69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_1839 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_1839  alkylhydroperoxidase AhpD  100 
 
 
79 aa  166  1e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.657831  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1906  uncharacterized peroxidase-related enzyme  48.72 
 
 
180 aa  82.4  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0226007  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2646  alkylhydroperoxidase AhpD core  36.25 
 
 
176 aa  54.7  0.0000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000104106  normal  0.490574 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3525  hypothetical protein  35.8 
 
 
194 aa  53.1  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3877  uncharacterized peroxidase-related enzyme  44.44 
 
 
200 aa  52.4  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.42439  normal  0.558522 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0435  alkylhydroperoxidase  42.62 
 
 
178 aa  51.6  0.000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0249  alkylhydroperoxidase AhpD core  38.89 
 
 
192 aa  51.6  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.331558  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3352  uncharacterized peroxidase-related enzyme  32.05 
 
 
176 aa  51.2  0.000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4730  putative alkylhydroperoxidase-like protein, AhpD family  34.62 
 
 
225 aa  50.8  0.000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.621118 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5290  uncharacterized peroxidase-related enzyme  38.89 
 
 
192 aa  50.4  0.000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.385188  normal  0.523649 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3407  uncharacterized peroxidase-related enzyme  34.57 
 
 
192 aa  50.4  0.000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4745  uncharacterized peroxidase-related enzyme  38.89 
 
 
192 aa  50.4  0.000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.969731 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5135  uncharacterized peroxidase-related enzyme  42.59 
 
 
189 aa  50.4  0.000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4868  uncharacterized peroxidase-related enzyme  38.89 
 
 
192 aa  50.4  0.000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.405716  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5460  hypothetical protein  38.89 
 
 
192 aa  50.4  0.000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5402  uncharacterized peroxidase-related enzyme  38.89 
 
 
192 aa  50.4  0.000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0092423 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3064  uncharacterized peroxidase-related enzyme  40.74 
 
 
192 aa  49.7  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.319513 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4592  uncharacterized peroxidase-related enzyme  38.89 
 
 
192 aa  50.1  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.991129  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3355  uncharacterized peroxidase-related enzyme  38.89 
 
 
192 aa  50.1  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0563256 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4675  uncharacterized peroxidase-related enzyme  35.8 
 
 
201 aa  50.1  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3419  hypothetical protein  40.74 
 
 
192 aa  49.7  0.00001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2286  uncharacterized peroxidase-related enzyme  31.51 
 
 
181 aa  50.1  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0758  hypothetical protein  41.82 
 
 
194 aa  48.9  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00140607  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3500  alkylhydroperoxidase  33.33 
 
 
177 aa  49.3  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4271  uncharacterized peroxidase-related enzyme  38.89 
 
 
192 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0429275  normal  0.148831 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4098  uncharacterized peroxidase-related enzyme  25.93 
 
 
211 aa  48.9  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0948482  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2199  hypothetical protein  34.15 
 
 
201 aa  48.5  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0950  alkylhydroperoxidase AhpD  40.74 
 
 
202 aa  48.1  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.430139  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2768  VCBS  30.77 
 
 
183 aa  48.1  0.00004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.9777  hitchhiker  0.00424718 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2666  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  30.77 
 
 
178 aa  47.8  0.00006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1750  alkylhydroperoxidase  30.38 
 
 
132 aa  47.8  0.00006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.430274  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2115  hypothetical protein  40.74 
 
 
192 aa  47.4  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.433121  normal  0.170797 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2532  alkylhydroperoxidase AhpD core  34.57 
 
 
196 aa  46.6  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8682  uncharacterized peroxidase-related enzyme  32.35 
 
 
192 aa  46.2  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6841  uncharacterized peroxidase-related enzyme  33.33 
 
 
192 aa  46.2  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3349  alkylhydroperoxidase  37.04 
 
 
201 aa  45.4  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.347693  normal  0.0410777 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0452  alkylhydroperoxidase  31.94 
 
 
177 aa  46.2  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.500905  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2723  uncharacterized peroxidase-related enzyme  30.86 
 
 
189 aa  45.4  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.114348  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5124  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  36.11 
 
 
178 aa  45.8  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2093  hypothetical protein  37.04 
 
 
201 aa  45.4  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.868254 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2999  uncharacterized peroxidase-related enzyme  32.1 
 
 
196 aa  46.2  0.0002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3071  uncharacterized peroxidase-related enzyme  38.89 
 
 
192 aa  45.8  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000318179  hitchhiker  0.00336398 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1250  alkylhydroperoxidase  27.78 
 
 
177 aa  45.4  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1446  uncharacterized peroxidase-related enzyme  38.89 
 
 
235 aa  44.7  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0895  carboxymuconolactone decarboxylase  31.71 
 
 
205 aa  45.1  0.0004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.371442  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0152  alkylhydroperoxidase  31.08 
 
 
137 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.909501  normal  0.070135 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2441  alkylhydroperoxidase  30.14 
 
 
163 aa  44.7  0.0004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7158  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  33.78 
 
 
178 aa  45.1  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3860  alcohol dehydrogenase  37.25 
 
 
135 aa  44.7  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2959  alkylhydroperoxidase  33.33 
 
 
172 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0199901 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3382  hypothetical protein  35.29 
 
 
135 aa  44.3  0.0006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.282694  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3520  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  25.97 
 
 
186 aa  43.9  0.0007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.857138  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4595  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  25.97 
 
 
186 aa  43.9  0.0007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2713  uncharacterized peroxidase-related enzyme  31.88 
 
 
172 aa  43.5  0.0009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.805371  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3389  alkylhydroperoxidase  31.75 
 
 
189 aa  43.1  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1945  uncharacterized peroxidase-related enzyme  38.89 
 
 
196 aa  43.1  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.449613 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0515  alkylhydroperoxidase AhpD core  35.48 
 
 
178 aa  43.5  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.51071  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3028  alkylhydroperoxidase  35.29 
 
 
118 aa  43.5  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.970861  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2298  alkylhydroperoxidase AhpD core  30.67 
 
 
151 aa  42.4  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2396  uncharacterized peroxidase-related enzyme  36.36 
 
 
199 aa  42.4  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.692596  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0076  alkylhydroperoxidase  26.83 
 
 
134 aa  42.7  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.555975 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2199  uncharacterized peroxidase-related enzyme  37.04 
 
 
195 aa  42.4  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2001  uncharacterized peroxidase-related enzyme  36.36 
 
 
198 aa  42.7  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.153933  normal  0.952873 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3238  alkylhydroperoxidase  30.43 
 
 
172 aa  42  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.114304  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3133  uncharacterized peroxidase-related enzyme  30.67 
 
 
190 aa  41.6  0.004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.293905  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1899  hypothetical protein  35 
 
 
209 aa  41.2  0.005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.31729 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3281  uncharacterized peroxidase-related enzyme  36.36 
 
 
192 aa  40.4  0.007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.366271  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3556  alkylhydroperoxidase AhpD core  35.85 
 
 
172 aa  40.4  0.008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.155775 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1632  alkylhydroperoxidase AhpD core  26.25 
 
 
130 aa  40.4  0.008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.134838  normal  0.2145 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>