More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I1756 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011312  VSAL_I1756  hemin importer ATP-binding subunit  100 
 
 		 260 aa  536  1e-151  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00991527  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001350  ABC-type hemin transport system ATPase component  59 
 
 		 260 aa  326  2.0000000000000001e-88  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000143522  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05239  hemin importer ATP-binding subunit  57.48 
 
 		 260 aa  315  5e-85  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0322  hemin importer ATP-binding subunit  56.81 
 
 		 259 aa  306  2.0000000000000002e-82  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00006173  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3333  hemin importer ATP-binding subunit  48.05 
 
 		 268 aa  244  9e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0946  hemin importer ATP-binding subunit  48.24 
 
 		 288 aa  231  9e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0960  hemin importer ATP-binding subunit  48.29 
 
 		 274 aa  231  1e-59  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3675  hemin importer ATP-binding subunit  48.24 
 
 		 272 aa  229  2e-59  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1048  hemin importer ATP-binding subunit  48.24 
 
 		 288 aa  230  2e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.540282 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3344  hemin importer ATP-binding subunit  47.84 
 
 		 290 aa  229  3e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.559601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1015  hemin importer ATP-binding subunit  47.84 
 
 		 288 aa  229  4e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0784  hemin importer ATP-binding subunit  48.26 
 
 		 254 aa  222  4.9999999999999996e-57  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3241  hemin importer ATP-binding subunit  47.04 
 
 		 272 aa  219  3e-56  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4685  hemin importer ATP-binding subunit  45.19 
 
 		 255 aa  215  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000508332  hitchhiker  0.00000000000000885497 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4551  hemin importer ATP-binding subunit  44.73 
 
 		 255 aa  210  1e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00000433574  decreased coverage  0.0000000113958 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0747  hemin importer ATP-binding subunit  45.15 
 
 		 255 aa  209  4e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000209221  decreased coverage  0.000000000000929505 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4798  hemin importer ATP-binding subunit  44.27 
 
 		 255 aa  209  4e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000262531  hitchhiker  0.00143182 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4687  hemin importer ATP-binding subunit  43.85 
 
 		 255 aa  208  9e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.687839  hitchhiker  0.000215024 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4010  hemin importer ATP-binding subunit  44.66 
 
 		 254 aa  207  9e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.240186 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5422  hemin importer ATP-binding subunit  43.53 
 
 		 255 aa  207  1e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0457387  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62280  hemin importer ATP-binding subunit  43.53 
 
 		 255 aa  207  1e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000951345  normal  0.390973 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2736  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (hemin)  42.42 
 
 		 262 aa  202  3e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42590  hemin importer ATP-binding subunit  42.13 
 
 		 255 aa  200  1.9999999999999998e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00288273  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0126  hemin importer ATP-binding subunit  41.7 
 
 		 277 aa  194  1e-48  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.27999  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1933  ABC transporter related  41.8 
 
 		 272 aa  194  2e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0373  ABC transporter related protein  39.62 
 
 		 293 aa  192  6e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0995  hemin importer ATP-binding subunit  44.58 
 
 		 255 aa  191  7e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000453335  hitchhiker  0.0000000000000146988 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2462  hemin importer ATP-binding subunit  42.52 
 
 		 265 aa  191  1e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.902212  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2764  hemin importer ATP-binding subunit  40.7 
 
 		 265 aa  184  9e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3805  hemin importer ATP-binding subunit  41.73 
 
 		 266 aa  184  2.0000000000000003e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0646  hemin importer ATP-binding subunit  41.73 
 
 		 266 aa  184  2.0000000000000003e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.370261 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3893  hemin importer ATP-binding subunit  41.73 
 
 		 266 aa  184  2.0000000000000003e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3618  hemin importer ATP-binding subunit  37.65 
 
 		 267 aa  179  2.9999999999999997e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.740254  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1607  ABC transporter related  38.31 
 
 		 269 aa  178  1e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000477386 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3877  ABC transporter related  42.25 
 
 		 266 aa  176  3e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0419238 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2165  hemin importer ATP-binding subunit  39.69 
 
 		 261 aa  176  4e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.203707  normal  0.489491 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1391  ABC transporter related protein  40.78 
 
 		 272 aa  175  6e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0444923 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3308  ABC transporter related  42.29 
 
 		 271 aa  174  9.999999999999999e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.069398  hitchhiker  0.00117724 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2384  hemin importer ATP-binding subunit  39.84 
 
 		 284 aa  174  9.999999999999999e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.258955  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1943  ABC transporter related  38.04 
 
 		 253 aa  174  9.999999999999999e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.82055  normal  0.0334831 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3537  ABC transporter related  37.4 
 
 		 264 aa  174  9.999999999999999e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.878481 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2341  hemin importer ATP-binding subunit  36.22 
 
 		 262 aa  173  1.9999999999999998e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0724766  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0571  hemin importer ATP-binding subunit  37.2 
 
 		 260 aa  173  2.9999999999999996e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.479313  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4205  hemin importer ATP-binding subunit  37.15 
 
 		 257 aa  173  2.9999999999999996e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.322573  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6719  ABC transporter related  39.92 
 
 		 259 aa  172  3.9999999999999995e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.000596509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3564  ABC transporter related  40.94 
 
 		 274 aa  171  1e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4590  ABC transporter related  39.29 
 
 		 274 aa  170  2e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.983683  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2832  hemin importer ATP-binding subunit  40.08 
 
