27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2571 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_2571  Pectate lyase  100 
 
 		 266 aa  546  1e-154  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.18079  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2563  Pectate lyase  72.81 
 
 		 259 aa  355  5.999999999999999e-97  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0171428  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0819  pectate lyase  67.28 
 
 		 427 aa  333  1e-90  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.28547  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2301  Pectate lyase  65.6 
 
 		 365 aa  319  3e-86  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.452858  normal  0.747236 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1313  Pectate lyase  61.3 
 
 		 430 aa  298  5e-80  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0268992  hitchhiker  0.00857009 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0329  Pectate lyase  58.26 
 
 		 445 aa  277  2e-73  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0745769 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4177  Pectate lyase  55.92 
 
 		 430 aa  248  7e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08453  Pectate lyasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5ATC7]  42.37 
 
 		 260 aa  190  2e-47  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03337  Pectate lyasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5B7Z3]  47.62 
 
 		 254 aa  188  9e-47  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00353943  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02542  pectate lyase (Eurofung)  41.92 
 
 		 264 aa  181  1e-44  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06106  pectate lyase (Eurofung)  45.09 
 
 		 244 aa  165  5.9999999999999996e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.148982 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06748  pectate lyase (Eurofung)  36.16 
 
 		 257 aa  135  7.000000000000001e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000825304  normal  0.0251072 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0608  hypothetical protein  40.09 
 
 		 452 aa  123  4e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2182  Pectate lyase  41.57 
 
 		 489 aa  120  3e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0866134  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1854  Pectate lyase  44.06 
 
 		 460 aa  115  5e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0715  Pectate lyase  41.24 
 
 		 233 aa  111  1.0000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.944836 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2020  Pectate lyase  37.71 
 
 		 574 aa  105  8e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.742128  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1273  Pectate lyase  35.78 
 
 		 346 aa  105  1e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.130582  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0988  Pectate lyase  37.75 
 
 		 351 aa  103  2e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3322  Pectate lyase  37.75 
 
 		 347 aa  101  1e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1703  hypothetical protein  35.86 
 
 		 392 aa  101  2e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.595343 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2308  hypothetical protein  38.81 
 
 		 511 aa  85.5  7e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00819182 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1373  type III helper protein HrpW1  34.34 
 
 		 424 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.00000104079  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3007  N-acetylglucosamine-6-phosphate deacetylase  36.89 
 
 		 424 aa  81.6  0.00000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0014113 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2775  HARPIN-like protein  36.42 
 
 		 380 aa  78.6  0.0000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.396388 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1184  type III helper protein HrpW1  35.25 
 
 		 441 aa  76.6  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.211632 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0897  hypothetical protein  22.14 
 
 		 361 aa  43.5  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.403321 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>