More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_1653 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009486  Tpet_1653  histidyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 420 aa  859    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.52822  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1726  histidyl-tRNA synthetase  93.81 
 
 		 420 aa  815    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0744  histidyl-tRNA synthetase  59.41 
 
 		 419 aa  506  9.999999999999999e-143  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.100604  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1453  histidyl-tRNA synthetase  56.46 
 
 		 421 aa  499  1e-140  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1804  histidyl-tRNA synthetase  50.96 
 
 		 421 aa  453  1.0000000000000001e-126  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000951278  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12150  histidyl-tRNA synthetase  50.86 
 
 		 419 aa  421  1e-116  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000175223  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3119  histidyl-tRNA synthetase  49.05 
 
 		 423 aa  415  1e-114  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0109936  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4486  histidyl-tRNA synthetase  48.34 
 
 		 423 aa  409  1e-113  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.451544  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0756  histidyl-tRNA synthetase  46.3 
 
 		 419 aa  408  1e-113  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000330653  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4536  histidyl-tRNA synthetase  48.34 
 
 		 423 aa  409  1e-113  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000118978  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4250  histidyl-tRNA synthetase  48.34 
 
 		 423 aa  410  1e-113  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000611517  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4298  histidyl-tRNA synthetase  47.87 
 
 		 423 aa  406  1.0000000000000001e-112  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.408041  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4136  histidyl-tRNA synthetase  47.87 
 
 		 423 aa  406  1.0000000000000001e-112  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4146  histidyl-tRNA synthetase  47.87 
 
 		 423 aa  406  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0483726  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4483  histidyl-tRNA synthetase  47.87 
 
 		 423 aa  406  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6071e-17 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4633  histidyl-tRNA synthetase  47.87 
 
 		 423 aa  406  1.0000000000000001e-112  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.4414  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0713  histidyl-tRNA synthetase  47.87 
 
 		 423 aa  406  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00404453  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1677  histidyl-tRNA synthetase  50.24 
 
 		 423 aa  405  1.0000000000000001e-112  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0038851 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2507  histidyl-tRNA synthetase  49.17 
 
 		 423 aa  408  1.0000000000000001e-112  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000231867  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4523  histidyl-tRNA synthetase  47.87 
 
 		 423 aa  406  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.845471  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3587  histidyl-tRNA synthetase  48.42 
 
 		 424 aa  399  9.999999999999999e-111  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000170234  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1472  histidyl-tRNA synthetase  47.97 
 
 		 418 aa  398  1e-109  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000135965  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0944  histidyl-tRNA synthetase  47.29 
 
 		 426 aa  396  1e-109  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2280  histidyl-tRNA synthetase  44.58 
 
 		 419 aa  384  1e-105  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000301062  unclonable  0.000000000414505 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0592  histidyl-tRNA synthetase  45.13 
 
 		 421 aa  383  1e-105  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000556243  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3096  histidyl-tRNA synthetase  44.74 
 
 		 416 aa  381  1e-104  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000698115  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1332  histidyl-tRNA synthetase  44.42 
 
 		 417 aa  380  1e-104  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000373388  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1166  histidyl-tRNA synthetase  45.32 
 
 		 416 aa  381  1e-104  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000433915 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0552  histidyl-tRNA synthetase  45.8 
 
 		 417 aa  379  1e-104  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0905  histidyl-tRNA synthetase  45.73 
 
 		 420 aa  377  1e-103  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0006  histidyl-tRNA synthetase  45.71 
 
 		 418 aa  378  1e-103  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3303  histidyl-tRNA synthetase  46.38 
 
 		 421 aa  378  1e-103  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.375458 
 
 
-
 
NC_002936  DET0006  histidyl-tRNA synthetase  45.8 
 
 		 418 aa  373  1e-102  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.14648  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1291  histidyl-tRNA synthetase  44.72 
 
 		 421 aa  374  1e-102  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0371866  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1041  histidyl-tRNA synthetase  42.93 
 
 		 419 aa  372  1e-102  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000286548  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1887  histidyl-tRNA synthetase  44.15 
 
 		 415 aa  375  1e-102  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_6  histidyl-tRNA synthetase  46.04 
 
 		 418 aa  373  1e-102  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1674  histidyl-tRNA synthetase  45.71 
 
 		 429 aa  370  1e-101  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2038  histidyl-tRNA synthetase  44.89 
 
 		 420 aa  368  1e-101  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.292734  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1193  histidyl-tRNA synthetase  44.87 
 
 		 424 aa  367  1e-100  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000346938  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2838  histidyl-tRNA synthetase  43.73 
 
 		 417 aa  365  1e-100  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1913  histidyl-tRNA synthetase  44.89 
 
 		 413 aa  367  1e-100  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.282682  hitchhiker  0.000195117 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1761  histidyl-tRNA synthetase  43.84 
 
 		 419 aa  368  1e-100  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.210094  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1184  histidyl-tRNA synthetase  46.86 
 
 		 429 aa  366  1e-100  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1211  histidyl-tRNA synthetase  46.86 
 
 		 429 aa  367  1e-100  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0811  histidine--tRNA ligase  44.71 
 
 		 422 aa  367  1e-100  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000276292  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3590  histidyl-tRNA synthetase  46.1 
 
 		 400 aa  367  1e-100  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0011  histidyl-tRNA synthetase  43.3 
 
 		 417 aa  365  1e-99  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1659  histidyl-tRNA synthetase  42.86 
 
 		 413 aa  362  8e-99  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0302823  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1900  histidyl-tRNA synthetase  46.04 
 
