228 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_4805 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_4805  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 163 aa  315  2e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4725  transcriptional regulator, MarR family  43.66 
 
 		 163 aa  94  9e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0489  transcriptional regulator, MarR family  40.14 
 
 		 148 aa  92  3e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0818  transcriptional regulator, MarR family  42.03 
 
 		 144 aa  88.2  4e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33960  transcriptional regulator  39.01 
 
 		 144 aa  87  9e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.064506  normal  0.816591 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4713  MarR family transcriptional regulator  44.06 
 
 		 150 aa  85.9  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0822  transcriptional regulator, MarR family  36.99 
 
 		 162 aa  84.3  6e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7164  transcriptional regulator, MarR family  35 
 
 		 144 aa  81.6  0.000000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.194557  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3726  MarR family transcriptional regulator  41.04 
 
 		 156 aa  81.6  0.000000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0914883  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10897  MarR family transcriptional regulator  43.17 
 
 		 143 aa  80.1  0.00000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3217  MarR family transcriptional regulator  36.57 
 
 		 150 aa  77.8  0.00000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0836001  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0241  regulatory protein, MarR  41.59 
 
 		 151 aa  75.5  0.0000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.41283  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4297  MarR family transcriptional regulator  40.71 
 
 		 159 aa  74.7  0.0000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.447261  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1252  regulatory protein MarR  37.17 
 
 		 146 aa  73.6  0.000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.906766  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0181  MarR family transcriptional regulator  42.34 
 
 		 161 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1354  MarR family transcriptional regulator  42.34 
 
 		 161 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1549  MarR family transcriptional regulator  42.34 
 
 		 161 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2731  MarR family transcriptional regulator  42.34 
 
 		 161 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2588  MarR family transcriptional regulator  42.34 
 
 		 161 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0209  MarR family transcriptional regulator  42.34 
 
 		 161 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.143126  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0417  MarR family transcriptional regulator  37.86 
 
 		 144 aa  72.8  0.000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.644689 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0833  transcriptional regulator, MarR family  41.26 
 
 		 151 aa  72  0.000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.119984  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0086  MarR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 143 aa  72.4  0.000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4468  MarR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 143 aa  72  0.000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0505  MarR family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 149 aa  72  0.000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.477244  hitchhiker  0.00736962 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4555  MarR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 143 aa  72  0.000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.334202  normal  0.226975 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4851  MarR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 143 aa  72  0.000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.228768  normal  0.062609 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1004  MarR family transcriptional regulator  41.61 
 
 		 161 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7223  MarR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 141 aa  71.2  0.000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.648034  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4072  MarR family transcriptional regulator  42.25 
 
 		 147 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5432  transcriptional regulator, MarR family  36.03 
 
 		 157 aa  70.9  0.000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.933752  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3797  MarR family transcriptional regulator  42.61 
 
 		 151 aa  70.5  0.000000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.624987  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4571  MarR family transcriptional regulator  42.61 
 
 		 151 aa  70.5  0.000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.565054  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5734  MarR family transcriptional regulator  42.61 
 
 		 151 aa  70.5  0.000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5018  transcriptional regulator, MarR family  35.71 
 
 		 140 aa  69.3  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1650  MarR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 162 aa  68.9  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.103704 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4830  MarR family transcriptional regulator  35.04 
 
 		 157 aa  69.3  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.538912  normal  0.641937 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7239  transcriptional regulator, MarR family  34.78 
 
 		 147 aa  68.6  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3927  regulatory protein, MarR  40 
 
 		 156 aa  67.8  0.00000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1273  MarR family transcriptional regulator  43.97 
 
 		 151 aa  67.4  0.00000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.270736  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0874  transcriptional regulator, MarR family  38.06 
 
 		 158 aa  67.4  0.00000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.211566  normal  0.0694607 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4190  transcriptional regulator, MarR family  40 
 
 		 147 aa  67.4  0.00000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.724781  normal  0.244242 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2020  MarR family transcriptional regulator  35.51 
 
 		 150 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.412827  normal  0.0213344 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30810  transcriptional regulator  37.4 
 
 		 145 aa  67  0.0000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5811  transcriptional regulator, MarR family  36.09 
 
 		 150 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.212082  normal  0.294475 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4463  MarR family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 151 aa  65.9  0.0000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0490827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4000  MarR family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 151 aa  65.9  0.0000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4309  MarR family transcriptional regulator  39.1 
 
 		 162 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.993253 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3208  MarR family transcriptional regulator  39.1 
 
 		 162 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.12726  normal  0.713181 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0762  MarR family transcriptional regulator  41.51 
 
