More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_0107 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_0107  Methyltransferase type 11  100 
 
 		 995 aa  1927    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0757  methyltransferase type 11  36.26 
 
 		 442 aa  108  4e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0768  methyltransferase type 11  35.48 
 
 		 442 aa  107  8e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.195883  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1074  methyltransferase type 11  34.64 
 
 		 436 aa  95.9  3e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.257037  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1388  methyltransferase type 11  34.31 
 
 		 477 aa  91.7  7e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.485949  normal  1 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3846  methyltransferase type 11  34.31 
 
 		 351 aa  90.5  1e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0403066  normal  0.436715 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21081  hypothetical protein  32.31 
 
 		 373 aa  87.4  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.781663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2177  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  36.81 
 
 		 345 aa  87  0.000000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.225032  hitchhiker  0.000137631 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1230  hypothetical protein  29.63 
 
 		 417 aa  86.3  0.000000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.643634  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0563  Methyltransferase type 11  34.94 
 
 		 396 aa  85.1  0.000000000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1780  mannosyltransferase, putative  32.65 
 
 		 1635 aa  84  0.00000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.731336  decreased coverage  0.0078788 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3019  hypothetical protein  36.03 
 
 		 306 aa  84  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0919  chromosome segregation ATPase  35.14 
 
 		 646 aa  82  0.00000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.446373  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3368  glycosyl transferase family protein  28.35 
 
 		 679 aa  81.6  0.00000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00886374 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0372  hypothetical protein  26.81 
 
 		 1085 aa  80.5  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2594  Methyltransferase type 11  35.67 
 
 		 272 aa  80.1  0.0000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2979  WbbD domain protein  35.67 
 
 		 272 aa  80.1  0.0000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3884  glycosyl transferase group 1  29.13 
 
 		 359 aa  76.6  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.242445 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1720  glycosyl transferase, group 1  32.98 
 
 		 377 aa  76.6  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.588865 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4138  glycosyl transferase family protein  27.76 
 
 		 624 aa  76.3  0.000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102626 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2764  glycosyl transferase group 1  26.02 
 
 		 357 aa  75.1  0.000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6932  glycosyl transferase group 1  28.84 
 
 		 1233 aa  71.2  0.00000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0899413 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1988  glycosyl transferase group 1  28.04 
 
 		 374 aa  71.2  0.00000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.590311  normal  0.0366847 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1229  putative glycosyltransferase  29.05 
 
 		 1219 aa  69.3  0.0000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.197488  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0855  glycosyl transferase, group 1  28.31 
 
 		 359 aa  68.9  0.0000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3753  methyltransferase type 11  23.2 
 
 		 2490 aa  68.2  0.0000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3816  glycosyl transferase group 1  28.71 
 
 		 379 aa  68.2  0.0000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5051  Glycosyltransferase-like protein  26.07 
 
 		 759 aa  67.4  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.172901  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5243  hypothetical protein  32.54 
 
 		 231 aa  67  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.204365  normal  0.202223 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00770  glycosyltransferase  31.01 
 
 		 916 aa  65.5  0.000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05800  glycosyltransferase  28.57 
 
 		 437 aa  65.1  0.000000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.504823  n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4283  glycosyl transferase, group 1  27.6 
 
 		 1229 aa  63.5  0.00000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0734  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 		 471 aa  62  0.00000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.399263 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1635  glycosyl transferase, group 1  26.97 
 
 		 623 aa  62  0.00000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.030735  normal  0.881168 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1903  hypothetical protein  26.28 
 
 		 376 aa  61.2  0.00000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.298907  normal  0.396986 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4009  glycosyl transferase, group 1  30.21 
 
 		 1386 aa  60.5  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0749  hypothetical protein  28.86 
 
 		 615 aa  59.7  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0752  methyltransferase type 11  31.29 
 
 		 214 aa  59.3  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0562  glycosyl transferase family 2  25.25 
 
 		 616 aa  59.7  0.0000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21071  hypothetical protein  27.27 
 
 		 1232 aa  59.3  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3232  hypothetical protein  31.13 
 
 		 323 aa  58.9  0.0000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.470904  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2646  glycosyl transferase, group 1  27.07 
 
 		 351 aa  58.5  0.0000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.637547  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1800  glycosyl transferase, group 1  33.58 
 
 		 394 aa  58.5  0.0000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.432856 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0690  glycosyl transferase, group 1  33.14 
 
 		 394 aa  58.5  0.0000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2454  LpsE protein  27.17 
 
 		 383 aa  58.2  0.0000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2368  glycosyl transferase group 1  29.75 
 
 		 409 aa  57.4  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.374877  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00760  methyltransferase family protein  34.44 
 
 		 200 aa  57  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.226135 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06140  glycosyltransferase  31.25 
 
 		 379 aa  57  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.191303  normal  0.988146 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0239  mannosyltransferase  27.27 
 
