More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_1141 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008698  Tpen_1141  flavin reductase domain-containing protein  100 
 
 
183 aa  364  1e-100  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.494396  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0743  flavin reductase domain protein FMN-binding  37.2 
 
 
185 aa  122  4e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1145  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  43.02 
 
 
197 aa  115  4e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1228  flavin reductase domain-containing protein  32.32 
 
 
192 aa  114  5e-25  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0382  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  44.44 
 
 
160 aa  114  6e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.610168  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1850  hypothetical protein  37.35 
 
 
180 aa  100  8e-21  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.147622 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0986  flavin reductase domain-containing protein  37.34 
 
 
244 aa  100  1e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.354559 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1270  flavin reductase domain-containing protein  37.87 
 
 
181 aa  99.4  3e-20  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.285703  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2040  flavin reductase domain protein FMN-binding  34.42 
 
 
186 aa  99  3e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.228084  hitchhiker  4.89831e-08 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3881  flavin reductase domain-containing protein  28.65 
 
 
209 aa  98.6  4e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2311  flavin reductase domain-containing protein  39.02 
 
 
180 aa  97.4  1e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.833881  hitchhiker  0.000888087 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1226  flavin reductase domain-containing protein  38.92 
 
 
248 aa  95.1  4e-19  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.384707 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2225  flavin reductase domain protein FMN-binding  29.65 
 
 
195 aa  94.4  9e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0359  flavin reductase domain-containing protein  31.4 
 
 
195 aa  90.9  8e-18  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.184245 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0401  flavin reductase domain-containing protein  37.95 
 
 
186 aa  90.9  1e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.181273 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1752  flavin reductase domain-containing protein  36.07 
 
 
152 aa  89.7  2e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.503981  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3444  flavin reductase domain-containing protein  29.88 
 
 
216 aa  90.1  2e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.280033  unclonable  7.09652e-06 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2205  flavin reductase-like, FMN-binding  35.16 
 
 
162 aa  87  1e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.361259  normal  0.347764 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1232  flavin reductase domain protein FMN-binding  29.59 
 
 
215 aa  87  1e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2046  hypothetical protein  33.74 
 
 
194 aa  85.1  5e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.179971  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1399  flavin reductase, putative  29.34 
 
 
192 aa  84.7  6e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0187374  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1661  flavoredoxin  29.34 
 
 
192 aa  84.7  6e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.600705  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1230  flavin reductase domain-containing protein  41.91 
 
 
177 aa  84.3  9e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.407466  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2185  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  34.25 
 
 
189 aa  82  4e-15  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00717772  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1546  flavin reductase domain-containing protein  33.7 
 
 
189 aa  81.6  5e-15  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.917994  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0343  flavin reductase-like, FMN-binding  28.99 
 
 
200 aa  81.3  7e-15  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.37872  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1712  flavin reductase domain-containing protein  33.15 
 
 
189 aa  80.5  1e-14  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.190889  normal  0.0473113 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3970  flavin reductase domain protein FMN-binding  32.75 
 
 
193 aa  80.9  1e-14  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.169391  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4083  flavin reductase domain protein FMN-binding  32.75 
 
 
225 aa  80.1  2e-14  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.575581 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1643  flavin reductase domain-containing protein  33.15 
 
 
189 aa  80.1  2e-14  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01420  hypothetical protein  33.15 
 
 
189 aa  80.1  2e-14  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01432  hypothetical protein  33.15 
 
 
189 aa  80.1  2e-14  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0792  flavin reductase domain-containing protein  34.11 
 
 
149 aa  80.1  2e-14  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2978  flavin reductase-like, FMN-binding  32.04 
 
 
205 aa  78.6  4e-14  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2194  flavin reductase domain-containing protein  32.6 
 
 
189 aa  78.2  6e-14  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0769  flavin reductase domain-containing protein  33.33 
 
 
149 aa  78.2  6e-14  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2072  flavin reductase domain-containing protein  33.71 
 
 
190 aa  78.2  7e-14  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1443  flavin reductase-like, FMN-binding  32.86 
 
 
189 aa  76.6  2e-13  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2210  flavin reductase domain-containing protein  31.61 
 
 
189 aa  76.3  2e-13  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7131  flavin reductase domain protein FMN-binding  31.54 
 
 
194 aa  76.3  3e-13  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0249  putative flavin reductase  31.54 
 
 
195 aa  75.9  3e-13  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.688531  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0347  flavin reductase domain-containing protein  36.43 
 
 
191 aa  75.9  3e-13  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.643208  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0805  flavin reductase-like, FMN-binding  32.84 
 
 
188 aa  75.5  4e-13  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2839  flavin reductase-like, FMN-binding  32.58 
 
 
202 aa  75.1  5e-13  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1253  flavin reductase-like, FMN-binding protein  34.19 
 
 
164 aa  74.7  6e-13  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.516374  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4765  flavin reductase-like, FMN-binding  31.67 
 
 
199 aa  74.7  6e-13  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.119665 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1327  flavin reductase domain protein FMN-binding  34.25 
 
 
192 aa  74.7  7e-13  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.646818  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0980  flavin reductase domain-containing protein  33.13 
 
 
194 aa  74.3  8e-13  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2479  flavin reductase domain protein FMN-binding  28.93 
 
 
186 aa  74.3  9e-13  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.261608 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4078  flavin reductase domain-containing protein  32.43 
 
 
204 aa  74.3  1e-12  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1222  flavin reductase domain protein FMN-binding  30.25 
 
 
215 aa  73.6  1e-12  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.996876  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0078  flavoredoxin  30.6 
 
