134 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_1441 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_1441  phosphodiesterase, MJ0936 family  100 
 
 		 150 aa  290  5e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0531917  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03300  phosphoesterase protein  58 
 
 		 151 aa  170  5.999999999999999e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.620314  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4206  phosphodiesterase  58 
 
 		 152 aa  169  1e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0444  hypothetical protein  56.67 
 
 		 157 aa  168  3e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04590  hypothetical protein  56 
 
 		 157 aa  167  5e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1020  phosphoesterase, putative  58.9 
 
 		 159 aa  164  5e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.417574  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2626  phosphodiesterase, MJ0936 family  57.64 
 
 		 162 aa  162  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.655099 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1492  phosphodiesterase  57.72 
 
 		 160 aa  161  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.953223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1508  hypothetical protein  56.25 
 
 		 162 aa  161  4.0000000000000004e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.192529 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2402  hypothetical protein  52 
 
 		 155 aa  153  9e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00855962 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2127  phosphodiesterase  50.67 
 
 		 152 aa  150  4e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.214713 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2610  phosphoesterase, putative  54 
 
 		 152 aa  150  5e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0330277  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2350  hypothetical protein  52.67 
 
 		 152 aa  148  2e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.24559 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1164  putative phosphodiesterase (yfcE)  52.63 
 
 		 154 aa  147  4e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0324  phosphodiesterase  51.33 
 
 		 152 aa  135  2e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00874535  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1000  hypothetical protein  45.7 
 
 		 153 aa  129  1.0000000000000001e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0102337 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2317  phosphodiesterase  48.1 
 
 		 174 aa  127  4.0000000000000003e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.179128  normal  0.0832015 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1529  hypothetical protein  48.68 
 
 		 154 aa  126  9.000000000000001e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.145823  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2256  phosphodiesterase  42.14 
 
 		 153 aa  125  2.0000000000000002e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2449  phosphodiesterase, MJ0936 family  44.94 
 
 		 173 aa  122  1e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1506  hypothetical protein  44.94 
 
 		 173 aa  122  2e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2361  phosphodiesterase, MJ0936 family  44.94 
 
 		 173 aa  121  3e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0202207  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2580  phosphodiesterase  35.9 
 
 		 161 aa  82.4  0.000000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1510  phosphodiesterase, MJ0936 family  38.99 
 
 		 159 aa  82  0.000000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1322  phosphodiesterase, MJ0936 family  33.97 
 
 		 165 aa  80.1  0.000000000000009  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0695947  normal  0.0513289 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03780  phosphoesterase, MJ0936 family  39.44 
 
 		 157 aa  79.3  0.00000000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00356209  normal  0.195847 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0395  phosphodiesterase, MJ0936 family  37.2 
 
 		 176 aa  78.2  0.00000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3064  phosphodiesterase, MJ0936 family  41.45 
 
 		 196 aa  77.8  0.00000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.109166  normal  0.620123 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0289  phosphodiesterase, MJ0936 family  33.33 
 
 		 170 aa  76.3  0.0000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2607  phosphodiesterase  39.26 
 
 		 168 aa  74.7  0.0000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000199018  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0059  hypothetical protein  37.5 
 
 		 160 aa  73.9  0.0000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03670  hypothetical protein  62.07 
 
 		 86 aa  72  0.000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19410  phosphoesterase, MJ0936 family  34.76 
 
 		 195 aa  72  0.000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000114035 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1638  phosphodiesterase, MJ0936 family  30.91 
 
 		 165 aa  72  0.000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0186  phosphodiesterase  32.91 
 
 		 179 aa  69.7  0.00000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1311  hypothetical protein  30.67 
 
 		 188 aa  68.9  0.00000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0825  phosphodiesterase, MJ0936 family  33.54 
 
 		 167 aa  68.2  0.00000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3036  phosphodiesterase, MJ0936 family  27.85 
 
 		 164 aa  65.5  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03090  phosphodiesterase, MJ0936 family  27.85 
 
 		 160 aa  65.5  0.0000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2672  hypothetical protein  26.99 
 
 		 166 aa  64.3  0.0000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3000  phosphodiesterase, MJ0936 family  27.27 
 
 		 163 aa  63.9  0.0000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.898077  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1389  phosphodiesterase  30.36 
 
 		 178 aa  63.9  0.0000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0456  phosphodiesterase  30.86 
 
 		 181 aa  63.9  0.0000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2971  metallophosphoesterase  34.59 
 
 		 163 aa  62.8  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2035  hypothetical protein  30 
 
 		 186 aa  63.2  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.14713  normal  0.52791 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2013  phosphodiesterase, MJ0936 family  28.57 
 
 		 163 aa  62.4  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.995963  normal  0.0956817 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4666  phosphodiesterase  26.11 
 
 		 178 aa  61.6  0.000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1360  hypothetical protein  30.63 
 
 		 176 aa  61.2  0.000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.021826  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0338  phosphodiesterase, MJ0936 family  33.12 
 
 		 175 aa  61.2  0.000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1836  phosphodiesterase, MJ0936 family  32.64 
 
