245 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_0109 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_0109  flagellar hook-associated protein FlgK  100 
 
 
485 aa  919    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3478  flagellar hook-associated protein FlgK  33.52 
 
 
503 aa  186  1.0000000000000001e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.109948 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2697  flagellar hook-associated protein FlgK  28.52 
 
 
486 aa  125  1e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3556  flagellar hook-associated protein FlgK  27.15 
 
 
493 aa  119  9.999999999999999e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.83285 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1100  hypothetical protein  31.25 
 
 
622 aa  110  5e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.782435  normal  0.13317 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2543  flagellar hook-associated protein FlgK  26.64 
 
 
613 aa  110  5e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.24751  normal  0.159596 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0765  flagellar hook-associated protein FlgK  25.97 
 
 
484 aa  110  8.000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1332  flagellar hook-associated protein  28.32 
 
 
619 aa  109  9.000000000000001e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.143121  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0914  flagellar hook-associated protein FlgK  27.68 
 
 
632 aa  107  5e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0951  flagellar hook-associated protein FlgK  27.68 
 
 
632 aa  107  5e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0338024 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0277  flagellar hook-associated protein FlgK  28.15 
 
 
472 aa  106  8e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0890  flagellar hook-associated protein FlgK  27.68 
 
 
632 aa  103  6e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4192  flagellar hook-associated protein FlgK  25 
 
 
484 aa  103  8e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4174  flagellar hook-associated protein FlgK  25.2 
 
 
487 aa  101  3e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0768  flagellar hook-associated protein  31.31 
 
 
588 aa  101  4e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.274286  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2737  flagellar hook-associated protein FlgK  25.43 
 
 
476 aa  100  5e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3816  flagellar hook-associated protein  28.93 
 
 
623 aa  100  8e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.308813  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3378  flagellar hook-associated protein FlgK  25.44 
 
 
485 aa  98.6  2e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5536  putative flagellar hook-associated protein 1 (HAP1, FlgK protein)  29.86 
 
 
611 aa  97.8  4e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0425173 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0393  flagellar hook-associated protein FlgK  27.18 
 
 
818 aa  97.4  5e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.890303  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2852  hypothetical protein  24.76 
 
 
727 aa  97.1  6e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0278  flagellar hook-associated protein FlgK  26.64 
 
 
487 aa  95.5  2e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0616827  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1668  flagellar hook-associated protein  27.04 
 
 
623 aa  92.8  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.121705 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1138  flagellar hook-associated protein FlgK  23.87 
 
 
484 aa  92  2e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2014  flagellar hook-associated protein  30.09 
 
 
618 aa  92  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1121  flagellar hook-associated protein FlgK  22.89 
 
 
456 aa  91.7  3e-17  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3043  flagellar hook-associated protein FlgK  23.87 
 
 
477 aa  90.1  7e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2529  hypothetical protein  23.56 
 
 
452 aa  89.4  1e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.704785  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4454  flagellar hook-associated protein FlgK  25.56 
 
 
623 aa  88.6  2e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1486  flagellar hook-associated protein  26.17 
 
 
626 aa  87.8  4e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2940  flagellar hook-associated protein FlgK  23.14 
 
 
482 aa  87  7e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.323756 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3784  flagellar hook-associated protein FlgK  31.11 
 
 
657 aa  86.7  9e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5544  flagellar hook-associated protein FlgK  27.48 
 
 
627 aa  85.5  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.125381 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0150  flagellar hook-associated protein FlgK  30.2 
 
 
657 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.626735 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0043  flagellar hook-associated protein FlgK  26.2 
 
 
496 aa  85.5  0.000000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3642  flagellar hook-associated protein  26.58 
 
 
457 aa  83.6  0.000000000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0864  flagellar hook-associated protein FlgK  25.16 
 
 
858 aa  83.2  0.000000000000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0841  flagellar hook-associated protein FlgK  25.16 
 
 
858 aa  83.2  0.00000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1112  flagellar hook-associated protein FlgK  26.68 
 
 
490 aa  82.8  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0317461  normal  0.701676 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2311  flagellar hook-associated protein FlgK  25.67 
 
 
623 aa  82.8  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0348946  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0066  flagellar hook-associated protein FlgK  24.69 
 
 
457 aa  82  0.00000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0989  flagellar hook-associated protein FlgK  23.36 
 
 
482 aa  81.3  0.00000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.100834  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3091  flagellar hook-associated protein FlgK  25.89 
 
 
709 aa  81.3  0.00000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1304  flagellar hook-associated protein FlgK  25.07 
 
 
481 aa  80.9  0.00000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0060  flagellar hook-associated protein FlgK  24.9 
 
 
457 aa  80.5  0.00000000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2964  flagellar hook-associated protein FlgK  25.07 
 
 
481 aa  79.3  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.517324 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2244  flagellar hook-associated protein FlgK  22.6 
 
 
489 aa  79.3  0.0000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0328  flagellar hook-associated protein FlgK  25.89 
 
 
846 aa  78.2  0.0000000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4195  flagellar hook-associated protein FlgK  25.26 
 
 
583 aa  78.2  0.0000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6507  flagellar hook-associated protein FlgK  23.87 
 
 
483 aa  78.2  0.0000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0419399 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0339  flagellar hook-associated protein FlgK  25.76 
 