 		 415 aa  360  2e-98  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2189  histidyl-tRNA synthetase  46.04 
 
 		 415 aa  360  3e-98  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2037  histidyl-tRNA synthetase  43.31 
 
 		 426 aa  358  9e-98  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1381  histidyl-tRNA synthetase  43.84 
 
 		 414 aa  356  5e-97  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.158923  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1257  histidyl-tRNA synthetase  46.6 
 
 		 429 aa  351  1e-95  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0737867  normal  0.65795 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2263  histidyl-tRNA synthetase  43.24 
 
 		 435 aa  350  4e-95  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.383817 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0969  histidyl-tRNA synthetase  46.25 
 
 		 411 aa  349  4e-95  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0491418  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0013  histidyl-tRNA synthetase  44.44 
 
 		 419 aa  348  9e-95  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1619  histidyl-tRNA synthetase  43.29 
 
 		 436 aa  348  9e-95  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0027  histidyl-tRNA synthetase  43.1 
 
 		 417 aa  346  4e-94  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.583474  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1136  histidyl-tRNA synthetase  43.91 
 
 		 414 aa  346  5e-94  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.850642  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1205  histidyl-tRNA synthetase  43.26 
 
 		 441 aa  345  8e-94  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.105107  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004348  histidyl-tRNA synthetase  46.13 
 
 		 422 aa  343  2.9999999999999997e-93  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0581  histidyl-tRNA synthetase  42.58 
 
 		 423 aa  343  2.9999999999999997e-93  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000550057  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5012  histidyl-tRNA synthetase  46.48 
 
 		 430 aa  343  2.9999999999999997e-93  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1721  histidyl-tRNA synthetase  44.66 
 
 		 420 aa  342  5e-93  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000299078  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1688  histidyl-tRNA synthetase  44.66 
 
 		 420 aa  342  5e-93  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0106909  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0385  histidyl-tRNA synthetase  43.03 
 
 		 410 aa  342  5.999999999999999e-93  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000994086 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0564  histidyl-tRNA synthetase  47.39 
 
 		 406 aa  342  8e-93  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01068  histidyl-tRNA synthetase  45.66 
 
 		 422 aa  342  8e-93  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0669  histidyl-tRNA synthetase  42.64 
 
 		 423 aa  341  1e-92  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000705937  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0902  histidyl-tRNA synthetase, class IIA  43.41 
 
 		 423 aa  338  9e-92  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.717157  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2228  histidyl-tRNA synthetase  42.4 
 
 		 430 aa  336  5e-91  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2890  histidyl-tRNA synthetase  43.41 
 
 		 424 aa  335  5.999999999999999e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.112536  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2716  histidyl-tRNA synthetase  43.41 
 
 		 424 aa  335  5.999999999999999e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0485  histidyl-tRNA synthetase  41.81 
 
 		 415 aa  334  2e-90  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2048  Histidine--tRNA ligase  42.55 
 
 		 424 aa  334  2e-90  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.167894  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2673  histidyl-tRNA synthetase  43.41 
 
 		 424 aa  334  2e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2779  histidyl-tRNA synthetase  43.41 
 
 		 424 aa  334  2e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2760  histidyl-tRNA synthetase  43.41 
 
 		 424 aa  334  2e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.580022 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04430  histidyl-tRNA synthetase  41.13 
 
 		 440 aa  332  7.000000000000001e-90  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.693263  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02406  histidyl-tRNA synthetase  43.17 
 
 		 424 aa  332  8e-90  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.820666  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1154  histidyl-tRNA synthetase  43.17 
 
 		 424 aa  332  8e-90  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.708603  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2665  histidyl-tRNA synthetase  43.17 
 
 		 424 aa  332  8e-90  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0415954  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2666  histidyl-tRNA synthetase  43.17 
 
 		 424 aa  332  8e-90  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.557016  normal  0.28458 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1163  histidyl-tRNA synthetase  43.17 
 
 		 424 aa  332  8e-90  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.878668  normal  0.0105907 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0289  histidyl-tRNA synthetase  44.33 
 
 		 422 aa  332  8e-90  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2798  histidyl-tRNA synthetase  43.17 
 
 		 424 aa  332  8e-90  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0241493  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3738  histidyl-tRNA synthetase  43.17 
 
 		 424 aa  332  8e-90  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02368  hypothetical protein  43.17 
 
 		 424 aa  332  8e-90  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.965235  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2889  histidyl-tRNA synthetase  42.93 
 
 		 424 aa  332  9e-90  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.731565  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0009  histidyl-tRNA synthetase  43.83 
 
 		 416 aa  331  2e-89  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0511453  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2313  histidyl-tRNA synthetase  41.15 
 
 		 415 aa  328  9e-89  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.335262 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4600  histidyl-tRNA synthetase  43.57 
 
 		 429 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3809  histidyl-tRNA synthetase  43.47 
 
 		 420 aa  327  2.0000000000000001e-88  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.985695  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0188  histidyl-tRNA synthetase  42.61 
 
 		 445 aa  326  6e-88  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.207705  decreased coverage  0.00812888 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6102  Histidine--tRNA ligase  42.69 
 
 		 421 aa  325  6e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.998614 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0393  histidyl-tRNA synthetase  42.52 
 
 		 429 aa  325  1e-87  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1294  histidyl-tRNA synthetase  43.46 
 
 		 424 aa  325  1e-87  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0417  histidyl-tRNA synthetase  43.46 
 
 		 424 aa  325  1e-87  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00143012 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3608  histidyl-tRNA synthetase  43.46 
 
 		 424 aa  325  1e-87  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.602511 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>