230 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_II0083 on replicon NC_011313
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011313  VSAL_II0083  putative permease  100 
 
 		 306 aa  606  9.999999999999999e-173  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2452  putative permease  85.53 
 
 		 304 aa  516  1.0000000000000001e-145  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2516  permease  81.73 
 
 		 316 aa  499  1e-140  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.114382  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1498  permease  81.79 
 
 		 307 aa  497  1e-140  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.562403  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3427  permease  64.08 
 
 		 356 aa  425  1e-118  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000000478015  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1217  permease  66.36 
 
 		 332 aa  422  1e-117  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3823  permease  61.47 
 
 		 358 aa  415  9.999999999999999e-116  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2338  permease  61.19 
 
 		 358 aa  413  1e-114  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.677868  normal  0.0877008 
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08200  permease  63.5 
 
 		 345 aa  399  9.999999999999999e-111  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000119775  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01499  hypothetical protein  64.09 
 
 		 345 aa  395  1e-109  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02580  hypothetical protein  64.09 
 
 		 345 aa  395  1e-109  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0503  hypothetical protein  59.54 
 
 		 358 aa  380  1e-104  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3797  putative permease  51.65 
 
 		 333 aa  317  1e-85  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.236031 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3989  putative permease  53.05 
 
 		 333 aa  315  9e-85  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.531766  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0864  permease  47.42 
 
 		 308 aa  257  2e-67  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.569206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0015  permease  47.95 
 
 		 301 aa  255  7e-67  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.684774  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0820  hypothetical protein  43.19 
 
 		 293 aa  241  1e-62  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05267  hypothetical protein  70.06 
 
 		 378 aa  238  9e-62  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0966  permease  38.89 
 
 		 311 aa  237  2e-61  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000479758  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3596  hypothetical protein  66.87 
 
 		 373 aa  237  2e-61  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0357  permease  43.24 
 
 		 294 aa  221  9.999999999999999e-57  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3859  permease  44.92 
 
 		 300 aa  216  2.9999999999999998e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.210987  normal  0.0366228 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2425  hypothetical protein  38.33 
 
 		 294 aa  210  2e-53  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.395757  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0315  permease  39.33 
 
 		 296 aa  210  2e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2503  permease  36.52 
 
 		 318 aa  207  2e-52  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.523202  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1730  permease, putative  35.48 
 
 		 315 aa  194  1e-48  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.157468  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0665  conserved hypothetical integral membrane protein (DUF318 domain protein)  34.91 
 
 		 324 aa  181  2e-44  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0438  permease  33.45 
 
 		 315 aa  179  7e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1178  permease  31.76 
 
 		 315 aa  176  3e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.330417  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0173  hypothetical protein  35.74 
 
 		 300 aa  176  5e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.589564  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0147  putative permease  48.07 
 
 		 359 aa  176  5e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0289  permease  35.74 
 
 		 300 aa  176  5e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2955  hypothetical protein  35 
 
 		 315 aa  176  6e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2555  permease  34.68 
 
 		 349 aa  172  5e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000127833  hitchhiker  0.00212732 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2023  permease  30.9 
 
 		 350 aa  171  2e-41  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2566  permease  33.56 
 
 		 324 aa  170  3e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.931351 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1875  permease  31.25 
 
 		 315 aa  169  5e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0519  permease  34.77 
 
 		 315 aa  167  1e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4600  permease  31.76 
 
 		 345 aa  163  3e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2640  permease  31.07 
 
 		 323 aa  163  3e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3673  permease  32.76 
 
 		 351 aa  162  9e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0398  hypothetical protein  30.74 
 
 		 344 aa  161  1e-38  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.679708  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2844  permease  30.28 
 
 		 348 aa  157  2e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.693493  normal  0.0127415 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0507  permease  30.79 
 
 		 356 aa  157  3e-37  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3641  permease  31.42 
 
 		 348 aa  157  3e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2181  permease  32.99 
 
 		 319 aa  157  3e-37  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000463978  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0464  permease  29.14 
 
 		 350 aa  156  4e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00000958774  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1117  permease  31.56 
 
