More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_3456 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_3456  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
265 aa  521  1e-147  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.840186 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1263  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  78.65 
 
 
266 aa  397  1e-109  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0439251  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3122  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  79.68 
 
 
294 aa  370  1e-102  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4842  putative ABC transporter inner membrane protein  59.29 
 
 
291 aa  283  2.0000000000000002e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.860771  normal  0.0587965 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2650  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  59.58 
 
 
300 aa  281  7.000000000000001e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.760179  normal  0.495505 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1466  ABC polyamine transporter, inner membrane subunit  59.17 
 
 
300 aa  279  4e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0507128  normal  0.124115 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1503  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  59.17 
 
 
312 aa  277  1e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.282781  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1114  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  59.34 
 
 
298 aa  276  2e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.731426  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1115  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  58.92 
 
 
298 aa  268  1e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.160058  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1416  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  59.91 
 
 
265 aa  266  2e-70  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.420576  normal  0.120136 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1457  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  59.05 
 
 
265 aa  265  5e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0255754 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1541  ABC transporter, permease protein  60.66 
 
 
347 aa  262  4.999999999999999e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0497  ABC transporter, permease protein  60.66 
 
 
362 aa  261  6e-69  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.675032  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0656  ABC transporter, permease protein  60.66 
 
 
362 aa  261  6e-69  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1211  ABC transporter, permease protein  60.66 
 
 
362 aa  261  6e-69  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.197633  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1415  ABC transporter, permease protein  60.25 
 
 
366 aa  261  6.999999999999999e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.146328  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1408  ABC transporter, permease protein  60.66 
 
 
366 aa  261  6.999999999999999e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.907459  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2833  ABC transporter, permease protein  60.25 
 
 
410 aa  259  3e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0920075  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4341  ABC spermidine/putrescine transporter, inner membrane subunit  60.18 
 
 
298 aa  258  7e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.801561  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2076  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  60.35 
 
 
298 aa  257  1e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0751  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  60.18 
 
 
300 aa  256  3e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1232  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  60.18 
 
 
300 aa  256  3e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.162755  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1206  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  60.18 
 
 
300 aa  256  3e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.177447  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1793  ABC transporter permease  58.19 
 
 
265 aa  253  3e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.849444  normal  0.0352963 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4044  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  56.49 
 
 
261 aa  253  3e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0830657  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2150  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  57.43 
 
 
268 aa  252  3e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0939917  normal  0.176342 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3314  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  56.45 
 
 
262 aa  251  9.000000000000001e-66  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.147455  normal  0.710727 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1665  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  56.49 
 
 
261 aa  250  1e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3075  ABC transporter, permease protein  64.15 
 
 
243 aa  249  2e-65  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1271  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  56.49 
 
 
261 aa  250  2e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.104135  normal  0.640499 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5852  molybdenum ABC transporter permease  56.07 
 
 
261 aa  249  3e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.581419  normal  0.526214 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4693  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  60.26 
 
 
264 aa  246  4e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0488  ABC transporter, permease protein  59.39 
 
 
264 aa  242  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1911  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.2 
 
 
253 aa  126  3e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00110867  normal  0.885774 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3397  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.98 
 
 
272 aa  102  6e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.210545  normal  0.706839 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2374  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.61 
 
 
304 aa  98.6  9e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2915  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.23 
 
 
267 aa  94.7  2e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6628  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.6 
 
 
264 aa  93.6  3e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.381273  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3539  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.65 
 
 
264 aa  93.6  3e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.447694  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5374  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.65 
 
 
264 aa  93.6  3e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.628457 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3236  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.7 
 
 
262 aa  92.4  7e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0387101  normal  0.554966 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0748  polyamine/opine/phosphonate ABC transporter inner membrane protein  32.9 
 
 
264 aa  92.4  7e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.467059  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1647  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.57 
 
 
262 aa  92.4  7e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.29435 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8149  ABC transporter  33.2 
 
 
266 aa  92  9e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.828592  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5060  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.47 
 
 
264 aa  91.3  1e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.183233 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1923  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.11 
 
 
262 aa  91.3  1e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.438917 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4429  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.47 
 
 
264 aa  90.9  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.186422  normal  0.676109 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3746  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.43 
 
 
268 aa  90.5  3e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.475602  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3161  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.16 
 
 
259 aa  89.7  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2522  ABC transporter, permease protein  31.33 
 
