211 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_2083 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_2083  paraquat-inducible protein A  100 
 
 
420 aa  815    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5823  paraquat-inducible protein A  46.43 
 
 
401 aa  329  6e-89  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.166267  normal  0.696161 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1324  integral membrane protein, PqiA family  29.01 
 
 
489 aa  183  4.0000000000000006e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.153858  normal  0.426119 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1669  PqiA family integral membrane protein  30.1 
 
 
415 aa  176  9.999999999999999e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000392356  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1780  PqiA family integral membrane protein  30.1 
 
 
450 aa  175  9.999999999999999e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2666  PqiA family integral membrane protein  29.85 
 
 
450 aa  168  2e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00001448  normal  0.0124404 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1842  integral membrane protein, PqiA family  30.2 
 
 
454 aa  166  8e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1351  paraquat-inducible protein A  27.8 
 
 
434 aa  164  2.0000000000000002e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00603606  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02850  hypothetical protein  28.37 
 
 
426 aa  160  6e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4089  paraquat-inducible protein A  29.52 
 
 
423 aa  157  2e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.645916  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1850  integral membrane protein, PqiA family  29.59 
 
 
426 aa  157  4e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.20863  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2138  integral membrane protein, PqiA family  28.72 
 
 
429 aa  157  5.0000000000000005e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.942277  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2007  hypothetical protein  31.34 
 
 
444 aa  155  1e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2101  integral membrane protein, PqiA family  28.06 
 
 
427 aa  155  1e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000268144  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1354  PqiA family integral membrane protein  28.32 
 
 
412 aa  154  2e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000343828  normal  0.147943 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01804  conserved inner membrane protein  28.06 
 
 
427 aa  154  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1799  PqiA family integral membrane protein  28.06 
 
 
427 aa  154  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.617144  normal  0.0501575 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01792  hypothetical protein  28.06 
 
 
427 aa  154  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2062  PqiA family integral membrane protein  28.06 
 
 
427 aa  154  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000156697  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2721  hypothetical protein  28.64 
 
 
413 aa  154  4e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2116  PqiA family integral membrane protein  30.62 
 
 
416 aa  154  4e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.327223  decreased coverage  0.0000761316 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2077  integral membrane protein, PqiA family  28.79 
 
 
427 aa  154  4e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.626049  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1809  integral membrane protein, PqiA family  28.06 
 
 
427 aa  153  5e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0679046  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2566  integral membrane protein, PqiA family  28.06 
 
 
427 aa  153  5e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000390803  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1924  PqiA family integral membrane protein  28.06 
 
 
427 aa  153  5.9999999999999996e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000171721  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3510  hypothetical protein  27.89 
 
 
464 aa  152  1e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.21998  normal  0.777652 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2403  PqiA family integral membrane protein  27.04 
 
 
427 aa  149  1.0000000000000001e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1919  PqiA family integral membrane protein  28.08 
 
 
427 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2114  PqiA family integral membrane protein  26.75 
 
 
426 aa  147  5e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.387585  normal  0.0225112 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1108  hypothetical protein  30.56 
 
 
419 aa  147  5e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000845315  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1864  PqiA family integral membrane protein  26.75 
 
 
426 aa  146  6e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0424283 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0650  PqiA family integral membrane protein  27.87 
 
 
449 aa  146  8.000000000000001e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0149918  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1540  paraquat-inducible membrane protein A  27.71 
 
 
408 aa  145  1e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.541735  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3536  PqiA family integral membrane protein  28.11 
 
 
449 aa  144  4e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.281669  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1283  integral membrane protein, PqiA family  27.3 
 
 
427 aa  142  8e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000216228  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2049  hypothetical protein  27.3 
 
 
427 aa  142  8e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1467  PqiA family integral membrane protein  27.3 
 
 
427 aa  142  8e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00123019  normal  0.152719 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1991  integral membrane protein, PqiA family  27.3 
 
 
427 aa  142  8e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.227718  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1987  integral membrane protein PqiA family  27.3 
 
 
427 aa  142  8e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.04812  hitchhiker  0.00476807 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2933  PqiA family integral membrane protein  25.49 
 
 
423 aa  140  3e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003427  paraquat-inducible protein A  26.8 
 
 
416 aa  140  3e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0651922  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1651  integral membrane protein, PqiA family  27.76 
 
 
422 aa  139  7e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003029  paraquat-inducible protein A  27.94 
 
 
401 aa  139  1e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5277  PqiA family integral membrane protein  29.28 
 
 
460 aa  137  4e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.340363  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5801  PqiA family integral membrane protein  29.91 
 
 
462 aa  137  4e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0413945  hitchhiker  0.00262359 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4852  PqiA family integral membrane protein  26.29 
 
 
415 aa  132  1.0000000000000001e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000220019 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1069  hypothetical protein  24.32 
 
 
417 aa  132  1.0000000000000001e-29  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.633648  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1126  Pqi5  26.08 
 
