More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_3368 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011891  A2cp1_3368  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 
326 aa  645    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3293  alpha/beta hydrolase fold  90.8 
 
 
323 aa  557  1e-158  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.104393  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3177  Alpha/beta hydrolase fold-1  86.03 
 
 
272 aa  469  1.0000000000000001e-131  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.97494  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3365  alpha/beta hydrolase fold  56.32 
 
 
265 aa  284  2.0000000000000002e-75  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.6363  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9382  alpha/beta hydrolase fold protein  53.88 
 
 
259 aa  283  3.0000000000000004e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3606  alpha/beta hydrolase fold  55.17 
 
 
265 aa  275  9e-73  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000510854 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0636  alpha/beta hydrolase fold protein  51.74 
 
 
263 aa  251  1e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1106  alpha/beta hydrolase fold protein  50.38 
 
 
283 aa  248  1e-64  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.112481  normal  0.804859 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4208  alpha/beta hydrolase fold protein  50.37 
 
 
268 aa  241  1e-62  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0653  alpha/beta hydrolase fold protein  39.8 
 
 
310 aa  226  3e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.754721  normal  0.0538261 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1367  alpha/beta hydrolase fold  48.08 
 
 
310 aa  226  4e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.819345  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5863  alpha/beta hydrolase fold protein  45.45 
 
 
265 aa  224  2e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.279453 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1470  alpha/beta hydrolase fold protein  47.45 
 
 
315 aa  223  4e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2025  alpha/beta hydrolase fold protein  47.04 
 
 
276 aa  206  5e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0565493 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1788  alpha/beta hydrolase fold protein  37.79 
 
 
279 aa  189  5e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0842408  hitchhiker  0.00140329 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1509  alpha/beta hydrolase fold  43.46 
 
 
261 aa  187  2e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.725835  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1790  alpha/beta hydrolase fold  38.19 
 
 
287 aa  179  4.999999999999999e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.333084  hitchhiker  0.00365614 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2251  Alpha/beta hydrolase fold-1  43.33 
 
 
284 aa  167  2e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.154511  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0017  alpha/beta hydrolase fold  36.1 
 
 
327 aa  164  1.0000000000000001e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0512561 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1382  alpha/beta hydrolase fold  39.93 
 
 
287 aa  163  3e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.327578  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1622  alpha/beta hydrolase fold  42.96 
 
 
284 aa  163  4.0000000000000004e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1695  alpha/beta hydrolase fold protein  42.59 
 
 
284 aa  163  5.0000000000000005e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.194275  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0737  alpha/beta hydrolase fold protein  36.64 
 
 
273 aa  159  7e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.755425  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5414  alpha/beta hydrolase fold protein  33.47 
 
 
261 aa  150  4e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0420195 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2181  alpha/beta hydrolase fold  40 
 
 
273 aa  145  9e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2120  alpha/beta hydrolase fold protein  35.27 
 
 
284 aa  142  6e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.466438 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2639  alpha/beta hydrolase fold  36.11 
 
 
280 aa  141  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2684  alpha/beta hydrolase fold  36.11 
 
 
280 aa  141  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.9064  normal  0.0215233 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4536  alpha/beta hydrolase fold protein  37.5 
 
 
279 aa  139  7.999999999999999e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.821334  normal  0.0123379 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2668  alpha/beta hydrolase fold  35.71 
 
 
280 aa  139  7.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.105125  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1299  hypothetical protein  33.33 
 
 
262 aa  125  8.000000000000001e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000000570356  normal  0.587837 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4878  alpha/beta hydrolase fold  31.58 
 
 
279 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0658691 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2398  alpha/beta hydrolase fold protein  33.33 
 
 
282 aa  112  6e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.240634  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2473  hypothetical protein  27.45 
 
 
286 aa  110  4.0000000000000004e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4064  alpha/beta hydrolase fold  25.76 
 
 
283 aa  107  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5301  putative oxidoreductase protein  34.52 
 
 
258 aa  106  6e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0102616  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4384  alpha/beta hydrolase fold protein  24.74 
 
 
283 aa  103  4e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.944451 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2505  alpha/beta family hydrolase  29.5 
 
 
279 aa  102  6e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3585  alpha/beta hydrolase fold  35.96 
 
 
270 aa  101  2e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5863  alpha/beta hydrolase fold  30.88 
 
 
270 aa  100  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.648074  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4082  alpha/beta hydrolase fold  29.66 
 
 
272 aa  100  4e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0534  putative peroxidase  28.14 
 
 
281 aa  94.7  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.476086  normal  0.88579 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7536  Alpha/beta hydrolase  31.43 
 
 
270 aa  90.9  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2846  alpha/beta hydrolase  31.48 
 
 
263 aa  90.9  3e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.455911  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7140  alpha/beta hydrolase fold protein  28.52 
 
 
425 aa  88.2  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6565  alpha/beta hydrolase fold  28.78 
 
 
270 aa  87.4  3e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.250077 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0648  alpha/beta hydrolase fold protein  32.68 
 
 
226 aa  87  4e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0281045 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0800  alpha/beta hydrolase fold  27.1 
 
 
267 aa  86.3  7e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.156653 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5717  alpha/beta hydrolase fold  29.66 
 
 
270 aa  86.3  7e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6081  alpha/beta hydrolase fold  29.66 
 
 
270 aa  86.3  7e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5984  alpha/beta hydrolase fold  44.92 
 
