More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_4513 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_4513  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  100 
 
 
335 aa  665    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4526  NMT1/THI5-like domain-containing protein  77.45 
 
 
336 aa  520  1e-146  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.600337  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1358  NMT1/THI5 like domain protein  29.21 
 
 
330 aa  79.3  0.00000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.502461  normal  0.023119 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2701  NMT1/THI5-like domain-containing protein  27.4 
 
 
331 aa  74.3  0.000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4888  NMT1/THI5 like domain protein  27.71 
 
 
343 aa  74.7  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3667  hypothetical protein  27.93 
 
 
335 aa  73.6  0.000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.175481  normal  0.114782 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1483  ABC transporter substrate-binding protein  30.84 
 
 
330 aa  73.2  0.000000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3098  hypothetical protein  27.62 
 
 
364 aa  72.4  0.000000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.616034 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1820  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  33.66 
 
 
327 aa  72  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.246405 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0027  twin-arginine translocation pathway signal  31.54 
 
 
365 aa  70.5  0.00000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2129  hypothetical protein  31.22 
 
 
341 aa  69.3  0.0000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.243208 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2758  NMT1/THI5 like domain protein  26 
 
 
354 aa  66.6  0.0000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.512132  normal  0.127832 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0785  putative ABC transporter, substrate-binding protein  27.1 
 
 
333 aa  66.2  0.0000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.299641  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0769  NMT1/THI5-like domain-containing protein  28.36 
 
 
354 aa  66.2  0.0000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7630  hypothetical protein  27.25 
 
 
363 aa  65.9  0.0000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.958132  normal  0.456344 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0882  putative ABC transporter, substrate-binding protein  27.1 
 
 
333 aa  65.9  0.0000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00238227  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0805  putative ABC transporter, substrate-binding protein  26.72 
 
 
333 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.5096200000000002e-46 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0798  ABC transporter, substrate-binding protein, putative  26.72 
 
 
333 aa  65.5  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0402  NMT1/THI5 like domain protein  24.01 
 
 
360 aa  65.5  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0638  ABC transporter, substrate-binding protein  26.72 
 
 
333 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0767  aliphatic sulfonates family ABC transporter, periplsmic ligand-binding protein  27.14 
 
 
322 aa  65.1  0.000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.250566 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2986  NMT1/THI5 like domain protein  25.57 
 
 
354 aa  65.1  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7798  sulfonate ABC transporter, periplasmic sulfonate- binding protein SsuA  30.81 
 
 
300 aa  64.7  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0615  NMT1/THI5-like domain-containing protein  28.71 
 
 
333 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0638  ABC transporter, substrate-binding protein  26.34 
 
 
333 aa  63.9  0.000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2979  NMT1/THI5-like domain-containing protein  27.33 
 
 
323 aa  64.3  0.000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1579  NMT1/THI5-like domain-containing protein  21.98 
 
 
342 aa  63.9  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00570901  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0644  NMT1/THI5-like domain-containing protein  28.71 
 
 
333 aa  63.5  0.000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4546  putative ABC transporter, substrate-binding protein  28.71 
 
 
333 aa  63.5  0.000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0574771  normal  0.650232 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0694  ABC transporter substrate-binding protein  25.95 
 
 
333 aa  63.2  0.000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0728  ABC transporter substrate-binding protein  25.95 
 
 
333 aa  63.2  0.000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.245129  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2272  putative signal peptide protein  29.11 
 
 
349 aa  62.8  0.000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.863816  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0392  twin-arginine translocation pathway signal  27.34 
 
 
352 aa  62.8  0.000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00263227 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2438  aliphatic sulfonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  25.89 
 
 
322 aa  62.8  0.000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3032  twin-arginine translocation pathway signal  29.13 
 
 
348 aa  62.4  0.000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000338526  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1513  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  26.79 
 
 
1075 aa  62.4  0.00000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.533351  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1211  aliphatic sulfonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  27.73 
 
 
321 aa  61.2  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3878  membrane lipoprotein lipid attachment site  22.34 
 
 
339 aa  61.6  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1138  NMT1/THI5-like domain-containing protein  29.54 
 
 
345 aa  61.2  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.847412  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3337  aliphatic sulfonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  28.53 
 
 
326 aa  61.6  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.181277  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0925  NMT1/THI5 like domain protein  27.62 
 
 
311 aa  60.8  0.00000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0676609  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3120  twin-arginine translocation pathway signal  22.58 
 
 
340 aa  60.8  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6283  NMT1/THI5 like domain protein  24.75 
 
 
381 aa  60.5  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.101312  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0815  NMT1/THI5 like domain protein  29.9 
 
 
321 aa  60.1  0.00000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.645027 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0035  hypothetical protein  33.65 
 
 
337 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0334  aliphatic sulfonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  28.41 
 
 
324 aa  59.7  0.00000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.316546  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1093  twin-arginine translocation pathway signal  27.9 
 
 
346 aa  59.7  0.00000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2599  ABC transporter, periplasmic substrate binding protein  25.42 
 
 
335 aa  59.7  0.00000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4888  ABC transporter, substrate-binding protein, aliphatic sulphonates  27.69 
 
