More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_1699 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010625  Bphy_6522  acriflavin resistance protein  37.74 
 
 		 1078 aa  701    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.658721  normal  0.0251174 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1722  AcrB/AcrD/AcrF family protein  59.02 
 
 		 1049 aa  1214    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02154  transport transmembrane protein  38.81 
 
 		 1064 aa  701    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5687  acriflavin resistance protein  36.3 
 
 		 1084 aa  684    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.117283 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3224  acriflavin resistance protein  37.24 
 
 		 1055 aa  702    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.292287 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0077  hypothetical protein  37.94 
 
 		 1058 aa  668    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4896  acriflavin resistance protein  38.91 
 
 		 1068 aa  716    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.428837 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1816  acriflavin resistance protein  39.08 
 
 		 1072 aa  690    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0132878  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1726  acriflavin resistance protein  37.02 
 
 		 1055 aa  696    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0296271  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2444  acriflavin resistance protein  37.34 
 
 		 1073 aa  694    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.011733 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3819  acriflavin resistance protein  38.91 
 
 		 1068 aa  716    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.847206  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1954  acriflavin resistance protein  36.39 
 
 		 1064 aa  669    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.124592  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3609  acriflavin resistance protein  35.96 
 
 		 1064 aa  674    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.810117  normal  0.320832 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5202  acriflavin resistance protein  38.46 
 
 		 1084 aa  734    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.842628  normal  0.949774 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4615  acriflavin resistance protein  35.98 
 
 		 1061 aa  654    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5200  acriflavin resistance protein  36.46 
 
 		 1052 aa  654    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3360  cation efflux transporter  36.94 
 
 		 1061 aa  702    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4362  AcrB/AcrD/AcrF family cation efflux protein  36.63 
 
 		 1060 aa  682    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.555572  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1393  cation efflux transporter  38.1 
 
 		 1081 aa  713    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.264044  normal  0.0907151 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2072  AcrB/AcrD/AcrF family cation efflux protein  38.1 
 
 		 1082 aa  702    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.739082  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1140  AcrB/AcrD/AcrF family cation efflux protein  36.07 
 
 		 1063 aa  671    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.359537 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5740  acriflavin resistance protein  38.65 
 
 		 1076 aa  709    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.473087  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5876  acriflavin resistance protein  38 
 
 		 1082 aa  701    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0898662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4650  acriflavin resistance protein  37.48 
 
 		 1064 aa  696    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.763131  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7212  acriflavin resistance protein  38.95 
 
 		 1065 aa  727    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.407199  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1750  acriflavin resistance protein  37.05 
 
 		 1065 aa  667    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.122403 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1699  acriflavin resistance protein  100 
 
 		 1044 aa  2117    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.920783  normal  0.0913661 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2553  acriflavin resistance protein  37.71 
 
 		 1072 aa  696    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.234071  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1501  acriflavin resistance protein  39.05 
 
 		 1082 aa  704    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.157071  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3751  acriflavin resistance protein  36.3 
 
 		 1084 aa  684    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4073  acriflavin resistance protein  37.14 
 
 		 1055 aa  700    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.435843  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2848  acriflavin resistance protein  34.73 
 
 		 1057 aa  647    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0271667 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4312  acriflavin resistance protein  37.18 
 
 		 1055 aa  696    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0578922  normal  0.332205 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6992  acriflavin resistance protein  38.77 
 
 		 1082 aa  710    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.166415 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4189  acriflavin resistance protein  37.02 
 
 		 1055 aa  689    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.431989  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0360  acriflavin resistance protein  36.51 
 
 		 1060 aa  678    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2096  acriflavin resistance protein  35.86 
 
 		 1072 aa  639    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3711  acriflavin resistance protein  37.21 
 
 		 1055 aa  691    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.123397  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5984  acriflavin resistance protein  38.74 
 
 		 1076 aa  714    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.026118  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4293  acriflavin resistance protein  37.14 
 
 		 1055 aa  700    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.630799  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4617  acriflavin resistance protein  36.3 
 
 		 1084 aa  684    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.406351  normal  0.0806311 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6328  acriflavin resistance protein  39.05 
 
 		 1082 aa  704    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0756078  normal  0.865641 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1437  acriflavin resistance protein  37.26 
 
 		 1064 aa  654    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.409748  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1966  acriflavin resistance protein  35.48 
 
 		 1072 aa  632  1e-179  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.882579  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3414  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.35 
 
 		 1462 aa  620  1e-176  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2952  acriflavin resistance protein  34.47 
 
 		 1057 aa  618  1e-175  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.477034  normal  0.0644125 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0178  AcrB/AcrD/AcrF family protein  34.25 
 
 		 1056 aa  608  9.999999999999999e-173  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0568  acriflavin resistance protein  35.85 
 
 		 1065 aa  605  1.0000000000000001e-171  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2878  acriflavin resistance protein  33.12 
 
 		 1070 aa  603  1.0000000000000001e-171  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.304321 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2716  acriflavin resistance protein  33.65 
 
 		 1057 aa  602  1e-170  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.222625  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0461  acriflavin resistance protein  32.73 
 
 		 1075 aa  573  1.0000000000000001e-162  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0226  acriflavin resistance protein  33.46 
 
