More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_0561 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_0561  50S ribosomal protein L13  100 
 
 		 142 aa  290  3e-78  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.0000000224516  normal  0.196899 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5005  50S ribosomal protein L13  59.29 
 
 		 142 aa  175  2e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00170298  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0346  ribosomal protein L13  56.93 
 
 		 144 aa  174  3e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000157006  normal  0.759016 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57590  50S ribosomal protein L13  59.29 
 
 		 142 aa  174  3e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000544643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0901  50S ribosomal protein L13  60 
 
 		 142 aa  174  4e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21990  LSU ribosomal protein L13P  59.12 
 
 		 145 aa  173  9e-43  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000237961  hitchhiker  0.00551635 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02460  50S ribosomal protein L13  58.57 
 
 		 142 aa  172  9.999999999999999e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000118525  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01510  50S ribosomal protein L13  58.57 
 
 		 142 aa  172  9.999999999999999e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  1.25739e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0429  ribosomal protein L13  54.61 
 
 		 154 aa  171  3.9999999999999995e-42  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.669525  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2206  50S ribosomal protein L13  58.27 
 
 		 151 aa  169  1e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0922  50S ribosomal protein L13  58.57 
 
 		 142 aa  169  1e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1315  50S ribosomal protein L13  57.86 
 
 		 142 aa  168  2e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.161959  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4534  50S ribosomal protein L13  57.86 
 
 		 142 aa  168  2e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4409  50S ribosomal protein L13  57.86 
 
 		 142 aa  168  2e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.867094  normal  0.414733 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1250  ribosomal protein L13  58.82 
 
 		 146 aa  169  2e-41  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03383  50S ribosomal protein L13  57.86 
 
 		 142 aa  168  3e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000333795  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2400  50S ribosomal protein L13  57.14 
 
 		 142 aa  167  5e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.767077  normal  0.0664641 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0901  50S ribosomal protein L13  56.43 
 
 		 143 aa  167  5e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000118039  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0156  50S ribosomal protein L13  57.97 
 
 		 145 aa  166  9e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.54845e-34 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0723  50S ribosomal protein L13  56.43 
 
 		 142 aa  166  9e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000205135  hitchhiker  0.00003559 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0143  50S ribosomal protein L13  57.97 
 
 		 145 aa  166  9e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000145264  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0143  50S ribosomal protein L13  57.97 
 
 		 145 aa  166  9e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000000163354  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0138  50S ribosomal protein L13  57.97 
 
 		 145 aa  166  9e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  7.36726e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0143  50S ribosomal protein L13  57.97 
 
 		 145 aa  166  9e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000175046  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0732  50S ribosomal protein L13  56.43 
 
 		 142 aa  166  9e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000680495  hitchhiker  0.00347567 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3652  50S ribosomal protein L13  56.43 
 
 		 142 aa  166  9e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000055141  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0175  50S ribosomal protein L13  57.97 
 
 		 145 aa  166  9e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000580183  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0165  50S ribosomal protein L13  57.97 
 
 		 145 aa  166  9e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000103793  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3940  50S ribosomal protein L13  57.14 
 
 		 142 aa  166  1e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0735  ribosomal protein L13  57.25 
 
 		 145 aa  166  1e-40  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.000000000119852  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4694  50S ribosomal protein L13  57.86 
 
 		 142 aa  166  1e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00889549  normal  0.0218905 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0137  50S ribosomal protein L13  57.97 
 
 		 145 aa  166  1e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000751399  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0541  ribosomal protein L13  57.14 
 
 		 142 aa  166  1e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0111293  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3269  50S ribosomal protein L13  57.14 
 
 		 142 aa  166  1e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000128707  hitchhiker  0.00000918521 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0678  50S ribosomal protein L13  57.14 
 
 		 142 aa  166  1e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000445483  hitchhiker  0.000251831 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0744  50S ribosomal protein L13  57.14 
 
 		 142 aa  166  1e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000000518641  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0692  50S ribosomal protein L13  57.14 
 
 		 142 aa  166  1e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000556575  decreased coverage  0.00000194665 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0211  50S ribosomal protein L13  57.86 
 
 		 142 aa  165  1e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000131451  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0136  50S ribosomal protein L13  57.97 
 
 		 145 aa  165  2e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000986136  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4120  50S ribosomal protein L13  57.86 
 
 		 142 aa  165  2e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.954115  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1103  50S ribosomal protein L13  58.02 
 
 		 150 aa  165  2e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.698543  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0103  50S ribosomal protein L13  57.14 
 
 		 142 aa  165  2e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000123224  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0702  50S ribosomal protein L13  56.43 
 
 		 142 aa  165  2e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000111952  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00881  50S ribosomal protein L13  57.14 
 
 		 142 aa  165  2e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19781  50S ribosomal protein L13  58.02 
 
 		 150 aa  165  2e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13040  50S ribosomal protein L13  56.43 
 
 		 142 aa  165  2e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2298  50S ribosomal protein L13  56.12 
 
 		 144 aa  165  2e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000160952  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3071  50S ribosomal protein L13  57.14 
 
 		 142 aa  165  2e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000152627  normal  0.192156 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004511  LSU ribosomal protein L13p (L13Ae)  56.43 
 
 		 142 aa  165  2e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000254571  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0726  50S ribosomal protein L13  57.55 
 
 		 143 aa  164  2.9999999999999998e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000578919  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5161  50S ribosomal protein L13  56.52 
 
