More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2731 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_2731  ABC transporter related  100 
 
 		 255 aa  495  1e-139  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4277  ABC transporter related protein  56.97 
 
 		 262 aa  285  4e-76  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2099  ABC transporter related  52.21 
 
 		 261 aa  256  2e-67  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4240  ABC transporter related  55.56 
 
 		 285 aa  255  6e-67  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.347698 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3884  ABC transporter related  51.39 
 
 		 267 aa  254  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.252663 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5060  ABC transporter related protein  57.08 
 
 		 264 aa  248  6e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.165572  normal  0.307259 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1413  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  54.07 
 
 		 295 aa  248  6e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2035  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  54.07 
 
 		 263 aa  247  1e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3153  iron chelate ABC transporter ATP-binding protein  54.07 
 
 		 263 aa  247  1e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3192  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  54.07 
 
 		 265 aa  247  1e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4783  ABC transporter related  57.43 
 
 		 263 aa  246  2e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0878  iron chelate ABC transporter ATP-binding protein  54.07 
 
 		 265 aa  247  2e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.382345  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2712  iron chelate ABC transporter ATP-binding protein  54.07 
 
 		 265 aa  247  2e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.203934  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1898  iron chelate ABC transporter ATP-binding protein  54.07 
 
 		 265 aa  247  2e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.303699  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3914  ABC transporter related  58 
 
 		 274 aa  246  3e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00146418  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0153  ABC transporter-like  46.69 
 
 		 260 aa  239  2e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3280  ABC transporter related  46.22 
 
 		 326 aa  237  1e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3182  ABC transporter related  46.22 
 
 		 321 aa  236  2e-61  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0867  ABC transporter related  52.44 
 
 		 261 aa  236  3e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.468249  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1348  ABC transporter related  52.44 
 
 		 261 aa  236  3e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.893482  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1330  ABC transporter related  52.03 
 
 		 261 aa  236  3e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.198336 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0840  ABC transporter related  46.22 
 
 		 321 aa  235  5.0000000000000005e-61  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4490  ABC transporter, ATPase subunit  52.03 
 
 		 265 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0876356  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4566  ABC transporter related  48.61 
 
 		 280 aa  230  2e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3790  ABC transporter related  52.23 
 
 		 262 aa  229  3e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00500294  normal  0.911746 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3382  ABC transporter related  44.18 
 
 		 308 aa  229  5e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1033  iron-compound ABC transporter, ATP-binding protein, putative  45.02 
 
 		 285 aa  228  7e-59  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2599  ABC transporter related  48.21 
 
 		 254 aa  227  2e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.628612  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2273  ABC transporter related  48.21 
 
 		 254 aa  223  2e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.788065  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3775  ABC transporter related protein  50 
 
 		 265 aa  223  2e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3725  ABC transporter related protein  49.6 
 
 		 249 aa  222  6e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0593  ABC transporter-like  47.88 
 
 		 262 aa  221  7e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.835078  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2963  ABC transporter related  43.72 
 
 		 293 aa  220  9.999999999999999e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1289  hypothetical protein  44.8 
 
 		 259 aa  221  9.999999999999999e-57  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.128877 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4086  ABC transporter related  47.11 
 
 		 279 aa  219  1.9999999999999999e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.778722 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0756  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein, putative  37.85 
 
 		 253 aa  219  3e-56  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.737485  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0997  ABC transporter related  43.72 
 
 		 297 aa  219  3e-56  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1009  ABC transporter related  43.72 
 
 		 297 aa  219  3e-56  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0975  ABC transporter related  43.72 
 
 		 297 aa  219  3e-56  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2708  ABC transporter related  51.88 
 
 		 257 aa  218  7e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2322  ABC transporter related protein  49.41 
 
 		 261 aa  217  1e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3366  ABC transporter related  43.32 
 
 		 297 aa  217  1e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17610  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  51 
 
 		 251 aa  215  5e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0874  ABC transporter related  42.11 
 
 		 269 aa  214  8e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2242  ABC transporter ATP-binding protein  50.62 
 
 		 257 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.698137  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5102  ABC transporter  47.23 
 
 		 259 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5561  iron-compound ABC transporter, ATP-binding protein, putative  47.23 
 
 		 259 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0712  ABC transporter-related protein  44.98 
 
 		 324 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4828  ABC transporter related  46.86 
 
 		 258 aa  212  3.9999999999999995e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.169592  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3736  ABC transporter-related protein  44.68 
 
 		 311 aa  212  4.9999999999999996e-54  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.652525 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1424  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  40.68 
 
 		 251 aa  211  7.999999999999999e-54  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000297439  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4222  ABC transporter related  49.19 
 
