More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_3404 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_3404  radical SAM enzyme, Cfr family  100 
 
 		 388 aa  780    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00306025  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1869  radical SAM protein  79.29 
 
 		 374 aa  601  1.0000000000000001e-171  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.340482 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0683  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  81.49 
 
 		 365 aa  601  1.0000000000000001e-171  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.882739  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3677  radical SAM enzyme, Cfr family  79.95 
 
 		 365 aa  588  1e-167  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1536  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  76.02 
 
 		 395 aa  580  1e-164  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0799869 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1000  radical SAM enzyme, Cfr family  78.82 
 
 		 388 aa  578  1e-164  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.189733  normal  0.570497 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3237  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  73.83 
 
 		 376 aa  543  1e-153  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5902  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  72.85 
 
 		 368 aa  525  1e-148  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.185229  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09960  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  73.77 
 
 		 370 aa  526  1e-148  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.434962  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1420  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  70.11 
 
 		 391 aa  521  1e-147  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0340942  normal  0.291727 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23560  radical SAM enzyme, Cfr family  68.82 
 
 		 364 aa  501  1e-141  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.208843 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1235  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  72.6 
 
 		 380 aa  501  1e-140  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.478405  hitchhiker  0.00730149 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1678  radical SAM enzyme, Cfr family  69.25 
 
 		 371 aa  500  1e-140  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1327  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  73.93 
 
 		 353 aa  501  1e-140  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1009  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  66.2 
 
 		 376 aa  497  1e-139  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.834278 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2114  radical SAM enzyme, Cfr family  70.08 
 
 		 368 aa  496  1e-139  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0781681  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1489  radical SAM enzyme, Cfr family  69.47 
 
 		 375 aa  494  1e-139  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2502  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  68.1 
 
 		 383 aa  492  9.999999999999999e-139  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.293735  normal  0.506779 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2203  radical SAM enzyme, Cfr family  71.47 
 
 		 388 aa  493  9.999999999999999e-139  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00426672  normal  0.359249 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2178  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  72.58 
 
 		 372 aa  493  9.999999999999999e-139  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0846545  hitchhiker  0.000495188 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3980  radical SAM enzyme, Cfr family  73.54 
 
 		 395 aa  488  1e-137  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.118303  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11240  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  61.43 
 
 		 426 aa  486  1e-136  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.43214  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2223  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  69.32 
 
 		 365 aa  487  1e-136  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.522742  normal  0.264818 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4121  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  68.77 
 
 		 365 aa  482  1e-135  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1536  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  66.84 
 
 		 430 aa  472  1e-132  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.571829 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21300  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  61.9 
 
 		 465 aa  471  1.0000000000000001e-131  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.830404  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12894  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  67.4 
 
 		 364 aa  465  9.999999999999999e-131  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.942196  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2006  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  68.35 
 
 		 374 aa  458  9.999999999999999e-129  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.578114  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2052  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  68.35 
 
 		 374 aa  458  9.999999999999999e-129  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1987  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  68.35 
 
 		 374 aa  458  9.999999999999999e-129  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0876088  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10170  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  59.07 
 
 		 429 aa  446  1.0000000000000001e-124  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3577  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  64.4 
 
 		 421 aa  447  1.0000000000000001e-124  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1185  radical SAM enzyme, Cfr family  62.99 
 
 		 389 aa  445  1.0000000000000001e-124  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1166  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  68.65 
 
 		 385 aa  447  1.0000000000000001e-124  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.800858  normal  0.253487 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0409  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  59.15 
 
 		 389 aa  421  1e-116  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.112692  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4305  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  50.99 
 
 		 363 aa  320  1.9999999999999998e-86  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0286  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  50 
 
 		 361 aa  312  4.999999999999999e-84  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0906  hypothetical protein  49.43 
 
 		 354 aa  289  5.0000000000000004e-77  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000000883258  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1376  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  46.11 
 
 		 399 aa  289  6e-77  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.503977 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3583  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  46.49 
 
 		 399 aa  287  2e-76  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1403  radical SAM enzyme, Cfr family  44.89 
 
 		 371 aa  279  6e-74  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2488  radical SAM protein  42.48 
 
 		 356 aa  274  2.0000000000000002e-72  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00360289  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2783  radical SAM enzyme, Cfr family  48.08 
 
 		 408 aa  273  3e-72  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0164  radical SAM enzyme, Cfr family  51.97 
 
 		 353 aa  272  9e-72  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1388  radical SAM enzyme, Cfr family  46.36 
 
 		 462 aa  268  1e-70  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000126812  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1119  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  41.38 
 
 		 343 aa  268  2e-70  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1955  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  42.49 
 
 		 365 aa  265  7e-70  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1993  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  39.83 
 