 		 264 aa  169  3e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4194  ABC transporter related  38.71 
 
 		 258 aa  168  6e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.089861  normal  0.298969 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4866  hemin importer ATP-binding subunit  38.74 
 
 		 256 aa  168  8e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.578744 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2322  hemin importer ATP-binding subunit  36.59 
 
 		 269 aa  167  1e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0161777  normal  0.765117 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3809  hemin importer ATP-binding subunit  38.74 
 
 		 266 aa  167  1e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0346315 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2136  hemin importer ATP-binding subunit  37.8 
 
 		 270 aa  167  1e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.740786  normal  0.620791 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5378  hemin importer ATP-binding subunit  39.68 
 
 		 261 aa  167  1e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.124371  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4373  ABC transporter related  40.78 
 
 		 271 aa  167  2e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.567007  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5816  ABC transporter related  37.31 
 
 		 259 aa  167  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0864104 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2440  ABC transporter-like protein  37.1 
 
 		 270 aa  166  2.9999999999999998e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0118809  normal  0.497052 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1967  hemin importer ATP-binding subunit  37.55 
 
 		 269 aa  166  5e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1564  ABC transporter related protein  38 
 
 		 259 aa  165  5e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.575357  normal  0.641346 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1737  hemin importer ATP-binding subunit  38.58 
 
 		 259 aa  165  8e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.183409 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0851  ABC transporter related  39.61 
 
 		 265 aa  165  8e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.317375  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0168  hemin importer ATP-binding subunit  36.29 
 
 		 262 aa  164  9e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2830  ABC transporter-like  39.06 
 
 		 268 aa  164  1.0000000000000001e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.652667  normal  0.515297 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0180  ABC transporter related  42.06 
 
 		 260 aa  164  1.0000000000000001e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.425432  normal  0.0680318 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2166  ABC transporter related protein  39.92 
 
 		 253 aa  164  1.0000000000000001e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.13025  normal  0.348663 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0455  hemin importer ATP-binding subunit  35.94 
 
 		 264 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.341265  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7222  ABC transporter related  36.36 
 
 		 282 aa  163  3e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3756  ABC transporter related protein  37.5 
 
 		 274 aa  163  3e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.681155  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09850  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  40.4 
 
 		 308 aa  162  6e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0480584  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3202  ABC transporter related  35.48 
 
 		 405 aa  162  6e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2708  ABC transporter related  38.26 
 
 		 257 aa  162  7e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0086  ABC transporter related  35.68 
 
 		 255 aa  161  9e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0971  iron-dicitrate transporter ATP-binding subunit  38.19 
 
 		 255 aa  161  1e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.51617  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8245  ABC transporter related  36.51 
 
 		 271 aa  160  2e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.475817  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2761  ABC transporter related protein  37.8 
 
 		 292 aa  159  3e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.503989  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0153  ABC transporter-like  37.35 
 
 		 260 aa  159  5e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1437  ABC Fe+3 hydroxamate (ferrichrome) transporter, ATPase subunit  36.67 
 
 		 255 aa  159  5e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2348  hemin importer ATP-binding subunit  34.44 
 
 		 261 aa  159  5e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00837343  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4776  hemin importer ATP-binding subunit  39.76 
 
 		 273 aa  159  5e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.633447  normal  0.666848 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2739  ABC transporter related  34.73 
 
 		 269 aa  159  5e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5319  hemin importer ATP-binding subunit  38.52 
 
 		 276 aa  158  7e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1378  hypothetical protein  36.82 
 
 		 409 aa  158  8e-38  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00009791  normal  0.0246408 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6474  ABC transporter related  36.47 
 
 		 269 aa  158  9e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.820871  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0217  hemin importer ATP-binding subunit  38.98 
 
 		 273 aa  157  1e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3140  ABC transporter related  37.07 
 
 		 269 aa  158  1e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00364263  normal  0.0746509 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3272  hemin importer ATP-binding subunit  36.15 
 
 		 264 aa  157  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00219245 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0343  hemin importer ATP-binding subunit  38.75 
 
 		 260 aa  157  2e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1829  ABC transporter related  34.88 
 
 		 257 aa  157  2e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.336355  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1301  ABC transporter-related protein  37.97 
 
 		 261 aa  156  3e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5427  hemin importer ATP-binding subunit  37.74 
 
 		 276 aa  156  4e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.394038  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4834  hemin importer ATP-binding subunit  37.74 
 
 		 276 aa  156  4e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5435  hemin importer ATP-binding subunit  37.74 
 
 		 276 aa  156  4e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.385416  normal  0.778137 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0180  ABC transporter related  36.78 
 
 		 258 aa  155  5.0000000000000005e-37  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1545  ABC transporter, ATPase subunit  40.36 
 
 		 268 aa  155  5.0000000000000005e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1444  hemin importer ATP-binding subunit  37.65 
 
 		 263 aa  155  6e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.326637  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3334  hemin importer ATP-binding subunit  37.93 
 
 		 280 aa  155  8e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.319448  hitchhiker  0.00127806 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2409  hemin importer ATP-binding subunit  35.68 
 
 		 268 aa  154  1e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.128742  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3476  ABC transporter related  37.15 
 
 		 260 aa  154  1e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2875  hemin importer ATP-binding subunit  37.89 
 
 		 272 aa  154  1e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.971494  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2062  ABC transporter-related protein  33.07 
 
 		 266 aa  153  2e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000277516  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>