More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_3135 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_3135  hypothetical protein  100 
 
 		 326 aa  657    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.82433  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  66.04 
 
 		 327 aa  446  1.0000000000000001e-124  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5278  extra-cytoplasmic solute receptor  67.67 
 
 		 331 aa  445  1.0000000000000001e-124  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.777708  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  54.03 
 
 		 339 aa  338  9e-92  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  52.15 
 
 		 330 aa  334  1e-90  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  52.01 
 
 		 330 aa  330  3e-89  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  50.16 
 
 		 328 aa  329  4e-89  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5589  hypothetical protein  52.45 
 
 		 335 aa  323  2e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3937  hypothetical protein  51.16 
 
 		 328 aa  321  9.999999999999999e-87  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2796  hypothetical protein  47.11 
 
 		 336 aa  311  9e-84  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.309219  normal  0.544833 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3671  extra-cytoplasmic solute receptor  52.6 
 
 		 334 aa  308  1.0000000000000001e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1017  hypothetical protein  48 
 
 		 304 aa  306  4.0000000000000004e-82  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.221773 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0596  hypothetical protein  45.65 
 
 		 336 aa  304  1.0000000000000001e-81  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0646  hypothetical protein  45.02 
 
 		 334 aa  303  3.0000000000000004e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  46.92 
 
 		 325 aa  299  5e-80  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  46.92 
 
 		 327 aa  298  6e-80  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6278  hypothetical protein  48.97 
 
 		 322 aa  298  1e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000130922  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4511  hypothetical protein  48.83 
 
 		 337 aa  297  1e-79  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3884  hypothetical protein  48.88 
 
 		 328 aa  297  2e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0462  hypothetical protein  48.23 
 
 		 345 aa  297  2e-79  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.170176 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0453  hypothetical protein  48.23 
 
 		 345 aa  296  3e-79  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.533416  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5035  hypothetical protein  47.21 
 
 		 339 aa  295  5e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.401942  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  44.34 
 
 		 331 aa  295  8e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  46.25 
 
 		 328 aa  295  9e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4821  hypothetical protein  45.45 
 
 		 330 aa  293  2e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1026  hypothetical protein  47.65 
 
 		 333 aa  293  4e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.346833  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0080  hypothetical protein  44.92 
 
 		 343 aa  290  2e-77  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.141434 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4513  hypothetical protein  47.47 
 
 		 338 aa  290  3e-77  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0122346  normal  0.691436 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5565  hypothetical protein  51.85 
 
 		 335 aa  289  5.0000000000000004e-77  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.517724  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3664  hypothetical protein  48.84 
 
 		 324 aa  288  9e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  46.49 
 
 		 328 aa  287  1e-76  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2092  twin-arginine translocation pathway signal  42.95 
 
 		 331 aa  287  1e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.061194  normal  0.4929 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  46.49 
 
 		 328 aa  288  1e-76  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  44.2 
 
 		 327 aa  287  2e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1078  hypothetical protein  44.52 
 
 		 344 aa  287  2e-76  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.058258  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0994  hypothetical protein  44.52 
 
 		 341 aa  287  2e-76  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1908  hypothetical protein  47.56 
 
 		 336 aa  286  2.9999999999999996e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.781517  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4389  hypothetical protein  46.15 
 
 		 321 aa  286  2.9999999999999996e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.907682 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4004  hypothetical protein  47.81 
 
 		 339 aa  286  5e-76  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.506172  normal  0.0371737 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0779  hypothetical protein  46.1 
 
 		 360 aa  285  5.999999999999999e-76  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1635  hypothetical protein  43.43 
 
 		 333 aa  285  5.999999999999999e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.345549  normal  0.902401 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0842  hypothetical protein  44.95 
 
 		 325 aa  285  9e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5061  extra-cytoplasmic solute receptor  45.33 
 
 		 335 aa  284  1.0000000000000001e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000369607  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2117  hypothetical protein  44.58 
 
 		 327 aa  284  1.0000000000000001e-75  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5119  hypothetical protein  41.88 
 
 		 328 aa  284  1.0000000000000001e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.111845 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2898  hypothetical protein  44.93 
 
 		 334 aa  283  2.0000000000000002e-75  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.000220815  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0191  hypothetical protein  46.28 
 
 		 335 aa  284  2.0000000000000002e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0823  hypothetical protein  42.32 
 
 		 325 aa  284  2.0000000000000002e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0213458 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4073  extra-cytoplasmic solute receptor  43.65 
 
 		 332 aa  283  3.0000000000000004e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000509768  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0489  hypothetical protein  44.51 
 
 		 344 aa  283  3.0000000000000004e-75  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2293  hypothetical protein  46.18 
 
 		 320 aa  283  4.0000000000000003e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000010806  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3949  hypothetical protein  45.96 
 
