133 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_0505 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013385  Adeg_0505  PilT protein domain protein  100 
 
 		 131 aa  266  7e-71  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3757  PilT domain-containing protein  32.8 
 
 		 135 aa  74.3  0.0000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00272094  normal  0.0228653 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0602  PilT protein domain protein  28.12 
 
 		 135 aa  73.9  0.0000000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.191075  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1533  PilT protein domain protein  29.13 
 
 		 132 aa  73.9  0.0000000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0497484  hitchhiker  0.000597174 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1461  PilT protein domain protein  34.85 
 
 		 134 aa  71.2  0.000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3905  PilT domain-containing protein  33.59 
 
 		 134 aa  68.9  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.646522  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1788  PilT protein domain protein  30.77 
 
 		 136 aa  69.3  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.813085  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2129  virulence-associated protein, putative  30.77 
 
 		 136 aa  69.3  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0156283  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3680  PilT protein domain protein  31.3 
 
 		 134 aa  68.2  0.00000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2719  PilT protein-like  27.48 
 
 		 151 aa  66.6  0.0000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.116591 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4624  PilT domain-containing protein  29.46 
 
 		 136 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.723585  normal  0.112001 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5055  PilT domain-containing protein  28.23 
 
 		 133 aa  64.3  0.0000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0286  PilT protein domain protein  29.69 
 
 		 135 aa  63.9  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.024358  decreased coverage  0.0024847 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6255  PilT domain-containing protein  30.16 
 
 		 135 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0358672  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3267  plasmid maintenance protein  25.78 
 
 		 132 aa  63.2  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3368  plasmid maintenance protein  25.58 
 
 		 133 aa  63.2  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.911  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2669  PilT protein-like  25.2 
 
 		 132 aa  62  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0691561  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6878  PilT domain-containing protein  30.65 
 
 		 136 aa  62  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.425666  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0414  PilT protein domain protein  30.95 
 
 		 135 aa  62.4  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8106  PilT protein domain protein  28.35 
 
 		 138 aa  62  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0091  PilT domain-containing protein  27.91 
 
 		 132 aa  60.8  0.000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0012  PilT protein domain-containing protein  32.58 
 
 		 133 aa  60.5  0.000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.948131 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2936  PilT domain-containing protein  28 
 
 		 130 aa  60.5  0.000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.203821 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1868  PilT domain-containing protein  24.81 
 
 		 133 aa  60.1  0.000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000212984  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1433  PilT protein domain protein  32.98 
 
 		 130 aa  60.1  0.000000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.697875  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2472  virulence associated protein C  25.38 
 
 		 133 aa  60.1  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00148493  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1325  nucleic acid binding protein  27.69 
 
 		 133 aa  60.1  0.00000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.000000000000354508  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0688  PilT domain-containing protein  25 
 
 		 132 aa  59.7  0.00000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.442109  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2777  PilT protein domain protein  26.56 
 
 		 134 aa  60.1  0.00000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0152  PilT protein domain protein  28.8 
 
 		 134 aa  59.3  0.00000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0420  PilT protein domain protein  29.46 
 
 		 137 aa  58.9  0.00000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0440  PilT protein-like  25.58 
 
 		 134 aa  58.5  0.00000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000179252  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2468  PilT protein domain protein  33.85 
 
 		 135 aa  58.2  0.00000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0500169  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1183  PilT protein domain protein  27.59 
 
 		 119 aa  57.4  0.00000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0728  PilT protein domain protein  25.4 
 
 		 132 aa  57.4  0.00000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.741529  hitchhiker  0.0000801582 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1771  hypothetical protein  27.34 
 
 		 133 aa  57  0.00000008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4014  PilT protein domain protein  30.77 
 
 		 137 aa  57  0.00000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00102621  hitchhiker  0.000259631 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1876  PilT protein domain protein  36.46 
 
 		 129 aa  57  0.00000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4187  DNA replication protein-like protein  20.31 
 
 		 135 aa  56.6  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.49294 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2951  PilT domain-containing protein  26.98 
 
 		 136 aa  56.6  0.0000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03915  predicted nucleic acid-binding protein,contains PIN domain  30.93 
 
 		 101 aa  57  0.0000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.968864  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1769  hypothetical protein  24.59 
 
 		 131 aa  55.8  0.0000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0638  PilT protein domain protein  26.32 
 
 		 136 aa  55.5  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0894  PilT protein, N-terminal  23.44 
 
 		 134 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.282292 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1319  PilT protein domain protein  28.68 
 
 		 140 aa  55.5  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0478  virulence-associated protein, putative  26.72 
 
 		 134 aa  55.5  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4076  plamid maintenance protein  20.31 
 
 		 135 aa  54.7  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1045  virulence-associated protein, putative  22.66 
 
 		 134 aa  54.7  0.0000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.491192  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1213  virulence associated protein C  28.91 
 
 		 138 aa  54.3  0.0000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1484  hypothetical protein  24.43 
 
