More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_0072 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010085  Nmar_0748  elongation factor EF-2  45.67 
 
 
730 aa  662    Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.259195 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1785  translation elongation factor aEF-2  50.21 
 
 
736 aa  713    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0976726  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2874  elongation factor EF-2  53.47 
 
 
729 aa  769    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2168  translation elongation factor aEF-2  54.04 
 
 
728 aa  781    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0152  elongation factor EF-2  53.06 
 
 
729 aa  772    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0614  elongation factor EF-2  59.2 
 
 
727 aa  883    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3686  elongation factor EF-2  59.37 
 
 
730 aa  854    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.913887  normal  0.280674 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0679  elongation factor EF-2  58.79 
 
 
727 aa  876    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2139  elongation factor EF-2  46.03 
 
 
740 aa  662    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0504  elongation factor EF-2  52.93 
 
 
729 aa  754    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.505462  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0279  elongation factor EF-2  58.12 
 
 
730 aa  858    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0211327  normal  0.0660713 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0072  translation elongation factor aEF-2  100 
 
 
734 aa  1501    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  0.000000000119399  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0213  elongation factor EF-2  46.3 
 
 
740 aa  666    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.551385 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2828  elongation factor EF-2  59.35 
 
 
731 aa  884    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.255319 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1304  elongation factor EF-2  58.79 
 
 
727 aa  878    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0366  translation elongation factor aEF-2  54.07 
 
 
728 aa  758    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1171  elongation factor EF-2  58.92 
 
 
730 aa  870    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.368378  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2205  elongation factor EF-2  60.71 
 
 
730 aa  889    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.909125  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0938  elongation factor EF-2  46.47 
 
 
740 aa  668    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1090  elongation factor EF-2  45.89 
 
 
740 aa  676    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0970791  hitchhiker  0.00132795 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0263  elongation factor EF-2  60 
 
 
731 aa  895    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0783  elongation factor EF-2  59.53 
 
 
727 aa  880    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0820  elongation factor EF-2  60.41 
 
 
730 aa  855    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0209  elongation factor EF-2  59.2 
 
 
727 aa  882    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0084  elongation factor EF-2  49.93 
 
 
736 aa  702    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000102607 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1613  elongation factor EF-2  57.3 
 
 
732 aa  825    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.502666 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0613  elongation factor EF-2  48.82 
 
 
734 aa  698    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.472828  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1957  elongation factor EF-2  45.62 
 
 
740 aa  664    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  7.15133e-18 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_35766  predicted protein  34.75 
 
 
828 aa  437  1e-121  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.412602  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0839  translation elongation factor G  31.28 
 
 
706 aa  298  3e-79  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0885  elongation factor G  30.63 
 
 
694 aa  293  9e-78  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000398473 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_66828  Elongation factor  34.67 
 
 
842 aa  292  2e-77  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0661  translation elongation factor G  30.16 
 
 
692 aa  290  6e-77  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0156588  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0418  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  29.45 
 
 
706 aa  290  7e-77  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000594856  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_52010  predicted protein  34.38 
 
 
848 aa  288  2.9999999999999996e-76  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0299674  hitchhiker  0.00863878 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0189  elongation factor G  29.95 
 
 
692 aa  281  2e-74  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.000566595  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1288  elongation factor G  30.01 
 
 
692 aa  279  1e-73  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000556702  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2021  elongation factor G  30.7 
 
 
691 aa  279  1e-73  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1537  elongation factor G  30.75 
 
 
691 aa  278  2e-73  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1562  elongation factor G  30.75 
 
 
691 aa  278  2e-73  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00909597  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2729  elongation factor G  30.03 
 
 
697 aa  278  2e-73  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.255792  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0104  elongation factor G  29.8 
 
 
689 aa  276  8e-73  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0108  elongation factor G  29.49 
 
 
692 aa  276  8e-73  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000924117  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0809  elongation factor G  30.79 
 
 
691 aa  276  8e-73  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000920124  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2622  translation elongation factor G  29.97 
 
 
697 aa  275  2.0000000000000002e-72  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000402697  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0212  elongation factor G  29.64 
 
 
692 aa  275  2.0000000000000002e-72  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00232583  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06330  elongation factor 2 (Eurofung)  33.84 
 
 
844 aa  275  3e-72  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.174897  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2172  translation elongation factor G  29.7 
 
 
698 aa  274  3e-72  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.063609  normal  0.792928 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0928  elongation factor G  28.36 
 
 
701 aa  275  3e-72  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.082436  hitchhiker  0.00424173 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0125  elongation factor G  29.1 
 
 
709 aa  275  3e-72  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0321  elongation factor G  29.95 
 
 
691 aa  272  1e-71  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0832332  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0357  translation elongation factor G  29.85 
 
 
692 aa  273  1e-71  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.0000142734  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0189  elongation factor G  29.33 
 