 
264 aa  89.7  5e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4356  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.39 
 
 
254 aa  89.4  5e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.943674  normal  0.650517 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4730  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.6 
 
 
264 aa  89.4  6e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.293753  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3633  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.6 
 
 
264 aa  89.4  6e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.332864 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3945  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.76 
 
 
264 aa  88.6  9e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.334886  normal  0.870267 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2333  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  30.9 
 
 
264 aa  87  3e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.161709  normal  0.782854 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6717  ABC spermidine/putrescine transporter, inner membrane subunit  32.97 
 
 
280 aa  87  3e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00799546  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2919  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.31 
 
 
261 aa  87  3e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.591991 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4689  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.63 
 
 
276 aa  86.7  3e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.363302  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2420  putative ABC spermidine/putrescine transporter permease protein  30.8 
 
 
281 aa  86.7  4e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.814446  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6311  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.8 
 
 
266 aa  86.3  5e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.103333  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0084  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.43 
 
 
272 aa  85.9  6e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0395984  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1834  ABC transporter, permease protein  33.48 
 
 
269 aa  85.9  6e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.632575 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0887  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.9 
 
 
263 aa  85.5  7e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1479  ABC transporter, permease protein  23.83 
 
 
260 aa  85.9  7e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0195961  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2347  Ornithine carbamoyltransferase  31.91 
 
 
288 aa  85.1  0.000000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00485927 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4437  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.87 
 
 
264 aa  84  0.000000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1559  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.82 
 
 
307 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.37571  normal  0.155307 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1644  ornithine carbamoyltransferase  31.39 
 
 
285 aa  83.6  0.000000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.574087 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1612  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.82 
 
 
307 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.142547 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1593  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.82 
 
 
307 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0707466  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0306  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.03 
 
 
264 aa  83.2  0.000000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5506  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.51 
 
 
267 aa  83.2  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.673957  normal  0.0589597 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3449  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.24 
 
 
269 aa  83.2  0.000000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.413551 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2022  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
299 aa  83.2  0.000000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.612103 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5050  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.81 
 
 
262 aa  83.2  0.000000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1115  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.12 
 
 
281 aa  82.8  0.000000000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.360283  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4848  ABC transporter, inner membrane subunit  31.36 
 
 
310 aa  82.4  0.000000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.432693  hitchhiker  0.000811543 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0808  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  32.65 
 
 
230 aa  82.4  0.000000000000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.65252  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0756  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.17 
 
 
264 aa  82  0.000000000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.533361  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3639  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.9 
 
 
268 aa  82  0.000000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.344703 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2299  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.63 
 
 
268 aa  81.6  0.00000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3799  ornithine carbamoyltransferase  31.28 
 
 
260 aa  81.6  0.00000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.195582 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0498  putative sperimidine/putrescine ABC transporter (permease protein)  32.96 
 
 
265 aa  82  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.986757  normal  0.371454 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1105  polyamine ABC transporter, permease protein  29.72 
 
 
267 aa  80.9  0.00000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0830  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.96 
 
 
265 aa  80.9  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.225733  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2156  ABC transporter, inner membrane subunit  29.96 
 
 
265 aa  80.9  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2708  ABC transporter membrane spanning protein (polyamine)  29.15 
 
 
264 aa  81.3  0.00000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.319241  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1203  ornithine carbamoyltransferase  27.36 
 
 
266 aa  80.5  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4322  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.03 
 
 
265 aa  81.3  0.00000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.102499  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1822  putative ABC transporter, permease protein  28.81 
 
 
282 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.131569  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2851  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.86 
 
 
273 aa  80.1  0.00000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.227272  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4607  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.84 
 
 
259 aa  80.5  0.00000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2084  ABC transporter, permease protein  28.81 
 
 
282 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.217938  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1111  ABC transporter, permease protein  28.81 
 
 
282 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0820  ABC transporter, permease protein  28.81 
 
 
282 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2838  ornithine carbamoyltransferase  29.82 
 
 
286 aa  80.1  0.00000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000365648  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1784  putative ABC transport system, membrane protein  28.81 
 
 
282 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0352  ABC transporter, permease protein  28.81 
 
 
282 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.734925  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3949  ornithine carbamoyltransferase  29.34 
 
 
287 aa  79.7  0.00000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.551991  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1687  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.45 
 
 
307 aa  79.7  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>