140 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_1704 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_1999  protein of unknown function DUF72  95.32 
 
 
363 aa  664    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.108887  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1704  hypothetical protein  100 
 
 
365 aa  728    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.792663 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1869  hypothetical protein  71.29 
 
 
390 aa  417  9.999999999999999e-116  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.19198  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2789  protein of unknown function DUF72  62.81 
 
 
359 aa  395  1e-109  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0971015  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3371  hypothetical protein  53.69 
 
 
374 aa  345  6e-94  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.241512  normal  0.96149 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0785  protein of unknown function DUF72  48.75 
 
 
361 aa  295  6e-79  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.223922 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0715  protein of unknown function DUF72  48.47 
 
 
361 aa  290  3e-77  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.044641  normal  0.0915207 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0765  hypothetical protein  51.23 
 
 
355 aa  288  1e-76  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.143157 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0813  hypothetical protein  45.98 
 
 
355 aa  274  2.0000000000000002e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2570  hypothetical protein  46.47 
 
 
433 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5902  hypothetical protein  47.06 
 
 
431 aa  272  7e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.834599 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0726  hypothetical protein  46.46 
 
 
435 aa  271  1e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.299364 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1959  hypothetical protein  46.18 
 
 
433 aa  270  2e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.479808  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0512  hypothetical protein  45.69 
 
 
379 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.204603  normal  0.230497 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2644  hypothetical protein  45.56 
 
 
356 aa  270  4e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2489  hypothetical protein  45.59 
 
 
440 aa  269  5.9999999999999995e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.457254  normal  0.59095 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0357  hypothetical protein  48.98 
 
 
522 aa  268  1e-70  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.0000555141  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1059  hypothetical protein  48.98 
 
 
519 aa  268  1e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.51988  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0657  hypothetical protein  48.98 
 
 
522 aa  268  1e-70  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.222869  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2492  hypothetical protein  48.98 
 
 
522 aa  268  1e-70  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000876051  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0899  hypothetical protein  48.98 
 
 
525 aa  268  1e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.103522  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0105  hypothetical protein  48.98 
 
 
522 aa  268  1e-70  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0559982  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2618  hypothetical protein  44.69 
 
 
440 aa  266  4e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0902  hypothetical protein  48.69 
 
 
525 aa  266  4e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0290977  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1823  hypothetical protein  47.94 
 
 
382 aa  264  2e-69  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.599232  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2594  hypothetical protein  47.15 
 
 
433 aa  264  2e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0715  hypothetical protein  46.35 
 
 
505 aa  262  6.999999999999999e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.0023847  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3223  protein of unknown function DUF72  46.01 
 
 
489 aa  255  7e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.873397  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0739  hypothetical protein  45.18 
 
 
422 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0200  protein of unknown function DUF72  39.78 
 
 
339 aa  205  1e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0831  protein of unknown function DUF72  29.63 
 
 
249 aa  71.6  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.270986  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0783  hypothetical protein  29.97 
 
 
249 aa  70.5  0.00000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.111895  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1934  protein of unknown function DUF72  27.83 
 
 
354 aa  69.7  0.00000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.978403  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0835  protein of unknown function DUF72  28.96 
 
 
249 aa  66.6  0.0000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0813  hypothetical protein  27.96 
 
 
251 aa  65.1  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.204786  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0100  protein of unknown function DUF72  22.79 
 
 
247 aa  63.5  0.000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34370  hypothetical protein  24.76 
 
 
313 aa  62.8  0.000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2839  hypothetical protein  27.36 
 
 
242 aa  60.5  0.00000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.991999  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3332  protein of unknown function DUF72  29.05 
 
 
284 aa  60.5  0.00000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000208142 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4197  hypothetical protein  25.25 
 
 
251 aa  60.1  0.00000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.052496  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1411  hypothetical protein  33.15 
 
 
245 aa  59.7  0.00000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2383  hypothetical protein  32.08 
 
 
244 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0169242  normal  0.0347484 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3144  protein of unknown function DUF72  33.52 
 
 
249 aa  58.5  0.0000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1394  hypothetical protein  27.01 
 
 
268 aa  57.8  0.0000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.159413  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3869  hypothetical protein  24.23 
 
 
343 aa  57.8  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0151783 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0212  hypothetical protein  28.18 
 
 
265 aa  57.4  0.0000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.79896 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3871  hypothetical protein  35.82 
 
 
203 aa  57  0.0000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.370827  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1234  hypothetical protein  25.24 
 
 
267 aa  57  0.0000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.595917  normal  0.101491 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3363  hypothetical protein  21.66 
 
 
236 aa  56.2  0.0000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0487  hypothetical protein  27.63 
 
 
242 aa  56.2  0.0000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2952  protein of unknown function DUF72  26.82 
 