 		 351 aa  55.8  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.205695  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1729  glycosyl transferase, group 1  30.53 
 
 		 838 aa  56.2  0.000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3634  glycosyl transferase group 1  31.67 
 
 		 1044 aa  56.2  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.578618  normal  0.0749406 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0201  methyltransferase type 12  26.28 
 
 		 185 aa  55.1  0.000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0296  glycosyl transferase, group 1  36.7 
 
 		 346 aa  55.1  0.000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0464  glycosyl transferase group 1  32.37 
 
 		 394 aa  54.7  0.000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.57819 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0862  glycosyl transferase group 1  31.31 
 
 		 381 aa  54.7  0.000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3004  methionine biosynthesis protein MetW  38.26 
 
 		 195 aa  54.3  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5879  glycosyl transferase group 1  30 
 
 		 395 aa  54.3  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.734858 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4941  glycosyl transferase group 1  33.85 
 
 		 414 aa  54.3  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.421428 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1896  glycosyl transferase group 1  27.62 
 
 		 860 aa  53.9  0.00001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00121907  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1962  mannosyltransferase  27.62 
 
 		 859 aa  53.9  0.00001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.000841107  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1293  glycosyl transferase group 1  23.21 
 
 		 407 aa  54.3  0.00001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2376  glycosyl transferase group 1  30.37 
 
 		 372 aa  54.7  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3447  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.12 
 
 		 369 aa  53.5  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2815  hypothetical protein  23.05 
 
 		 341 aa  53.5  0.00002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0738  glycosyl transferase group 1  32.58 
 
 		 361 aa  53.1  0.00002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0666  hypothetical protein  26.72 
 
 		 233 aa  53.5  0.00002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.207992  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5499  Methyltransferase type 11  29.14 
 
 		 196 aa  53.1  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.456016  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0017  glycosyl transferase group 1  28 
 
 		 377 aa  53.9  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0057  glycosyl transferase group 1  32.95 
 
 		 791 aa  53.1  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.169678  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1238  glycosyl transferase group 1  32.86 
 
 		 349 aa  53.5  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0206606  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0077  hypothetical protein  28.78 
 
 		 353 aa  53.1  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2514  glycosyl transferase group 1  33.94 
 
 		 351 aa  53.1  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0260745  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3861  hypothetical protein  36.36 
 
 		 583 aa  52.8  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.20317 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4385  glycosyl transferase group 1  34.96 
 
 		 378 aa  53.1  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.610092  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0080  Methyltransferase type 11  28.78 
 
 		 353 aa  53.1  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3205  Methyltransferase type 11  29.92 
 
 		 210 aa  53.1  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2367  glycosyl transferase group 1  25.71 
 
 		 387 aa  52.4  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0400427  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2316  glycosyl transferase group 1  25.71 
 
 		 387 aa  52.4  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0390  Methyltransferase type 11  28.76 
 
 		 267 aa  52.8  0.00004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0126  glycosyl transferase group 1  29.29 
 
 		 371 aa  52.4  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3357  Methyltransferase type 11  31.06 
 
 		 211 aa  52.8  0.00004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4195  glycosyl transferase, group 1  29.78 
 
 		 873 aa  52.4  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1273  glycosyl transferase, group 1  30.08 
 
 		 380 aa  52.4  0.00004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00681714 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1073  glycosyl transferase, group 1  34.51 
 
 		 1261 aa  52.4  0.00004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.328377  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1579  glycosyl transferase group 1  28.82 
 
 		 394 aa  52.4  0.00004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000114352  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0456  glycosyl transferase group 1  24.65 
 
 		 366 aa  52  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3698  hypothetical protein  44.74 
 
 		 449 aa  52  0.00005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1051  glycosyl transferase, group 1  32.43 
 
 		 445 aa  52  0.00005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.876229 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29120  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  29.53 
 
 		 203 aa  52  0.00005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2838  glycosyl transferase group 1  27.47 
 
 		 373 aa  52.4  0.00005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.326547  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0222  methionine biosynthesis MetW  30.89 
 
 		 206 aa  52  0.00006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3768  glycosyl transferase group 1  31.58 
 
 		 366 aa  52  0.00006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2168  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.53 
 
 		 815 aa  52  0.00006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2484  glycosyl transferase, group 1  26.22 
 
 		 856 aa  52  0.00006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.672737  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0569  glycosyl transferase group 1  29.61 
 
 		 422 aa  52  0.00006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3267  hypothetical protein  28.66 
 
 		 303 aa  51.6  0.00007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2132  methyltransferase type 11  29.68 
 
 		 274 aa  51.6  0.00007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2364  glycosyl transferase group 1  30.45 
 
 		 774 aa  51.6  0.00007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.869085  normal  0.0140446 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4271  glycosyl transferase group 1  31.31 
 
 		 400 aa  51.6  0.00007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.614702 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4615  glycosyl transferase, group 1  24.46 
 
 		 382 aa  51.6  0.00008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.352309  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>