 		 347 aa  265  8.999999999999999e-70  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1065  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  41.79 
 
 		 364 aa  265  1e-69  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1011  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  40.52 
 
 		 343 aa  264  2e-69  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1711  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  39.53 
 
 		 347 aa  264  2e-69  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.294696  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1436  radical SAM enzyme, Cfr family  41.54 
 
 		 348 aa  263  3e-69  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1249  radical SAM protein  45.53 
 
 		 360 aa  258  2e-67  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09940  radical SAM enzyme, Cfr family  43.48 
 
 		 349 aa  257  3e-67  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0834  radical SAM protein  43.88 
 
 		 428 aa  256  6e-67  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0281827 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0331  radical SAM enzyme, Cfr family  41.04 
 
 		 344 aa  256  6e-67  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.81414 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0665  radical SAM enzyme, Cfr family  40.8 
 
 		 341 aa  255  7e-67  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1338  radical SAM enzyme, Cfr family  40.34 
 
 		 351 aa  255  7e-67  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0802459  normal  0.737261 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2229  radical SAM enzyme, Cfr family  46.36 
 
 		 372 aa  255  1.0000000000000001e-66  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.225702  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1313  radical SAM enzyme, Cfr family  44.98 
 
 		 360 aa  254  2.0000000000000002e-66  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2317  radical SAM enzyme, Cfr family  46.06 
 
 		 372 aa  254  2.0000000000000002e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.144753  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1043  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  40.46 
 
 		 341 aa  253  4.0000000000000004e-66  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1631  hypothetical protein  45.48 
 
 		 372 aa  252  1e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.212269  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3906  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  40.75 
 
 		 362 aa  251  2e-65  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3715  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  40.75 
 
 		 362 aa  251  2e-65  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3605  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  40.75 
 
 		 362 aa  251  2e-65  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3623  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  40.75 
 
 		 362 aa  251  2e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3912  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  40.75 
 
 		 362 aa  251  2e-65  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00181542  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4002  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  40.75 
 
 		 362 aa  251  2e-65  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3878  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  40.75 
 
 		 362 aa  251  2e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.42646e-19 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1791  radical SAM protein  46.04 
 
 		 359 aa  251  2e-65  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2516  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  40.46 
 
 		 362 aa  250  3e-65  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00628508  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2180  radical SAM protein  45.67 
 
 		 377 aa  249  4e-65  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1751  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  39.42 
 
 		 342 aa  249  6e-65  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.493385  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3963  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  40.46 
 
 		 362 aa  249  7e-65  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1280  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  40.75 
 
 		 362 aa  248  1e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0793601 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0633  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  43.87 
 
 		 344 aa  247  2e-64  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0572  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  37.43 
 
 		 349 aa  247  3e-64  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00705994  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1623  hypothetical protein  43.6 
 
 		 362 aa  247  3e-64  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00271207 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2988  hypothetical protein  41.95 
 
 		 364 aa  246  4e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.45923  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0825  hypothetical protein  41.69 
 
 		 366 aa  246  4e-64  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1361  radical SAM enzyme, Cfr family  38.96 
 
 		 372 aa  246  4e-64  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1708  radical SAM protein  41.67 
 
 		 350 aa  246  4.9999999999999997e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2051  radical SAM protein  42.45 
 
 		 376 aa  245  8e-64  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0429585  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_3052  predicted protein  42.78 
 
 		 378 aa  245  9.999999999999999e-64  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.100127  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1421  radical SAM protein  43.42 
 
 		 373 aa  245  9.999999999999999e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.196113  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5022  radical SAM protein  44.9 
 
 		 397 aa  244  1.9999999999999999e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.380261  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1385  radical SAM protein  40.51 
 
 		 351 aa  244  1.9999999999999999e-63  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1287  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  42.36 
 
 		 373 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.900175 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2740  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  39.04 
 
 		 393 aa  244  1.9999999999999999e-63  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1590  radical SAM protein  47.37 
 
 		 318 aa  244  3e-63  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2956  radical SAM enzyme, Cfr family  39.58 
 
 		 342 aa  243  3.9999999999999997e-63  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1115  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  39.89 
 
 		 392 aa  243  5e-63  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1699  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  38.92 
 
 		 348 aa  243  6e-63  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2887  hypothetical protein  43.18 
 
 		 366 aa  242  7.999999999999999e-63  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4328  radical SAM protein  41.74 
 
 		 381 aa  242  7.999999999999999e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000000214748 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0421  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  39.73 
 
 		 398 aa  242  9e-63  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.662236  hitchhiker  0.00298691 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1290  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  39.73 
 
 		 398 aa  242  9e-63  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1183  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  39.73 
 
 		 398 aa  242  9e-63  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3315  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  41.21 
 
 		 373 aa  241  1e-62  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>