 		 141 aa  54.3  0.0000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.174904  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4147  PilT domain-containing protein  31.25 
 
 		 134 aa  54.3  0.0000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.448502  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0442  nitrogen regulatory protein NtrR  31.25 
 
 		 134 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.315733  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1848  PilT protein domain protein  25.4 
 
 		 129 aa  53.9  0.0000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2366  PilT protein domain protein  27.35 
 
 		 137 aa  53.5  0.0000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1340  PilT protein domain protein  26.45 
 
 		 129 aa  53.1  0.000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.382871  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3461  PilT domain-containing protein  26.15 
 
 		 135 aa  53.1  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.999718 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1509  PilT domain-containing protein  32.04 
 
 		 147 aa  53.1  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.203613  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1904  PilT protein domain protein  23.02 
 
 		 129 aa  53.1  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.101114 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0701  PilT protein domain protein  33.07 
 
 		 136 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.528227 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2127  vapC protein, putative  28.12 
 
 		 133 aa  52.4  0.000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3732  nucleic acid-binding protein  29.01 
 
 		 132 aa  52.4  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2826  PilT protein-like  23.2 
 
 		 135 aa  52.4  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.640016  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0985  PilT domain-containing protein  28.91 
 
 		 129 aa  52.4  0.000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.483809  normal  0.193625 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1321  PIN domain protein  32.28 
 
 		 130 aa  52.4  0.000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.282385  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1380  PilT domain-containing protein  32.28 
 
 		 128 aa  52.4  0.000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.978498  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3968  PilT domain-containing protein  26.15 
 
 		 135 aa  52.8  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.10464  normal  0.34904 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3269  PilT protein-like  28.35 
 
 		 133 aa  52  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.159462  hitchhiker  0.00995267 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1337  PilT protein domain protein  24 
 
 		 129 aa  52  0.000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.1325  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1623  virulence associated protein VagD, putative  27.61 
 
 		 134 aa  51.6  0.000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1823  PilT domain-containing protein  29.01 
 
 		 142 aa  51.6  0.000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.402154  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5766  PilT protein domain protein  29.6 
 
 		 126 aa  51.2  0.000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.300152  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0138  PilT domain-containing protein  23.62 
 
 		 133 aa  51.2  0.000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0058  PilT protein domain protein  24.59 
 
 		 148 aa  51.2  0.000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1526  PilT protein-like  29.03 
 
 		 129 aa  51.2  0.000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000713835  decreased coverage  0.00911334 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1127  PilT domain-containing protein  28.57 
 
 		 133 aa  50.8  0.000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.539233 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3320  PilT protein-like  23.62 
 
 		 133 aa  50.4  0.000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1138  PilT domain-containing protein  25.76 
 
 		 133 aa  50.8  0.000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2498  PilT protein domain protein  33.33 
 
 		 136 aa  49.7  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0159803 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1433  NtrR protein  25.6 
 
 		 140 aa  50.1  0.00001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2987  PilT protein domain protein  25 
 
 		 137 aa  49.7  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4437  PilT protein-like  28.91 
 
 		 134 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0013  PilT protein-like  28.46 
 
 		 140 aa  48.9  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.96964 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0483  PilT domain-containing protein  28.12 
 
 		 133 aa  49.3  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3585  PilT protein domain protein  26.45 
 
 		 129 aa  49.3  0.00002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3865  PilT domain-containing protein  25.81 
 
 		 126 aa  49.3  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.870941  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12568  hypothetical protein  32.81 
 
 		 125 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.724019  normal  0.141761 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2343  PilT domain-containing protein  31.45 
 
 		 133 aa  49.3  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.487913  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2539  PilT domain-containing protein  30.95 
 
 		 136 aa  48.9  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.948556 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1063  PilT protein domain protein  25.76 
 
 		 139 aa  48.9  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.471234  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3079  PilT protein-like  30.53 
 
 		 146 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.046913  normal  0.55485 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3558  PilT domain-containing protein  27.91 
 
 		 128 aa  48.9  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0156  PilT protein domain protein  30.47 
 
 		 134 aa  48.5  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36180  PilT domain-containing protein  24.41 
 
 		 136 aa  48.1  0.00004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3729  PilT protein-like  24.41 
 
 		 133 aa  47.8  0.00005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.294534  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2557  PilT protein domain protein  27.48 
 
 		 135 aa  47.8  0.00005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.308124  normal  0.19537 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1067  PilT protein domain protein  23.08 
 
 		 134 aa  47.8  0.00005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3346  PilT protein-like  30 
 
 		 146 aa  47.4  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.732175  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2597  PilT protein-like protein  30.95 
 
 		 133 aa  47.4  0.00006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11426  hypothetical protein  32.54 
 
 		 133 aa  47.4  0.00006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.3127099999999998e-21  normal  0.106237 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5262  PilT protein domain protein  29.93 
 
 		 142 aa  47.4  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0679342  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>