 		 149 aa  65.1  0.0000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.967077  normal  0.4484 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4057  MarR family transcriptional regulator  39.1 
 
 		 162 aa  65.1  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8888  hypothetical protein  38.1 
 
 		 153 aa  64.7  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0278  transcriptional regulator, MarR family  34.26 
 
 		 175 aa  64.7  0.0000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1702  MarR family transcriptional regulator  36 
 
 		 156 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1608  MarR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 151 aa  63.2  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0698671 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2307  transcriptional regulator, MarR family  34.04 
 
 		 149 aa  62.4  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.581889 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0468  MarR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 173 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3587  transcriptional regulator, MarR family  38.64 
 
 		 161 aa  63.2  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.84675  normal  0.423141 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4006  transcriptional regulator, MarR family  40.86 
 
 		 145 aa  63.2  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.769794  normal  0.0504485 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3289  MarR family transcriptional regulator  35.24 
 
 		 147 aa  61.6  0.000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.131138 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0767  transcriptional regulator, MarR family  36.61 
 
 		 150 aa  59.7  0.00000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2817  transcriptional regulator, MarR family  35.14 
 
 		 150 aa  59.3  0.00000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.90591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2060  MarR family transcriptional regulator  39.17 
 
 		 156 aa  59.3  0.00000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1031  transcriptional regulator, MarR family  34.81 
 
 		 152 aa  57.8  0.00000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3057  MarR family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 161 aa  57.4  0.00000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.407625 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2849  transcriptional regulator, MarR family  33.83 
 
 		 143 aa  57.4  0.00000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5003  MarR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 150 aa  57.4  0.00000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.263591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6049  MarR family transcriptional regulator  33.58 
 
 		 146 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0181443  normal  0.76378 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1713  MarR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 159 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6019  transcriptional regulator, MarR family  39.62 
 
 		 149 aa  55.8  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.107791  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1992  transcriptional regulator, MarR family  36.79 
 
 		 146 aa  55.8  0.0000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.4979  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0109  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 139 aa  55.8  0.0000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1269  MarR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 150 aa  54.7  0.0000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2402  transcriptional regulator, MarR family  36.36 
 
 		 150 aa  53.1  0.000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1259  MarR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 150 aa  53.5  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.518732 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13520  transcriptional regulator  36.51 
 
 		 163 aa  53.1  0.000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.219319  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1692  DNA-binding transcriptional repressor MarR  32.69 
 
 		 144 aa  53.1  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1650  DNA-binding transcriptional repressor MarR  32.69 
 
 		 144 aa  53.1  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0219827  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1625  DNA-binding transcriptional repressor MarR  32.69 
 
 		 144 aa  53.1  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1815  DNA-binding transcriptional repressor MarR  32.69 
 
 		 144 aa  53.1  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1633  DNA-binding transcriptional repressor MarR  32.69 
 
 		 144 aa  53.1  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.400135  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1235  MarR family transcriptional regulator  40.4 
 
 		 144 aa  53.1  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.236148  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1964  MarR family transcriptional regulator  36.28 
 
 		 150 aa  52.8  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000642572  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0411  transcriptional regulator, MarR family  34.07 
 
 		 139 aa  53.1  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.418684  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0856  MarR family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 146 aa  52.4  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.859075  normal  0.01483 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2828  MarR family transcriptional regulator  28.35 
 
 		 142 aa  51.2  0.000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.940435  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10041  MarR family transcriptional regulator  34.58 
 
 		 208 aa  51.2  0.000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.964365 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1154  MarR family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 164 aa  50.8  0.000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.246648  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2120  MarR family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 164 aa  50.8  0.000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.401109  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1595  MarR family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 164 aa  50.8  0.000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000929046  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0255  MarR family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 164 aa  50.8  0.000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1958  MarR family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 164 aa  50.8  0.000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1975  MarR family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 164 aa  50.8  0.000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0792948  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0906  MarR family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 164 aa  50.8  0.000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.670814  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5385  MarR family transcriptional regulator  33.09 
 
 		 152 aa  50.4  0.000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.640191  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2171  regulatory protein, MarR  31.2 
 
 		 132 aa  50.4  0.000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5474  MarR family transcriptional regulator  33.09 
 
 		 171 aa  50.8  0.000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.117895  normal  0.12821 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5761  MarR family transcriptional regulator  33.09 
 
 		 171 aa  50.8  0.000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23740  transcriptional regulator  34.86 
 
 		 159 aa  50.4  0.000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3041  MarR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 142 aa  50.1  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.726471  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>