More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_1681 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008578  Acel_1681  alcohol dehydrogenase  100 
 
 
350 aa  699    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.217905  hitchhiker  0.000000155935 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2814  putative dehydrogenase  57.31 
 
 
349 aa  380  1e-104  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2703  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  55.17 
 
 
348 aa  372  1e-102  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.609447 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4177  alcohol dehydrogenase  58.17 
 
 
358 aa  358  8e-98  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.886524  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0462  alcohol dehydrogenase  54.89 
 
 
348 aa  351  8.999999999999999e-96  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00242186 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0391  alcohol dehydrogenase  50.86 
 
 
348 aa  330  2e-89  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6870  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  58.5 
 
 
343 aa  323  3e-87  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4017  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  34.46 
 
 
368 aa  171  2e-41  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.344704  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1301  galactose 1-dehydrogenase / glucose 1-dehydrogenase  33.81 
 
 
358 aa  168  2e-40  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1304  alcohol dehydrogenase  35.31 
 
 
356 aa  164  2.0000000000000002e-39  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.19327  normal  0.319474 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0797  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.39 
 
 
356 aa  156  5.0000000000000005e-37  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3495  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  37.26 
 
 
370 aa  153  4e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2591  alcohol dehydrogenase  37.26 
 
 
370 aa  152  5.9999999999999996e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.596845  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1146  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.87 
 
 
355 aa  142  9.999999999999999e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4392  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30.73 
 
 
356 aa  132  1.0000000000000001e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.22661  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2270  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  28.53 
 
 
354 aa  126  5e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.249944  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2582  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30.35 
 
 
365 aa  122  9.999999999999999e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0941  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  29.46 
 
 
360 aa  122  9.999999999999999e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  decreased coverage  0.000857514  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0792  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  28.08 
 
 
366 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1714  alcohol dehydrogenase  26.74 
 
 
366 aa  114  3e-24  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.656799  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3492  hypothetical protein  30.09 
 
 
342 aa  77.4  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.835811  normal  0.583011 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1037  putative dehydrogenase  25.48 
 
 
340 aa  76.6  0.0000000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3592  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  29.63 
 
 
347 aa  75.1  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.167683  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0429  alcohol dehydrogenase  33.43 
 
 
336 aa  75.1  0.000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0511556  normal  0.882763 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0803  putative dehydrogenase  24.79 
 
 
343 aa  73.6  0.000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.506069  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3998  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  29.55 
 
 
333 aa  73.2  0.000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.582496  normal  0.235514 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00443  alcohol dehydrogenase, zinc-containing, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G04620)  26.59 
 
 
348 aa  73.2  0.000000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.712673  normal  0.179972 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1804  alcohol dehydrogenase  26.36 
 
 
349 aa  72.4  0.00000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1933  putative dehydrogenase  28.12 
 
 
339 aa  71.2  0.00000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.121666  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02666  sorbitol/xylitol dehydrogenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G02000)  25.51 
 
 
373 aa  70.5  0.00000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1166  alcohol dehydrogenase  29.08 
 
 
351 aa  70.1  0.00000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.343531  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3849  alcohol dehydrogenase  26.44 
 
 
336 aa  69.7  0.00000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1874  GroES-related  30.49 
 
 
335 aa  68.9  0.0000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.335289  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5063  alcohol dehydrogenase  29.37 
 
 
347 aa  68.2  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.724577  normal  0.863659 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2056  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.46 
 
 
342 aa  67.8  0.0000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6310  alcohol dehydrogenase  27.7 
 
 
345 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.408904 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2119  dehydrogenase starvation-sensing protein  26.65 
 
 
340 aa  66.2  0.0000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0953  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  25.98 
 
 
336 aa  66.2  0.0000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00776384  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1659  alcohol dehydrogenase  28.61 
 
 
339 aa  66.2  0.0000000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.741659  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2061  Alcohol dehydrogenase GroES domain-containing protein  28.32 
 
 
339 aa  65.9  0.000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.929745 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6469  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  30.35 
 
 
345 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.940711  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6704  alcohol dehydrogenase  30.35 
 
 
345 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.710863  normal  0.158251 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4840  alcohol dehydrogenase  30.34 
 
 
330 aa  65.9  0.000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0609  alcohol dehydrogenase  28.88 
 
 
352 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0295083  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2002  putative dehydrogenase  32.08 
 
 
343 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2235  alcohol dehydrogenase  27.4 
 
 
340 aa  64.3  0.000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000256926  hitchhiker  0.0000000000711864 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0642  alcohol dehydrogenase  28.92 
 
 
352 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2636  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  25.27 
 
 
340 aa  63.9  0.000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.108984  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1915  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.42 
 
 
349 aa  63.5  0.000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.482777  normal  0.264492 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1737  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  28.57 
 
 
347 aa  63.5  0.000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0264649 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1223  alcohol dehydrogenase  25.97 
 