 		 1087 aa  569  1e-161  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.959643  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4165  acriflavin resistance protein  33.18 
 
 		 1076 aa  571  1e-161  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.352988 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4538  acriflavin resistance protein  32.84 
 
 		 1090 aa  570  1e-161  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3856  acriflavin resistance protein  33.09 
 
 		 1076 aa  570  1e-161  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.525319  normal  0.112482 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4315  acriflavin resistance protein  33.67 
 
 		 1080 aa  565  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.676925  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4013  acriflavin resistance protein  32.24 
 
 		 1052 aa  561  1e-158  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00812103  normal  0.0431694 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1277  acriflavin resistance protein  32.4 
 
 		 1109 aa  550  1e-155  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2616  acriflavin resistance protein  32.33 
 
 		 1087 aa  547  1e-154  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0710341  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3160  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.52 
 
 		 1460 aa  543  1e-153  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1160  acriflavin resistance protein  31.4 
 
 		 1086 aa  543  1e-153  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.561236 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0256  acriflavin resistance protein  30.83 
 
 		 1104 aa  529  1e-148  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.543076  normal  0.0161956 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4285  acriflavin resistance protein  31.05 
 
 		 1095 aa  527  1e-148  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.731883  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2583  acriflavin resistance protein  31.05 
 
 		 1072 aa  506  1e-141  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000643867  normal  0.0481028 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4520  acriflavin resistance protein  31.57 
 
 		 1043 aa  490  1e-137  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2369  acriflavin resistance protein  31.53 
 
 		 1050 aa  485  1e-135  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000403174 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0176  acriflavin resistance protein  29.67 
 
 		 1034 aa  471  1.0000000000000001e-131  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4004  acriflavin resistance protein  30.43 
 
 		 1470 aa  462  9.999999999999999e-129  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05050  acriflavin resistance protein  31.54 
 
 		 1011 aa  462  9.999999999999999e-129  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000211109  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2359  acriflavin resistance protein  32.12 
 
 		 1028 aa  450  1e-125  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.995142  normal  0.101465 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0763  acriflavin resistance protein  29.41 
 
 		 1039 aa  447  1.0000000000000001e-124  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1939  acriflavin resistance protein  29.21 
 
 		 1044 aa  439  1e-121  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1667  acriflavin resistance protein  28.78 
 
 		 1095 aa  438  1e-121  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.954276 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2664  outer membrane efflux protein  29 
 
 		 1496 aa  435  1e-120  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1732  acriflavin resistance protein  31.17 
 
 		 1027 aa  431  1e-119  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1942  acriflavin resistance protein  27.58 
 
 		 1040 aa  432  1e-119  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.211904  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2523  acriflavin resistance protein  30.19 
 
 		 1026 aa  431  1e-119  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.199891 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1937  acriflavin resistance protein  28.63 
 
 		 1034 aa  428  1e-118  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.256217  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0540  AcrB/AcrD/AcrF family protein  28.1 
 
 		 1049 aa  424  1e-117  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2349  acriflavin resistance protein  28.22 
 
 		 1070 aa  426  1e-117  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.253914  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0165  acriflavin resistance protein  28.08 
 
 		 1032 aa  424  1e-117  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3888  acriflavin resistance protein  28.44 
 
 		 1048 aa  422  1e-116  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.471381  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2950  acriflavin resistance protein  30.59 
 
 		 1044 aa  420  1e-116  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0752  acriflavin resistance protein  27.98 
 
 		 1071 aa  419  9.999999999999999e-116  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1876  acriflavin resistance protein  28.57 
 
 		 1017 aa  416  9.999999999999999e-116  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2518  acriflavin resistance protein  28.44 
 
 		 1041 aa  417  9.999999999999999e-116  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00118511  normal  0.514323 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2664  acriflavin resistance protein  28.56 
 
 		 1039 aa  417  9.999999999999999e-116  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1579  acriflavin resistance protein  29.25 
 
 		 1046 aa  419  9.999999999999999e-116  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0815  acriflavin resistance protein  28.81 
 
 		 1036 aa  416  9.999999999999999e-116  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0965  AcrB/AcrD/AcrF family protein  29.2 
 
 		 1024 aa  415  1e-114  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00708155  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2953  acriflavin resistance protein  29.5 
 
 		 1038 aa  416  1e-114  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.133437  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1043  nodulation protein precursor  28.66 
 
 		 1069 aa  411  1e-113  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3179  acriflavin resistance protein  28.37 
 
 		 1023 aa  410  1e-113  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000434633  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2131  AcrB/AcrD/AcrF family protein  29.33 
 
 		 1024 aa  408  1.0000000000000001e-112  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2817  acriflavin resistance protein  28.04 
 
 		 1053 aa  409  1.0000000000000001e-112  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1907  acriflavin resistance protein  28.35 
 
 		 1051 aa  405  1e-111  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0495674  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2099  acriflavin resistance protein  29.68 
 
 		 1043 aa  406  1e-111  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1989  acriflavin resistance protein  28.72 
 
 		 1031 aa  401  9.999999999999999e-111  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0902  acriflavin resistance protein  29.49 
 
 		 1029 aa  399  1e-109  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.621432  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6213  acriflavin resistance protein  29 
 
 		 1055 aa  397  1e-109  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.717195  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>