More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_0400 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_0091  adenylate/guanylate cyclase  63.63 
 
 
859 aa  1110    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.101175 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0400  adenylate/guanylate cyclase  100 
 
 
864 aa  1785    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3744  GAF/PAS/PAC sensor-containing adenylate/guanylate cyclase  62.87 
 
 
858 aa  1115    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3735  adenylate/guanylate cyclase  54.71 
 
 
860 aa  357  6.999999999999999e-97  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0169064  normal  0.419577 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2413  GAF/PAS/PAC sensor-containing adenylate/guanylate cyclase  53.66 
 
 
861 aa  356  1e-96  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0647  adenylate/guanylate cyclase  47.52 
 
 
911 aa  298  3e-79  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.707555  normal  0.864231 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1477  putative adenylate/guanylate cyclase  45.65 
 
 
903 aa  277  7e-73  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.861008  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1344  adenylate/guanylate cyclase  40.41 
 
 
794 aa  221  3e-56  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4085  adenylate/guanylate cyclase  39.07 
 
 
746 aa  221  3.9999999999999997e-56  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.104935 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0034  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  36 
 
 
758 aa  217  7e-55  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000015313  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3697  adenylate/guanylate cyclase  36.72 
 
 
696 aa  207  6e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.61471  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1969  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  38.98 
 
 
696 aa  207  8e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0397866  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1858  adenylate/guanylate cyclase  37.25 
 
 
734 aa  199  2.0000000000000003e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.88873  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1986  adenylate cyclase, putative  47.58 
 
 
636 aa  196  1e-48  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000955851  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0983  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  37.04 
 
 
737 aa  195  3e-48  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7152  adenylate/guanylate cyclase  34.85 
 
 
744 aa  195  4e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1889  putative adenylate/guanylate cyclase  46.12 
 
 
645 aa  193  1e-47  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2129  adenylate/guanylate cyclase  38.19 
 
 
741 aa  193  1e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1553  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  35.39 
 
 
754 aa  190  9e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.333757 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1276  hypothetical protein  37.86 
 
 
701 aa  189  1e-46  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2802  adenylate/guanylate cyclase  32.09 
 
 
702 aa  189  1e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.523853  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1277  hypothetical protein  38.52 
 
 
701 aa  189  3e-46  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4017  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  33.83 
 
 
701 aa  187  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.556421 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3049  adenylate/guanylate cyclase  35.88 
 
 
713 aa  186  1.0000000000000001e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0991  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  35.29 
 
 
703 aa  186  1.0000000000000001e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.358146  normal  0.0115754 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5176  adenylate/guanylyl cyclase  34.71 
 
 
717 aa  182  2e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.263029  normal  0.588904 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1046  adenylate/guanylate cyclase  33.44 
 
 
726 aa  182  2.9999999999999997e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000197957  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3884  adenylate/guanylate cyclase  39.26 
 
 
667 aa  181  8e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0907  putative PAS/PAC sensor protein  31.61 
 
 
535 aa  178  4e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1703  hypothetical protein  35.23 
 
 
758 aa  177  5e-43  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1704  hypothetical protein  35.23 
 
 
758 aa  177  9e-43  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1205  adenylate/guanylate cyclase  35.07 
 
 
724 aa  176  9.999999999999999e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000104961  normal  0.0234559 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4565  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  30.99 
 
 
761 aa  174  5e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.593943  normal  0.183616 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0057  putative Chase2 sensor protein  38.77 
 
 
650 aa  174  5.999999999999999e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00712657 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2382  adenylate/guanylate cyclase  37.89 
 
 
752 aa  174  9e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0671  putative adenylate/guanylate cyclase  33.33 
 
 
593 aa  173  1e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.810132 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4571  adenylate/guanylate cyclase with GAF sensor and FHA domain protein  42.99 
 
 
546 aa  173  1e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.226096  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0932  adenylate/guanylate cyclase catalytic domain-containing protein  32.41 
 
 
936 aa  172  3e-41  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2702  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  34.7 
 
 
656 aa  169  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00394792  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0558  adenylate/guanylate cyclase  40.09 
 
 
665 aa  169  2e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.132478  normal  0.264577 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0411  adenylate/guanylate cyclase catalytic domain-containing protein  33.44 
 
 
694 aa  169  2.9999999999999998e-40  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0173822  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0331  putative adenylate/guanylate cyclase  40 
 
 
641 aa  168  4e-40  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0302  putative Chase2 sensor protein  39.44 
 
 
670 aa  168  4e-40  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3090  putative Chase2 sensor protein  39.45 
 
 
614 aa  168  4e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3621  putative adenylate/guanylate cyclase  41.28 
 
 
607 aa  166  2.0000000000000002e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00483  adenylate cyclase  38.17 
 
 
358 aa  166  2.0000000000000002e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0015  putative adenylate/guanylate cyclase  42.34 
 
 
284 aa  165  3e-39  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.391867  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2371  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  34.2 
 
 
657 aa  165  3e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0177701 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0296  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  39.13 
 
 
672 aa  165  3e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1135  adenylate cyclase  34.51 
 
