More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_0849 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010465  YPK_0849  peptidase M48 Ste24p  100 
 
 		 250 aa  516  1e-146  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.322576  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0845  M48 family peptidase  99.6 
 
 		 250 aa  514  1.0000000000000001e-145  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3351  M48 family peptidase  99.2 
 
 		 250 aa  514  1.0000000000000001e-145  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3955  peptidase M48 Ste24p  85.6 
 
 		 250 aa  453  1.0000000000000001e-126  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3239  peptidase M48, Ste24p  73.49 
 
 		 252 aa  395  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3315  peptidase M48, Ste24p  73.49 
 
 		 252 aa  394  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3704  peptidase M48 Ste24p  76.4 
 
 		 250 aa  382  1e-105  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02766  predicted peptidase  69.08 
 
 		 252 aa  377  1e-103  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0758  peptidase M48 Ste24p  68.67 
 
 		 252 aa  375  1e-103  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4238  peptidase, M48B family  69.08 
 
 		 252 aa  377  1e-103  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3270  M48B family peptidase  69.08 
 
 		 252 aa  377  1e-103  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3369  peptidase, M48B family  69.08 
 
 		 252 aa  377  1e-103  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.433794  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0775  peptidase M48 Ste24p  68.67 
 
 		 252 aa  375  1e-103  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0200008 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3078  M48B family peptidase  69.08 
 
 		 252 aa  377  1e-103  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00267563 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3094  M48B family peptidase  68.67 
 
 		 252 aa  375  1e-103  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3342  peptidase M48, Ste24p  70.68 
 
 		 252 aa  358  3e-98  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.887566  normal  0.0880517 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3901  peptidase M48 Ste24p  76.8 
 
 		 250 aa  351  5e-96  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2547  peptidase M48 Ste24p  64.4 
 
 		 251 aa  343  1e-93  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.282417  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3335  peptidase M48 Ste24p  66.67 
 
 		 252 aa  320  9.000000000000001e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.490632  normal  0.0905245 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00913  predicted peptidase with chaperone function  62.14 
 
 		 254 aa  320  9.999999999999999e-87  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.297471  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1092  peptidase M48, Ste24p  58.73 
 
 		 253 aa  320  9.999999999999999e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.000219795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1006  M48B family peptidase  62.14 
 
 		 254 aa  320  9.999999999999999e-87  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000612622  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00920  hypothetical protein  62.14 
 
 		 254 aa  320  9.999999999999999e-87  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.297268  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2687  peptidase M48 Ste24p  62.14 
 
 		 254 aa  320  9.999999999999999e-87  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000000650264  normal  0.800439 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1015  M48B family peptidase  62.14 
 
 		 254 aa  320  9.999999999999999e-87  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000261576  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1070  peptidase, M48B family  62.14 
 
 		 262 aa  320  9.999999999999999e-87  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000805539  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2734  peptidase M48 Ste24p  61.73 
 
 		 254 aa  318  5e-86  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000015723  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1077  peptidase M48, Ste24p  57.94 
 
 		 253 aa  318  7e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.676639  normal  0.12014 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1012  peptidase M48, Ste24p  57.94 
 
 		 253 aa  318  7e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.453448  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0985  peptidase M48, Ste24p  57.94 
 
 		 253 aa  318  7e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00562813  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1044  peptidase M48, Ste24p  57.94 
 
 		 253 aa  318  7e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.330667  normal  0.397377 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2211  M48B family peptidase  61.51 
 
 		 254 aa  313  1.9999999999999998e-84  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000159617  normal  0.373836 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2419  peptidase, M48B family  61.8 
 
 		 235 aa  309  2e-83  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000823036  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0353  putative lipoprotein  61.97 
 
 		 252 aa  300  2e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03610  putative putative Zn-dependent protease with chaperone function  61.54 
 
 		 252 aa  295  5e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00852154  hitchhiker  0.000000000112328 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2139  peptidase M48, Ste24p  60.32 
 
 		 251 aa  290  2e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.821135  normal  0.237268 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2706  peptidase M48, Ste24p  57.26 
 
 		 250 aa  287  9e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.268844  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2849  peptidase M48, Ste24p  59.83 
 
 		 249 aa  276  2e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1960  peptidase M48, Ste24p  59.13 
 
 		 250 aa  263  2e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6085  peptidase M48, Ste24p  54.98 
 
 		 253 aa  257  1e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.656597 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2807  peptidase M48, Ste24p  54.18 
 
 		 253 aa  255  4e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2674  peptidase M48 Ste24p  54.18 
 
 		 253 aa  254  8e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2755  peptidase M48, Ste24p  55.38 
 
 		 253 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2779  peptidase M48 Ste24p  55.38 
 
 		 253 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.76757  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2142  peptidase M48, Ste24p  54.58 
 
 		 604 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0546  peptidase M48 Ste24p  52.99 
 
 		 253 aa  253  3e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.786234  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0474  peptidase M48, Ste24p  57.21 
 
 		 261 aa  246  2e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2648  peptidase M48 Ste24p  51 
 
 		 254 aa  238  6.999999999999999e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.254413 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0489  peptidase M48 Ste24p  45.78 
 
