More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_3817 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_3817  ABC transporter-related protein  100 
 
 
228 aa  451  1.0000000000000001e-126  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0197266  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0434  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  61.93 
 
 
247 aa  268  5.9999999999999995e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.03996  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0149  ABC transporter related  60.19 
 
 
247 aa  260  1e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.744689  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4262  ABC transporter related  55.6 
 
 
251 aa  259  3e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00208688  hitchhiker  0.000194583 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4288  ABC transporter related  46.95 
 
 
241 aa  206  3e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0030977 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5755  ABC transporter related  46.12 
 
 
235 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.805145  normal  0.982959 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3206  putative branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  44.93 
 
 
238 aa  193  2e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3016  ABC transporter related  43.97 
 
 
237 aa  192  3e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.328844 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3318  ABC transporter related  45.26 
 
 
236 aa  192  4e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2667  ABC transporter related  43.97 
 
 
237 aa  192  4e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.796761  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2245  ABC transporter ATP-binding protein  47.6 
 
 
233 aa  189  2e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.310243  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0025  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  44.44 
 
 
238 aa  190  2e-47  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0028  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  44.44 
 
 
238 aa  189  2.9999999999999997e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1726  ABC transporter related  44.04 
 
 
237 aa  189  2.9999999999999997e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.972485  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2450  ABC transporter related  46.29 
 
 
233 aa  188  5e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0805  ABC transporter related  44.19 
 
 
239 aa  188  5e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0545  ABC transporter related  44.26 
 
 
234 aa  188  7e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.756199 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1819  ABC transporter related protein  44.29 
 
 
234 aa  188  7e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.527395  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2057  ABC transporter related  46.29 
 
 
233 aa  187  2e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1564  ABC transporter related protein  45.26 
 
 
232 aa  186  2e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2774  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  42.74 
 
 
233 aa  186  3e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1434  ABC transporter related  44.39 
 
 
230 aa  185  4e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3863  ABC transporter related  41.74 
 
 
229 aa  185  4e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.870749  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3935  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  45.58 
 
 
230 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1259  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  38.89 
 
 
237 aa  184  1.0000000000000001e-45  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.575608 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2306  ABC transporter related protein  42.27 
 
 
236 aa  183  2.0000000000000003e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5672  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  40.43 
 
 
229 aa  181  6e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3116  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  39.57 
 
 
229 aa  181  9.000000000000001e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.552332  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0050  ABC transporter related  44.5 
 
 
232 aa  180  1e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.906419  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2414  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein, putative  43.4 
 
 
229 aa  180  2e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.765839  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4430  ABC transporter  43.06 
 
 
232 aa  179  2e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1473  ABC transporter related  45.62 
 
 
236 aa  180  2e-44  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2971  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  38.79 
 
 
229 aa  179  2e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.202994 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2027  ABC transporter related  42.55 
 
 
234 aa  179  2e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.813889  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5583  urea ABC transporter ATP-binding protein UrtE  44.44 
 
 
232 aa  180  2e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0412532  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1566  ABC transporter related  45.09 
 
 
234 aa  180  2e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3736  ABC transporter related  40.43 
 
 
229 aa  180  2e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5508  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  42.79 
 
 
254 aa  180  2e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2866  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  40.93 
 
 
233 aa  180  2e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4632  ABC transporter related  40.43 
 
 
229 aa  180  2e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.267394  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3591  ABC transporter ATP-binding protein  39.57 
 
 
229 aa  179  2e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3576  ABC transporter related  46.76 
 
 
838 aa  179  2e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4906  ABC transporter related  40.87 
 
 
229 aa  179  2e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.463566 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1425  ABC transporter-related protein  44.24 
 
 
232 aa  179  2.9999999999999997e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2201  ABC transporter  43.4 
 
 
229 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0824308  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1284  ABC transporter related  42.98 
 
 
234 aa  179  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.275207  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3686  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  42.45 
 
 
248 aa  179  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0747254  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1446  ABC transporter related  42.98 
 
 
234 aa  179  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0771597  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2037  ABC transporter ATP-binding protein  41.59 
 
 
230 aa  179  4e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.221876 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0274  ABC transporter related  46.08 
 