 		 145 aa  164  4e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000749627  hitchhiker  0.00000001137 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3711  50S ribosomal protein L13  56.43 
 
 		 142 aa  164  4e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.145139  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3294  50S ribosomal protein L13  56.83 
 
 		 143 aa  164  4e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000182384  hitchhiker  0.00115677 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2207  50S ribosomal protein L13  55.47 
 
 		 142 aa  164  5e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.146726  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1747  50S ribosomal protein L13  59.09 
 
 		 142 aa  164  5.9999999999999996e-40  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.000000679553  normal  0.257999 
 
 
 
NC_004578  PSPTO_4426  ribosomal protein L13  58.39 
 
 		 142 aa  163  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.145375  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1981  50S ribosomal protein L13  58.96 
 
 		 150 aa  163  6.9999999999999995e-40  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0574002  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01710  LSU ribosomal protein L13P  53.28 
 
 		 148 aa  163  8e-40  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.00000000965518  hitchhiker  0.0000000000992925 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2789  50S ribosomal protein L13  55.71 
 
 		 142 aa  163  8e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.000000137696  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0256  50S ribosomal protein L13  56.52 
 
 		 143 aa  163  9e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000758972  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0350  50S ribosomal protein L13  58.96 
 
 		 150 aa  163  9e-40  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.861215 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0138  50S ribosomal protein L13  55.8 
 
 		 145 aa  162  2.0000000000000002e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000668177  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0144  50S ribosomal protein L13  58.7 
 
 		 145 aa  161  2.0000000000000002e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000514694  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16521  50S ribosomal protein L13  57.69 
 
 		 170 aa  161  3e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0797487  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0789  50S ribosomal protein L13  55.71 
 
 		 142 aa  161  3e-39  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0876  50S ribosomal protein L13  55.71 
 
 		 142 aa  161  3e-39  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00520364  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0506  50S ribosomal protein L13  55.71 
 
 		 142 aa  161  3e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000158843  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04010  50S ribosomal protein L13  55 
 
 		 142 aa  161  4.0000000000000004e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23291  50S ribosomal protein L13  56.92 
 
 		 150 aa  160  4.0000000000000004e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0794  50S ribosomal protein L13  55 
 
 		 144 aa  160  4.0000000000000004e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000000346357  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3730  50S ribosomal protein L13  56.83 
 
 		 151 aa  160  5.0000000000000005e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0904  50S ribosomal protein L13  56.43 
 
 		 142 aa  160  6e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.222508  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2836  50S ribosomal protein L13  58.57 
 
 		 142 aa  160  7e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3797  50S ribosomal protein L13  55 
 
 		 142 aa  160  8.000000000000001e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000189229  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0752  50S ribosomal protein L13  55.71 
 
 		 142 aa  160  8.000000000000001e-39  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000272076  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0880  ribosomal protein L13  58.78 
 
 		 147 aa  159  8.000000000000001e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1565  50S ribosomal protein L13  58.33 
 
 		 142 aa  159  9e-39  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000267326  normal  0.325038 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0747  50S ribosomal protein L13  56.92 
 
 		 143 aa  159  1e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000197035  normal  0.0408198 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0524  50S ribosomal protein L13  54.29 
 
 		 142 aa  159  1e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000026356  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1134  50S ribosomal protein L13  54.29 
 
 		 142 aa  159  1e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000016322  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4222  50S ribosomal protein L13  56.92 
 
 		 143 aa  159  1e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000000936521  hitchhiker  0.00032903 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0459  50S ribosomal protein L13  54.29 
 
 		 142 aa  159  1e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000127467  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1783  50S ribosomal protein L13  57.97 
 
 		 145 aa  159  1e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000118025  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2242  50S ribosomal protein L13  55.71 
 
 		 142 aa  159  1e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.140836  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1881  ribosomal protein L13  53.62 
 
 		 144 aa  159  1e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.366723  normal  0.0642672 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3639  50S ribosomal protein L13  54.29 
 
 		 142 aa  158  2e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.0081105  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0140  50S ribosomal protein L13  56.52 
 
 		 145 aa  158  2e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0292  50S ribosomal protein L13  53.57 
 
 		 142 aa  159  2e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000415233  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0320  ribosomal protein L13  51.8 
 
 		 148 aa  159  2e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000140761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0798  50S ribosomal protein L13  56.06 
 
 		 142 aa  158  2e-38  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000205698  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0801  50S ribosomal protein L13  57.25 
 
 		 151 aa  158  2e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0726  50S ribosomal protein L13  53.57 
 
 		 144 aa  158  2e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.618323  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1319  ribosomal protein L13  57.55 
 
 		 149 aa  157  3e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.236256  normal  0.684404 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4349  50S ribosomal protein L13  54.29 
 
 		 142 aa  158  3e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000000122799  hitchhiker  0.00298092 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1900  50S ribosomal protein L13  54.01 
 
 		 142 aa  157  3e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.03474e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0299  50S ribosomal protein L13  53.57 
 
 		 142 aa  157  3e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0000151129  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1232  50S ribosomal protein L13  57.14 
 
 		 142 aa  157  3e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.0000000229053  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3360  50S ribosomal protein L13  55 
 
 		 142 aa  158  3e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000892865  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17401  50S ribosomal protein L13  57.14 
 
 		 143 aa  157  3e-38  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1451  50S ribosomal protein L13  57.55 
 
 		 147 aa  158  3e-38  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000158182  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>