 		 451 aa  53.5  0.000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.294018  normal  0.368539 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2098  amine oxidase, flavin-containing  35.29 
 
 		 490 aa  53.1  0.000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2213  protoporphyrinogen oxidase  41.05 
 
 		 451 aa  53.5  0.000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2259  protoporphyrinogen oxidase  41.05 
 
 		 451 aa  53.5  0.000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.685145  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1169  protoporphyrinogen oxidase  21.96 
 
 		 473 aa  53.1  0.000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_29633  predicted protein  40.51 
 
 		 949 aa  53.1  0.000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1155  hypothetical protein  19.64 
 
 		 495 aa  52.4  0.00001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1418  amine oxidase  45.95 
 
 		 396 aa  53.1  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1154  protoporphyrinogen oxidase  22.22 
 
 		 473 aa  52.8  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2218  protoporphyrinogen oxidase  29.32 
 
 		 482 aa  52.4  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.184801 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1885  protoporphyrinogen oxidase  19.72 
 
 		 466 aa  52.4  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000633111  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3551  protoporphyrinogen oxidase  23.46 
 
 		 495 aa  52  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0051763  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2828  protoporphyrinogen oxidase  28.91 
 
 		 488 aa  51.6  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1919  protoporphyrinogen oxidase  19.72 
 
 		 466 aa  52.4  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00206772  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4537  hypothetical protein  28.9 
 
 		 667 aa  52  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.229647  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3289  amine oxidase, flavin-containing  35.29 
 
 		 487 aa  51.6  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3185  hypothetical protein  45.28 
 
 		 245 aa  51.6  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.29229  hitchhiker  0.00171019 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0728  FAD dependent oxidoreductase  34.04 
 
 		 570 aa  51.2  0.00003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0404381  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1556  amine oxidase (flavin-containing)  45.74 
 
 		 450 aa  51.2  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2893  amine oxidase  26.32 
 
 		 456 aa  51.6  0.00003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.400001  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2020  amine oxidase, flavin-containing  35.29 
 
 		 487 aa  51.6  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2262  amine oxidase  37.78 
 
 		 436 aa  51.6  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0239134  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1580  amine oxidase (flavin-containing)  45.74 
 
 		 450 aa  51.2  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03731  hypothetical protein  41.3 
 
 		 938 aa  51.6  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.968761 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1008  putative protoporphyrinogen oxidase  26.63 
 
 		 432 aa  51.2  0.00004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.961775  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0739  hypothetical protein  38.14 
 
 		 570 aa  50.8  0.00004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1310  putative protoporphyrinogen oxidase  26.63 
 
 		 432 aa  51.2  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.643053  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0521  protoporphyrinogen oxidase  24.53 
 
 		 467 aa  51.2  0.00004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0286  putative protoporphyrinogen oxidase  26.63 
 
 		 432 aa  51.2  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0469337  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1724  putative oxidoreductase  26.63 
 
 		 432 aa  51.2  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0447228  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5174  protoporphyrinogen oxidase  27.35 
 
 		 470 aa  51.2  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00221395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1808  putative oxidoreductase  26.63 
 
 		 432 aa  51.2  0.00004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1366  protoporphyrinogen oxidase  21.98 
 
 		 482 aa  50.8  0.00005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.409095  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4659  protoporphyrinogen oxidase  30.82 
 
 		 476 aa  50.8  0.00005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000642175  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3381  hypothetical protein  39.47 
 
 		 416 aa  50.4  0.00006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1831  protoporphyrinogen oxidase  29.35 
 
 		 447 aa  50.4  0.00006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1553  protoporphyrinogen oxidase  41.67 
 
 		 473 aa  50.4  0.00006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0082  amine oxidase  31.9 
 
 		 436 aa  50.1  0.00007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1381  UDP-galactopyranose mutase  32.58 
 
 		 463 aa  50.1  0.00007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.399176  normal  0.525187 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2794  hypothetical protein  29.21 
 
 		 429 aa  50.1  0.00008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2774  amine oxidase  33.73 
 
 		 417 aa  50.1  0.00009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.858792  normal  0.589984 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1160  hypothetical protein  18.79 
 
 		 495 aa  49.7  0.0001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_40191  amine oxidase  50.98 
 
 		 468 aa  49.3  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.389508  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>