More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_1537 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_1537  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  100 
 
 
364 aa  730    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.307864 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0480  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  73.55 
 
 
357 aa  545  1e-154  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0493  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  73.55 
 
 
357 aa  546  1e-154  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.79936  normal  0.265363 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4297  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  72.88 
 
 
357 aa  537  1e-151  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1488  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  72.25 
 
 
357 aa  533  1e-150  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000150762 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3356  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase, short form  71.51 
 
 
358 aa  529  1e-149  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.971675  normal  0.216053 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2860  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  55.12 
 
 
355 aa  390  1e-107  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0954  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  53.85 
 
 
354 aa  385  1e-106  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.526326  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0258  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  52.75 
 
 
356 aa  384  1e-105  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5787  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  50.69 
 
 
358 aa  384  1e-105  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.189117 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5901  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  50.41 
 
 
356 aa  362  4e-99  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1687  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  51.37 
 
 
356 aa  362  4e-99  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0065  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  49.17 
 
 
355 aa  361  1e-98  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1817  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  48.2 
 
 
355 aa  360  3e-98  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0065  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  48.9 
 
 
355 aa  359  5e-98  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0713  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  49.86 
 
 
358 aa  358  6e-98  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.974379 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1383  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  49.86 
 
 
355 aa  356  3.9999999999999996e-97  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1800  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  49.31 
 
 
357 aa  355  5e-97  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4165  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  47.93 
 
 
355 aa  355  5e-97  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.387622  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4128  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  48.2 
 
 
355 aa  355  6.999999999999999e-97  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0631243  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1214  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  48.48 
 
 
355 aa  353  2.9999999999999997e-96  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.383113  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1450  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  49.86 
 
 
376 aa  348  8e-95  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0747  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  46.99 
 
 
359 aa  346  4e-94  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0413  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  47.53 
 
 
355 aa  338  7e-92  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0183855  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2754  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  45.21 
 
 
355 aa  337  1.9999999999999998e-91  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6491  dTDP-glucose pyrophosphorylase-like protein  46.56 
 
 
355 aa  331  1e-89  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2034  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  45.08 
 
 
357 aa  327  2.0000000000000001e-88  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1214  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  45.08 
 
 
357 aa  320  3e-86  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0631  dTDP-glucose pyrophosphorylase-like protein  44.78 
 
 
355 aa  315  6e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2143  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  41.53 
 
 
357 aa  301  2e-80  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.591307  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0733  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  43.44 
 
 
355 aa  292  5e-78  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1845  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  44.41 
 
 
349 aa  291  1e-77  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0548966  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2794  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  41.76 
 
 
354 aa  286  2.9999999999999996e-76  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.181075 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0628  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  40.49 
 
 
358 aa  281  1e-74  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.437993  normal  0.532658 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0340  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  39.56 
 
 
355 aa  275  1.0000000000000001e-72  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.830656  normal  0.0393179 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2643  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  38.9 
 
 
354 aa  268  1e-70  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2096  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  41.21 
 
 
353 aa  267  2e-70  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00805861 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2508  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  45.15 
 
 
344 aa  262  6e-69  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0124  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  40.88 
 
 
351 aa  243  5e-63  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    unclonable  0.00000000000000322504 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2020  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  36.63 
 
 
397 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.611525 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2341  nucleotidyl transferase  35.47 
 
 
396 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00221584  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2395  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  36.46 
 
 
296 aa  179  5.999999999999999e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.737045 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5509  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  38.98 
 
 
296 aa  179  8e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2672  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  36.11 
 
 
296 aa  179  8e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00250825  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4001  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  36.11 
 
 
294 aa  179  9e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0192  nucleotidyl transferase  31.13 
 
 
365 aa  178  1e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.415123 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3693  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  36.11 
 
 
289 aa  177  2e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.701903  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1395  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  39.67 
 
 
296 aa  177  3e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0479  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  35.6 
 
