More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_0767 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012791  Vapar_0767  glycosyl transferase family 2  100 
 
 
602 aa  1219  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3926  glycosyl transferase family protein  43.35 
 
 
1509 aa  520  1e-146  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.554209  normal  0.869546 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0396  glycosyl transferase family protein  48.5 
 
 
625 aa  510  1e-143  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0878  glycosyl transferase family protein  48.5 
 
 
625 aa  510  1e-143  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2296  glycosyl transferase family protein  47.08 
 
 
632 aa  499  1e-140  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.870587  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0849  glycosyl transferase family protein  48.85 
 
 
625 aa  495  1e-139  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.33844 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1074  glycosyl transferase, group 2 family protein  41.98 
 
 
1561 aa  491  1e-137  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.755532  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1492  glycosyl transferase family 2  45.92 
 
 
958 aa  426  1e-118  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0883  glycosyl transferase family 2  39.27 
 
 
723 aa  421  1e-116  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00968  putative glycosyltransferase family 2 protein  43.39 
 
 
731 aa  413  1e-114  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3973  glycosyl transferase family protein  48.86 
 
 
1275 aa  410  1e-113  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1503  glycosyl transferase family 2  45.03 
 
 
733 aa  405  1e-111  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0354  glycosyl transferase family protein  38.99 
 
 
658 aa  403  1e-111  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0288  glycosyl transferase family protein  45.49 
 
 
709 aa  394  1e-108  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0772  glycosyl transferase family protein  45.49 
 
 
709 aa  394  1e-108  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0620  glycosyl transferase, group 2 family protein  46.41 
 
 
610 aa  385  1e-105  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2707  glycosyl transferase family protein  40.7 
 
 
1486 aa  348  1e-94  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.228337 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0852  glycosyl transferase family protein  40.18 
 
 
765 aa  347  4e-94  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1576  glycosyl transferase family 2  38.51 
 
 
746 aa  340  6e-92  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2408  glycosyl transferase family 2  35.43 
 
 
1334 aa  328  2e-88  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0315  glycosyl transferase family protein  43.95 
 
 
775 aa  325  1e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.177291 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1948  glycosyl transferase family 2  38.93 
 
 
721 aa  321  3e-86  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2225  glycosyl transferase family 2  37.81 
 
 
717 aa  320  3e-86  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.432582 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0933  glycosyl transferase family 2  37.31 
 
 
1152 aa  320  4e-86  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1949  glycosyl transferase family protein  38 
 
 
717 aa  320  5e-86  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.603088  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0906  glycosyl transferase family 2  37.31 
 
 
1152 aa  320  5e-86  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1840  glycosyl transferase family 2  38.04 
 
 
710 aa  318  2e-85  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0202284  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3207  glycosyl transferase family protein  41.16 
 
 
576 aa  315  1e-84  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0775  glycosyl transferase family 2  40.22 
 
 
617 aa  310  4e-83  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2042  glycosyl transferase family 2  40.27 
 
 
832 aa  308  1e-82  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.635088  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1253  glycosyl transferase family 2  37.28 
 
 
1067 aa  308  2e-82  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1792  glycosyl transferase, group 2 family protein  39.17 
 
 
809 aa  306  6e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0102114 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0929  glycosyl transferase family protein  42.52 
 
 
796 aa  305  2e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.283533 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4407  glycosyl transferase family protein  38.95 
 
 
1359 aa  303  7e-81  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1401  glycosyl transferase family protein  41.26 
 
 
808 aa  301  3e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4005  glycosyl transferase family 2  37.25 
 
 
790 aa  300  5e-80  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.318857  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1729  glycosyl transferase family protein  41.12 
 
 
728 aa  296  1e-78  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.95068 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2921  glycosyl transferase family protein  40.53 
 
 
880 aa  294  3e-78  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1841  glycosyl transferase family 2  41.77 
 
 
652 aa  294  4e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.333459  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0589  glycosyl transferase family protein  40.14 
 
 
684 aa  288  3e-76  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.271762  normal  0.0559054 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2836  glycosyl transferase family protein  40.34 
 
 
1759 aa  285  1e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0244809 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2052  glycosyl transferase family 2  36.67 
 
 
794 aa  285  1e-75  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.039975  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0729  glycosyl transferase family protein  37.35 
 
 
586 aa  284  4e-75  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.155064  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2999  glycosyl transferase family 2  38.07 
 
 
988 aa  281  2e-74  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1360  glycosyl transferase, group 1  35.33 
 
 
1991 aa  281  3e-74  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.976549  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3489  glycosyl transferase family protein  41.13 
 
 
635 aa  277  3e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.473052  normal  0.0475235 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1842  glycosyl transferase family 2  38.16 
 
 
531 aa  276  1e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3223  glycosyl transferase family protein  39.57 
 
 
729 aa  275  2e-72  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0564  glycosyl transferase family 2  40.45 
 
 
670 aa  274  3e-72  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.501276 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4883  glycosyl transferase family protein  38.78 
 
