More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_3136 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_3136  hypothetical protein  100 
 
 
456 aa  942    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.141218 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4687  hypothetical protein  54.88 
 
 
446 aa  480  1e-134  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4163  hypothetical protein  54.65 
 
 
446 aa  479  1e-134  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.45343  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0934  hypothetical protein  53.95 
 
 
446 aa  478  1e-133  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3821  hypothetical protein  54.65 
 
 
446 aa  476  1e-133  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000353101 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3587  hypothetical protein  54.19 
 
 
446 aa  478  1e-133  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5503  hypothetical protein  54.19 
 
 
446 aa  478  1e-133  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4780  hypothetical protein  54.19 
 
 
446 aa  478  1e-133  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1364  hypothetical protein  54.06 
 
 
449 aa  472  1e-132  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1536  hypothetical protein  54.52 
 
 
449 aa  474  1e-132  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0347  hypothetical protein  54.06 
 
 
449 aa  472  1e-132  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.31983  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0944  hypothetical protein  54.06 
 
 
449 aa  472  1e-132  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0142965  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0627  hypothetical protein  54.06 
 
 
449 aa  472  1e-132  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.804751  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1275  hypothetical protein  54.06 
 
 
449 aa  472  1e-132  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.381328  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2467  hypothetical protein  54.06 
 
 
449 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.549012  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1202  hypothetical protein  54.06 
 
 
449 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4297  hypothetical protein  54 
 
 
448 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.90094  normal  0.321538 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4978  hypothetical protein  54 
 
 
448 aa  458  1e-127  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3182  hypothetical protein  54 
 
 
448 aa  458  1e-127  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.224381 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6715  hypothetical protein  49.66 
 
 
454 aa  425  1e-118  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.284821 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6480  hypothetical protein  49.44 
 
 
454 aa  422  1e-117  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8150  hypothetical protein  48.55 
 
 
448 aa  420  1e-116  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.387109  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1166  hypothetical protein  45.72 
 
 
452 aa  393  1e-108  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.41749  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4437  hypothetical protein  45.5 
 
 
451 aa  394  1e-108  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0691941  normal  0.936595 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2915  aminotransferase class-III  44.34 
 
 
449 aa  378  1e-103  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0414678  normal  0.128852 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3718  hypothetical protein  43.97 
 
 
455 aa  368  1e-101  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.072939 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2631  aminotransferase class-III  41.8 
 
 
451 aa  365  1e-100  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3512  hypothetical protein  42.73 
 
 
447 aa  366  1e-100  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000425245  hitchhiker  0.000284968 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2923  aminotransferase class-III  42.47 
 
 
451 aa  366  1e-100  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0806486  normal  0.849242 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1296  putative aminotransferase  43.22 
 
 
460 aa  361  2e-98  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.566567 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1032  aminotransferase class-III  42.47 
 
 
450 aa  359  6e-98  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0404  aminotransferase class-III  42.02 
 
 
454 aa  357  1.9999999999999998e-97  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1491  aminotransferase  41.86 
 
 
463 aa  345  1e-93  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.361229  normal  0.972235 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2379  aminotransferase class-III  40.96 
 
 
471 aa  342  8e-93  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00692435  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3010  putative aminotransferase  39.37 
 
 
466 aa  339  7e-92  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.115201  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0379  aminotransferase class-III  40.22 
 
 
443 aa  336  3.9999999999999995e-91  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2643  putative aminotransferase  39.14 
 
 
460 aa  336  7e-91  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.431158  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1902  putative aminotransferase  39.73 
 
 
459 aa  333  4e-90  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.483281  normal  0.25146 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4382  hypothetical protein  39.73 
 
 
459 aa  332  8e-90  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.68656  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48850  putative aminotransferase  39.21 
 
 
457 aa  328  1.0000000000000001e-88  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1582  adenosylmethionine--8-amino-7-oxononanoate aminotransferase  41.18 
 
 
453 aa  327  2.0000000000000001e-88  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.603934  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1320  aminotransferase  39.65 
 
 
450 aa  327  3e-88  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0408042  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1580  adenosylmethionine-8-amino-7-oxononanoate aminotransferase  40.04 
 
 
455 aa  325  7e-88  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.206322 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1727  aminotransferase  38.19 
 
 
449 aa  324  2e-87  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1519  aminotransferase  38.19 
 
 
449 aa  324  2e-87  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.152783  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1491  aminotransferase  37.97 
 
 
449 aa  324  2e-87  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.112289  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1481  aminotransferase  37.97 
 
 
449 aa  324  2e-87  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1636  aminotransferase  38.19 
 
 
450 aa  324  2e-87  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0545  putative aminotransferase  40.09 
 
 
458 aa  324  2e-87  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0281  putative aminotransferase  38.34 
 
 
453 aa  323  3e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1704  aminotransferase  37.75 
 
