41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_3233 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_1326  hypothetical protein  45.99 
 
 		 1141 aa  960    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.770705  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2241  hypothetical protein  50.07 
 
 		 731 aa  654    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0974985 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3233  hypothetical protein  100 
 
 		 1129 aa  2288    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1081  hypothetical protein  42.4 
 
 		 1107 aa  848    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.202194  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1819  hypothetical protein  44.27 
 
 		 1154 aa  879    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0470618 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2756  hypothetical protein  43.56 
 
 		 1162 aa  919    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.206504  normal  0.110579 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1132  hypothetical protein  43.36 
 
 		 1174 aa  858    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00035988 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1709  hypothetical protein  44.44 
 
 		 1154 aa  877    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.18586  normal  0.0585819 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2238  hypothetical protein  48.14 
 
 		 389 aa  363  7.0000000000000005e-99  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0102712 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4847  putative restriction enzyme  24.58 
 
 		 1219 aa  157  1e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.0000521229  normal  0.767237 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3080  hypothetical protein  24.56 
 
 		 1425 aa  154  1e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1677  hypothetical protein  27.93 
 
 		 1171 aa  143  1.9999999999999998e-32  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00114545 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1156  hypothetical protein  24.84 
 
 		 1324 aa  141  4.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2107  hypothetical protein  26.28 
 
 		 1270 aa  140  1e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0339  putative restriction enzyme  27.87 
 
 		 1205 aa  137  9.999999999999999e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00710778  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1235  hypothetical protein  25.77 
 
 		 1484 aa  134  1.0000000000000001e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.616183  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0601  hypothetical protein  26.12 
 
 		 1497 aa  133  2.0000000000000002e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.548482  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0295  type II restriction enzyme  24.61 
 
 		 1167 aa  133  2.0000000000000002e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1608  hypothetical protein  25.75 
 
 		 1182 aa  132  4.0000000000000003e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.102768 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5027  type II restriction enzyme  23.09 
 
 		 1180 aa  132  5.0000000000000004e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.776061  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1916  hypothetical protein  21.93 
 
 		 1430 aa  129  2.0000000000000002e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1895  type IIS restriction enzyme  24.43 
 
 		 612 aa  128  7e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.4814  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3731  hypothetical protein  26.42 
 
 		 1174 aa  124  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2493  type IIS restriction enzyme  24.45 
 
 		 1183 aa  123  1.9999999999999998e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1299  Eco57I restriction endonuclease  24.11 
 
 		 1144 aa  123  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0387167  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02930  hypothetical protein  26.15 
 
 		 1131 aa  117  2.0000000000000002e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.264298  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0561  hypothetical protein  21.46 
 
 		 1162 aa  116  3e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02940  hypothetical protein  26.98 
 
 		 1140 aa  115  4.0000000000000004e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.45552  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2288  type II restriction enzyme  24.06 
 
 		 1160 aa  113  2.0000000000000002e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2038  hypothetical protein  19.88 
 
 		 1241 aa  85.1  0.000000000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.769996  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2208  hypothetical protein  24.13 
 
 		 1218 aa  84.7  0.000000000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00220427  normal  0.956264 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_260  hypothetical protein  25.83 
 
 		 1359 aa  80.9  0.0000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1273  hypothetical protein  18.94 
 
 		 1125 aa  77  0.000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1124  hypothetical protein  22.93 
 
 		 1326 aa  60.8  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0583  hypothetical protein  21.89 
 
 		 882 aa  57.8  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0997  hypothetical protein  26.67 
 
 		 706 aa  57  0.000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2889  N-6 DNA methylase  41.3 
 
 		 578 aa  51.6  0.00007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0217  N-6 DNA methylase  40.22 
 
 		 578 aa  50.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2547  type IIS restriction endonuclease, putative  21.25 
 
 		 1076 aa  46.2  0.003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00176401  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1159  hypothetical protein  24.92 
 
 		 1036 aa  45.8  0.004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3298  putative type II DNA modification enzyme  26.86 
 
 		 1322 aa  44.7  0.01  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>