110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3562 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_3562  Bile acid:sodium symporter  100 
 
 		 327 aa  598  1e-170  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5425  bile acid:sodium symporter  71.25 
 
 		 345 aa  317  2e-85  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.18483 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4948  bile acid:sodium symporter  62.03 
 
 		 336 aa  277  1e-73  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.805052  decreased coverage  0.00366916 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2727  Bile acid:sodium symporter  60 
 
 		 342 aa  276  4e-73  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0035  sodium:bile acid symporter family protein  43.53 
 
 		 329 aa  249  4e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.514466  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1983  bile acid:sodium symporter  49.19 
 
 		 322 aa  249  5e-65  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4024  Bile acid:sodium symporter  49.68 
 
 		 330 aa  243  3.9999999999999997e-63  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14710  arsenite efflux pump ACR3-like permease  58.39 
 
 		 326 aa  241  2e-62  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1965  bile acid:sodium symporter  48.87 
 
 		 322 aa  239  2.9999999999999997e-62  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4468  bile acid:sodium symporter  55.24 
 
 		 331 aa  235  7e-61  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4299  bile acid:sodium symporter  55.24 
 
 		 331 aa  235  7e-61  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4199  bile acid:sodium symporter  55.24 
 
 		 331 aa  235  7e-61  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3638  bile acid:sodium symporter  50.64 
 
 		 326 aa  235  8e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.283342 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2614  putative efflux protein  51.13 
 
 		 318 aa  233  3e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.732804  normal  0.635928 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4674  bile acid:sodium symporter  64.21 
 
 		 311 aa  221  9.999999999999999e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.179615  normal  0.0121274 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2037  Bile acid:sodium symporter  48.87 
 
 		 325 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12320  arsenite efflux pump ACR3-like permease  57.56 
 
 		 316 aa  211  2e-53  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1101  bile acid:sodium symporter  52.77 
 
 		 323 aa  202  7e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0421  Bile acid:sodium symporter  58.18 
 
 		 331 aa  200  3e-50  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2338  bile acid:sodium symporter  47.62 
 
 		 325 aa  194  2e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0670  bile acid/Na+ symporter family protein  46.95 
 
 		 317 aa  192  9e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3937  Bile acid:sodium symporter  47.04 
 
 		 323 aa  188  1e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0701  bile acid:sodium symporter  47.91 
 
 		 317 aa  187  3e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.479661  normal  0.0319334 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1550  bile acid:sodium symporter  44.16 
 
 		 321 aa  187  3e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.9402  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0702  bile acid:sodium symporter  42.77 
 
 		 317 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.344357  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06310  arsenite efflux pump ACR3-like permease  57.85 
 
 		 343 aa  181  1e-44  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.377649  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4131  bile acid:sodium symporter  47.9 
 
 		 325 aa  181  1e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18500  sodium:bile acid symporter family protein  40.13 
 
 		 325 aa  181  2e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.292869  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3276  bile acid:sodium symporter  40.76 
 
 		 336 aa  171  1e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.278714  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5580  sodium:bile acid symporter family protein  42.77 
 
 		 320 aa  168  1e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0196  Bile acid:sodium symporter  58.1 
 
 		 323 aa  164  2.0000000000000002e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.635742  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4514  bile acid:sodium symporter  42.77 
 
 		 317 aa  160  3e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1762  Bile acid:sodium symporter  41.14 
 
 		 332 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.215905  normal  0.663205 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4621  transporter, putative  44.07 
 
 		 247 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.572424  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1488  bile acid:sodium symporter  44.07 
 
 		 247 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3671  bile acid:sodium symporter  41.53 
 
 		 319 aa  123  4e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1569  arsenite efflux pump  32.52 
 
 		 323 aa  86.7  5e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.41034  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1771  bile acid:sodium symporter  26.14 
 
 		 321 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000272591  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1749  arsenical-resistance protein  25.82 
 
 		 321 aa  83.6  0.000000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000037149  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1727  arsenical-resistance protein  25.49 
 
 		 321 aa  84  0.000000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000732374  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1943  sodium/bile acid symporter family protein  25.16 
 
 		 321 aa  82.8  0.000000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.63514e-32 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1913  sodium/bile acid symporter family protein  25.16 
 
 		 321 aa  82.4  0.000000000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000299328  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3431  sodium/bile acid symporter family protein  25.16 
 
 		 321 aa  82.4  0.000000000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000505133  hitchhiker  0.0000000126508 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1769  sodium/bile acid symporter family protein  25.16 
 
 		 321 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000068477  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1907  sodium/bile acid symporter family protein  25.16 
 
 		 321 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000305377  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1992  sodium/bile acid symporter family protein  25.49 
 
 		 321 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000495919  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2013  sodium/bile acid symporter family protein  25.16 
 
 		 321 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000010765  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06410  hypothetical protein  53.12 
 
 		 255 aa  73.2  0.000000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.489079  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1346  Bile acid:sodium symporter  32.12 
 
 		 334 aa  72.4  0.000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2405  arsenical-resistance protein  27.07 
 