 
189 aa  73.6  2e-12  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00025705  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1572  flavin reductase domain protein FMN-binding  30.83 
 
 
190 aa  72.4  4e-12  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0520  flavin reductase domain protein FMN-binding  32.56 
 
 
189 aa  70.5  1e-11  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1855  flavin reductase domain-containing protein  29.29 
 
 
186 aa  70.5  1e-11  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.165677  normal  0.56563 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40150  Flavin reductase-like protein  28.39 
 
 
177 aa  70.1  2e-11  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.710187  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2083  flavin reductase-like, FMN-binding  27.44 
 
 
208 aa  70.1  2e-11  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2701  flavin reductase domain protein FMN-binding  29.87 
 
 
189 aa  70.1  2e-11  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0642  flavin reductase domain protein FMN-binding  31.72 
 
 
190 aa  69.7  2e-11  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0563737  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0259  flavoredoxin  32.84 
 
 
189 aa  69.3  3e-11  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0922  flavin reductase domain protein FMN-binding  32.82 
 
 
195 aa  69.3  3e-11  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1524  flavin reductase domain protein FMN-binding  33.09 
 
 
215 aa  69.3  3e-11  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3226  flavin reductase domain protein FMN-binding  27.59 
 
 
185 aa  69.3  3e-11  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.352328  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2846  flavin reductase domain-containing protein  29.93 
 
 
200 aa  68.2  6e-11  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  5.00824e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1899  hypothetical protein  27.01 
 
 
202 aa  68.2  7e-11  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.843142  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5504  flavin reductase domain protein FMN-binding  32 
 
 
330 aa  67.8  8e-11  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.414218  decreased coverage  0.000482944 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0162  flavin reductase-like protein  32.5 
 
 
167 aa  67.8  8e-11  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0252  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  31.61 
 
 
177 aa  67.8  8e-11  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0553  flavin reductase domain-containing protein  36.7 
 
 
173 aa  67  1e-10  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00870813 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5370  flavin reductase domain protein FMN-binding  29.76 
 
 
223 aa  66.2  2e-10  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.480853 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0160  flavin reductase domain protein FMN-binding  31.54 
 
 
159 aa  66.2  2e-10  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1255  flavin reductase domain-containing protein  29.17 
 
 
216 aa  66.6  2e-10  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0643  flavin reductase domain protein FMN-binding  30.25 
 
 
159 aa  66.2  2e-10  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0543494  normal  0.644181 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1643  flavin reductase-like protein  32.14 
 
 
170 aa  66.6  2e-10  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.170463  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1189  flavin reductase domain protein FMN-binding  25.31 
 
 
186 aa  65.9  3e-10  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.00243403  normal  0.450798 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1781  flavin reductase-like, FMN-binding protein  35.21 
 
 
179 aa  65.9  3e-10  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.160868  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3486  flavin reductase domain protein FMN-binding  30.52 
 
 
192 aa  65.9  3e-10  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0349  flavin reductase domain-containing protein  29.77 
 
 
160 aa  66.2  3e-10  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0388  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  28.12 
 
 
159 aa  65.5  4e-10  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1331  flavin reductase domain-containing protein FMN-binding protein  32.26 
 
 
157 aa  65.9  4e-10  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0131046  normal  0.0375915 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0126  flavin reductase domain protein FMN-binding  29.22 
 
 
194 aa  65.1  5e-10  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3068  flavin reductase domain-containing protein  29.01 
 
 
176 aa  64.7  6e-10  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.293275  normal  0.441099 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4448  flavin reductase domain protein FMN-binding  35.71 
 
 
165 aa  65.1  6e-10  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3722  flavin reductase domain protein FMN-binding  30.5 
 
 
176 aa  64.7  7e-10  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0423931 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3293  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  26.71 
 
 
216 aa  64.7  7e-10  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.902968  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6997  flavin reductase-like, FMN-binding protein  33.61 
 
 
179 aa  63.9  1e-09  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00974297 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2549  flavin reductase domain-containing protein  29.32 
 
 
190 aa  63.5  1e-09  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.355058  normal  0.136226 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3349  flavoredoxin Flr  26.47 
 
 
188 aa  64.3  1e-09  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0445888 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1555  flavin reductase domain-containing protein  29.73 
 
 
186 aa  63.9  1e-09  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2781  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  24.14 
 
 
167 aa  63.9  1e-09  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  3.73643e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0723  Conserved protein/domain typically associated with flavoprotein oxygenase DIM6/NTAB family-like protein  26.53 
 
 
170 aa  63.2  2e-09  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2602  flavin reductase domain protein FMN-binding  27.91 
 
 
160 aa  63.5  2e-09  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2523  flavin reductase-like, FMN-binding  32.77 
 
 
346 aa  63.5  2e-09  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2695  flavin reductase domain-containing protein  35.77 
 
 
178 aa  63.5  2e-09  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.2164  normal  0.150119 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0862  flavin reductase-like, FMN-binding  30.3 
 
 
178 aa  63.2  2e-09  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.374228  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1886  FMN-binding protein  30.86 
 
 
214 aa  63.2  2e-09  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.340076  normal  0.59613 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0187  flavoredoxin  30.23 
 
 
190 aa  62.8  2e-09  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.871882  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2915  flavin reductase domain protein FMN-binding  29.07 
 
 
203 aa  63.2  2e-09  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5343  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  29.17 
 
 
157 aa  62.8  3e-09  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3504  flavin reductase domain protein FMN-binding  27.91 
 
 
160 aa  62.8  3e-09  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.507811  normal  0.0756522 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>