 
450 aa  323  4e-87  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1287  hypothetical protein  42.89 
 
 
459 aa  323  5e-87  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0354138  normal  0.112297 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0952  putative aminotransferase  38.17 
 
 
455 aa  322  6e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2244  adenosylmethionine-8-amino-7-oxononanoate aminotransferase  38.67 
 
 
455 aa  323  6e-87  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2218  aminotransferase  40.04 
 
 
450 aa  322  6e-87  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1524  aminotransferase  37.75 
 
 
450 aa  322  7e-87  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.642809  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1673  aminotransferase  37.97 
 
 
450 aa  322  9.000000000000001e-87  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0301264  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1778  aminotransferase  37.75 
 
 
450 aa  322  9.000000000000001e-87  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.250209  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2727  putative aminotransferase  39.91 
 
 
478 aa  322  9.999999999999999e-87  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.692247  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1338  aminotransferase class-III  41.22 
 
 
479 aa  322  9.999999999999999e-87  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000660385 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3671  aminotransferase  37.75 
 
 
450 aa  321  1.9999999999999998e-86  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0477751  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3172  aminotransferase  39.91 
 
 
449 aa  320  1.9999999999999998e-86  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.606908  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1254  putative aminotransferase  40.37 
 
 
464 aa  319  7e-86  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.179444  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1407  putative aminotransferase  37.84 
 
 
456 aa  319  7e-86  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0061  hypothetical protein  38.27 
 
 
465 aa  318  9e-86  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.543932  hitchhiker  0.00333997 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5182  putative aminotransferase  38.34 
 
 
453 aa  318  1e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5242  putative aminotransferase  38.11 
 
 
453 aa  318  1e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.292623  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5089  putative aminotransferase  38.34 
 
 
453 aa  318  1e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.441787  normal  0.847711 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0051  adenosylmethionine-8-amino-7-oxononanoate aminotransferase  39.17 
 
 
470 aa  317  2e-85  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.132142 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0421  aminotransferase  40 
 
 
456 aa  317  2e-85  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7510  hypothetical protein  37.97 
 
 
467 aa  318  2e-85  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6604  aminotransferase  39.2 
 
 
456 aa  318  2e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.112591  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03900  putative aminotransferase  37.5 
 
 
456 aa  317  2e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0390  putative aminotransferase  37.5 
 
 
456 aa  317  2e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1738  putative aminotransferase  38.94 
 
 
470 aa  316  4e-85  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000987202 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5308  aminotransferase, class III  39.03 
 
 
455 aa  316  5e-85  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0371  aminotransferase  38.67 
 
 
452 aa  316  5e-85  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.913976 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3719  aminotransferase class-III  39.28 
 
 
455 aa  316  7e-85  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1928  aminotransferase  39.17 
 
 
459 aa  315  7e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4663  putative aminotransferase  36.61 
 
 
451 aa  315  9e-85  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2166  adenosylmethionine-8-amino-7-oxononanoate aminotransferase  40.13 
 
 
455 aa  315  9.999999999999999e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1101  putative aminotransferase  37.5 
 
 
455 aa  315  9.999999999999999e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.27722 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5406  putative aminotransferase  38.52 
 
 
454 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00027228 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4866  putative aminotransferase  38.34 
 
 
454 aa  313  3.9999999999999997e-84  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00453658  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7547  hypothetical protein  42.5 
 
 
465 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.21317 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2668  aminotransferase  40.14 
 
 
457 aa  313  3.9999999999999997e-84  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0184  aminotransferase  38.73 
 
 
456 aa  313  4.999999999999999e-84  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0145634  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0199  aminotransferase  38.51 
 
 
456 aa  313  5.999999999999999e-84  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0221401  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1331  aminotransferase  38.22 
 
 
451 aa  313  5.999999999999999e-84  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2054  hypothetical protein  37.16 
 
 
467 aa  312  9e-84  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0191  aminotransferase  38.73 
 
 
456 aa  312  9e-84  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2025  aminotransferase, class III  37.44 
 
 
450 aa  312  1e-83  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.685949  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0278  hypothetical protein  42.46 
 
 
462 aa  311  1e-83  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2633  putative aminotransferase  37.04 
 
 
455 aa  311  2e-83  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0244739  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2051  adenosylmethionine-8-amino-7-oxononanoate aminotransferase  40.13 
 
 
453 aa  311  2e-83  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6578  hypothetical protein  42.05 
 
 
465 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.204775  normal  0.0135068 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3472  hypothetical protein  37.47 
 
 
457 aa  310  2.9999999999999997e-83  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0632118  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5731  hypothetical protein  42.05 
 
 
465 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6095  hypothetical protein  42.05 
 
 
465 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2452  adenosylmethionine-8-amino-7-oxononanoate aminotransferase  36 
 
 
452 aa  309  5.9999999999999995e-83  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>