 
241 aa  56.2  0.0000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4591  protein of unknown function DUF72  26.92 
 
 
303 aa  55.8  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.083858 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1153  hypothetical protein  27.36 
 
 
271 aa  55.5  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0523991  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3133  protein of unknown function DUF72  30.46 
 
 
244 aa  55.8  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0190  hypothetical protein  38.55 
 
 
256 aa  55.1  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.665614  normal  0.961864 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0717  hypothetical protein  25.33 
 
 
242 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0831  hypothetical protein  28.07 
 
 
249 aa  54.7  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.251695  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3824  protein of unknown function DUF72  29.41 
 
 
247 aa  53.9  0.000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0542563  normal  0.011447 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1160  hypothetical protein  23.05 
 
 
261 aa  53.5  0.000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0500427  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1295  hypothetical protein  23.05 
 
 
261 aa  53.5  0.000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.168214  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0353  hypothetical protein  33.09 
 
 
259 aa  53.5  0.000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0504287 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0902  protein of unknown function DUF72  25.41 
 
 
254 aa  53.1  0.000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.125228  normal  0.753863 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3462  hypothetical protein  27.48 
 
 
318 aa  53.1  0.000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1896  hypothetical protein  31.94 
 
 
254 aa  53.1  0.000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1538  protein of unknown function DUF72  31.28 
 
 
254 aa  53.1  0.000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4505  hypothetical protein  26.87 
 
 
284 aa  52.8  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.15421  normal  0.57305 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2682  protein of unknown function DUF72  30.77 
 
 
277 aa  52.8  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.995394  normal  0.372724 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3234  protein of unknown function DUF72  31.98 
 
 
244 aa  51.6  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3035  hypothetical protein  32.49 
 
 
246 aa  52  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0160246  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4328  protein of unknown function DUF72  28.24 
 
 
303 aa  51.2  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.937313 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0222  protein of unknown function DUF72  25.89 
 
 
242 aa  51.6  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0268  hypothetical protein  27.48 
 
 
286 aa  50.8  0.00003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0138  hypothetical protein  23.2 
 
 
387 aa  51.2  0.00003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4306  protein of unknown function DUF72  24.75 
 
 
268 aa  51.2  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3659  hypothetical protein  23.72 
 
 
267 aa  50.4  0.00004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0127  hypothetical protein  25 
 
 
246 aa  50.8  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3671  protein of unknown function DUF72  29.93 
 
 
321 aa  50.8  0.00004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.639508  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2198  hypothetical protein  22.97 
 
 
248 aa  50.1  0.00006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.389644  normal  0.68785 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1965  hypothetical protein  26.05 
 
 
282 aa  50.1  0.00007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00519894  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0238  protein of unknown function DUF72  26.77 
 
 
247 aa  49.7  0.00007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000268215  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0651  hypothetical protein  26.97 
 
 
252 aa  49.7  0.00007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.481358  normal  0.780906 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1799  hypothetical protein  23.08 
 
 
267 aa  49.7  0.00008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00128055  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3084  hypothetical protein  26.24 
 
 
293 aa  49.7  0.00009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0630619 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3609  hypothetical protein  25.34 
 
 
272 aa  49.3  0.00009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.945741 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3451  hypothetical protein  24.87 
 
 
249 aa  48.9  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5255  protein of unknown function DUF72  32.2 
 
 
280 aa  49.3  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.455274  normal  0.396482 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0459  protein of unknown function DUF72  29.18 
 
 
300 aa  49.3  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0078  protein of unknown function DUF72  23.99 
 
 
241 aa  48.9  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.483229  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2381  hypothetical protein  30.88 
 
 
243 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00190357 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2976  hypothetical protein  28.99 
 
 
259 aa  48.1  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.120346  normal  0.110544 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4566  protein of unknown function DUF72  25.6 
 
 
281 aa  48.5  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1924  protein of unknown function DUF72  24.43 
 
 
268 aa  48.1  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.845031  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1684  protein of unknown function DUF72  22.78 
 
 
282 aa  48.1  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.180097 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3221  protein of unknown function DUF72  24.66 
 
 
242 aa  48.1  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2348  protein of unknown function DUF72  23.62 
 
 
308 aa  48.1  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.104689  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3105  hypothetical protein  32.1 
 
 
301 aa  47.8  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.578331 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2244  hypothetical protein  28.8 
 
 
293 aa  47.8  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0119465 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0034  hypothetical protein  25.4 
 
 
340 aa  47.8  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.605387  decreased coverage  0.00440217 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3443  hypothetical protein  26.01 
 
 
243 aa  47.4  0.0004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1739  protein of unknown function DUF72  23.66 
 
 
268 aa  47  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.173371  normal  0.964673 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>