More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_1800 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_1800  GTP-binding proten HflX  100 
 
 
479 aa  949  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2215  GTP-binding proten HflX  74.95 
 
 
484 aa  669  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.166526  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2151  GTP-binding protein, HSR1-related  73.93 
 
 
483 aa  619  1e-176  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.464276  normal  0.0136453 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2164  GTP-binding protein, HSR1-related  73.72 
 
 
483 aa  618  1e-176  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.951338  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2210  GTP-binding protein, HSR1-related  73.72 
 
 
483 aa  618  1e-176  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.60775  normal  0.0439435 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2436  GTP-binding protein, HSR1-related  74.68 
 
 
482 aa  612  1e-174  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.445847  normal  0.220236 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12738  GTP-binding protein hflX  73.54 
 
 
495 aa  606  1e-172  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.324868 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3960  GTP-binding protein, HSR1-related  72.22 
 
 
482 aa  602  1e-171  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.342247  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1231  small GTP-binding protein  68.43 
 
 
503 aa  578  1e-164  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.592117  normal  0.0200783 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7080  GTP-binding proten HflX  67.48 
 
 
502 aa  576  1e-163  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.750227 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3905  GTP-binding proten HflX  69.15 
 
 
512 aa  569  1e-161  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.13556  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3269  GTP-binding proten HflX  68.05 
 
 
485 aa  565  1e-160  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000617793  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1051  GTP-binding proten HflX  65.57 
 
 
509 aa  562  1e-159  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.128813 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27610  GTP-binding proten HflX  65.44 
 
 
482 aa  563  1e-159  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0684  GTP-binding proten HflX  67.17 
 
 
512 aa  558  1e-158  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.518988  normal  0.674112 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0820  small GTP-binding protein domain-containing protein  66.89 
 
 
493 aa  553  1e-156  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1140  GTP-binding proten HflX  68.24 
 
 
501 aa  554  1e-156  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.762868 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1436  GTP-binding proten HflX  68.64 
 
 
480 aa  549  1e-155  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3511  small GTP-binding protein domain-containing protein  67.33 
 
 
486 aa  545  1e-154  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.67992  normal  0.0915245 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1468  GTP-binding proten HflX  63.52 
 
 
553 aa  542  1e-153  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.15477e-09 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2263  GTP-binding family protein ; K03665 GTP-binding protein HflX  64.83 
 
 
494 aa  541  1e-153  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0586252 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3837  GTP-binding protein, HSR1-related  64.58 
 
 
493 aa  543  1e-153  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1466  small GTP-binding protein  64.3 
 
 
522 aa  541  1e-152  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00807526  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3981  GTP-binding proten HflX  63.18 
 
 
487 aa  538  1e-151  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0693971  normal  0.0467716 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17490  GTP-binding proten HflX  62.58 
 
 
517 aa  534  1e-150  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.106124  normal  0.236778 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1449  GTP-binding protein, HSR1-related  65.05 
 
 
494 aa  530  1e-149  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.062201  normal  0.276789 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10600  GTP-binding proten HflX  64.75 
 
 
521 aa  528  1e-149  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.697427  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1407  small GTP-binding protein  64.63 
 
 
515 aa  524  1e-147  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  1.55427e-05 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1562  GTP-binding proten HflX  64.82 
 
 
505 aa  519  1e-146  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.410019  hitchhiker  0.00407104 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1255  GTP-binding proten HflX  64.98 
 
 
515 aa  516  1e-145  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23070  GTP-binding proten HflX  64.25 
 
 
515 aa  515  1e-145  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0748737 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2436  GTP-binding proten HflX  66.21 
 
 
493 aa  514  1e-145  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.292704  normal  0.693712 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07300  small GTP-binding protein domain/GTP-binding conserved hypothetical protein TIGR00650  65.43 
 
 
546 aa  511  1e-143  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4564  GTP-binding proten HflX  64.72 
 
 
466 aa  493  1e-138  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.631716  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1503  small GTP-binding protein  62.1 
 
 
530 aa  483  1e-135  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0726763  normal  0.6234 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1482  small GTP-binding protein  62.64 
 
 
524 aa  483  1e-135  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.578947  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0164  GTPase  57.08 
 
 
501 aa  464  1e-129  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0583  GTP-binding protein HflX  55.68 
 
 
512 aa  451  1e-125  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.622699 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1612  GTP-binding proten HflX  48.47 
 
 
436 aa  353  4e-96  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  2.11402e-05  unclonable  5.44053e-16 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10790  GTP-binding proten HflX  48.71 
 
 
433 aa  353  5e-96  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000931239  unclonable  2.74038e-09 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0772  GTP-binding proten HflX  43.06 
 
 
437 aa  335  1e-90  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.426006  normal  0.338027 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11140  small GTP-binding protein  45.05 
 
 
395 aa  325  7e-88  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1110  GTP-binding protein, HSR1-related  49.76 
 
 
422 aa  323  3e-87  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  6.12987e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3611  GTP-binding proten HflX  44.28 
 
 
414 aa  322  9e-87  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0108116  normal  0.379187 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1408  GTP-binding proten HflX  43.6 
 
 
441 aa  313  3e-84  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3144  small GTP-binding protein  44.76 
 
 
454 aa  306  7e-82  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000830464  normal 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_1719  predicted protein  42.62 
 