 		 256 aa  207  2e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0533108 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1855  Zn-dependent protease with chaperone function-like  41.7 
 
 		 312 aa  188  5.999999999999999e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0553216  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0117  peptidase M48, Ste24p  41.89 
 
 		 275 aa  172  5.999999999999999e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0226  peptidase M48, Ste24p  36.05 
 
 		 289 aa  166  4e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.303922  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0225  peptidase M48, Ste24p  39.83 
 
 		 290 aa  160  2e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.242215  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2098  peptidase M48 Ste24p  37.3 
 
 		 269 aa  156  4e-37  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.380945  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0212  peptidase M48, Ste24p  30.98 
 
 		 267 aa  93.2  4e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000330567  normal  0.366898 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2861  peptidase M48, Ste24p  27.56 
 
 		 271 aa  92.8  5e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0581  peptidase M48 Ste24p  32.95 
 
 		 424 aa  90.9  2e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0013814  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0787  peptidase M48, Ste24p  30.29 
 
 		 272 aa  89.7  4e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0759  hypothetical protein  30.29 
 
 		 279 aa  89.4  5e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0801  peptidase M48 Ste24p  29.93 
 
 		 272 aa  89  7e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.740627 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3072  peptidase M48 Ste24p  28.8 
 
 		 271 aa  88.6  8e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4429  peptidase M48 Ste24p  30.97 
 
 		 271 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1783  zinc metallopeptidase  24.89 
 
 		 270 aa  85.1  8e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3390  peptidase M48 Ste24p  27.84 
 
 		 268 aa  84.7  0.000000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000240796  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1144  lipoprotein, putative  29.17 
 
 		 272 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.599312  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0984  peptidase M48, Ste24p  28.79 
 
 		 282 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00306933  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2062  peptidase M48, Ste24p  24.43 
 
 		 270 aa  84  0.000000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.02015  normal  0.416312 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0813  peptidase M48 Ste24p  32.37 
 
 		 365 aa  84.3  0.000000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1711  M48 family peptidase  26.74 
 
 		 267 aa  84.3  0.000000000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1865  peptidase M48, Ste24p  30 
 
 		 280 aa  83.6  0.000000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.130359  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2197  hypothetical protein  26.82 
 
 		 265 aa  82.4  0.000000000000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0148  peptidase M48, Ste24p  31.58 
 
 		 268 aa  82.4  0.000000000000006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1809  peptidase M48 Ste24p  27.64 
 
 		 289 aa  82.4  0.000000000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000151059 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0032  peptidase M48, Ste24p  26.04 
 
 		 270 aa  81.3  0.00000000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1437  M48 family peptidase  28 
 
 		 264 aa  80.9  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.142211  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0992  peptidase M48, Ste24p  27.42 
 
 		 272 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000000166595  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1850  peptidase M48, Ste24p  28.51 
 
 		 278 aa  80.9  0.00000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0548  peptidase M48, Ste24p  24.52 
 
 		 268 aa  80.1  0.00000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.420219  hitchhiker  0.000000269933 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0655  peptidase M48, Ste24p  28.09 
 
 		 268 aa  79.3  0.00000000000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0730736  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0517  peptidase M48, Ste24p  30.61 
 
 		 281 aa  79.3  0.00000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2092  peptidase M48 Ste24p  31.77 
 
 		 280 aa  79.3  0.00000000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1308  peptidase M48, Ste24p  27.84 
 
 		 293 aa  79  0.00000000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.038834  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0210  peptidase M48, Ste24p  28.37 
 
 		 280 aa  79  0.00000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0856  peptidase M48 Ste24p  26.67 
 
 		 268 aa  77.4  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3182  peptidase M48 Ste24p  26.42 
 
 		 487 aa  77.4  0.0000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.258553  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0890  peptidase M48, Ste24p  31.87 
 
 		 228 aa  75.9  0.0000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.397549  normal  0.908613 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4714  peptidase M48, Ste24p  29.2 
 
 		 272 aa  75.9  0.0000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.134186  normal  0.0690011 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1219  hypothetical protein  25.9 
 
 		 258 aa  75.5  0.0000000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1887  peptidase M48, Ste24p  33.54 
 
 		 274 aa  75.5  0.0000000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61290  putative lipoprotein  31.96 
 
 		 273 aa  75.5  0.0000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3668  peptidase M48, Ste24p  27.17 
 
 		 273 aa  75.5  0.0000000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1212  peptidase M48  27.09 
 
 		 285 aa  75.1  0.0000000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0972  peptidase M48, Ste24p  28.16 
 
 		 268 aa  75.1  0.0000000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000310302  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2379  peptidase M48 Ste24p  26.14 
 
 		 285 aa  74.7  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00799572  normal  0.0495258 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0456  peptidase M48 Ste24p  28.57 
 
 		 395 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0072  peptidase M48 Ste24p  30.95 
 
 		 260 aa  74.3  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4358  peptidase M48 Ste24p  25.66 
 
 		 282 aa  73.9  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5278  putative lipoprotein  29.61 
 
 		 273 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0624214  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1134  peptidase M48 Ste24p  25.48 
 
 		 487 aa  74.3  0.000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0070  peptidase M48 Ste24p  30.95 
 
 		 260 aa  74.3  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.885024  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>