More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_3186 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_0672  UvrD/REP helicase  62.06 
 
 		 595 aa  746    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0183847  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3055  UvrD/REP helicase  56.34 
 
 		 608 aa  712    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3048  UvrD/REP helicase  57.02 
 
 		 608 aa  723    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0267526  normal  0.137348 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3186  UvrD/REP helicase  100 
 
 		 603 aa  1243    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.985169  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1515  UvrD/REP helicase  35.93 
 
 		 575 aa  364  3e-99  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0347716  hitchhiker  2.10005e-16 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4163  UvrD/REP helicase  37.23 
 
 		 550 aa  343  5e-93  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.533051  normal  0.232274 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2458  UvrD/REP helicase  32.9 
 
 		 586 aa  268  2.9999999999999995e-70  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.411519  normal  0.923114 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0546  UvrD/REP helicase  34.04 
 
 		 569 aa  253  8.000000000000001e-66  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0849  UvrD/REP helicase  28.65 
 
 		 845 aa  102  2e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.462782  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2947  UvrD/REP helicase  30.03 
 
 		 678 aa  95.5  2e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1337  UvrD/REP helicase  29.69 
 
 		 678 aa  94.4  6e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0621  ATP-dependent DNA helicase PcrA  28.47 
 
 		 659 aa  92.8  2e-17  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.12705  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1455  UvrD/REP helicase  25.68 
 
 		 715 aa  92  3e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1325  UvrD/REP helicase  28.08 
 
 		 678 aa  92  3e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00634324  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0903  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.21 
 
 		 662 aa  90.5  8e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000149159  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6025  UvrD/REP helicase  24.11 
 
 		 787 aa  87.4  7e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3764  DNA-dependent helicase II  29.76 
 
 		 724 aa  85.5  0.000000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0497  DNA-dependent helicase II  26.32 
 
 		 726 aa  85.1  0.000000000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.615928  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2348  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.94 
 
 		 730 aa  84.3  0.000000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0164573  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0381  UvrD/REP helicase  25.91 
 
 		 688 aa  83.6  0.000000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0971471 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3374  ATP-dependent DNA helicase Rep  25.75 
 
 		 671 aa  83.2  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.654782  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0419  DNA-dependent helicase II  29.28 
 
 		 721 aa  83.2  0.00000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.590239  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1021  UvrD/REP helicase  26.37 
 
 		 783 aa  81.3  0.00000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.751613  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0641  UvrD/REP helicase  23.51 
 
 		 602 aa  80.9  0.00000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1960  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.53 
 
 		 730 aa  80.5  0.00000000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1994  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.53 
 
 		 730 aa  80.5  0.00000000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0317  UvrD/REP helicase  27.55 
 
 		 1032 aa  80.1  0.0000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.907606  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0050  ATP-dependent DNA helicase Rep  26.92 
 
 		 658 aa  79.7  0.0000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0153579  normal  0.502615 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1146  ATP-dependent DNA helicase PcrA  23.63 
 
 		 725 aa  79.7  0.0000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0047  ATP-dependent DNA helicase Rep  25 
 
 		 849 aa  79.7  0.0000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.760315  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1235  UvrD/REP helicase  24.61 
 
 		 680 aa  79.7  0.0000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1633  UvrD/REP helicase  26.21 
 
 		 681 aa  80.1  0.0000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1696  UvrD/REP helicase  26.32 
 
 		 793 aa  80.1  0.0000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.99054 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0745  UvrD/REP helicase  26.85 
 
 		 655 aa  79.3  0.0000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2961  ATP-dependent DNA helicase  26.71 
 
 		 678 aa  79  0.0000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.26035  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4158  UvrD/REP helicase  26.47 
 
 		 668 aa  79  0.0000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.140406 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0199  ATP-dependent DNA helicase Rep  25.93 
 
 		 674 aa  79.3  0.0000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1581  UvrD/REP helicase  26.64 
 
 		 648 aa  78.6  0.0000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1532  UvrD/REP helicase  26.64 
 
 		 648 aa  78.6  0.0000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0217049  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3456  UvrD/REP helicase  26.21 
 
 		 671 aa  77.8  0.0000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3385  DNA-dependent helicase II  26.51 
 
 		 726 aa  77.8  0.0000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0721  UvrD/REP helicase  25.69 
 
 		 656 aa  77.8  0.0000000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3520  UvrD/REP helicase  26.21 
 
 		 671 aa  77.8  0.0000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0760  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.94 
 
 		 737 aa  77.8  0.0000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3440  UvrD/REP helicase  27.95 
 
 		 682 aa  77.8  0.0000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.155249  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0368  superfamily I DNA/RNA helicase  26.4 
 
 		 696 aa  77.8  0.0000000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0779  UvrD/REP helicase  26.4 
 
 		 630 aa  77.8  0.0000000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3373  DNA-dependent helicase II  27.18 
 