 
335 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.135954  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1249  alcohol dehydrogenase  25.69 
 
 
335 aa  63.5  0.000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.257646  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1590  alcohol dehydrogenase  29.79 
 
 
342 aa  63.5  0.000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  decreased coverage  0.00466455  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1258  alcohol dehydrogenase  28 
 
 
344 aa  63.5  0.000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0672332  normal  0.983976 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3224  alcohol dehydrogenase  28.24 
 
 
317 aa  63.5  0.000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.234723  normal  0.02058 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5476  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  29.35 
 
 
335 aa  62.8  0.000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.674809  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3728  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  29.35 
 
 
352 aa  62.8  0.000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.854934  normal  0.447633 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3920  L-threonine 3-dehydrogenase  25.75 
 
 
350 aa  62.8  0.000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.344166  normal  0.087716 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2217  alcohol dehydrogenase  26.17 
 
 
357 aa  62.8  0.000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1589  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  26.86 
 
 
341 aa  62.8  0.000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1608  putative dehydrogenase  30.28 
 
 
339 aa  62.8  0.000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0153  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  27.09 
 
 
323 aa  62.8  0.000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.568823  normal  0.158485 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1649  putative dehydrogenase  31.6 
 
 
343 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1617  putative dehydrogenase  30.77 
 
 
339 aa  62.4  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0765  putative dehydrogenase  31.6 
 
 
343 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0512  putative dehydrogenase  31.6 
 
 
343 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.345922  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1676  putative dehydrogenase  30.77 
 
 
339 aa  62.4  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0880  alcohol dehydrogenase  26.16 
 
 
351 aa  62.4  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.173388  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0584  putative dehydrogenase  31.6 
 
 
343 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.24761  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0695  putative dehydrogenase  31.6 
 
 
343 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.375651  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2097  putative dehydrogenase  31.6 
 
 
343 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08552  alcohol dehydrogenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G01490)  27.41 
 
 
363 aa  61.2  0.00000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.580046 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1269  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  25.28 
 
 
340 aa  61.2  0.00000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10900  putative alcohol dehydrogenase (Zn-dependent)  29.63 
 
 
352 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.867442  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5268  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  27.25 
 
 
346 aa  60.8  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2070  alcohol dehydrogenase  26.33 
 
 
336 aa  60.8  0.00000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0148  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  28.18 
 
 
338 aa  60.5  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0329198 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4119  alcohol dehydrogenase  23.96 
 
 
356 aa  60.8  0.00000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.362779  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1787  putative dehydrogenase  26.86 
 
 
339 aa  60.8  0.00000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.496797  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1666  putative dehydrogenase  30.32 
 
 
339 aa  60.5  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.747821  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6341  alcohol dehydrogenase  30.05 
 
 
336 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00479428  normal  0.719872 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1789  alcohol dehydrogenase  28.14 
 
 
343 aa  60.8  0.00000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.490533  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1620  putative dehydrogenase  27.21 
 
 
339 aa  60.5  0.00000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00863317  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86924  D-xylulose reductase (Xylitol dehydrogenase) (XDH)  25.66 
 
 
363 aa  60.5  0.00000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0565  alcohol dehydrogenase  27.53 
 
 
341 aa  60.1  0.00000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.678248  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1644  zinc-binding alcohol dehydrogenase  27.53 
 
 
341 aa  60.1  0.00000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.14571  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0660  alcohol dehydrogenase  27.53 
 
 
341 aa  60.1  0.00000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5628  L-threonine 3-dehydrogenase  27.4 
 
 
341 aa  60.1  0.00000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1670  alcohol dehydrogenase  27.53 
 
 
341 aa  60.1  0.00000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0490  alcohol dehydrogenase  27.4 
 
 
341 aa  60.1  0.00000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.283915  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1619  alcohol dehydrogenase  27.53 
 
 
341 aa  60.1  0.00000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2235  alcohol dehydrogenase  27.53 
 
 
341 aa  60.1  0.00000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2153  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  26.22 
 
 
340 aa  60.1  0.00000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0293801  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3701  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  26.41 
 
 
321 aa  60.1  0.00000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.535864  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0159  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  28.57 
 
 
347 aa  59.7  0.00000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.306594  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0196  alcohol dehydrogenase  26.15 
 
 
338 aa  59.7  0.00000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.583804  normal  0.0665338 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4980  alcohol dehydrogenase  26.44 
 
 
357 aa  59.7  0.00000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.155342 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01549  predicted oxidoreductase, Zn-dependent and NAD(P)-binding  26.5 
 
 
339 aa  58.9  0.0000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0963058  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2063  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  26.5 
 
 
339 aa  58.9  0.0000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00265684  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0066  L-threonine 3-dehydrogenase  25.75 
 
 
341 aa  58.9  0.0000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>