More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_0678 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_0678  amino acid transporter  100 
 
 		 421 aa  825    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.633232  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4173  amino acid permease-associated region  38.92 
 
 		 429 aa  228  2e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.235964  normal  0.356034 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0336  amino acid permease-associated region  37.56 
 
 		 433 aa  205  1e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.733586 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04118  cationic amino acid transporter  37.67 
 
 		 426 aa  189  1e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.382994  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2719  amino acid permease-associated region  28.13 
 
 		 427 aa  158  2e-37  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0307129  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0445  amino acid permease  28.87 
 
 		 426 aa  151  2e-35  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000397922  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00777  putative cationic amino acid transport protein  30.85 
 
 		 435 aa  147  5e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0079  putative amino acid permease  30.28 
 
 		 440 aa  138  2e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1640  amino acid permease-associated region  29.95 
 
 		 503 aa  124  4e-27  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.469925  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1685  amino acid permease-associated region  27.87 
 
 		 451 aa  118  1.9999999999999998e-25  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1394  amino acid permease-associated region  29.38 
 
 		 443 aa  117  6e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1474  amino acid transporter  29.75 
 
 		 445 aa  115  1.0000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.221068  normal  0.529495 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0867  amino acid transporter  26.37 
 
 		 450 aa  115  1.0000000000000001e-24  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00919336  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2206  amino acid permease-associated region  31.25 
 
 		 452 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.218547  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3114  amino acid transporter  27.49 
 
 		 446 aa  114  2.0000000000000002e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.988661  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1679  amino acid transporter  30.58 
 
 		 440 aa  114  3e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.895738 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1826  amino acid permease-associated region  26.74 
 
 		 436 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3285  amino acid transporter  26.74 
 
 		 522 aa  110  5e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2346  amino acid permease-associated region  30.42 
 
 		 447 aa  110  5e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3914  amino acid permease-associated region  31.85 
 
 		 495 aa  110  6e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1651  amino acid permease-associated region  28.19 
 
 		 466 aa  107  6e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3835  amino acid transporter  29.13 
 
 		 439 aa  105  1e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.507141 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1307  amino acid permease-associated region  26.56 
 
 		 445 aa  104  3e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.678061 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4886  amino acid permease family protein  31.13 
 
 		 438 aa  104  3e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000145673  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4743  amino acid permease  31.13 
 
 		 438 aa  104  3e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000004453  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1769  amino acid permease-associated region  25.12 
 
 		 439 aa  104  3e-21  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5261  amino acid permease family protein  31.13 
 
 		 438 aa  104  3e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00026519  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5129  amino acid permease family protein  31.13 
 
 		 438 aa  104  4e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5157  amino acid permease family protein  31.13 
 
 		 438 aa  103  4e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4682  putative fructoselysine transporter  30.75 
 
 		 445 aa  103  4e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4728  amino acid permease  31.13 
 
 		 438 aa  104  4e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000742695  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5170  amino acid permease family protein  31.13 
 
 		 437 aa  103  4e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5163  amino acid permease family protein  30.82 
 
 		 437 aa  103  5e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3566  putative fructoselysine transporter  30.03 
 
 		 462 aa  103  6e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0342  putative fructoselysine transporter  30.03 
 
 		 445 aa  103  6e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.473347 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3840  putative fructoselysine transporter  30.03 
 
 		 462 aa  103  6e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03221  predicted fructoselysine transporter  30.03 
 
 		 445 aa  103  7e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0342  amino acid permease-associated region  30.03 
 
 		 445 aa  103  7e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03173  hypothetical protein  30.03 
 
 		 445 aa  103  7e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0195  amino acid permease-associated region  26.32 
 
 		 745 aa  103  7e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3748  putative fructoselysine transporter  30.15 
 
 		 462 aa  102  1e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.211488  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4845  amino acid permease-associated region  31.13 
 
 		 437 aa  101  2e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.976414  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0976  amino acid transporter  28.73 
 
 		 470 aa  101  2e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0046598 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3351  amino acid transporter  27.27 
 
 		 485 aa  102  2e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1932  amino acid permease-associated region  27.96 
 
 		 461 aa  101  3e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1855  amino acid transporter  28.17 
 
 		 443 aa  100  4e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.599049  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3609  amino acid permease-associated region  29.87 
 
 		 435 aa  100  4e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2801  amino acid permease  28.36 
 
 		 476 aa  100  6e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.764757  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1341  amino acid permease-associated region  26.09 
 
 		 496 aa  98.6  2e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1408  cationic amino acid transporter  25.84 
 
 		 483 aa  98.6  2e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0734654  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4640  arginine:agmatin antiporter  26.74 
 
 		 445 aa  97.8  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4689  arginine:agmatin antiporter  26.74 
 
