237 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_0022 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_0022  degV family protein  100 
 
 		 288 aa  587  1e-167  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.314645  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0362  degV family protein  53.52 
 
 		 288 aa  320  9.999999999999999e-87  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1362  degV family protein  51.04 
 
 		 288 aa  293  2e-78  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0445178  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1324  degV family protein  51.04 
 
 		 288 aa  291  6e-78  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000165489  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14080  degV family protein  38.27 
 
 		 290 aa  158  1e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000464693  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1346  degV family protein  34.15 
 
 		 279 aa  152  5.9999999999999996e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.22835 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2132  degV family protein  36.01 
 
 		 280 aa  139  6e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1951  degV family protein  34.03 
 
 		 286 aa  137  2e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.33596  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2876  degV family protein  33.56 
 
 		 286 aa  137  2e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000561682 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2679  degV family protein  32.98 
 
 		 286 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.776437  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2629  DegV family protein  32.98 
 
 		 286 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000230947  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2872  degV family protein  32.98 
 
 		 286 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.428011  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2918  degV family protein  32.98 
 
 		 286 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0030  degV family protein  32.86 
 
 		 291 aa  136  5e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2677  degV family protein  34.14 
 
 		 286 aa  135  7.000000000000001e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000367338  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2886  degV family protein  32.63 
 
 		 286 aa  135  9e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2602  DegV family protein  32.63 
 
 		 286 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00489344  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3733  degV family protein  31.82 
 
 		 280 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.131703  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2906  degV family protein  32.63 
 
 		 286 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00204393  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2359  degV family protein  32.98 
 
 		 286 aa  133  3e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.823292  normal  0.669443 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4890  degV family protein  31.47 
 
 		 280 aa  132  6.999999999999999e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0030  degV family protein  33.21 
 
 		 291 aa  132  7.999999999999999e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4990  degV family protein  30.99 
 
 		 280 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10110  degV family protein  32.41 
 
 		 299 aa  130  2.0000000000000002e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000366641  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5045  degV family protein  31.12 
 
 		 280 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4875  degV family protein  31.12 
 
 		 280 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5430  degV family protein  31.12 
 
 		 280 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5286  degV family protein  31.12 
 
 		 280 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000358242 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5304  degV family protein  30.77 
 
 		 280 aa  129  7.000000000000001e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5362  degV family protein  30.77 
 
 		 280 aa  129  7.000000000000001e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0416  DegV family protein  29.24 
 
 		 288 aa  129  8.000000000000001e-29  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1370  degV family protein  31.1 
 
 		 271 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0560747  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1901  hypothetical protein  34.17 
 
 		 281 aa  128  1.0000000000000001e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2801  degV family protein  29.68 
 
 		 284 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00587122  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0716  degV family protein  32.98 
 
 		 287 aa  126  3e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5316  degV family protein  30.42 
 
 		 280 aa  125  6e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.940861  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5642  degV family protein  30.42 
 
 		 280 aa  125  6e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.121288  hitchhiker  0.00000000000040368 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3239  degV family protein  31.14 
 
 		 281 aa  125  1e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1342  DegV family protein  32.77 
 
 		 282 aa  124  2e-27  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.833534  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0172  DegV family protein  33.45 
 
 		 279 aa  123  3e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1648  degV family protein  30.85 
 
 		 280 aa  123  4e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000062676  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1076  degV family protein  31.58 
 
 		 280 aa  123  4e-27  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.313955  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3318  degV family protein  30.18 
 
 		 282 aa  122  8e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17990  degV family protein  30 
 
 		 285 aa  122  9e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.980655  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3042  degV family protein  31.6 
 
 		 281 aa  121  9.999999999999999e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00021741  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0903  degV family protein  29.58 
 
 		 282 aa  121  9.999999999999999e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.964833  normal  0.127362 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0933  degV family protein  29.41 
 
 		 292 aa  121  9.999999999999999e-27  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1265  degV family protein  30.88 
 
 		 281 aa  120  3e-26  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2228  degV family protein  30.14 
 
 		 280 aa  120  3e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000426041  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3096  degV family protein  30.14 
 
 		 287 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000019497  hitchhiker  1.30761e-16 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1048  DegV  30.88 
 
 		 280 aa  119  4.9999999999999996e-26  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.925497  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1514  hypothetical protein  31.82 
 