 
495 aa  77.8  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.295463  normal  0.857916 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1007  flagellar hook-associated protein FlgK  25 
 
 
704 aa  77.8  0.0000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.159823  normal  0.701147 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0715  flagellar hook-associated protein FlgK  29.65 
 
 
587 aa  77.4  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0658  flagellar hook-associated protein FlgK  25.44 
 
 
489 aa  77  0.0000000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.897346  normal  0.563505 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0832  flagellar hook-associated protein FlgK  25.4 
 
 
463 aa  76.6  0.0000000000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0695  flagellar hook-associated protein FlgK  25.2 
 
 
487 aa  76.6  0.0000000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.946799  normal  0.0971828 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0438  flagellar hook-associated protein  22.39 
 
 
477 aa  75.9  0.000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2930  flagellar hook-associated protein  25.55 
 
 
458 aa  76.3  0.000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.685458  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4185  flagellar hook-associated protein FlgK  27.19 
 
 
623 aa  76.6  0.000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.781196  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2958  flagellar hook-associated protein FlgK  27.63 
 
 
657 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.360284 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0684  flagellar hook-associated protein FlgK  25 
 
 
487 aa  75.9  0.000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.145832  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1465  hypothetical protein  25.34 
 
 
630 aa  74.3  0.000000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0276  flagellar hook-associated protein FlgK  29.15 
 
 
714 aa  74.7  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3335  flagellar hook-associated protein FlgK  29.15 
 
 
667 aa  74.3  0.000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0473  flagellar hook-associated protein FlgK  29.15 
 
 
667 aa  74.3  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3344  flagellar hook-associated protein FlgK  29.15 
 
 
667 aa  74.3  0.000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3004  flagellar hook-associated protein FlgK  29.15 
 
 
667 aa  74.3  0.000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2089  flagellar hook-associated protein FlgK  29.15 
 
 
667 aa  74.3  0.000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0288  flagellar hook-associated protein FlgK  29.15 
 
 
667 aa  74.3  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0250  flagellar hook-associated protein FlgK  29.15 
 
 
667 aa  73.6  0.000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1767  flagellar hook-associated protein FlgK  30.58 
 
 
549 aa  73.6  0.000000000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04918  flagellar hook-associated protein  24.24 
 
 
457 aa  73.6  0.000000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0371  flagellar hook-associated protein FlgK  26.26 
 
 
495 aa  73.2  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.294715  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0246  flagellar hook-associated protein FlgK  24.55 
 
 
452 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1226  flagellar hook-associated protein FlgK  27.12 
 
 
637 aa  72.4  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.548532  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1788  flagellar hook-associated protein FlgK  22.57 
 
 
532 aa  72  0.00000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1622  flagellar hook-associated protein FlgK  25.14 
 
 
482 aa  72  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.560607 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4099  flagellar hook-associated protein FlgK  23.38 
 
 
478 aa  72.4  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1043  flagellar hook-associated protein FlgK  23.09 
 
 
464 aa  72  0.00000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2369  hypothetical protein  26.61 
 
 
647 aa  71.6  0.00000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7241  putative flagellar hook-associated protein  24.06 
 
 
599 aa  71.6  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.52345  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5250  flagellar hook-associated protein FlgK  27.04 
 
 
486 aa  70.9  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.516905 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3569  flagellar hook-associated protein FlgK  23.79 
 
 
454 aa  70.5  0.00000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.303644  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2239  flagellar hook-associated protein FlgK  23.79 
 
 
464 aa  70.1  0.00000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0758  flagellar hook-associated protein FlgK  28.45 
 
 
683 aa  69.3  0.0000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02919  Flagellar hook-associated protein  26.64 
 
 
680 aa  69.3  0.0000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2841  flagellar hook-associated protein FlgK  25.94 
 
 
681 aa  68.9  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.673988  normal  0.205437 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2204  hypothetical protein  26.61 
 
 
920 aa  68.6  0.0000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1675  flagellar hook-associated protein FlgK  24.45 
 
 
525 aa  68.2  0.0000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0874  flagellar hook-associated protein  27.44 
 
 
588 aa  68.6  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0013  flagellar hook-associated protein FlgK  21.96 
 
 
475 aa  68.2  0.0000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000731  flagellar hook-associated protein FlgK  22.92 
 
 
457 aa  68.6  0.0000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0351  flagellar hook-associated protein FlgK  29.57 
 
 
642 aa  67.8  0.0000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.309905  normal  0.119919 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1551  flagellar hook-associated protein FlgK  25.7 
 
 
432 aa  67.8  0.0000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.890668  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1526  flagellar hook-associated protein FlgK  25.7 
 
 
432 aa  67.8  0.0000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0305654  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1515  flagellar hook-associated protein FlgK  25.7 
 
 
432 aa  67.8  0.0000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3000  flagellar hook-associated protein FlgK  26.37 
 
 
472 aa  68.2  0.0000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000379276 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1669  flagellar hook-associated protein FlgK  25.7 
 
 
432 aa  67.8  0.0000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0935  flagellar hook-associated protein FlgK  27.62 
 
 
640 aa  67.8  0.0000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.789193  normal  0.776781 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3743  flagellar hook-associated protein FlgK  27.39 
 
 
631 aa  67.8  0.0000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>