 
339 aa  59.3  0.00000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.108184  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1882  NMT1/THI5 like domain-containing protein  26.6 
 
 
361 aa  59.3  0.00000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.4783 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2680  hypothetical protein  33.17 
 
 
364 aa  59.3  0.00000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.254313  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2975  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  26.64 
 
 
336 aa  59.3  0.00000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.459543  normal  0.113322 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3272  hypothetical protein  33.17 
 
 
337 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0251  hypothetical protein  33.17 
 
 
337 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.368343  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2656  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.35 
 
 
915 aa  58.9  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0038  hypothetical protein  33.17 
 
 
337 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0038  hypothetical protein  33.17 
 
 
337 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2697  hypothetical protein  33.17 
 
 
337 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0381  aliphatic sulfonates family ABC transporter, periplsmic ligand-binding protein  28.41 
 
 
324 aa  58.9  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.996496 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1855  hypothetical protein  33.17 
 
 
337 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0945611  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4269  NMT1/THI5-like domain-containing protein  22.68 
 
 
341 aa  58.5  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.933987  normal  0.0127409 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0940  ABC transporter, periplasmic substrate binding protein  26.09 
 
 
335 aa  58.5  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0524  aliphatic sulfonate ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  31.65 
 
 
341 aa  58.2  0.0000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2258  NMT1/THI5 like domain protein  34.96 
 
 
340 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0306  twin-arginine translocation pathway signal  23.7 
 
 
331 aa  58.2  0.0000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2334  putative signal peptide protein  29.25 
 
 
344 aa  58.2  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.643163  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3508  twin-arginine translocation pathway signal  26.14 
 
 
342 aa  57.8  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.276709  normal  0.0987839 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2748  extracellular solute-binding protein  29.89 
 
 
340 aa  57.8  0.0000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.715028  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1675  putative signal peptide protein  29.22 
 
 
371 aa  57.4  0.0000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.88323 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1678  hypothetical protein  27.21 
 
 
334 aa  57.8  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.296494  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19500  hypothetical protein  27.57 
 
 
334 aa  57.4  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1791  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, aliphatic sulfonates family  29.35 
 
 
329 aa  57.4  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3405  aliphatic sulfonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  27.45 
 
 
327 aa  57  0.0000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.215064  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2312  putative sulfonate ABC transporter, sulfonate-binding protein  29.11 
 
 
328 aa  57  0.0000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.355114  hitchhiker  0.0000000431055 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2402  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like  27.89 
 
 
347 aa  57.4  0.0000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.150141  normal  0.561383 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1097  NMT1/THI5-like domain-containing protein  29.29 
 
 
362 aa  57.4  0.0000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.93236 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1276  aliphatic sulfonates family ABC transporter, periplsmic ligand-binding protein  26.3 
 
 
330 aa  56.6  0.0000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.577364  normal  0.218021 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3959  NMT1/THI5 like domain protein  27.04 
 
 
344 aa  57  0.0000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2398  aliphatic sulfonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  28.47 
 
 
326 aa  57  0.0000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.593949 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3603  ABC transporter, substrate-binding protein, aliphatic sulphonates  29.63 
 
 
329 aa  56.6  0.0000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.213356  normal  0.339437 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0413  aliphatic sulfonates family ABC transporter, periplsmic ligand-binding protein  28.1 
 
 
324 aa  56.6  0.0000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.523769  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0983  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  25.09 
 
 
334 aa  56.2  0.0000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4165  NMT1/THI5-like domain-containing protein  25.53 
 
 
331 aa  56.2  0.0000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0994431  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1395  NMT1/THI5 like domain-containing protein  28.51 
 
 
339 aa  56.2  0.0000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.311199 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0889  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like  27.31 
 
 
390 aa  56.2  0.0000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.390575  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2254  extracellular solute-binding protein  36.13 
 
 
336 aa  56.2  0.0000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2960  sulfonate ABC transporter, sulfonate-binding protein, putative  26.53 
 
 
328 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.641077  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2664  alkanesulfonates-binding protein  26.19 
 
 
328 aa  55.5  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.760849  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3812  NMT1/THI5 like domain protein  23.08 
 
 
365 aa  55.8  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.424332 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5799  twin-arginine translocation pathway signal  26.28 
 
 
349 aa  55.5  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1937  diguanylate cyclase  22.85 
 
 
775 aa  55.5  0.000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3110  twin-arginine translocation pathway signal  26.15 
 
 
346 aa  55.5  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.995497  normal  0.585688 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4036  aliphatic sulfonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  26.76 
 
 
330 aa  55.5  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.110095 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4226  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  35.17 
 
 
317 aa  55.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0963703  normal  0.823727 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6347  hypothetical protein  40.22 
 
 
319 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.884307  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2105  extracellular solute-binding protein  30.91 
 
 
347 aa  55.1  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.109451  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0544  aliphatic sulfonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  28.84 
 
 
334 aa  54.7  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.97989  normal  0.846557 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4331  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  32.93 
 
 
315 aa  54.7  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0888724 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1460  twin-arginine translocation pathway signal  30.87 
 
 
348 aa  55.1  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00145692  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5063  putative ABC transporter, substrate-binding protein  35.71 
 
 
337 aa  55.1  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>