 
417 aa  132  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.865331  normal  0.906807 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0365  PqiA family integral membrane protein  26.04 
 
 
415 aa  131  2.0000000000000002e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1172  paraquat-inducible protein A  26.08 
 
 
417 aa  131  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.718604  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1021  paraquat-inducible protein A  26.08 
 
 
417 aa  131  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00323586  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1138  paraquat-inducible protein A  26.08 
 
 
417 aa  131  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.946739  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1104  paraquat-inducible protein A  26.08 
 
 
417 aa  131  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.163733 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1682  integral membrane protein, PqiA family  27.36 
 
 
422 aa  130  5.0000000000000004e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36030  paraquat-inducible protein A  37.77 
 
 
206 aa  129  9.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000103971 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1793  integral membrane protein, PqiA family  25.36 
 
 
458 aa  127  3e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2550  paraquat-inducible protein A  25.59 
 
 
428 aa  127  3e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.731619  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3044  paraquat-inducible protein A  34.87 
 
 
204 aa  126  6e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.123343 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2367  paraquat-inducible protein A  26.25 
 
 
417 aa  126  7e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.658309  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00954  paraquat-inducible membrane protein A  26.25 
 
 
417 aa  125  1e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000174021  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2693  integral membrane protein, PqiA family  26.25 
 
 
417 aa  125  1e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.098958  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2646  PqiA family integral membrane protein  26.25 
 
 
417 aa  125  1e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00999711  hitchhiker  0.00049713 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00961  hypothetical protein  26.25 
 
 
417 aa  125  1e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000262211  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1065  paraquat-inducible protein A  26.25 
 
 
417 aa  125  1e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000565994  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1059  paraquat-inducible protein A  26.25 
 
 
417 aa  125  1e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000508779  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2066  integral membrane protein, PqiA family  24.63 
 
 
448 aa  125  2e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1114  paraquat-inducible protein A  26.25 
 
 
417 aa  125  2e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0100863  normal  0.917256 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2169  paraquat-inducible protein A  26.25 
 
 
417 aa  125  2e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000394614  normal  0.228835 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62030  paraquat-inducible protein A-like protein  37.23 
 
 
206 aa  124  2e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0197125 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2639  PqiA family integral membrane protein  26.23 
 
 
428 aa  125  2e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1989  paraquat-inducible protein A  26.23 
 
 
428 aa  125  2e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5397  paraquat-inducible protein A  38.1 
 
 
206 aa  124  3e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.563787  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1462  PqiA family integral membrane protein  29.89 
 
 
417 aa  123  7e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.103115  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3375  paraquat-inducible protein A  37.44 
 
 
212 aa  122  9.999999999999999e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0541727 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1745  PqiA family integral membrane protein  23.36 
 
 
414 aa  121  3e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0758068  hitchhiker  0.0000336386 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3289  paraquat-inducible protein A  36.22 
 
 
214 aa  121  3e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0580  paraquat-inducible protein A  36.27 
 
 
249 aa  120  6e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0166734  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3140  paraquat-inducible protein A  36.22 
 
 
209 aa  120  6e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0258  paraquat-inducible protein A  38.24 
 
 
212 aa  118  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2678  paraquat-inducible protein A  35.64 
 
 
252 aa  117  3e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2534  paraquat-inducible protein A  34.92 
 
 
224 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0039  putative paraquat-inducible protein  35.71 
 
 
220 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.355976  normal  0.169833 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1014  paraquat-inducible protein A  37.85 
 
 
205 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.586652  normal  0.11146 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2673  paraquat-inducible protein A  33.5 
 
 
209 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.44394  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0518  Paraquat-inducible protein A  37.61 
 
 
245 aa  115  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02350  hypothetical protein  29.26 
 
 
324 aa  114  3e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02655  integral membrane protein, PqiA family  26.21 
 
 
380 aa  114  3e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.399105  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0644  paraquat-inducible protein A  33.86 
 
 
207 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00578555 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4781  paraquat-inducible protein A  34.72 
 
 
207 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0611001 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44080  PqiA family protein  35.68 
 
 
208 aa  113  5e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.179105  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0531  Paraquat-inducible protein A  36.7 
 
 
245 aa  113  6e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0402  paraquat-inducible protein A  36.98 
 
 
213 aa  113  6e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3381  putative paraquat-inducible protein  36.22 
 
 
209 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42460  Paraquat-inducible protein A  34.92 
 
 
207 aa  112  1.0000000000000001e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0293  paraquat-inducible protein A  36.22 
 
 
220 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1155  paraquat-inducible protein A  36.22 
 
 
220 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3339  paraquat-inducible protein A  36.22 
 
 
220 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3373  paraquat-inducible protein A  36.22 
 
 
220 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1571  paraquat-inducible protein A  33.5 
 
 
216 aa  111  2.0000000000000002e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1269  hypothetical protein  35.71 
 
 
220 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>