115 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_0104 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_0104  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 391 aa  735    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1989  major facilitator transporter  80.31 
 
 		 392 aa  568  1e-161  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.143925  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2468  major facilitator superfamily MFS_1  51 
 
 		 397 aa  253  4.0000000000000004e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0995  major facilitator superfamily MFS_1  38.86 
 
 		 394 aa  142  8e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0816  major facilitator transporter  30.09 
 
 		 450 aa  108  1e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.678777  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2641  major facilitator transporter  29.36 
 
 		 396 aa  104  3e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.990355  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2048  major facilitator superfamily transporter  27.4 
 
 		 366 aa  89.4  9e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.424567  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2488  major facilitator superfamily transporter  29.64 
 
 		 395 aa  88.2  2e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0416147 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1372  major facilitator superfamily MFS_1  29.64 
 
 		 395 aa  86.7  6e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1776  major facilitator superfamily MFS_1  25.71 
 
 		 387 aa  85.5  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3076  major facilitator transporter  27.68 
 
 		 401 aa  84.3  0.000000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.297998 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0775  major facilitator superfamily MFS_1  28.57 
 
 		 385 aa  80.9  0.00000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0960  major facilitator transporter  27.79 
 
 		 381 aa  79.7  0.00000000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3303  major facilitator superfamily transporter  29.01 
 
 		 414 aa  79.3  0.0000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.176544  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2071  major facilitator superfamily transporter  28.57 
 
 		 368 aa  77.8  0.0000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00490774 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4736  major facilitator transporter  27.09 
 
 		 393 aa  66.6  0.0000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.601804 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0375  major facilitator superfamily permease  23.93 
 
 		 411 aa  65.9  0.000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00039813  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2167  major facilitator transporter  27.22 
 
 		 403 aa  64.3  0.000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.215044  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2713  major facilitator transporter  23.24 
 
 		 412 aa  60.8  0.00000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.11572 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0894  major facilitator superfamily MFS_1  27.37 
 
 		 403 aa  60.5  0.00000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0095  major facilitator superfamily MFS_1  27.3 
 
 		 395 aa  59.3  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0592  major facilitator superfamily MFS_1  26.33 
 
 		 383 aa  57.4  0.0000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0179102 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0806  major facilitator transporter  25.13 
 
 		 396 aa  55.8  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.674294 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1368  major facilitator superfamily permease  23.38 
 
 		 402 aa  53.9  0.000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0796  major facilitator transporter  25 
 
 		 391 aa  52.8  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0840  major facilitator superfamily MFS_1  26.38 
 
 		 413 aa  52  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0805  major facilitator superfamily MFS_1  27.08 
 
 		 408 aa  51.2  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.659867  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0984  major facilitator transporter  25.17 
 
 		 404 aa  50.4  0.00005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0960  major facilitator superfamily MFS_1  25.77 
 
 		 413 aa  50.4  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.272153  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3078  major facilitator superfamily MFS_1  23.72 
 
 		 457 aa  50.1  0.00006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.493541  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0773  multidrug resistance protein, putative  27.6 
 
 		 399 aa  48.9  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1853  major facilitator superfamily MFS_1  24.37 
 
 		 387 aa  48.9  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000358317  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1515  putative inner membrane efflux protein  30.6 
 
 		 401 aa  48.9  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.158169 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3029  major facilitator transporter  26.94 
 
 		 376 aa  48.1  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000550731  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0894  major facilitator transporter  23.99 
 
 		 453 aa  47.8  0.0003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.298012  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0588  major facilitator transporter  25.41 
 
 		 384 aa  47.8  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0912003  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0496  inner membrane transport protein YajR  24.26 
 
 		 454 aa  48.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2737  hypothetical protein  25.14 
 
 		 435 aa  47.4  0.0004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.55543  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3798  major facilitator transporter  25.71 
 
 		 412 aa  47.4  0.0004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000146089 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2983  major facilitator superfamily MFS_1  26.6 
 
 		 404 aa  47.8  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0850  major facilitator superfamily MFS_1  23.36 
 
 		 406 aa  47.4  0.0005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2468  putative transport protein  23.37 
 
 		 390 aa  47  0.0005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4632  bicyclomycin resistance protein  26.54 
 
 		 384 aa  47.4  0.0005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000966537  hitchhiker  0.00000000000000156092 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0475  inner membrane transport protein YajR  24.26 
 
 		 454 aa  46.6  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3166  major facilitator superfamily MFS_1  25.07 
 
 		 406 aa  46.6  0.0008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0477  inner membrane transport protein YajR  24.26 
 
 		 454 aa  46.6  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0704  bicyclomycin resistance protein  25.93 
 
 		 384 aa  46.6  0.0008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0412703  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1502  major facilitator family protein  26.54 
 