 
483 aa  164  5.0000000000000005e-39  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1131  adenylate cyclase  38.22 
 
 
483 aa  164  7e-39  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0401  adenylate/guanylate cyclase catalytic domain-containing protein  33.45 
 
 
797 aa  164  8.000000000000001e-39  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.173302  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0929  adenylate/guanylate cyclase  34.46 
 
 
738 aa  164  9e-39  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.144822  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0280  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  38.7 
 
 
656 aa  164  9e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0078  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  37.75 
 
 
585 aa  162  2e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0981996 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28331  guanylate cyclase  41.3 
 
 
632 aa  162  2e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.345698 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5187  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  29.41 
 
 
758 aa  162  2e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1218  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  33.8 
 
 
611 aa  162  4e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0668  putative adenylate/guanylate cyclase  33.45 
 
 
701 aa  161  5e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00673986  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0494  adenylate/guanylate cyclase  35.62 
 
 
364 aa  160  1e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0343  transmembrane sensor-like domain-containing protein  35.95 
 
 
638 aa  158  4e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0559  adenylate/guanylate cyclase  37.27 
 
 
523 aa  158  5.0000000000000005e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.855978  normal  0.139536 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1894  putative Chase2 sensor protein  35.52 
 
 
729 aa  157  7e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0276882  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2575  adenylate/guanylate cyclase  38.79 
 
 
740 aa  156  1e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0521558  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1446  hypothetical protein  36.29 
 
 
441 aa  156  2e-36  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1538  hypothetical protein  36.71 
 
 
431 aa  156  2e-36  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2543  adenylate/guanylate cyclase  31.77 
 
 
712 aa  155  2e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.00000118563  normal  0.086844 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1077  adenylate cyclase  37.56 
 
 
513 aa  155  2.9999999999999998e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4645  adenylate/guanylate cyclase  35.62 
 
 
546 aa  152  2e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.98897  normal  0.0884819 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1100  putative adenylate/guanylate cyclase  31.56 
 
 
479 aa  152  2e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2729  adenylate/guanylate cyclase  38.78 
 
 
1119 aa  152  3e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0163544 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5658  GAF sensor signal transduction histidine kinase  44 
 
 
602 aa  151  5e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.525886  normal  0.309242 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3068  serine phosphatase  34.85 
 
 
612 aa  150  8e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.266208  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3177  adenylate/guanylate cyclase with GAF and PAS/PAC sensors  32.67 
 
 
971 aa  150  9e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1821  adenylate/guanylate cyclase  35.9 
 
 
738 aa  150  9e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0453734  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2619  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  37.23 
 
 
658 aa  150  1.0000000000000001e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.103266  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2694  putative PAS/PAC sensor protein  33.73 
 
 
969 aa  149  2.0000000000000003e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0176534  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2685  adenylate/guanylate cyclase  39.57 
 
 
1093 aa  149  3e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.111623 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2534  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  32.08 
 
 
764 aa  149  3e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.263424  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3663  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  32.14 
 
 
723 aa  149  3e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.93824  normal  0.384107 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2857  adenylate/guanylate cyclase  34.98 
 
 
1805 aa  148  4.0000000000000006e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2892  putative phytochrome sensor protein  39 
 
 
453 aa  145  2e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.719364 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4698  adenylate/guanylate cyclase  35.85 
 
 
735 aa  146  2e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0663  putative adenylate/guanylate cyclase  35.47 
 
 
632 aa  146  2e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.389437  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1674  adenylate/guanylate cyclase  29.21 
 
 
731 aa  146  2e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.285397  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2169  adenylate/guanylate cyclase  34.33 
 
 
756 aa  145  2e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0505849  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1658  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  36.15 
 
 
577 aa  146  2e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.791017  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3462  putative adenylate/guanylate cyclase  38.46 
 
 
651 aa  145  3e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5657  adenylate/guanylate cyclase  31.64 
 
 
421 aa  145  4e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.517681  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3153  adenylate/guanylate cyclase  31.95 
 
 
759 aa  144  5e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3360  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  34.76 
 
 
723 aa  144  5e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1908  adenylate/guanylate cyclase with GAF sensor and FHA domain  33.19 
 
 
518 aa  144  6e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.136997  normal  0.266082 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3568  adenylate/guanylate cyclase  37.22 
 
 
526 aa  144  8e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.456079 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3029  adenylate/guanylate cyclase  33.33 
 
 
482 aa  144  9e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2515  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  43.35 
 
 
650 aa  143  9.999999999999999e-33  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.764918 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1643  adenylate/guanylate cyclase  35.21 
 
 
536 aa  142  1.9999999999999998e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.292421  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2346  CHASE2 domain-containing protein  31.25 
 
 
760 aa  143  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.285183  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2161  adenylate/guanylate cyclase with GAF sensor(s)  37.67 
 
 
1020 aa  143  1.9999999999999998e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0428251  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1618  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.51 
 
 
711 aa  142  3e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.491163 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2253  adenylate cyclase  35.84 
 
 
518 aa  141  4.999999999999999e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0171825 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>