 
320 aa  176  5e-43  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00000000331909  decreased coverage  0.00000000439199 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1373  putative glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  35.83 
 
 
245 aa  176  5e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1115  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  35.83 
 
 
245 aa  176  7e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4255  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  36.11 
 
 
296 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2354  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  36.11 
 
 
296 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2377  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  37.45 
 
 
299 aa  173  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.217402  hitchhiker  0.000893073 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0054  Nucleotidyl transferase  37.76 
 
 
243 aa  172  6.999999999999999e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1335  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase, putative  35.43 
 
 
245 aa  171  1e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.161343  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1135  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  35.43 
 
 
245 aa  171  1e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1109  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  35.43 
 
 
245 aa  171  1e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1228  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  35.43 
 
 
245 aa  171  1e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1267  putative glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  35.43 
 
 
245 aa  171  2e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4018  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  38.84 
 
 
305 aa  171  2e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.520137 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4074  putative glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  35.43 
 
 
245 aa  171  2e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.859637  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1296  putative glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  35.43 
 
 
245 aa  171  2e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00103191 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0166  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  39.92 
 
 
293 aa  170  3e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.455037  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1783  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  40.08 
 
 
293 aa  170  4e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00712451 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5838  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  38.98 
 
 
295 aa  169  7e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.494959  normal  0.263713 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1450  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  38.98 
 
 
306 aa  169  8e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0591  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  37.8 
 
 
291 aa  169  8e-41  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.600436  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0529  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  34.17 
 
 
400 aa  168  1e-40  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4076  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  38.02 
 
 
296 aa  168  1e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0532179  normal  0.23652 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2230  nucleotidyl transferase  38.68 
 
 
235 aa  168  1e-40  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3848  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  38.02 
 
 
296 aa  168  1e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0517  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  37.86 
 
 
293 aa  167  2e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0684  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase protein  38.84 
 
 
292 aa  167  2e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4028  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  37.86 
 
 
310 aa  168  2e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4141  Nucleotidyl transferase  36.06 
 
 
253 aa  168  2e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000020886 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09040  Glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  35.15 
 
 
292 aa  167  2e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00724889  normal  0.162392 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2319  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  38.71 
 
 
293 aa  168  2e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.103885 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0187  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  37.86 
 
 
293 aa  167  2e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13103  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  37.65 
 
 
286 aa  168  2e-40  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1122  nucleotidyl transferase  34.65 
 
 
245 aa  167  2e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.236297  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0924  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase, long form  38.43 
 
 
293 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.390731 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1423  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  37.22 
 
 
291 aa  167  2.9999999999999998e-40  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1399  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  38.68 
 
 
290 aa  167  4e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2181  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  38.27 
 
 
289 aa  166  5e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.112189  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0714  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  37.59 
 
 
295 aa  166  5e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2023  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  33.72 
 
 
405 aa  166  5e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.562906 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0752  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  38.68 
 
 
297 aa  166  5e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2733  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  37.22 
 
 
292 aa  166  5.9999999999999996e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3859  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  33.45 
 
 
290 aa  166  5.9999999999999996e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4164  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  37.7 
 
 
291 aa  166  5.9999999999999996e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.375509  normal  0.0599581 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1402  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  36.63 
 
 
291 aa  166  5.9999999999999996e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00196644 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0200  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  38.27 
 
 
289 aa  166  5.9999999999999996e-40  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.310491  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0505  nucleotidyl transferase  34.17 
 
 
400 aa  166  5.9999999999999996e-40  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1277  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  38.02 
 
 
296 aa  166  8e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0064  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  37.45 
 
 
304 aa  166  9e-40  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0303  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  38.52 
 
 
298 aa  166  9e-40  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0255  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  38.43 
 
 
309 aa  165  9e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.201113  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2677  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  37.19 
 
 
292 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.475432  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2344  nucleotidyl transferase  34.04 
 
 
405 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00861405  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>