55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_2880 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011206  Lferr_2499  von Willebrand factor type A  100 
 
 
225 aa  466  9.999999999999999e-131  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.950174  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2880  von Willebrand factor type A domain protein  100 
 
 
225 aa  466  9.999999999999999e-131  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.158441  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0637  von Willebrand factor, type A  57.99 
 
 
224 aa  280  1e-74  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2107  von Willebrand factor type A  57.87 
 
 
254 aa  262  3e-69  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1160  von Willebrand factor type A domain protein  61.36 
 
 
219 aa  261  4.999999999999999e-69  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01967  hypothetical protein  60.91 
 
 
219 aa  260  1e-68  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01978  hypothetical protein  60.91 
 
 
219 aa  260  1e-68  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3010  von Willebrand factor type A domain protein  60.91 
 
 
219 aa  259  2e-68  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.136954 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0987  von Willebrand factor type A domain-containing protein  60.91 
 
 
219 aa  259  2e-68  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.233145 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2365  von Willebrand factor type A domain-containing protein  60.45 
 
 
219 aa  258  4e-68  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1584  von Willebrand factor type A  60.91 
 
 
219 aa  258  5.0000000000000005e-68  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.154972  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1568  von Willebrand factor type A  60.91 
 
 
219 aa  258  5.0000000000000005e-68  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.921097  normal  0.435058 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2215  von Willebrand factor type A domain-containing protein  60.91 
 
 
219 aa  258  5.0000000000000005e-68  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1103  von Willebrand factor, type A  49.77 
 
 
224 aa  211  1e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0560  von Willebrand factor type A  49.31 
 
 
230 aa  209  3e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0134  von Willebrand factor, type A  47.93 
 
 
218 aa  208  6e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.864003  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3137  von Willebrand factor type A  47.25 
 
 
224 aa  204  1e-51  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2368  von Willebrand factor, type A  47.69 
 
 
220 aa  202  5e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1917  von Willebrand factor, type A  45.85 
 
 
1204 aa  199  3e-50  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.137165 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2727  von Willebrand factor, type A  46.95 
 
 
233 aa  196  2.0000000000000003e-49  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3006  hypothetical protein  44.13 
 
 
222 aa  176  4e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4762  von Willebrand factor type A domain protein  40.72 
 
 
224 aa  150  1e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0482  von Willebrand factor type A  38.39 
 
 
222 aa  149  3e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0810  von Willebrand factor, type A  38.34 
 
 
233 aa  136  2e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2991  von Willebrand factor type A  30.65 
 
 
219 aa  97.4  2e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00948375  normal  0.342829 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0508  putative tellurium resistance protein  30.81 
 
 
212 aa  92  7e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0570  von Willebrand factor type A  30.81 
 
 
212 aa  92  7e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1086  putative tellurium resistance protein  30.81 
 
 
212 aa  92  7e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3687  von Willebrand factor type A  31.35 
 
 
212 aa  90.9  2e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.189845  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3684  von Willebrand factor type A  28.57 
 
 
346 aa  86.3  3e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.497723  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4669  von Willebrand factor, type A  30.48 
 
 
212 aa  85.9  4e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.264174  normal  0.0341202 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1089  putative tellurium resistance protein  28.5 
 
 
346 aa  82.8  0.000000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0567  von Willebrand factor type A  28.5 
 
 
346 aa  82.8  0.000000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0505  putative tellurium resistance protein  28.5 
 
 
346 aa  82.8  0.000000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1166  von Willebrand factor type A  28.5 
 
 
212 aa  80.9  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4203  von Willebrand factor type A  30.66 
 
 
244 aa  79.7  0.00000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.258867  normal  0.0187609 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0628  hypothetical protein  30.11 
 
 
212 aa  77.4  0.0000000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1172  von Willebrand factor type A  28.02 
 
 
352 aa  77  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5987  von Willebrand factor, type A  31.76 
 
 
248 aa  75.5  0.0000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.919016  normal 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4666  von Willebrand factor, type A  26.6 
 
 
350 aa  73.6  0.000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.404551  normal  0.0464435 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4255  von Willebrand factor, type A  29.47 
 
 
240 aa  67  0.0000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0506  putative tellurium resistance protein  28.18 
 
 
212 aa  65.1  0.0000000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0568  von Willebrand factor type A  29.67 
 
 
233 aa  64.3  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3685  von Willebrand factor type A  27.69 
 
 
212 aa  64.7  0.000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.523422  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1498  von Willebrand factor type A  31.85 
 
 
228 aa  64.7  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0630  hypothetical protein  26.75 
 
 
343 aa  63.5  0.000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1643  von Willebrand factor type A  25.59 
 
 
223 aa  63.2  0.000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1088  putative tellurium resistance protein  29.12 
 
 
222 aa  62.4  0.000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4667  von Willebrand factor, type A  29.95 
 
 
213 aa  60.8  0.00000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.40968  normal  0.0500765 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1170  von Willebrand factor type A  35.2 
 
 
211 aa  60.1  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.906773 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0629  hypothetical protein  26.88 
 
 
225 aa  55.5  0.0000007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7176  von Willebrand factor type A  26.89 
 
 
238 aa  47  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.135257  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04060  hypothetical protein  25.77 
 
 
272 aa  47  0.0002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.151575 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1510  hypothetical protein  23.89 
 
 
154 aa  45.8  0.0005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.836921  normal  0.0611826 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3131  von Willebrand factor, type A  25.3 
 
 
565 aa  43.5  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>