 
703 aa  272  2e-71  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.180447  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0228  translation elongation factor G  29.52 
 
 
729 aa  271  2.9999999999999997e-71  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16321  elongation factor G  29.95 
 
 
691 aa  271  2.9999999999999997e-71  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16891  elongation factor G  30.12 
 
 
691 aa  270  7e-71  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.900412  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0101  elongation factor G  29.05 
 
 
692 aa  270  8.999999999999999e-71  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000583321  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0624  translation elongation factor G  28.66 
 
 
705 aa  269  1e-70  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0145  elongation factor G  29.48 
 
 
698 aa  268  2e-70  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000355615  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0289  elongation factor G  28.61 
 
 
698 aa  269  2e-70  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000225468  unclonable  2.3107599999999997e-27 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0677  elongation factor G  30.01 
 
 
692 aa  268  2e-70  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00774195  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2537  translation elongation factor G  29.61 
 
 
701 aa  268  2.9999999999999995e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2375  elongation factor G  30.17 
 
 
698 aa  267  4e-70  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.092172  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0167  elongation factor G  28.93 
 
 
698 aa  268  4e-70  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000307195  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1486  elongation factor G  29.69 
 
 
695 aa  267  5e-70  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000303107  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1223  elongation factor G  29.56 
 
 
697 aa  266  8e-70  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.0000218328  hitchhiker  0.000228753 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1187  translation elongation factor G  28.55 
 
 
688 aa  266  8.999999999999999e-70  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.000000405339  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23631  elongation factor G  29.72 
 
 
691 aa  266  1e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.221598 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2081  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  29.6 
 
 
700 aa  266  1e-69  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1861  elongation factor G  28.99 
 
 
709 aa  265  2e-69  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.000000111702  hitchhiker  0.00673824 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1645  elongation factor G  29.57 
 
 
700 aa  265  2e-69  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.562984  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1871  elongation factor G  30.45 
 
 
696 aa  265  3e-69  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00956938  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0597  elongation factor G  28.71 
 
 
704 aa  263  6e-69  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0295214  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0210  elongation factor G  28.36 
 
 
698 aa  263  6.999999999999999e-69  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000406039  unclonable  0.0000140529 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4059  elongation factor G  29.7 
 
 
698 aa  263  1e-68  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00239546  hitchhiker  0.000000505947 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3762  elongation factor G  29.75 
 
 
698 aa  263  1e-68  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000464555  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0197  elongation factor G  29.7 
 
 
698 aa  263  1e-68  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0142343  unclonable  0.0000182182 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0193  elongation factor G  29.7 
 
 
698 aa  263  1e-68  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000238252  n/a   
 
 
-
 
NC_009037  Sbal_4467  elongation factor G  29.7 
 
 
698 aa  263  1e-68  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0246  elongation factor G  28.07 
 
 
695 aa  262  2e-68  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1141  elongation factor G  28.38 
 
 
691 aa  261  2e-68  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000161111  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0698  elongation factor G  27.9 
 
 
692 aa  261  3e-68  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000205392  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0181  elongation factor G  29.05 
 
 
698 aa  261  3e-68  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000344622  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2463  elongation factor G  29.53 
 
 
692 aa  261  4e-68  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.691904  normal  0.0191825 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3146  translation elongation factor G  28.22 
 
 
704 aa  261  4e-68  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.199563  normal 
 
 
-
 
NC_006686  CND06220  translation elongation factor 2  33.71 
 
 
826 aa  260  5.0000000000000005e-68  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0419  elongation factor G  29.33 
 
 
692 aa  261  5.0000000000000005e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000206577  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4324  translation elongation factor G  28.96 
 
 
703 aa  260  5.0000000000000005e-68  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3684  elongation factor G  28.25 
 
 
706 aa  260  8e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.312611  hitchhiker  0.00286415 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0102  elongation factor G  28.57 
 
 
692 aa  260  8e-68  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000176822  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0228  elongation factor G  29.59 
 
 
698 aa  259  9e-68  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4111  elongation factor G  27.98 
 
 
703 aa  259  1e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.318672 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2714  translation elongation factor G  29.21 
 
 
691 aa  259  1e-67  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00080335  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0189  translation elongation factor G  30.08 
 
 
691 aa  259  2e-67  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0306  translation elongation factor G  28.55 
 
 
715 aa  258  3e-67  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00107497  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0138  elongation factor G  28.44 
 
 
692 aa  256  8e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000590247  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3385  elongation factor G  27.32 
 
 
703 aa  256  8e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.418357  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0253  elongation factor G  29.23 
 
 
700 aa  256  8e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000396279  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2773  elongation factor G  30.35 
 
 
698 aa  256  9e-67  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000856998  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1032  elongation factor G  28.9 
 
 
703 aa  256  1.0000000000000001e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>