 
653 aa  273  5e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.830469  normal  0.0228705 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2613  glycosyl transferase family protein  43.94 
 
 
556 aa  271  3e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0402  methyltransferase FkbM  37.04 
 
 
1644 aa  271  4e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0882  FkbM family methyltransferase  37.04 
 
 
1644 aa  270  4e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1062  glycosyl transferase family protein  35.34 
 
 
783 aa  270  4e-71  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0600  glycosyl transferase family 2  40.41 
 
 
684 aa  269  9e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.149205 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1495  glycosyltransferase protein  36.23 
 
 
632 aa  268  3e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.403758  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0588  glycosyl transferase family protein  38.57 
 
 
551 aa  261  4e-68  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.231059  normal  0.109318 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0192  glycosyl transferase family protein  35.53 
 
 
996 aa  259  1e-67  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1525  glycosyl transferase family 2  36.76 
 
 
857 aa  255  2e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0599  glycosyl transferase family 2  39.07 
 
 
551 aa  254  3e-66  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.144427 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3488  glycosyl transferase family protein  38.94 
 
 
539 aa  254  3e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0396544 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4882  glycosyl transferase family protein  38.75 
 
 
526 aa  253  5e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.763618  normal  0.0207356 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2009  glycosyl transferase  33.11 
 
 
810 aa  253  7e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0548  glycosyl transferase family protein  36.77 
 
 
784 aa  252  1e-65  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0563  glycosyl transferase family 2  37.85 
 
 
555 aa  252  2e-65  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.158623 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15980  Glycosyl transferase, family 2  36.06 
 
 
1182 aa  249  9e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.967945  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2719  glycosyl transferase family 2  34.36 
 
 
662 aa  248  2e-64  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4777  glycosyl transferase family 2  35.04 
 
 
742 aa  247  5e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0542  glycosyl transferase family protein  31.27 
 
 
983 aa  244  2e-63  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.211097  normal  0.295918 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0725  glycosyl transferase family protein  34.07 
 
 
734 aa  244  3e-63  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.492928  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0769  glycosyl transferase family 2  33.16 
 
 
732 aa  244  4e-63  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.034944 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0804  glycosyl transferase family 2  33.69 
 
 
725 aa  241  3e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.16838 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4626  glycosyl transferase family 2  34.84 
 
 
742 aa  239  8e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.18553  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4260  glycosyl transferase family protein  34.62 
 
 
742 aa  238  2e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.109167  normal  0.249298 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0845  glycosyl transferase family protein  33.22 
 
 
725 aa  238  3e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  decreased coverage  0.00935412  normal  0.295818 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3720  glycosyl transferase family protein  34.03 
 
 
1193 aa  231  2e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1508  glycosyl transferase family protein  35.42 
 
 
1198 aa  229  2e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2886  glycosyl transferase family 2  31.88 
 
 
1213 aa  227  4e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.242978  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0422  glycosyl transferase family protein  34.17 
 
 
1297 aa  224  3e-57  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1815  glycosyl transferase family 2  33.41 
 
 
958 aa  221  3e-56  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.613695  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1946  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.71 
 
 
1191 aa  217  5e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.678208  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2593  glycosyl transferase family protein  33.05 
 
 
1187 aa  217  6e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.842346  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50300  hypothetical protein  34.92 
 
 
1694 aa  215  2e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0552832  decreased coverage  0.000853187 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1971  glycosyl transferase family 2  30.77 
 
 
1084 aa  214  3e-54  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1918  glycosyl transferase, group 2 family protein  34.54 
 
 
1173 aa  211  4e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1555  glycosyl transferase family 2  31.3 
 
 
1188 aa  208  2e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3469  glycosyl transferase family protein  32.4 
 
 
1190 aa  204  3e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.65715  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2650  glycosyl transferase family protein  31.55 
 
 
1177 aa  202  2e-50  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4280  hypothetical protein  33.97 
 
 
1171 aa  201  4e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0236  hypothetical protein  29.44 
 
 
783 aa  199  2e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  7.17832e-06  normal  0.75423 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1482  glycosyl transferase family protein  33.26 
 
 
1162 aa  197  7e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.345967  normal  0.675162 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1517  glycosyl transferase family protein  31.08 
 
 
974 aa  196  8e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.206981  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3468  glycosyl transferase family protein  31.13 
 
 
968 aa  196  9e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06183  O-antigen biosynthesis protein  33.19 
 
 
1165 aa  188  3e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.00444077  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00983  O-antigen biosynthesis protein  33.19 
 
 
1165 aa  188  3e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1479  methyltransferase type 11  29.96 
 
 
2046 aa  186  1e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.604446 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1476  glycosyl transferase family protein  33.7 
 
 
1192 aa  186  1e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.891442 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1947  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.84 
 
 
968 aa  186  2e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1529  glycosyl transferase family 2  40.81 
 
 
748 aa  182  1e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3633  glycosyl transferase, group 1  29.59 
 
 
510 aa  163  9e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.015452  normal  0.125381 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>