67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_2805 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_2805  hypothetical protein  100 
 
 
1317 aa  2657    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.467826  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2474  hypothetical protein  26.62 
 
 
1369 aa  478  1e-133  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.291418 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0698  hypothetical protein  21.56 
 
 
1310 aa  82  0.00000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.125559  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1717  hypothetical protein  23.74 
 
 
1423 aa  76.6  0.000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0158292 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0687  protein of unknown function DUF490  21.45 
 
 
1308 aa  75.9  0.000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.343326  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0653  hypothetical protein  21.45 
 
 
1308 aa  75.9  0.000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0907804  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0688  protein of unknown function DUF490  21.45 
 
 
1308 aa  74.7  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1821  hypothetical protein  22.6 
 
 
1056 aa  69.7  0.0000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1103  hypothetical protein  24.12 
 
 
1398 aa  68.6  0.0000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4828  hypothetical protein  21.85 
 
 
1392 aa  67  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.470253  normal  0.310225 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1561  hypothetical protein  22.34 
 
 
1406 aa  63.9  0.00000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.222268  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2482  hypothetical protein  21 
 
 
1462 aa  63.2  0.00000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.915526  normal  0.262243 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0413  protein of unknown function DUF490  22.71 
 
 
1405 aa  62  0.00000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2645  hypothetical protein  22.57 
 
 
1362 aa  59.7  0.0000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1750  protein of unknown function DUF490  20.56 
 
 
1025 aa  57.8  0.000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0834  putative signal peptide protein  23.41 
 
 
1243 aa  57.8  0.000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0654835  normal  0.24318 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3646  hypothetical protein  20.23 
 
 
1224 aa  58.2  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0441929 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4225  hypothetical protein  20.9 
 
 
1428 aa  56.6  0.000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.436488  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0070  hypothetical protein  22.42 
 
 
1270 aa  56.2  0.000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6778  protein of unknown function DUF490  22.77 
 
 
1530 aa  54.3  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3627  protein of unknown function DUF490  21.37 
 
 
2140 aa  54.7  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.1533 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2511  hypothetical protein  19.58 
 
 
1319 aa  54.3  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0732118  normal  0.936586 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0874  hypothetical protein  24.71 
 
 
1489 aa  53.9  0.00002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2622  hypothetical protein  22.1 
 
 
1276 aa  53.9  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0261  hypothetical protein  26.39 
 
 
1144 aa  52.8  0.00005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0432  protein of unknown function DUF490  19.43 
 
 
1448 aa  52.4  0.00006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.883753 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1443  hypothetical protein  22.99 
 
 
1304 aa  51.6  0.00009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2888  hypothetical protein  23.06 
 
 
1869 aa  51.2  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.547557  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1130  hypothetical protein  23.98 
 
 
1783 aa  51.6  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.455724 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2098  hypothetical protein  24.19 
 
 
1500 aa  51.6  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00780  hypothetical protein  22.37 
 
 
1290 aa  51.2  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3915  protein of unknown function DUF490  21.83 
 
 
2032 aa  50.8  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.411951 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0066  AsmA family protein  23.91 
 
 
931 aa  50.1  0.0003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.255308  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0447  hypothetical protein  19.17 
 
 
1352 aa  50.1  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0340  hypothetical protein  21.43 
 
 
1174 aa  49.7  0.0004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0830  hypothetical protein  21.95 
 
 
1256 aa  49.3  0.0005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0579081  normal  0.633226 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0173  protein of unknown function DUF490  20.74 
 
 
1507 aa  49.3  0.0005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3491  hypothetical protein  21.72 
 
 
1215 aa  49.3  0.0005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1002  hypothetical protein  24.48 
 
 
1487 aa  48.9  0.0007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.19226  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6385  hypothetical protein  22.99 
 
 
1448 aa  48.5  0.0008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3415  hypothetical protein  22.12 
 
 
1340 aa  48.5  0.0009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1088  protein of unknown function DUF490  19.71 
 
 
1485 aa  48.5  0.0009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000343401 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4775  hypothetical protein  22.12 
 
 
1259 aa  48.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04540  hypothetical protein  27.1 
 
 
748 aa  48.1  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4809  hypothetical protein  22.12 
 
 
1259 aa  48.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4690  hypothetical protein  22.12 
 
 
1259 aa  48.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62650  hypothetical protein  27.59 
 
 
1088 aa  47.8  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4830  hypothetical protein  22.12 
 
 
1259 aa  48.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4679  hypothetical protein  22.12 
 
 
1259 aa  48.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3574  protein of unknown function DUF490  22.12 
 
 
1342 aa  47  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1009  hypothetical protein  20.92 
 
 
656 aa  46.6  0.003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.526606 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2889  protein of unknown function DUF490  20.29 
 
 
1441 aa  46.6  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.913216 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0371  hypothetical protein  20.54 
 
 
1262 aa  46.6  0.003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5452  hypothetical protein  26.72 
 
 
1088 aa  47  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.381107  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2596  protein of unknown function DUF490  22.66 
 
 
1304 aa  46.2  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.346321 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0165  hypothetical protein  19.82 
 
 
1504 aa  46.2  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.615752  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2388  hypothetical protein  20.8 
 
 
1451 aa  46.2  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.130143  normal  0.0161246 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2766  hypothetical protein  20.43 
 
 
1463 aa  45.8  0.005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.70976  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0383  hypothetical protein  22.7 
 
 
1395 aa  45.8  0.005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2678  hypothetical protein  23.51 
 
 
1501 aa  45.8  0.005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0362  protein of unknown function DUF748  18.71 
 
 
1330 aa  45.8  0.005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0174  hypothetical protein  21.97 
 
 
1505 aa  45.8  0.006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0399  hypothetical protein  22.32 
 
 
1258 aa  45.1  0.008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4900  AsmA  32.22 
 
 
741 aa  45.1  0.009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0460  hypothetical protein  21.58 
 
 
1256 aa  45.1  0.01  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.524454  normal  0.757907 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2750  hypothetical protein  22.03 
 
 
1229 aa  45.1  0.01  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.478411  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001693  uncharacterized protein YtfN  21.5 
 
 
1254 aa  45.1  0.01  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>