 		 722 aa  77.8  0.0000000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0151  ATP-dependent DNA helicase Rep  24.29 
 
 		 674 aa  77.8  0.0000000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4969  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.33 
 
 		 753 aa  77.4  0.0000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3642  DNA-dependent helicase II  27 
 
 		 726 aa  77.4  0.0000000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0467  DNA-dependent helicase II  26.85 
 
 		 722 aa  77  0.0000000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0468  DNA-dependent helicase II  26.51 
 
 		 721 aa  77  0.0000000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000657213  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2813  UvrD/REP helicase  26.17 
 
 		 754 aa  77  0.000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0085  UvrD/REP helicase  23.75 
 
 		 1016 aa  76.6  0.000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.60174  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4015  DNA-dependent helicase II  26.51 
 
 		 722 aa  76.6  0.000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1806  DNA-dependent helicase II  26.91 
 
 		 721 aa  76.6  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1807  DNA-dependent helicase II  26.91 
 
 		 721 aa  76.6  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2149  DNA-dependent helicase II  27.13 
 
 		 723 aa  76.6  0.000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0743865  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2724  UvrD/REP helicase  25.95 
 
 		 678 aa  76.6  0.000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0128  DNA-dependent helicase II  26.87 
 
 		 741 aa  76.6  0.000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000143952  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2014  ATP-dependent DNA helicase PcrA  28.05 
 
 		 729 aa  76.6  0.000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0270  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.34 
 
 		 732 aa  76.6  0.000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf847  ATP-dependent DNA helicase  26.2 
 
 		 726 aa  76.6  0.000000000001  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.710587  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0029  DNA-dependent helicase II  27.13 
 
 		 720 aa  76.3  0.000000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0473  DNA-dependent helicase II  26.85 
 
 		 722 aa  76.6  0.000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0426  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25 
 
 		 748 aa  76.3  0.000000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0469  DNA-dependent helicase II  26.85 
 
 		 722 aa  76.6  0.000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.154526  normal  0.949387 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0351  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.03 
 
 		 753 aa  76.6  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0286  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.16 
 
 		 747 aa  76.3  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2355  UvrD/REP helicase  27.42 
 
 		 724 aa  75.9  0.000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000607129  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0959  UvrD/REP helicase  28.15 
 
 		 705 aa  75.9  0.000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3892  DNA-dependent helicase II  26.51 
 
 		 722 aa  76.3  0.000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0285  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.5 
 
 		 741 aa  76.3  0.000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0441  DNA-dependent helicase II  26.51 
 
 		 722 aa  75.9  0.000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.419194  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3818  DNA-dependent helicase II  26.51 
 
 		 722 aa  75.9  0.000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1911  UvrD/REP helicase  28.27 
 
 		 742 aa  75.9  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.306722  normal  0.156803 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0716  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.74 
 
 		 685 aa  75.9  0.000000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0682  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.01 
 
 		 756 aa  76.3  0.000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0445546  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1443  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.92 
 
 		 729 aa  75.1  0.000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.520259  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0334  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.91 
 
 		 747 aa  75.1  0.000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0291  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.91 
 
 		 751 aa  75.1  0.000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0275  ATP-dependent DNA helicase  25.91 
 
 		 753 aa  75.1  0.000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0377  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.91 
 
 		 751 aa  75.1  0.000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2187  ATP-dependent DNA helicase Rep  28.03 
 
 		 662 aa  75.1  0.000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.285249  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0336  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.91 
 
 		 751 aa  75.1  0.000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0305  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.91 
 
 		 747 aa  75.1  0.000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1845  UvrD/REP helicase  28.03 
 
 		 662 aa  75.1  0.000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0186  DNA-dependent helicase II  26.17 
 
 		 723 aa  75.1  0.000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1142  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.33 
 
 		 759 aa  75.1  0.000000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00645373  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0278  ATP-dependent DNA helicase  25.91 
 
 		 751 aa  75.1  0.000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1007  UvrD/REP helicase  26.07 
 
 		 738 aa  75.1  0.000000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0699  UvrD/Rep family helicase  27.45 
 
 		 689 aa  75.1  0.000000000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1083  acyl carrier protein  25.99 
 
 		 677 aa  74.7  0.000000000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4586  ATP-dependent DNA helicase UvrD  26.7 
 
 		 787 aa  74.3  0.000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.721141 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1255  putative site-specific DNA methyltransferase  26.09 
 
 		 677 aa  74.7  0.000000000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0960  UvrD/REP helicase  26.7 
 
 		 846 aa  74.3  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1420  UvrD/REP helicase  26.7 
 
 		 787 aa  74.7  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0732039  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1442  UvrD/REP helicase  26.7 
 
 		 787 aa  74.7  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1322  UvrD/REP helicase  28.12 
 
 		 840 aa  74.3  0.000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>