82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_4902 on replicon NC_009717
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009717  Xaut_4902  blue (type1) copper domain-containing protein  100 
 
 		 156 aa  321  3e-87  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7873  blue (type 1) copper domain protein  75.64 
 
 		 156 aa  264  4e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4824  blue (type1) copper domain-containing protein  67.1 
 
 		 160 aa  228  3e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.904248  normal  0.294152 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4603  blue (type1) copper domain-containing protein  71.32 
 
 		 160 aa  214  5e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.258245 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1092  blue (type 1) copper domain protein  63.69 
 
 		 165 aa  212  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4269  blue (type1) copper domain-containing protein  55.9 
 
 		 161 aa  186  7e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.25109 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3425  putative copper tolerance protein  57.46 
 
 		 151 aa  163  6.9999999999999995e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.792125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6520  putative copper tolerance protein (cupredoxin)  54.07 
 
 		 153 aa  159  1e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.264526  normal  1 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9844  copper tolerance protein  50.63 
 
 		 159 aa  159  1e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9849  copper tolerance protein  50.63 
 
 		 159 aa  159  2e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5030  blue (type1) copper domain-containing protein  48.03 
 
 		 159 aa  150  5.9999999999999996e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.4583  normal  0.77741 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2668  blue (type1) copper domain-containing protein  47.68 
 
 		 163 aa  142  2e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.975423  normal  0.234604 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5863  blue (type 1) copper domain protein  52.99 
 
 		 159 aa  141  4e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1267  blue (type1) copper domain-containing protein  51.97 
 
 		 171 aa  135  2e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00034808 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2721  blue (type1) copper domain-containing protein  48.51 
 
 		 166 aa  134  4e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0479159  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2197  blue (type 1) copper domain protein  49.25 
 
 		 164 aa  134  6.0000000000000005e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5685  blue (type 1) copper domain protein  51.59 
 
 		 168 aa  132  9.999999999999999e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1635  oxidoreductase  48.03 
 
 		 181 aa  130  5e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.400621  normal  0.0387336 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3913  blue (type 1) copper domain protein  40.12 
 
 		 162 aa  127  6e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.444429  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4027  blue (type 1) copper domain protein  40.12 
 
 		 162 aa  127  6e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0457304  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3487  blue (type1) copper domain-containing protein  41.4 
 
 		 170 aa  124  4.0000000000000003e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3980  blue (type 1) copper domain protein  39.49 
 
 		 166 aa  120  6e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3995  blue (type1) copper domain-containing protein  45.53 
 
 		 180 aa  120  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.704782  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2655  blue (type1) copper domain-containing protein  41.73 
 
 		 164 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.366193  normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4551  blue (type1) copper domain-containing protein  40.76 
 
 		 171 aa  117  6e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1833  blue (type 1) copper domain protein  38.82 
 
 		 159 aa  117  6e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00584393 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0734  blue (type 1) copper domain protein  40.94 
 
 		 159 aa  117  7.999999999999999e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.227893  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6116  putative oxido-reductase protein CopI  38.75 
 
 		 158 aa  115  3e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.251154  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1207  blue (type 1) copper domain protein  37.27 
 
 		 160 aa  114  3.9999999999999997e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0922177  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1667  blue (type1) copper domain-containing protein  39.24 
 
 		 164 aa  114  5e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.393546 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2601  blue (type1) copper domain-containing protein  38.51 
 
 		 160 aa  114  6e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.377321  normal  0.709674 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1260  blue (type1) copper domain-containing protein  41.04 
 
 		 272 aa  114  6.9999999999999995e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0922125  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2909  blue (type1) copper domain-containing protein  41.73 
 
 		 163 aa  114  6.9999999999999995e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.272302  normal  0.0133564 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5106  blue (type 1) copper domain protein  41.06 
 
 		 160 aa  113  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00549955 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3263  putative copper binding protein  45.95 
 
 		 176 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4053  transposase Tn3 family protein  36.97 
 
 		 166 aa  111  4.0000000000000004e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0575  blue (type1) copper domain-containing protein  36.88 
 
 		 154 aa  101  3e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0159129  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2350  hypothetical protein  31.15 
 
 		 182 aa  100  5e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27840  hypothetical protein  32.42 
 
 		 205 aa  97.4  7e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3854  uncharacterized copper-binding protein  35.33 
 