 
300 aa  85.9  8e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0152397 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3027  alpha/beta hydrolase fold protein  25.78 
 
 
285 aa  85.5  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1287  alpha/beta hydrolase fold protein  30.25 
 
 
255 aa  85.1  0.000000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00130508  normal  0.0205637 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1534  lipolytic enzyme  31.73 
 
 
294 aa  84.7  0.000000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.277395  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2178  hydrolase, putative  29.25 
 
 
233 aa  83.6  0.000000000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6102  alpha/beta hydrolase fold  28.41 
 
 
270 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2090  putative hydrolase  28.77 
 
 
233 aa  82.8  0.000000000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.787524  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1628  alpha/beta hydrolase fold protein  34.39 
 
 
229 aa  82.8  0.000000000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.989142  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1764  alpha/beta hydrolase fold  29.25 
 
 
271 aa  82.4  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.718391  normal  0.0637777 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  33.63 
 
 
265 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2292  alpha/beta hydrolase fold  29.15 
 
 
275 aa  82.4  0.00000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.288944 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0316  alpha/beta hydrolase fold  31.21 
 
 
316 aa  80.9  0.00000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00247828  hitchhiker  0.00660595 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3907  alpha/beta hydrolase fold  26.25 
 
 
269 aa  79.7  0.00000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.0000000804884  normal  0.943348 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4021  alpha/beta hydrolase fold protein  26.25 
 
 
269 aa  79.7  0.00000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  unclonable  0.000000197083  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0911  alpha/beta hydrolase fold protein  25.83 
 
 
276 aa  79.3  0.00000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.139412 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4246  alpha/beta hydrolase fold  29.5 
 
 
288 aa  79.3  0.00000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.912428  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1078  alpha/beta hydrolase fold protein  26.92 
 
 
253 aa  79  0.0000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1714  alpha/beta hydrolase fold  28.82 
 
 
265 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.557122  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2264  alpha/beta hydrolase fold protein  31.67 
 
 
290 aa  79  0.0000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.426899  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0733  alpha/beta hydrolase fold  29.07 
 
 
280 aa  78.2  0.0000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.204474  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5458  alpha/beta hydrolase fold protein  27.31 
 
 
270 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.306625  normal  0.0166355 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3797  alpha/beta hydrolase fold protein  32.68 
 
 
248 aa  78.6  0.0000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4321  alpha/beta hydrolase fold  29.43 
 
 
280 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0798376 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2446  alpha/beta hydrolase fold protein  29.43 
 
 
309 aa  77.8  0.0000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.969901  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4235  alpha/beta hydrolase fold  36.3 
 
 
252 aa  77.4  0.0000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.125145  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1945  alpha/beta hydrolase fold  28.32 
 
 
346 aa  77.4  0.0000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2612  alpha/beta hydrolase fold  39.68 
 
 
250 aa  77  0.0000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.899373  normal  0.0292589 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0777  alpha/beta hydrolase fold  31.71 
 
 
284 aa  77  0.0000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.547366 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2179  alpha/beta hydrolase fold protein  40.48 
 
 
271 aa  76.6  0.0000000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0908  alpha/beta hydrolase fold protein  34.48 
 
 
253 aa  76.6  0.0000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000766289  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0806  alpha/beta hydrolase fold  25.34 
 
 
279 aa  75.9  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0845651 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2400  alpha/beta hydrolase fold  29.71 
 
 
288 aa  75.1  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2526  alpha/beta hydrolase fold  29.74 
 
 
275 aa  73.9  0.000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7870  alpha/beta hydrolase fold protein  29.33 
 
 
250 aa  73.6  0.000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.645188  normal  0.180866 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2510  alpha/beta hydrolase fold protein  39.13 
 
 
267 aa  73.6  0.000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00182924  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3303  3-Oxoadipate enol-lactonase  23.63 
 
 
300 aa  73.2  0.000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.664184  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0403  alpha/beta hydrolase fold  28.47 
 
 
291 aa  73.2  0.000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0391  alpha/beta hydrolase fold  28.47 
 
 
291 aa  73.2  0.000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.115733 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0412  alpha/beta hydrolase fold  28.47 
 
 
291 aa  73.2  0.000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0866892  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1897  alpha/beta hydrolase fold  36.69 
 
 
264 aa  73.2  0.000000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.595115  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4748  alpha/beta hydrolase fold  29.04 
 
 
295 aa  72.8  0.000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.259792  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0298  B-ketoadipate enol-lactone hydrolase protein  35.83 
 
 
279 aa  72.8  0.000000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1230  alpha/beta hydrolase fold  28.21 
 
 
261 aa  72.8  0.000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6602  alpha/beta hydrolase fold  28.21 
 
 
261 aa  72.8  0.000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.472817  normal  0.1504 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1968  putative alpha/beta hydrolase fold  29.07 
 
 
259 aa  72  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0153168  normal  0.143128 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1935  alpha/beta hydrolase  39.64 
 
 
268 aa  72.4  0.00000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3643  alpha/beta hydrolase fold  37.76 
 
 
284 aa  72.4  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.191319  normal  0.297531 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2732  alpha/beta hydrolase fold  26.55 
 
 
271 aa  72  0.00000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1168  alpha/beta hydrolase fold protein  39.47 
 
 
271 aa  71.2  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.375352  normal  0.0130652 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09470  Alpha/beta hydrolase fold protein  40.68 
 
 
290 aa  71.6  0.00000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.688745  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>