 
234 aa  179  4e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.655874  normal  0.777571 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3554  ABC transporter related  42.13 
 
 
234 aa  179  4e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.256863  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0936  ABC transporter related  42.47 
 
 
234 aa  179  4e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000438141  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2189  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  42.06 
 
 
230 aa  178  4.999999999999999e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.113026 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64310  putative ABC transport ATP-binding subunit  43.52 
 
 
232 aa  178  4.999999999999999e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.349847  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1866  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  42.06 
 
 
230 aa  178  5.999999999999999e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.357667 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3377  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  40.87 
 
 
248 aa  178  7e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3141  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  40.87 
 
 
233 aa  178  7e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0660  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  47.25 
 
 
237 aa  178  7e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0355  ABC transporter related  44.04 
 
 
234 aa  178  7e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1946  ABC transporter related protein  40.28 
 
 
233 aa  177  8e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.987949  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3568  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  42.92 
 
 
250 aa  177  9e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.895169  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4889  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  42.59 
 
 
232 aa  177  1e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0800  ABC transporter related  41.94 
 
 
238 aa  177  1e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.595603 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0592  ABC transporter related  41.94 
 
 
238 aa  177  1e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.479264  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2519  ABC transporter related  41.01 
 
 
238 aa  177  1e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.644805  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0597  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  43.1 
 
 
252 aa  177  1e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0909896  normal  0.0238528 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2494  ABC transporter related  41.01 
 
 
238 aa  177  1e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6115  ABC transporter related  41.01 
 
 
238 aa  176  2e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4329  ABC transporter related  46.79 
 
 
237 aa  177  2e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0788  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  41.94 
 
 
238 aa  176  2e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2412  ABC transporter related  41.01 
 
 
238 aa  176  2e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0329519 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3314  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  42.79 
 
 
231 aa  177  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1444  ABC transporter related  40.83 
 
 
237 aa  176  2e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1883  ABC transporter related  40.55 
 
 
238 aa  176  2e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1771  ABC transporter related  38.26 
 
 
229 aa  176  3e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2541  ABC transporter related  41.01 
 
 
238 aa  176  3e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3165  ABC transporter related  45.37 
 
 
241 aa  176  3e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.317931  normal  0.242045 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5826  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  41.01 
 
 
238 aa  175  4e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.455686  normal  0.134982 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0329  ABC transporter related  41.74 
 
 
230 aa  175  4e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.287188  normal  0.159726 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0952  ABC transporter related  40.25 
 
 
235 aa  175  4e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0192  ABC transporter related  42.54 
 
 
229 aa  176  4e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4021  ABC transporter related  43.98 
 
 
235 aa  175  4e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0586  ABC transporter-like  43.06 
 
 
232 aa  175  5e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0697  ABC transporter related  41.67 
 
 
232 aa  175  5e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1865  ABC transporter related  41.45 
 
 
247 aa  175  5e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1198  ABC transporter related  41.12 
 
 
230 aa  175  5e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0175131  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0266  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  41.47 
 
 
238 aa  175  6e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  unclonable  0.0000000214299  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1146  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  41.47 
 
 
238 aa  175  6e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.000313887  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0945  ABC transporter related  46.05 
 
 
233 aa  175  6e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0986  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  41.47 
 
 
238 aa  175  6e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.0000000350992  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0943  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  41.47 
 
 
238 aa  175  6e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00876691  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0882  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  41.47 
 
 
238 aa  175  6e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  unclonable  0.000000000000026853  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0992  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  41.47 
 
 
238 aa  175  6e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00134652  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1970  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  41.47 
 
 
234 aa  174  7e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.000000796203  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3058  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  42.33 
 
 
231 aa  174  7e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1576  ABC transporter related  41.63 
 
 
231 aa  175  7e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.422459 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0568  ABC transporter related  40 
 
 
229 aa  174  8e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.850064  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2432  ABC transporter related protein  41.82 
 
 
237 aa  174  8e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00198447  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3532  ABC transporter related  43.32 
 
 
236 aa  174  9e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.10442  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0297  ABC branched chain amino acid transporter, ATPase subunit  45.97 
 
 
232 aa  174  9e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0146285  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>