 		 177 aa  96.7  1e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.874975 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2231  blue (type1) copper domain-containing protein  34.44 
 
 		 177 aa  94.4  6e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.503031  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0125  copper-binding protein  30.29 
 
 		 177 aa  92.4  2e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1676  blue (type1) copper domain-containing protein  28.25 
 
 		 167 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.549233  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2232  hypothetical protein  28.88 
 
 		 185 aa  82  0.000000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.53865  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0348  blue (type1) copper domain-containing protein  37.86 
 
 		 189 aa  82.4  0.000000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.471869 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0969  hypothetical protein  29.59 
 
 		 169 aa  75.1  0.0000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001394  hypothetical protein  33.87 
 
 		 188 aa  74.7  0.0000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000508588  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06367  hypothetical protein  33.87 
 
 		 188 aa  74.3  0.0000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0713  hypothetical protein  33.08 
 
 		 190 aa  74.3  0.0000000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1700  blue (type1) copper domain-containing protein  28.11 
 
 		 175 aa  71.6  0.000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00435665 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2159  plastocyanin/azurin family copper binding protein  24.86 
 
 		 175 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.0076427  normal  0.727347 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3583  hypothetical protein  24.03 
 
 		 175 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2149  nitrite reductase, copper-containing  25 
 
 		 534 aa  55.8  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2073  blue (type1) copper domain-containing protein  31.25 
 
 		 161 aa  53.1  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.256815  normal  0.746059 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2540  blue-copper-protein-like protein  24.35 
 
 		 153 aa  52  0.000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.00275414  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1660  blue (type 1) copper domain protein  22.39 
 
 		 314 aa  48.5  0.00003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0017  plastocyanin  32.46 
 
 		 116 aa  48.9  0.00003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.771707  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1088  plastocyanin  29.82 
 
 		 125 aa  48.5  0.00003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000603452 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06371  plastocyanin  32.46 
 
 		 116 aa  48.9  0.00003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0952102  normal  0.874773 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0916  plastocyanin  29.82 
 
 		 119 aa  47.8  0.00005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.222865  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2238  multicopper oxidase type 3  31.13 
 
 		 505 aa  47.8  0.00006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.468125  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10711  plastocyanin  32.46 
 
 		 128 aa  47.4  0.00007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.590546 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1576  hypothetical protein  24.56 
 
 		 167 aa  47.4  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0471287  hitchhiker  0.0000128418 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3677  hypothetical protein  25.86 
 
 		 157 aa  47  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18341  plastocyanin  29.17 
 
 		 119 aa  45.4  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.259314 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1802  blue (type1) copper domain-containing protein  27.01 
 
 		 179 aa  45.4  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.495145 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1015  plastocyanin  28.95 
 
 		 126 aa  45.4  0.0003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.381594  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1998  nitrite reductase (NO-forming)  22.36 
 
 		 451 aa  45.4  0.0003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2745  plastocyanin  31.09 
 
 		 139 aa  45.1  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.412974 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2581  blue-copper-protein-like protein  24.19 
 
 		 147 aa  44.3  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2634  blue (type 1) copper domain protein  28.33 
 
 		 140 aa  44.3  0.0007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2240  plastocyanin  28.07 
 
 		 119 aa  43.9  0.0008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2294  plastocyanin  28.07 
 
 		 119 aa  43.9  0.0008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0308558  normal  0.029451 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0581  plastocyanin  29.17 
 
 		 116 aa  43.9  0.0008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2921  blue (type 1) copper domain protein  26.85 
 
 		 125 aa  43.9  0.0009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0439603  normal  0.638215 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1326  nitrite reductase, copper-containing  28.7 
 
 		 466 aa  43.9  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.852268  normal  0.995257 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06371  plastocyanin  30 
 
 		 116 aa  43.5  0.001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4485  hypothetical protein  25.44 
 
 		 178 aa  42.7  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.475375  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2981  hypothetical protein  23.48 
 
 		 150 aa  42.4  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.227676  normal  0.693329 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0759  blue (type1) copper domain-containing protein  26.67 
 
 		 287 aa  42  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00521723  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06071  plastocyanin  30.7 
 
 		 116 aa  41.6  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_34733  plastocyanin, chloroplast precursor  26.5 
 
 		 104 aa  40.4  0.009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>