 		 339 aa  282  5.000000000000001e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187886  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0179  hypothetical protein  44.79 
 
 		 328 aa  282  5.000000000000001e-75  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.303741 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1513  hypothetical protein  45.33 
 
 		 337 aa  282  6.000000000000001e-75  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.283946  normal  0.153712 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3983  extra-cytoplasmic solute receptor  45.23 
 
 		 328 aa  282  6.000000000000001e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0104878 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5112  hypothetical protein  44.92 
 
 		 325 aa  281  9e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386337  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0116  hypothetical protein  43.03 
 
 		 331 aa  281  1e-74  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0099  hypothetical protein  43.03 
 
 		 331 aa  281  1e-74  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.361253  normal  0.47407 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4214  hypothetical protein  46.44 
 
 		 324 aa  280  3e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2872  hypothetical protein  44.56 
 
 		 334 aa  280  3e-74  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.446965 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4385  hypothetical protein  42.81 
 
 		 323 aa  280  3e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.944912  normal  0.325254 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4047  extra-cytoplasmic solute receptor  43.43 
 
 		 329 aa  278  8e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0364236  normal  0.64466 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4433  extra-cytoplasmic solute receptor  45.79 
 
 		 327 aa  278  1e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.318216 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4334  twin-arginine translocation pathway signal  43.67 
 
 		 335 aa  277  2e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0464074 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0143  hypothetical protein  45.8 
 
 		 330 aa  277  2e-73  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.627963 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0161  hypothetical protein  45.8 
 
 		 330 aa  277  2e-73  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2752  hypothetical protein  42.86 
 
 		 325 aa  276  3e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.299516 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4876  extra-cytoplasmic solute receptor  45.64 
 
 		 328 aa  276  3e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.748926  normal  0.754985 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1083  hypothetical protein  44.67 
 
 		 337 aa  276  5e-73  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.371432  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0200  hypothetical protein  44.79 
 
 		 349 aa  275  7e-73  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4526  twin-arginine translocation pathway signal  46.49 
 
 		 337 aa  275  7e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2114  hypothetical protein  48.1 
 
 		 325 aa  272  5.000000000000001e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00328294 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1912  hypothetical protein  43.71 
 
 		 335 aa  272  6e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3801  extra-cytoplasmic solute receptor  42.72 
 
 		 330 aa  272  6e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.828068  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0843  hypothetical protein  40.99 
 
 		 323 aa  271  9e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0159621  normal  0.161906 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2991  hypothetical protein  46.08 
 
 		 333 aa  271  1e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.36978  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0909  hypothetical protein  46.92 
 
 		 329 aa  271  1e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1197  hypothetical protein  46.86 
 
 		 324 aa  270  2e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0522  hypothetical protein  42.81 
 
 		 324 aa  271  2e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5108  extra-cytoplasmic solute receptor  44.01 
 
 		 326 aa  270  2.9999999999999997e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000000000351886  normal  0.964391 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5896  hypothetical protein  42.9 
 
 		 332 aa  269  4e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.971815  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1868  hypothetical protein  45.4 
 
 		 330 aa  270  4e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3420  hypothetical protein  42.51 
 
 		 320 aa  269  5e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.21089  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5113  extra-cytoplasmic solute receptor  42.72 
 
 		 330 aa  268  8e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000122246  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2765  hypothetical protein  42.95 
 
 		 332 aa  268  8.999999999999999e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.555979  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2753  hypothetical protein  40.19 
 
 		 327 aa  268  8.999999999999999e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0378897 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3624  hypothetical protein  44.48 
 
 		 330 aa  268  1e-70  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.210677  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2537  hypothetical protein  44.16 
 
 		 329 aa  268  1e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2507  hypothetical protein  44.19 
 
 		 336 aa  268  1e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4972  hypothetical protein  45.15 
 
 		 328 aa  268  1e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.345918  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0835  hypothetical protein  42.17 
 
 		 351 aa  267  1e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0180096  normal  0.0225936 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3406  hypothetical protein  45.43 
 
 		 322 aa  267  2e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.88077 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4229  twin-arginine translocation pathway signal  43.29 
 
 		 335 aa  267  2e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.467764  normal  0.364318 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6145  hypothetical protein  42.2 
 
 		 332 aa  266  2.9999999999999995e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.8095  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3145  hypothetical protein  44.88 
 
 		 333 aa  266  2.9999999999999995e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.261814  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0250  hypothetical protein  43.96 
 
 		 319 aa  266  4e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4610  hypothetical protein  41.01 
 
 		 322 aa  266  4e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0432088  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0257  hypothetical protein  44.67 
 
 		 334 aa  266  4e-70  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0797  hypothetical protein  45.12 
 
 		 386 aa  266  5e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5894  extra-cytoplasmic solute receptor  43.65 
 
 		 358 aa  266  5e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>