 		 445 aa  97.8  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4640  arginine:agmatin antiporter  26.74 
 
 		 445 aa  97.8  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4556  arginine:agmatin antiporter  26.74 
 
 		 445 aa  97.8  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3527  amino acid permease-associated region  27.34 
 
 		 555 aa  97.4  4e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0238018  normal  0.261752 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4549  arginine:agmatin antiporter  26.74 
 
 		 445 aa  96.7  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.226613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1725  amino acid permease  26.89 
 
 		 525 aa  97.1  6e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6732  amino acid transporter  28.17 
 
 		 489 aa  96.7  6e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.156437  normal  0.210596 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0462  amino acid permease family protein  26.89 
 
 		 518 aa  96.7  7e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5198  amino acid permease-associated region  26.58 
 
 		 441 aa  96.3  9e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.043341  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03986  arginine:agmatin  28.05 
 
 		 445 aa  95.9  1e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3877  amino acid permease-associated region  28.05 
 
 		 445 aa  95.9  1e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5628  arginine:agmatin antiporter  28.05 
 
 		 445 aa  95.9  1e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4355  arginine:agmatin antiporter  27.22 
 
 		 445 aa  96.3  1e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.705479  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4580  arginine:agmatin antiporter  28.05 
 
 		 445 aa  95.9  1e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.721219  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2919  amino acid permease family protein  25.74 
 
 		 471 aa  95.9  1e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.236218  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03947  hypothetical protein  28.05 
 
 		 445 aa  95.9  1e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2269  amino acid permease-associated region  30.77 
 
 		 492 aa  95.5  1e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.841553  normal  0.0284439 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4669  arginine:agmatin antiporter  28.05 
 
 		 445 aa  95.9  1e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3152  amino acid permease family protein  25.74 
 
 		 471 aa  95.9  1e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.496369 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3141  amino acid permease family protein  25.74 
 
 		 471 aa  95.9  1e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.681445  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3912  arginine:agmatin antiporter  28.05 
 
 		 445 aa  95.9  1e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.27107  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0385  amino acid permease-associated region  27.78 
 
 		 453 aa  95.5  2e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000859435  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0084  threonine transporter  30.15 
 
 		 387 aa  95.1  2e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0156  amino acid permease-associated region  27 
 
 		 462 aa  95.1  2e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.041937  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3228  amino acid permease-associated region  27.22 
 
 		 473 aa  94.4  3e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0431  amino acid transporter  27.34 
 
 		 517 aa  94.4  3e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0271358  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4427  amino acid permease-associated region  27.57 
 
 		 452 aa  94  4e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.181856  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0069  amino acid transporter  26.2 
 
 		 433 aa  94.4  4e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.266806  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0543  amino acid permease-associated region  29.54 
 
 		 456 aa  94  5e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00639269  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2178  amino acid transporter  26.74 
 
 		 422 aa  93.6  6e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0107099  normal  0.19984 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5772  amino acid permease-associated region  29.82 
 
 		 543 aa  93.2  8e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2726  amino acid permease-associated region  29.82 
 
 		 530 aa  93.2  9e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3386  amino acid permease-associated region  30.15 
 
 		 482 aa  92.8  1e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.944667  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1326  arginine:agmatin antiporter  28.23 
 
 		 444 aa  92.8  1e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.501085  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4612  arginine:agmatin antiporter  27.74 
 
 		 445 aa  92.4  1e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3592  amino acid transporter  26.99 
 
 		 532 aa  92.4  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.337468 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1634  amino acid permease-associated region  25.12 
 
 		 476 aa  91.7  2e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.131349  normal  0.325388 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2782  arginine:agmatin antiporter  28.23 
 
 		 444 aa  92  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.604082  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2693  amino acid permease-associated region  27.55 
 
 		 786 aa  91.7  2e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2861  arginine:agmatin antiporter  28.23 
 
 		 444 aa  92  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0608832  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1961  amino acid permease-associated region  28.75 
 
 		 469 aa  92  2e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0292842  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2601  amino acid permease-associated region  27.18 
 
 		 532 aa  91.3  3e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0504  amino acid permease-associated region  27.18 
 
 		 532 aa  91.3  3e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.907763  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0477  amino acid permease-associated region  27.18 
 
 		 532 aa  91.3  3e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.694981 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00850  cationic amino acid transporter  26.74 
 
 		 486 aa  90.9  4e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.0000549978  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06077  cationic amino acid transporter  26.74 
 
 		 486 aa  90.9  4e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00275694  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2893  amino acid permease-associated region  27.46 
 
 		 532 aa  90.5  5e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0706357  normal  0.902102 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2084  amino acid permease-associated region  25.76 
 
 		 770 aa  90.5  5e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0190  putative amino acid/amine transport protein  25.81 
 
 		 452 aa  90.5  5e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>