More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3009 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_4926  alpha amylase catalytic region  63.3 
 
 		 578 aa  696    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0526  alpha amylase catalytic region  55.38 
 
 		 562 aa  636    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3009  alpha amylase catalytic region  100 
 
 		 555 aa  1127    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4886  alpha amylase catalytic region  63.6 
 
 		 571 aa  665    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1154  alpha amylase catalytic region  64.55 
 
 		 577 aa  708    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.144841  decreased coverage  0.0000326761 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0913  alpha amylase, catalytic region  59.7 
 
 		 622 aa  662    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2932  alpha amylase catalytic region  60.25 
 
 		 557 aa  617  1e-175  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31510  glycosidase  59.44 
 
 		 596 aa  616  1e-175  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.382371  normal  0.756128 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4140  oligo-1,6-glucosidase  51.68 
 
 		 558 aa  612  9.999999999999999e-175  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000871956  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3843  alpha amylase catalytic region  52.39 
 
 		 558 aa  611  1e-173  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00167819  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2716  alpha amylase catalytic region  53.98 
 
 		 559 aa  610  1e-173  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0292835  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4066  oligo-1,6-glucosidase  51.33 
 
 		 558 aa  606  9.999999999999999e-173  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.828435  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3924  oligo-1,6-glucosidase  51.5 
 
 		 558 aa  605  9.999999999999999e-173  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.12031  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3756  oligo-1,6-glucosidase  51.5 
 
 		 558 aa  606  9.999999999999999e-173  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000260004  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4034  oligo-1,6-glucosidase  51.68 
 
 		 558 aa  607  9.999999999999999e-173  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3772  oligo-1,6-glucosidase  51.5 
 
 		 558 aa  606  9.999999999999999e-173  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.719962  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4231  oligo-1,6-glucosidase  51.5 
 
 		 558 aa  605  9.999999999999999e-173  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.24722  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1118  oligo-1,6-glucosidase  51.15 
 
 		 558 aa  607  9.999999999999999e-173  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00264328  normal  0.397885 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4121  oligo-1,6-glucosidase  51.15 
 
 		 558 aa  604  1.0000000000000001e-171  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00158128  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3323  alpha amylase catalytic region  55.13 
 
 		 570 aa  604  1.0000000000000001e-171  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0165  alpha amylase catalytic region  52.3 
 
 		 557 aa  596  1e-169  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000167663  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22530  alpha amylase catalytic region  53.42 
 
 		 562 aa  594  1e-168  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1497  glycosidase  56.54 
 
 		 606 aa  588  1e-167  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.990687  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0899  trehalose-6-phosphate hydrolase  50.44 
 
 		 560 aa  572  1.0000000000000001e-162  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1332  alpha amylase, catalytic domain protein  50.88 
 
 		 639 aa  558  1e-157  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.86601 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1621  alpha,alpha-phosphotrehalase  48.31 
 
 		 563 aa  552  1e-156  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.459004  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2383  dextran glucosidase  47.79 
 
 		 566 aa  550  1e-155  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2553  alpha,alpha-phosphotrehalase  49.2 
 
 		 563 aa  547  1e-154  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2342  alpha amylase catalytic region  49.29 
 
 		 538 aa  548  1e-154  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2048  alpha amylase catalytic region  51.15 
 
 		 572 aa  539  9.999999999999999e-153  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.105277  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09460  alpha amylase catalytic region  47.43 
 
 		 563 aa  540  9.999999999999999e-153  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0188478  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0222  trehalose-6-phosphate hydrolase  48.57 
 
 		 538 aa  540  9.999999999999999e-153  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000721173  hitchhiker  0.00000000000157233 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08330  sucrose isomerase  51.41 
 
 		 600 aa  540  9.999999999999999e-153  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0897  trehalose-6-phosphate hydrolase  47.94 
 
 		 556 aa  538  9.999999999999999e-153  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.175919  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2908  trehalose-6-phosphate hydrolase  47.08 
 
 		 562 aa  540  9.999999999999999e-153  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.812493  normal  0.508935 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1406  alpha amylase catalytic region  50.19 
 
 		 555 aa  537  1e-151  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0354  alpha amylase catalytic region  46.32 
 
 		 554 aa  536  1e-151  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0481  glycosyl hydrolase family protein  48.66 
 
 		 554 aa  533  1e-150  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000250656  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0357  glycosyl hydrolase family protein  46.55 
 
 		 554 aa  531  1e-150  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000071861  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0347  alpha-glucosidase  46.55 
 
 		 554 aa  531  1e-150  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000225343  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0343  alpha-glucosidase  46.73 
 
 		 554 aa  534  1e-150  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000029424  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0371  glycosyl hydrolase family protein  46.55 
 
 		 554 aa  531  1e-150  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000236448  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2521  alpha amylase catalytic region  47.76 
 
 		 556 aa  533  1e-150  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0427  glycosyl hydrolase family protein  48.57 
 
 		 554 aa  531  1e-150  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000114694  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0413  glycosyl hydrolase family protein  46.55 
 
 		 554 aa  531  1e-150  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000830485 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0040  glucosidase  49.73 
 
 		 556 aa  535  1e-150  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0470  glycosyl hydrolase family protein  46.37 
 
 		 554 aa  533  1e-150  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000621788  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0601  alpha amylase catalytic region  49.04 
 
 		 554 aa  533  1e-150  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000199149  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1564  alpha-D-1,4-glucosidase  47.5 
 
 		 549 aa  528  1e-149  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2519  alpha amylase  48.84 
 
 		 582 aa  530  1e-149  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.252753 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0352  alpha amylase catalytic region  46.37 
 