 		 354 aa  68.2  0.0000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.173342  normal  0.119158 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1404  arsenical-resistance protein  29.13 
 
 		 345 aa  65.1  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.319903  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0071  Bile acid:sodium symporter  32.77 
 
 		 329 aa  58.9  0.0000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2827  arsenical-resistance protein  28.3 
 
 		 355 aa  57.4  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2427  Bile acid:sodium symporter  34.17 
 
 		 327 aa  56.6  0.0000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3134  arsenical-resistance protein  28.94 
 
 		 357 aa  56.2  0.0000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.79933  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5054  arsenical-resistance protein  26.93 
 
 		 359 aa  55.8  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1981  arsenical-resistance protein  26.7 
 
 		 352 aa  55.5  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.182111  normal  0.240849 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3198  arsenical-resistance protein  28.82 
 
 		 362 aa  54.3  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.470943  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0214  arsenical-resistance protein  27.79 
 
 		 358 aa  54.3  0.000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1023  arsenical-resistance protein  26.59 
 
 		 381 aa  53.1  0.000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.878952  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3340  arsenical-resistance protein  27.97 
 
 		 358 aa  53.1  0.000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.36602 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2137  arsenical-resistance protein  26.45 
 
 		 360 aa  52.4  0.000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1702  arsenical-resistance protein ACR3  23.44 
 
 		 356 aa  52  0.00001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.98666 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3744  arsenical-resistance protein  26.8 
 
 		 363 aa  52.4  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.171539  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0554  bile acid:sodium symporter  22.19 
 
 		 350 aa  52  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000301487  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1119  arsenical-resistance protein  26.26 
 
 		 348 aa  52.4  0.00001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.335014 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1085  arsenical-resistance protein  26.59 
 
 		 381 aa  51.2  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.55277  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5376  arsenical-resistance protein  28.01 
 
 		 367 aa  50.8  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3430  arsenical-resistance protein  27.46 
 
 		 369 aa  50.8  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.383745  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3643  arsenical-resistance protein  25.58 
 
 		 381 aa  50.1  0.00005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0704607  normal  0.350418 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2958  arsenical-resistance protein  24.54 
 
 		 362 aa  49.7  0.00006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.610234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1444  arsenical-resistance protein  26.19 
 
 		 357 aa  49.7  0.00007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.953895  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1289  arsenical-resistance protein  26.04 
 
 		 354 aa  48.5  0.0001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0606387  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0502  arsenical-resistance protein  26.33 
 
 		 356 aa  48.9  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0704877  normal  0.0273723 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1704  heavy metal resistance membrane protein  22.36 
 
 		 352 aa  48.1  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.253794  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2741  arsenical-resistance protein  36.49 
 
 		 349 aa  48.5  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4497  arsenical-resistance protein  27.46 
 
 		 368 aa  48.5  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.783409 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2021  arsenical-resistance protein  25.82 
 
 		 351 aa  47.8  0.0003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2570  arsenical-resistance protein  25.21 
 
 		 361 aa  47.4  0.0003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3424  arsenical-resistance protein  27.67 
 
 		 348 aa  46.6  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4497  arsenical-resistance protein  28.04 
 
 		 360 aa  47  0.0005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3940  arsenical-resistance protein  26.6 
 
 		 352 aa  47  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.29771  normal  0.461155 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1555  arsenical-resistance protein ACR3  27.96 
 
 		 362 aa  46.6  0.0006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.362934  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0558  arsenical-resistance protein  20.97 
 
 		 350 aa  46.6  0.0006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.228234  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5148  arsenical-resistance protein  23.51 
 
 		 353 aa  46.2  0.0007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.317121  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1733  arsenical-resistance protein, putative  19.41 
 
 		 347 aa  46.2  0.0008  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.126518  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2233  arsenical-resistance protein  26.4 
 
 		 365 aa  46.2  0.0008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0939  hypothetical protein  22.26 
 
 		 358 aa  45.4  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3222  arsenical-resistance protein  26.2 
 
 		 367 aa  45.4  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0846  arsenical-resistance protein  23.67 
 
 		 351 aa  45.4  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1937  arsenical-resistance protein  26.89 
 
 		 372 aa  45.8  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000566056  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3602  arsenical-resistance protein  25.98 
 
 		 357 aa  45.1  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.494637 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26440  arsenical-resistance protein  25.48 
 
 		 369 aa  44.7  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.904411  normal  0.208413 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2651  hypothetical protein  72.41 
 
 		 73 aa  44.7  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001409  arsenical-resistance protein ACR3  22.71 
 
 		 351 aa  44.7  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2344  ACR3 permease  27.71 
 
 		 363 aa  44.3  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3469  arsenical-resistance protein  25.75 
 
 		 368 aa  44.3  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.368276 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4018  arsenical-resistance protein  31.5 
 
 		 381 aa  44.3  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0793  arsenical-resistance protein  26.06 
 
 		 367 aa  44.3  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2859  arsenical-resistance protein  24.92 
 
 		 352 aa  43.9  0.004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>