 		 170 aa  61.2  0.000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1793  phosphodiesterase, MJ0936 family  33.08 
 
 		 172 aa  60.5  0.000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.696685  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1628  phosphodiesterase  30.77 
 
 		 190 aa  60.1  0.00000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0076  phosphodiesterase  27.5 
 
 		 163 aa  59.7  0.00000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1322  phosphodiesterase, MJ0936 family  28.79 
 
 		 167 aa  59.3  0.00000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.473634  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0028  phosphodiesterase, MJ0936 family  34.03 
 
 		 182 aa  58.9  0.00000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.54449  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13528  hypothetical protein  25.32 
 
 		 163 aa  58.9  0.00000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0329  phosphodiesterase, MJ0936 family  31.21 
 
 		 172 aa  58.5  0.00000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0779553  normal  0.0229363 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3620  phosphodiesterase, MJ0936 family  30.86 
 
 		 162 aa  57.8  0.00000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.626533  normal  0.471048 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1357  hypothetical protein  26.95 
 
 		 173 aa  57.4  0.00000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1346  phosphodiesterase, MJ0936 family  33.58 
 
 		 167 aa  56.2  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00939202  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0745  phosphodiesterase  27.16 
 
 		 163 aa  56.6  0.0000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.751272  normal  0.75862 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1477  phosphodiesterase  32.86 
 
 		 148 aa  56.6  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1850  phosphodiesterase, MJ0936 family  35.71 
 
 		 164 aa  55.5  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.447532 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5609  phosphodiesterase  33.09 
 
 		 168 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.749126  normal  0.532509 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03671  hypothetical protein  52.73 
 
 		 64 aa  55.5  0.0000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2380  phosphodiesterase, MJ0936 family  29.58 
 
 		 171 aa  55.1  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.871136 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0919  phosphodiesterase  31.33 
 
 		 188 aa  54.3  0.0000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000234313  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0370  phosphodiesterase  30.22 
 
 		 164 aa  54.3  0.0000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000132589  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02370  phosphoesterase, MJ0936 family  31.85 
 
 		 178 aa  53.1  0.000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.569795  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1503  phosphoesterase  29.17 
 
 		 168 aa  52.4  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  9.802300000000002e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0810  phosphodiesterase  26.38 
 
 		 164 aa  52.8  0.000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1287  phosphodiesterase  28.14 
 
 		 168 aa  52.4  0.000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1173  phosphodiesterase  25.15 
 
 		 163 aa  52.8  0.000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.111939  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2058  phosphodiesterase, MJ0936 family  31.76 
 
 		 168 aa  52  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000252538 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0852  phosphodiesterase, MJ0936 family  30.13 
 
 		 163 aa  52  0.000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0170  hypothetical protein  30.83 
 
 		 173 aa  51.2  0.000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4978  hypothetical protein  32.14 
 
 		 172 aa  51.6  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.703942  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5066  phosphodiesterase  32.14 
 
 		 172 aa  51.6  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5359  phosphodiesterase  32.14 
 
 		 172 aa  51.6  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1231  phosphodiesterase  31.65 
 
 		 173 aa  51.2  0.000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.234159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0738  phosphodiesterase  24.84 
 
 		 181 aa  50.8  0.000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1240  phosphodiesterase  28.98 
 
 		 184 aa  50.8  0.000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1198  phosphodiesterase  31.21 
 
 		 182 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.244677  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1112  phosphodiesterase  30.83 
 
 		 188 aa  49.7  0.00001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.279035  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0553  phosphodiesterase  26.28 
 
 		 166 aa  49.3  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.279938  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1420  phosphodiesterase, MJ0936 family  33.09 
 
 		 181 aa  48.5  0.00003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.856818  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1380  phosphodiesterase  23.57 
 
 		 171 aa  48.5  0.00003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3565  phosphodiesterase, MJ0936 family  34.27 
 
 		 169 aa  48.1  0.00004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7192  phosphodiesterase, MJ0936 family  30.34 
 
 		 167 aa  48.1  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1749  hypothetical protein  29.68 
 
 		 160 aa  47.8  0.00005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.116925 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1431  phosphodiesterase  30 
 
 		 165 aa  47.8  0.00005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1245  phosphodiesterase  27.14 
 
 		 171 aa  47.8  0.00005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1391  phosphodiesterase  27.14 
 
 		 171 aa  47  0.0001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0641  phosphodiesterase  29.93 
 
 		 185 aa  46.6  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.558734  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0839  phosphodiesterase, MJ0936 family  26.85 
 
 		 158 aa  46.6  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0437301  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0201  phosphodiesterase  31.84 
 
 		 168 aa  46.2  0.0002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.605154  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0517  phosphodiesterase  27.14 
 
 		 171 aa  46.2  0.0002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.745546  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0530  phosphodiesterase, MJ0936 family  31.11 
 
 		 162 aa  45.1  0.0004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0345  phosphodiesterase, MJ0936 family  28.89 
 
 		 162 aa  43.9  0.0007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.24583 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1550  phosphodiesterase  27.34 
 
 		 180 aa  43.9  0.0007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>