 		 254 aa  211  9e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1116  ABC transporter related  41.83 
 
 		 307 aa  211  9e-54  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0443  ABC transporter related  49.8 
 
 		 257 aa  211  1e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.152213 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0760  iron-compound ABC transporter, ATP-binding protein, putative  45.42 
 
 		 271 aa  210  2e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0404  ABC transporter related  45.11 
 
 		 283 aa  209  3e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26400  putative ATP-binding component of ABC transporter  49.79 
 
 		 257 aa  209  3e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.749781  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1426  ABC transporter related protein  46.92 
 
 		 266 aa  207  1e-52  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0987  ABC transporter related  42.11 
 
 		 264 aa  205  6e-52  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.343956  normal  0.294383 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0560  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport system protein  50.84 
 
 		 257 aa  204  8e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23980  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  50.4 
 
 		 339 aa  204  8e-52  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.862389 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3207  ABC transporter related  42.23 
 
 		 253 aa  204  1e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.712241  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3258  iron ABC transporter, ATP-binding protein  47.08 
 
 		 263 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.047532  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04360  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  52.61 
 
 		 285 aa  199  3e-50  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3096  ABC transporter  48.12 
 
 		 263 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.516576 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2982  ABC transporter related  47.74 
 
 		 254 aa  197  1.0000000000000001e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.200508  normal  0.223625 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2653  ABC transporter related protein  45.53 
 
 		 275 aa  196  2.0000000000000003e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.015626  normal  0.494788 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1927  ABC transporter related  47.5 
 
 		 262 aa  195  6e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0701632 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2830  ABC transporter-like  44.92 
 
 		 268 aa  194  1e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.652667  normal  0.515297 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21290  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  44.49 
 
 		 257 aa  192  4e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.426648 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0602  ABC transporter-related protein  43.2 
 
 		 418 aa  192  4e-48  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.660447  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5100  ABC transporter related  39.44 
 
 		 253 aa  191  7e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0130853  normal  0.02881 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1752  ABC transporter related protein  37.05 
 
 		 266 aa  191  7e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0105422  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2056  ABC transporter related  46.67 
 
 		 262 aa  191  9e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4300  ABC transporter related  44 
 
 		 303 aa  191  1e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.308775  decreased coverage  0.0000186519 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00190  ABC transporter related  35.46 
 
 		 418 aa  189  2.9999999999999997e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00177587  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0187  ABC transporter related  40.32 
 
 		 275 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.184625  normal  0.796471 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3279  ABC transporter related  46.44 
 
 		 262 aa  189  4e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1378  hypothetical protein  38.8 
 
 		 409 aa  189  4e-47  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00009791  normal  0.0246408 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2584  ABC transporter related  47.92 
 
 		 273 aa  188  5.999999999999999e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5021  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (iron)  42.92 
 
 		 384 aa  188  9e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0722878  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2397  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  41.02 
 
 		 255 aa  187  1e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.497702 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42590  hemin importer ATP-binding subunit  46.64 
 
 		 255 aa  187  1e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00288273  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0258  ABC transporter related  44.05 
 
 		 424 aa  187  1e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.431626 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0298  ABC transporter related  34.4 
 
 		 266 aa  187  2e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2416  iron ABC transporter, ATP-binding protein, putative  46.44 
 
 		 262 aa  187  2e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.484616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1832  ABC transporter related protein  42.68 
 
 		 490 aa  186  2e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04153  iron-dicitrate transporter subunit  40.8 
 
 		 255 aa  185  5e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3713  ABC transporter related protein  40.8 
 
 		 255 aa  185  5e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4864  iron-dicitrate transporter ATP-binding subunit  40.8 
 
 		 255 aa  185  5e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2793  ABC transporter related  44 
 
 		 414 aa  185  5e-46  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04116  hypothetical protein  40.8 
 
 		 255 aa  185  5e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2164  ABC transporter related  39.48 
 
 		 270 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0739  iron-dicitrate transporter ATP-binding subunit  40.4 
 
 		 255 aa  184  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2583  ABC transporter related protein  44.94 
 
 		 293 aa  184  1.0000000000000001e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.641759  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0882  corrinoid ABC transporter ATPase  42.74 
 
 		 424 aa  183  2.0000000000000003e-45  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1932  ABC transporter related  32.8 
 
 		 266 aa  183  2.0000000000000003e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1239  ABC transporter related  44.4 
 
 		 292 aa  182  3e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.469823  normal  0.0861739 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0214  ferrichrome ABC transporter  36.08 
 
 		 259 aa  182  3e-45  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1285  ABC transporter related  38.02 
 
 		 255 aa  182  5.0000000000000004e-45  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0279038  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>