 		 352 aa  156  4e-37  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.107708 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3659  permease  31.05 
 
 		 349 aa  156  5.0000000000000005e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1704  hypothetical protein  29.29 
 
 		 341 aa  155  8e-37  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.91407 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2949  permease  32.11 
 
 		 351 aa  154  2e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0110  permease  32.25 
 
 		 321 aa  154  2e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1709  hypothetical protein  30 
 
 		 323 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00218353  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1707  permease  29.35 
 
 		 352 aa  153  2.9999999999999998e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1427  putative permease  29.89 
 
 		 322 aa  152  5.9999999999999996e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1474  permease  31.29 
 
 		 353 aa  152  8.999999999999999e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.614025  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0934  permease  29.81 
 
 		 319 aa  151  1e-35  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00064116  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4202  transporter  28.28 
 
 		 352 aa  151  2e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2565  permease  29.25 
 
 		 338 aa  150  3e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000010966  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0857  permease  33.45 
 
 		 315 aa  150  3e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.398013  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0548  permease  29.47 
 
 		 318 aa  149  6e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000695477  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3942  permease  30.23 
 
 		 354 aa  149  7e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0335  permease  30.03 
 
 		 331 aa  148  9e-35  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.943617  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4062  permease  33.21 
 
 		 377 aa  148  1.0000000000000001e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.78082  normal  0.984142 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3620  permease  30.95 
 
 		 351 aa  147  2.0000000000000003e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3419  permease  30.23 
 
 		 354 aa  147  2.0000000000000003e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0153  hypothetical protein  30.23 
 
 		 323 aa  146  5e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2196  permease  32.66 
 
 		 317 aa  146  5e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000111416  normal  0.407571 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3415  permease  30.03 
 
 		 351 aa  146  5e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.178005  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1645  permease  29.57 
 
 		 350 aa  145  6e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.701842  normal  0.852279 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3722  permease-like  29.67 
 
 		 381 aa  145  9e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1783  permease  32.57 
 
 		 362 aa  143  3e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4283  permease  29.11 
 
 		 337 aa  142  6e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3190  permease  28.34 
 
 		 335 aa  142  6e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1066  permease  30.86 
 
 		 337 aa  142  6e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3647  permease  27.52 
 
 		 364 aa  142  6e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.5727 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2282  permease  28.81 
 
 		 330 aa  142  7e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.954207 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2777  permease-like  29.63 
 
 		 363 aa  142  9.999999999999999e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1092  permease  29.01 
 
 		 337 aa  142  9.999999999999999e-33  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.000361743  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1430  permease  29.24 
 
 		 318 aa  140  1.9999999999999998e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.611447  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0265  permease  28.28 
 
 		 367 aa  141  1.9999999999999998e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.730665  normal  0.803514 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3497  permease  30.6 
 
 		 331 aa  140  3e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0728  permease  29.39 
 
 		 353 aa  140  3e-32  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1299  permease  28.91 
 
 		 338 aa  139  3.9999999999999997e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.201061  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1935  permease  29.09 
 
 		 353 aa  139  4.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1027  transporter  29.09 
 
 		 366 aa  139  6e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0534  permease  29.89 
 
 		 331 aa  139  6e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3357  putative permease  31.27 
 
 		 336 aa  138  1e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.138974  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1870  permease  29.55 
 
 		 319 aa  138  1e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.788351  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1089  permease  29.39 
 
 		 366 aa  138  1e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2048  permease  27.81 
 
 		 336 aa  138  1e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0492  permease  29.35 
 
 		 331 aa  138  1e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0049  permease  29.89 
 
 		 353 aa  137  2e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3776  permease  28.99 
 
 		 331 aa  137  2e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3958  permease  28.99 
 
 		 331 aa  137  2e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3832  permease  28.99 
 
 		 331 aa  137  2e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0535  hypothetical protein  29.35 
 
 		 331 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1725  permease  28.24 
 
 		 337 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0731  permease  29.63 
 
 		 337 aa  134  9.999999999999999e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000000936228  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1828  permease  28.93 
 
 		 330 aa  133  3e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.22223  normal  0.735803 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>