56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aasi_1167 on replicon NC_010830
Organism: Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010830  Aasi_1167  hypothetical protein  100 
 
 		 160 aa  319  9.999999999999999e-87  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.254719 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0807  regulatory protein RecX  39.19 
 
 		 156 aa  109  2.0000000000000002e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3046  regulatory protein RecX  44.53 
 
 		 163 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0143268 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1022  regulatory protein RecX  41.55 
 
 		 153 aa  107  5e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5048  regulatory protein RecX  37.5 
 
 		 151 aa  107  6e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02685  putative transcriptional regulatory protein  39.74 
 
 		 159 aa  106  1e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.392987  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3722  regulatory protein RecX  39.86 
 
 		 161 aa  102  3e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.658929  normal  0.895852 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1030  regulatory protein RecX  35.67 
 
 		 159 aa  99.8  2e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3293  regulatory protein RecX  36.96 
 
 		 150 aa  99  3e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0157  regulatory protein RecX  25.55 
 
 		 161 aa  67.4  0.00000000008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0496  regulatory protein RecX  25.66 
 
 		 157 aa  60.5  0.00000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0012362 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2490  recombination regulator RecX  29.23 
 
 		 269 aa  56.2  0.0000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0012  regulatory protein RecX  23.74 
 
 		 150 aa  56.2  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3947  regulatory protein RecX  27.69 
 
 		 153 aa  54.3  0.0000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1049  regulatory protein RecX  28.38 
 
 		 206 aa  53.9  0.0000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00125006  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0412  recombination regulator RecX  27.54 
 
 		 258 aa  52.8  0.000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1379  recombination regulator RecX  24.48 
 
 		 155 aa  52  0.000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.111051  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3247  regulatory protein RecX  23.08 
 
 		 179 aa  52  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.168045 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1220  recombination regulator RecX  21.28 
 
 		 199 aa  52.4  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.401061  normal  0.253487 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0710  regulatory protein RecX  25.93 
 
 		 149 aa  51.6  0.000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1370  recombination regulator RecX  34.44 
 
 		 271 aa  50.1  0.00001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000852349  hitchhiker  0.000000015244 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2203  regulatory protein RecX  22.83 
 
 		 170 aa  50.4  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0433  recombination regulator RecX  26.52 
 
 		 270 aa  50.1  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38550  recombination regulator RecX  24.31 
 
 		 155 aa  50.4  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4032  recX protein  23.08 
 
 		 152 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3102  regulatory protein RecX  25.38 
 
 		 152 aa  49.7  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0001896  normal  0.93172 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1378  recombination regulator RecX  27.1 
 
 		 264 aa  49.3  0.00002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.122405  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3159  regulatory protein RecX  26.32 
 
 		 154 aa  47.8  0.00007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.975837  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2010  regulatory protein RecX  25.74 
 
 		 151 aa  47.4  0.00009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.71121 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0020  regulatory protein RecX  25.35 
 
 		 150 aa  47.4  0.00009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0528  recombination regulator RecX  23.33 
 
 		 156 aa  47  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00754387  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0842  recombination regulator RecX  28.21 
 
 		 168 aa  46.6  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000969432  unclonable  0.0000000113027 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1832  regulatory protein RecX  26.15 
 
 		 210 aa  47  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000237613  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0437  recombination regulator RecX  26.52 
 
 		 270 aa  46.2  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1047  hypothetical protein  25.23 
 
 		 145 aa  45.8  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.507009 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2342  regulatory protein RecX  22.64 
 
 		 202 aa  46.2  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1176  recombination regulator RecX  23.08 
 
 		 156 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.190547 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4804  recombination regulator RecX  25.95 
 
 		 270 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0102051  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0519  recombination regulator RecX  25.95 
 
 		 270 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0571  recombination regulator RecX  25.19 
 
 		 270 aa  44.3  0.0007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0426  recombination regulator RecX  25.19 
 
 		 270 aa  44.3  0.0007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0572  recombination regulator RecX  25.19 
 
 		 270 aa  44.3  0.0007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1159  regulatory protein RecX  26.02 
 
 		 129 aa  44.3  0.0007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2007  recombination regulator RecX  26.09 
 
 		 175 aa  43.9  0.0008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2178  recombination regulator RecX  26.4 
 
 		 212 aa  43.5  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3014  recombination regulator RecX  24.82 
 
 		 150 aa  43.5  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.170069  hitchhiker  0.000000000000467148 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1489  regulatory protein RecX  23.31 
 
 		 214 aa  43.1  0.002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1119  regulatory protein RecX  22.06 
 
 		 254 aa  43.1  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.13349  normal  0.174575 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1645  recombination regulator RecX  25.23 
 
 		 165 aa  42  0.003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4182  regulatory protein RecX  20.75 
 
 		 192 aa  42  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.463928  normal  0.171516 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1889  recombination regulator RecX  26.4 
 
 		 212 aa  42  0.004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1426  regulatory protein RecX  22.4 
 
 		 220 aa  40.8  0.007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.032748 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0497  recombination regulator RecX  24.43 
 
 		 270 aa  40.4  0.009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0516  recombination regulator RecX  24.43 
 
 		 270 aa  40.4  0.009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.342634  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0487  recombination regulator RecX  24.43 
 
 		 270 aa  40.4  0.009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0430  recombination regulator RecX  24.43 
 
 		 270 aa  40.4  0.01  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>