75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_1540 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_1540  PilT protein domain protein  100 
 
 		 137 aa  266  7e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3326  PilT domain-containing protein  44.78 
 
 		 143 aa  84.7  4e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0141  PilT protein-like  40.43 
 
 		 157 aa  84  6e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3714  PilT protein domain protein  43.85 
 
 		 139 aa  81.3  0.000000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.440396  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4109  PilT protein-like  42.31 
 
 		 127 aa  79.7  0.00000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0552  PilT domain-containing protein  40.91 
 
 		 127 aa  77.8  0.00000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1765  PilT protein domain protein  43.18 
 
 		 142 aa  77.8  0.00000000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0806025  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5572  PilT domain-containing protein  45.38 
 
 		 126 aa  74.7  0.0000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0396621  normal  0.199506 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3106  PilT domain-containing protein  44.8 
 
 		 127 aa  65.1  0.0000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.194845  normal  0.285105 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0688  PilT domain-containing protein  31.15 
 
 		 132 aa  58.5  0.00000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.442109  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0459  PilT protein domain protein  37.41 
 
 		 137 aa  56.2  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.063195 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2472  virulence associated protein C  33.33 
 
 		 133 aa  56.2  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00148493  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2620  PilT protein domain protein  33.08 
 
 		 134 aa  55.1  0.0000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1127  PilT domain-containing protein  34.68 
 
 		 133 aa  53.9  0.0000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.539233 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4257  PilT domain-containing protein  36.29 
 
 		 140 aa  52  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.599841  hitchhiker  0.000155832 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1325  nucleic acid binding protein  30.83 
 
 		 133 aa  51.6  0.000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.000000000000354508  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3212  PilT protein domain protein  36.22 
 
 		 128 aa  51.6  0.000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0181493  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0074  PilT protein domain protein  36.27 
 
 		 139 aa  51.6  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1868  PilT domain-containing protein  30.71 
 
 		 133 aa  51.2  0.000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000212984  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0138  PilT domain-containing protein  34.13 
 
 		 133 aa  51.2  0.000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3697  PilT protein domain protein  37.21 
 
 		 138 aa  51.2  0.000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4014  PilT protein domain protein  34.91 
 
 		 137 aa  50.8  0.000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00102621  hitchhiker  0.000259631 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4187  DNA replication protein-like protein  35.66 
 
 		 135 aa  50.8  0.000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.49294 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3320  PilT protein-like  34.68 
 
 		 133 aa  49.3  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4076  plamid maintenance protein  34.88 
 
 		 135 aa  48.9  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2733  PilT protein-like  33.08 
 
 		 145 aa  48.5  0.00003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.489446  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2669  PilT protein-like  31.97 
 
 		 132 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0691561  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36180  PilT domain-containing protein  34.4 
 
 		 136 aa  48.1  0.00004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5884  PilT domain-containing protein  35.83 
 
 		 148 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.669409 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4396  PilT protein domain protein  38.1 
 
 		 125 aa  48.1  0.00004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0827  PilT protein domain protein  36.19 
 
 		 133 aa  47.8  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00471695 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0444  PilT domain-containing protein  39.83 
 
 		 133 aa  47.8  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0154  PilT domain-containing protein  34.92 
 
 		 133 aa  47.8  0.00006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4210  PilT domain-containing protein  37.76 
 
 		 146 aa  47.4  0.00007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.242184  normal  0.98897 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2777  PilT protein domain protein  30.33 
 
 		 134 aa  47  0.00009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2951  PilT domain-containing protein  30.83 
 
 		 136 aa  46.6  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1045  virulence-associated protein, putative  32.73 
 
 		 134 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.491192  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3269  PilT protein-like  34.62 
 
 		 133 aa  46.2  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.159462  hitchhiker  0.00995267 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1623  virulence associated protein VagD, putative  34.92 
 
 		 134 aa  45.8  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1070  PilT protein-like protein  35.29 
 
 		 145 aa  45.4  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3224  PilT domain-containing protein  42.05 
 
 		 100 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.418408 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2617  nucleic acid binding protein  38.54 
 
 		 134 aa  45.8  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.243477 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3939  PilT protein domain protein  32.99 
 
 		 133 aa  45.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2332  PilT protein-like  36.57 
 
 		 140 aa  45.1  0.0004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.221502 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0442  nitrogen regulatory protein NtrR  34.43 
 
 		 134 aa  44.7  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.315733  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0894  PilT protein, N-terminal  32.73 
 
 		 134 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.282292 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2129  virulence-associated protein, putative  36 
 
 		 136 aa  44.3  0.0006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0156283  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1788  PilT protein domain protein  36 
 
 		 136 aa  44.3  0.0006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.813085  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2505  PilT protein domain protein  30.56 
 
 		 142 aa  43.9  0.0007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4581  PilT protein-like  35.82 
 
 		 140 aa  43.9  0.0008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.766949  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1823  PilT domain-containing protein  30.5 
 
 		 142 aa  43.9  0.0008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.402154  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0701  PilT protein domain protein  31.58 
 
 		 136 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.528227 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5170  PilT protein domain protein  32.38 
 
 		 147 aa  43.1  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2468  PilT protein domain protein  30.6 
 
 		 135 aa  43.5  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0500169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3905  PilT domain-containing protein  33.02 
 
 		 134 aa  43.5  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.646522  normal  1 
 
 
-
 
NC_011367  Gdia_3569  PilT protein domain protein  35.79 
 
 		 140 aa  42.4  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1048  PilT protein domain protein  43.1 
 
 		 109 aa  42.4  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.71366  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1319  PilT protein domain protein  34.68 
 
 		 140 aa  42.4  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3767  PilT domain-containing protein  36.09 
 
 		 140 aa  42.7  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.546918  normal  0.369065 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1138  PilT domain-containing protein  35.56 
 
 		 133 aa  42.4  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0469  PilT domain-containing protein  33.33 
 
 		 141 aa  42  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4028  PilT protein domain protein  32.84 
 
 		 141 aa  41.6  0.004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0155  PilT protein domain protein  29.46 
 
 		 139 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.538447 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0713  PilT domain-containing protein  29.69 
 
 		 141 aa  41.6  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000185206  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0898  PilT protein domain protein  32.11 
 
 		 131 aa  41.2  0.005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.185586  normal  0.0272728 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0630  PilT protein domain protein  40.82 
 
 		 137 aa  41.2  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.317071 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4538  PilT protein domain protein  32.33 
 
 		 140 aa  41.2  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.104439 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0983  PilT domain-containing protein  30.08 
 
 		 133 aa  41.2  0.005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4019  PilT protein-like  32.33 
 
 		 144 aa  40.8  0.006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.506281 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1848  PilT protein domain protein  33.06 
 
 		 129 aa  40.4  0.007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013163  Cyan8802_4589  PilT protein domain protein  27.13 
 
 		 139 aa  40.8  0.007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000022459  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3474  PilT domain-containing protein  34.56 
 
 		 141 aa  40.4  0.008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.26779 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5055  PilT domain-containing protein  33.7 
 
 		 133 aa  40.4  0.008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3682  PilT domain-containing protein  38.1 
 
 		 134 aa  40  0.01  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.362926  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2936  PilT domain-containing protein  34.02 
 
 		 130 aa  40  0.01  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.203821 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>