 		 279 aa  119  6e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1485  hypothetical protein  31.82 
 
 		 279 aa  119  6e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.417725  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1740  degV family protein  32.17 
 
 		 280 aa  119  7.999999999999999e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2276  degV family protein  30.5 
 
 		 280 aa  118  9e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000585321  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2031  DegV family protein  30.14 
 
 		 280 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000818656  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2029  DegV family protein  30.14 
 
 		 280 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.367646  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2272  degV family protein  30.14 
 
 		 287 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.27553e-41 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2357  degV family protein  30.14 
 
 		 287 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000321528  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2070  degV family protein  30.85 
 
 		 280 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00374337  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1522  hypothetical protein  29.45 
 
 		 295 aa  117  3e-25  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.487789  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04370  degV family protein  31.36 
 
 		 285 aa  117  3e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2258  degV family protein  32.06 
 
 		 293 aa  117  3e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0884307  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2385  degV family protein  31.12 
 
 		 279 aa  116  3.9999999999999997e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1050  hypothetical protein  31.25 
 
 		 283 aa  116  5e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1587  degV family protein  31.43 
 
 		 280 aa  115  6.9999999999999995e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000247514  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1018  hypothetical protein  29.75 
 
 		 313 aa  115  8.999999999999998e-25  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0136614  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1037  degV family protein  33.62 
 
 		 282 aa  114  1.0000000000000001e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.00760689  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0790  degV family protein  30.11 
 
 		 288 aa  114  2.0000000000000002e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0678582  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0773  degV family protein  30.11 
 
 		 288 aa  114  2.0000000000000002e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.511677  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2091  degV family protein  29.93 
 
 		 282 aa  113  3e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0091257  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2246  degV family protein  29.93 
 
 		 282 aa  113  3e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0152108  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1542  degV family protein  29.47 
 
 		 287 aa  113  4.0000000000000004e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1001  DegV family protein  30.39 
 
 		 282 aa  113  4.0000000000000004e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.794121  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0211  DegV family protein  28.27 
 
 		 286 aa  113  4.0000000000000004e-24  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.187112  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0296  degV family protein  29.86 
 
 		 283 aa  113  4.0000000000000004e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0442  DegV family protein  31.9 
 
 		 291 aa  113  4.0000000000000004e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.416835  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1651  degV family protein  30.5 
 
 		 282 aa  112  6e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0124  hypothetical protein  28.91 
 
 		 286 aa  112  7.000000000000001e-24  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0301  degV family protein  29.86 
 
 		 283 aa  112  8.000000000000001e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.173313  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1107  degV family protein  30.82 
 
 		 282 aa  110  2.0000000000000002e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2554  degV family protein  32.17 
 
 		 279 aa  110  3e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000605397  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1500  hypothetical protein  25.98 
 
 		 281 aa  109  4.0000000000000004e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.886569  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1743  degV family protein  26.57 
 
 		 281 aa  109  5e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0123277 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1517  degV family protein  32.61 
 
 		 279 aa  109  7.000000000000001e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.706998  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1607  degV family protein  28.12 
 
 		 285 aa  109  7.000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.213702  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05250  degV family protein  28.67 
 
 		 284 aa  108  1e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000355152  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0772  degV family protein  31.12 
 
 		 280 aa  108  1e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0942  hypothetical protein  27.27 
 
 		 285 aa  107  2e-22  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1310  degV family protein  30.27 
 
 		 292 aa  107  3e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1014  hypothetical protein  29.43 
 
 		 282 aa  107  3e-22  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0363  degV family protein  30.11 
 
 		 277 aa  107  3e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.294942  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1307  degV family protein  32.25 
 
 		 279 aa  106  4e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.675608  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1049  DegV  28.27 
 
 		 281 aa  106  5e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_116  DegV protein  28.62 
 
 		 279 aa  106  5e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1121  degV family protein  27.11 
 
 		 294 aa  105  7e-22  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0399  degV family protein  27.4 
 
 		 279 aa  105  7e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000011327  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_363  DegV  27.76 
 
 		 279 aa  104  1e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000284109  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1077  degV family protein  29.12 
 
 		 281 aa  104  1e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.13132  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1216  DegV family protein  28.52 
 
 		 278 aa  104  2e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>