 		 465 aa  45.8  0.001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0741  multidrug resistance protein, putative  26.04 
 
 		 390 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0188639  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0584  multidrug ABC transporter  25.93 
 
 		 390 aa  46.2  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0583  multidrug ABC transporter  25.93 
 
 		 390 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1529  major facilitator transporter  33.96 
 
 		 476 aa  46.2  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0552  major facilitator transporter  24.32 
 
 		 407 aa  46.2  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.929363 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2112  major facilitator superfamily permease  29.31 
 
 		 405 aa  46.2  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.954954  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1292  major facilitator transporter  26.54 
 
 		 465 aa  46.2  0.001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.674052  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1633  major facilitator superfamily MFS_1  30.32 
 
 		 503 aa  46.2  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0865478  normal  0.084905 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0483  inner membrane transport protein YajR  24.26 
 
 		 454 aa  46.2  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.121319 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0538  inner membrane transport protein YajR  24.26 
 
 		 454 aa  46.2  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.342738  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0801  putative multidrug resistance protein  25.93 
 
 		 390 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000590572  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00375  predicted transporter  23.72 
 
 		 454 aa  45.1  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3182  major facilitator superfamily MFS_1  23.72 
 
 		 454 aa  45.4  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.565255  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3086  quinolone resistence protein NorA  22.7 
 
 		 399 aa  45.1  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.388424  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0726  putative multidrug resistance protein  27.66 
 
 		 487 aa  45.1  0.002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3953  major facilitator transporter  26.77 
 
 		 431 aa  45.4  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.690116  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2106  major facilitator transporter  21.05 
 
 		 399 aa  45.1  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00044461  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0499  major facilitator transporter  23.72 
 
 		 454 aa  45.1  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0459  major facilitator transporter  23.72 
 
 		 454 aa  45.1  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3635  major facilitator superfamily MFS_1  31.2 
 
 		 441 aa  45.4  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2690  major facilitator transporter  19.3 
 
 		 401 aa  45.4  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0667129  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3206  major facilitator transporter  23.72 
 
 		 454 aa  45.4  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000090157 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0463  major facilitator transporter  23.72 
 
 		 454 aa  45.1  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0349  transporter, major facilitator family  23.72 
 
 		 454 aa  45.1  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0511  transporter, major facilitator family  23.72 
 
 		 454 aa  45.4  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.905004  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3843  major facilitator superfamily MFS_1  31.15 
 
 		 397 aa  45.4  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0201188 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4821  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  25.47 
 
 		 479 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4827  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  25.47 
 
 		 469 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4635  major facilitator superfamily MFS_1  25.14 
 
 		 410 aa  45.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.720897 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1982  major facilitator superfamily MFS_1  32.82 
 
 		 434 aa  45.1  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.130406  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00379  hypothetical protein  23.72 
 
 		 454 aa  45.1  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.859371  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1620  major facilitator superfamily MFS_1  24.49 
 
 		 419 aa  44.3  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00719862  normal  0.0630669 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3100  major facilitator family transporter  22.7 
 
 		 399 aa  44.7  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.085117  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4441  multidrug resistance protein B  25.47 
 
 		 478 aa  44.3  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000526976  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2997  quinolone resistence protein  22.7 
 
 		 399 aa  44.7  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0116888  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4459  multidrug resistance protein B  25.47 
 
 		 478 aa  44.7  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0324211  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3345  major facilitator family transporter  22.7 
 
 		 399 aa  44.7  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4214  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 		 414 aa  44.7  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4851  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.47 
 
 		 478 aa  44.3  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.16573  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0640  multidrug resistance protein  25.31 
 
 		 390 aa  43.9  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4605  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25 
 
 		 478 aa  44.3  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000135395  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3398  general substrate transporter  25 
 
 		 411 aa  44.3  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0177815  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0674  multidrug resistance protein  25.31 
 
 		 390 aa  43.9  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00116506  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4961  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25 
 
 		 478 aa  44.3  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0262919  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0744  major facilitator transporter  22.96 
 
 		 433 aa  43.9  0.004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0364296  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4724  tetracycline resistance protein, class B  24.67 
 
 		 401 aa  43.9  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.357008  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2678  major facilitator superfamily MFS_1  25.97 
 
 		 408 aa  43.9  0.004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0729  putative multidrug resistance protein  25.31 
 
 		 392 aa  43.9  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.97646e-50 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5194  Permeases of the major facilitator superfamily  25.19 
 
 		 436 aa  44.3  0.004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4881  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 		 408 aa  43.9  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2658  major facilitator superfamily protein  24.93 
 
 		 409 aa  43.9  0.005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.605129  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4572  General substrate transporter  30.77 
 
 		 477 aa  43.9  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>