44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_3451 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_3451  hypothetical protein  100 
 
 		 404 aa  798    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.332754  normal  0.721306 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2778  hypothetical protein  99.26 
 
 		 404 aa  790    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.962875  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3774  hypothetical protein  63.11 
 
 		 389 aa  418  1e-116  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5061  hypothetical protein  53.83 
 
 		 381 aa  322  6e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0250139  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1022  hypothetical protein  45.51 
 
 		 401 aa  236  6e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.924972  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0631  hypothetical protein  34.73 
 
 		 376 aa  192  6e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0310  hypothetical protein  38.75 
 
 		 345 aa  186  7e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.187979  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2888  hypothetical protein  33.87 
 
 		 354 aa  183  4.0000000000000006e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.195659  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0187  hypothetical protein  31.03 
 
 		 396 aa  177  3e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.255815 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1424  hypothetical protein  32.01 
 
 		 399 aa  175  1.9999999999999998e-42  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0154311  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1837  hypothetical protein  34.38 
 
 		 384 aa  167  4e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0245984  normal  0.0224069 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2036  hypothetical protein  33.43 
 
 		 379 aa  159  8e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00898362  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0487  hypothetical protein  33.61 
 
 		 388 aa  155  1e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1104  protein of unknown function DUF1555  34.49 
 
 		 410 aa  154  2e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.915613  normal  0.696745 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1075  protein of unknown function DUF1555  34.22 
 
 		 410 aa  152  8e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4864  hypothetical protein  30.92 
 
 		 394 aa  152  8.999999999999999e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.019631  unclonable  0.000000201965 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5253  hypothetical protein  32.36 
 
 		 419 aa  151  2e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.462445 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08866  hypothetical protein  30.43 
 
 		 363 aa  150  5e-35  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2766  hypothetical protein  31.51 
 
 		 384 aa  143  5e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.391487  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1936  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.6 
 
 		 1016 aa  142  9e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3999  phytase  30.75 
 
 		 1844 aa  130  5.0000000000000004e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4386  hypothetical protein  29.94 
 
 		 390 aa  114  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.47419 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3038  hypothetical protein  29.27 
 
 		 387 aa  114  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.79094 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2281  hypothetical protein  31.1 
 
 		 344 aa  112  1.0000000000000001e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2644  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.37 
 
 		 383 aa  98.2  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.465109 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3472  hypothetical protein  29.37 
 
 		 383 aa  98.2  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6147  hypothetical protein  27.92 
 
 		 494 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2717  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.02 
 
 		 657 aa  61.6  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.814877 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0365  hypothetical protein  27.27 
 
 		 469 aa  56.2  0.0000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.058637  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0293  lipoprotein  29.68 
 
 		 348 aa  55.5  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.851518  normal  0.0926992 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1211  hypothetical protein  26.55 
 
 		 504 aa  54.3  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.816612  normal  0.530795 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1903  hypothetical protein  23.34 
 
 		 494 aa  53.1  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000927643 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3554  hypothetical protein  27.07 
 
 		 466 aa  52.8  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4474  hypothetical protein  27.15 
 
 		 330 aa  50.4  0.00006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.220216  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4951  hypothetical protein  27.06 
 
 		 438 aa  48.5  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0822619 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7563  hypothetical protein  34.86 
 
 		 358 aa  47  0.0006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0285  hypothetical protein  35.78 
 
 		 359 aa  46.6  0.0007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.106647 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1103  protein of unknown function DUF1555  25.36 
 
 		 501 aa  47  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.428306  normal  0.970899 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1074  protein of unknown function DUF1555  25.36 
 
 		 501 aa  46.6  0.0008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0544  hypothetical protein  33.94 
 
 		 384 aa  46.6  0.0008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.200606 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3467  hemolysin-type calcium-binding region  23.2 
 
 		 1175 aa  46.2  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0541  hypothetical protein  33.62 
 
 		 332 aa  45.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.682132  normal  0.522386 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0496  hypothetical protein  33.98 
 
 		 382 aa  44.3  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4265  hypothetical protein  28.29 
 
 		 429 aa  43.1  0.008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.223589  normal  0.265147 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>