 		 554 aa  530  1e-149  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00857994  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4891  glycosyl hydrolase family protein  48.47 
 
 		 554 aa  529  1e-149  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000186881  normal  0.167059 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0051  alpha amylase catalytic region  53.03 
 
 		 590 aa  529  1e-149  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.237414 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1595  alpha-D-1,4-glucosidase  47.5 
 
 		 549 aa  528  1e-149  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2381  alpha-D-1,4-glucosidase  46.28 
 
 		 568 aa  530  1e-149  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0828  trehalose-6-phosphate hydrolase  49.02 
 
 		 556 aa  526  1e-148  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0959378  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1070  alpha-glucosidase  46.67 
 
 		 551 aa  522  1e-147  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.297332  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2260  alpha amylase catalytic region  51.16 
 
 		 552 aa  525  1e-147  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0144984  normal  0.633948 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0545  alpha,alpha-phosphotrehalase  45.02 
 
 		 553 aa  522  1e-147  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3625  alpha amylase catalytic region  47.61 
 
 		 571 aa  520  1e-146  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004234  trehalose-6-phosphate hydrolase  46.02 
 
 		 561 aa  521  1e-146  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0161937  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0083  alpha amylase, catalytic region  46.38 
 
 		 560 aa  520  1e-146  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0810365  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01206  hypothetical protein  45.66 
 
 		 561 aa  515  1.0000000000000001e-145  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1924  glucan 1,6-alpha-glucosidase  46.89 
 
 		 535 aa  513  1e-144  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0668  alpha,alpha-phosphotrehalase  45.2 
 
 		 553 aa  514  1e-144  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0687  alpha,alpha-phosphotrehalase  44.84 
 
 		 553 aa  509  1e-143  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0700  trehalose-6-phosphate hydrolase  45.2 
 
 		 553 aa  510  1e-143  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0543  alpha,alpha-phosphotrehalase (trehalose-6-phosphate hydrolase)  44.84 
 
 		 553 aa  510  1e-143  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0761  alpha,alpha-phosphotrehalase  45.02 
 
 		 553 aa  510  1e-143  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0433  trehalose-6-phosphate hydrolase  46.76 
 
 		 562 aa  509  1e-143  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000180763  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0421  putative oligo-1,6-glucosidase  44.25 
 
 		 554 aa  509  1e-143  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.591118  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1851  trehalose-6-phosphate hydrolase  46.9 
 
 		 531 aa  510  1e-143  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0599  trehalose-6-phosphate hydrolase  44.66 
 
 		 553 aa  507  9.999999999999999e-143  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0543  alpha,alpha-phosphotrehalase (trehalose-6-phosphate hydrolase)  44.84 
 
 		 553 aa  507  9.999999999999999e-143  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0632  trehalose-6-phosphate hydrolase  44.66 
 
 		 553 aa  507  9.999999999999999e-143  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4669  alpha,alpha-phosphotrehalase  44.84 
 
 		 553 aa  508  9.999999999999999e-143  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.2503e-20 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0417  oligo-1,6-glucosidase  42.23 
 
 		 554 aa  508  9.999999999999999e-143  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0518  trehalose-6-phosphate hydrolase  43.16 
 
 		 560 aa  506  9.999999999999999e-143  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000559563  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1378  alpha amylase catalytic region  43.24 
 
 		 553 aa  497  1e-139  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000100533  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0243  alpha amylase catalytic region  44.4 
 
 		 536 aa  498  1e-139  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0528  trehalose-6-phosphate hydrolase  47.96 
 
 		 554 aa  493  9.999999999999999e-139  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.664084  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0438  trehalose-6-phosphate hydrolase  45.23 
 
 		 551 aa  489  1e-137  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.683069  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0578  trehalose-6-phosphate hydrolase  41.87 
 
 		 556 aa  490  1e-137  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0303  alpha amylase catalytic region  49.28 
 
 		 557 aa  489  1e-137  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2758  trehalose-6-phosphate hydrolase  44.54 
 
 		 563 aa  489  1e-137  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1506  trehalose-6-phosphate hydrolase  44.88 
 
 		 561 aa  487  1e-136  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0542  alpha,alpha-phosphotrehalase  42.63 
 
 		 555 aa  486  1e-136  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.764323  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0523  trehalose-6-phosphate hydrolase  42.68 
 
 		 560 aa  487  1e-136  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4800  trehalose-6-phosphate hydrolase  44.86 
 
 		 550 aa  483  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.235757  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4855  trehalose-6-phosphate hydrolase  45.05 
 
 		 550 aa  485  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0911834  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4834  trehalose-6-phosphate hydrolase  44.86 
 
 		 550 aa  483  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4736  trehalose-6-phosphate hydrolase  44.68 
 
 		 550 aa  483  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4705  trehalose-6-phosphate hydrolase  44.68 
 
 		 550 aa  481  1e-134  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0221451  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2575  alpha amylase catalytic region  43.56 
 
 		 604 aa  477  1e-133  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.260702  normal  0.580332 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4844  trehalose-6-phosphate hydrolase  43.78 
 
 		 551 aa  472  1e-132  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.257097  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2341  alpha amylase catalytic region  40.72 
 
 		 554 aa  473  1e-132  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4493  trehalose-6-phosphate hydrolase  43.6 
 
 		 551 aa  473  1e-132  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04107  trehalose-6-P hydrolase  43.42 
 
 		 551 aa  471  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0052  alpha amylase catalytic region  45.74 
 
 		 577 aa  471  1.0000000000000001e-131  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.316768 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4811  trehalose-6-phosphate hydrolase  43.42 
 
 		 551 aa  471  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>