 
415 aa  305  1e-81  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2926  GTP1/OBG protein  43.36 
 
 
444 aa  304  2e-81  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0180067  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2334  small GTP-binding protein  44.99 
 
 
454 aa  303  3e-81  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2081  small GTP-binding protein  42.69 
 
 
582 aa  303  4e-81  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00812611  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1259  GTP-binding protein, HSR1-related  43.36 
 
 
421 aa  303  6e-81  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.027448  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0658  GTP-binding proten HflX  47.29 
 
 
425 aa  301  2e-80  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0528  GTP-binding proten HflX  56.9 
 
 
384 aa  301  2e-80  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.270654  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3097  GTP-binding proten HflX  44.23 
 
 
461 aa  300  4e-80  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  3.56343e-05  normal  0.400149 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0534  GTP-binding proten HflX  41.77 
 
 
420 aa  299  6e-80  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  1.87355e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3241  GTP-binding proten HflX  44.74 
 
 
553 aa  296  6e-79  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.300166  normal  0.108052 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0394  small GTP-binding protein  41.1 
 
 
406 aa  295  9e-79  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000766043  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3259  GTP-binding proten HflX  45.28 
 
 
450 aa  294  3e-78  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0957781 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0178  GTP-binding proten HflX  44.05 
 
 
596 aa  293  3e-78  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.22171  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4111  GTP-binding proten HflX  44.68 
 
 
425 aa  292  1e-77  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1689  GTP1/OBG protein  39.42 
 
 
419 aa  291  2e-77  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1737  GTP-binding protein, HSR1-related  47.29 
 
 
434 aa  291  2e-77  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.260139  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1434  GTP-binding protein HSR1-related  38.61 
 
 
419 aa  291  2e-77  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2721  GTP-binding proten HflX  43.34 
 
 
442 aa  290  5e-77  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.43015  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1951  GTP-binding protein  37.96 
 
 
419 aa  290  6e-77  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.697887  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1872  GTP-binding protein  37.73 
 
 
419 aa  289  9e-77  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.26379e-12 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1674  GTP-binding protein  37.5 
 
 
419 aa  288  1e-76  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.887073  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1650  GTP-binding protein  37.5 
 
 
419 aa  287  2e-76  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.101149  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1835  GTP-binding protein  37.59 
 
 
419 aa  287  3e-76  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3508  GTP-binding protein  37.73 
 
 
419 aa  286  4e-76  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1355  GTP-binding protein HflX  47.86 
 
 
435 aa  287  4e-76  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0898  GTP-binding proten HflX  44.08 
 
 
417 aa  286  5e-76  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.105158  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2012  GTP-binding proten HflX  42.93 
 
 
440 aa  286  6e-76  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1693  GTP-binding protein  37.5 
 
 
419 aa  285  1e-75  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.78132  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1828  GTP-binding protein  37.5 
 
 
419 aa  285  1e-75  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.990495  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0410  GTP-binding protein HflX  38.71 
 
 
420 aa  285  1e-75  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1584  GTP-binding proten HflX  48.43 
 
 
434 aa  284  2e-75  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2666  putative GTP-binding protein  42.09 
 
 
441 aa  284  3e-75  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5672  GTP-binding proten HflX  43.65 
 
 
433 aa  283  5e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1441  small GTP-binding protein  40.78 
 
 
413 aa  283  6e-75  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2262  GTP-binding proten HflX  39.49 
 
 
435 aa  282  8e-75  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0057  GTP-binding proten HflX  44.3 
 
 
450 aa  282  8e-75  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.583436  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0275  GTP-binding proten HflX  44.44 
 
 
564 aa  282  9e-75  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0275  GTP-binding proten HflX  44.44 
 
 
564 aa  282  1e-74  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32115  predicted protein  40.04 
 
 
519 aa  281  2e-74  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0250041 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65300  putative GTP-binding protein  43.41 
 
 
433 aa  281  2e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0879  GTP-binding proten HflX  48.1 
 
 
561 aa  280  4e-74  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0122  GTP-binding protein HSR1-related  39.73 
 
 
421 aa  280  5e-74  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000776229  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4893  GTP-binding protein HflX  42.75 
 
 
433 aa  277  3e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3720  putative GTPase HflX  41.93 
 
 
426 aa  277  3e-73  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00523075  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4769  GTP-binding protein, HSR1-related  42.75 
 
 
433 aa  277  3e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1195  GTP-binding protein  46.53 
 
 
412 aa  277  3e-73  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00118595  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4945  GTP-binding proten HflX  42.75 
 
 
433 aa  277  3e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.017296 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3918  putative GTPase HflX  41.93 
 
 
426 aa  276  4e-73  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.240209  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0069  GTP-binding protein  44.7 
 
 
450 aa  277  4e-73  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3237  GTP-binding protein, HSR1-related  42.05 
 
 
430 aa  277  4e-73  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1731  GTP-binding proten HflX  42.07 
 
 
434 aa  276  7e-73  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1628  GTP-binding protein, HSR1-related  37.89 
 
 
425 aa  275  1e-72  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0432  putative GTPase HflX  41.89 
 
 
426 aa  275  1e-72  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000150209  unclonable  3.63353e-08 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1081  GTP-binding proten HflX  40.69 
 
 
405 aa  275  1e-72  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0783851  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>