150 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_3297 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_8908  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  74.7 
 
 		 672 aa  947    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3297  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  100 
 
 		 659 aa  1284    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.925836 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8108  ATP-dependent DNA helicase  52.39 
 
 		 719 aa  649    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4482  hypothetical protein  54.48 
 
 		 680 aa  629  1e-179  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4077  hypothetical protein  54.56 
 
 		 695 aa  617  1e-175  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0451671 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21750  DNA/RNA helicase, superfamily I  54.92 
 
 		 695 aa  599  1e-170  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.114546 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4146  putative ATP-dependent DNA helicase  54.01 
 
 		 717 aa  595  1e-169  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1224  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  52.87 
 
 		 645 aa  590  1e-167  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.188464 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0164  ATP-dependent DNA helicase  55.62 
 
 		 684 aa  588  1e-166  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.532739 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0489  hypothetical protein  53.08 
 
 		 692 aa  582  1.0000000000000001e-165  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0388236 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4871  hypothetical protein  53.88 
 
 		 666 aa  580  1e-164  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4092  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  53.65 
 
 		 670 aa  581  1e-164  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.445905  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2694  hypothetical protein  52.24 
 
 		 679 aa  564  1.0000000000000001e-159  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.129277 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2397  putative ATP/GTP binding protein  50.14 
 
 		 727 aa  543  1e-153  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.115029  normal  0.0547233 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2447  putative ATP-dependent DNA helicase  48.88 
 
 		 792 aa  528  1e-148  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.250058  normal  0.190451 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24030  DNA/RNA helicase, superfamily I  41.04 
 
 		 710 aa  358  9.999999999999999e-98  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2679  Superfamily I DNA and RNA helicase  36.88 
 
 		 1048 aa  299  1e-79  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.357877  normal  0.0252741 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3796  putative helicase  34.99 
 
 		 735 aa  271  2.9999999999999997e-71  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2547  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  35.29 
 
 		 861 aa  271  4e-71  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0101417  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1829  ATP-dependent DNA helicase  35.23 
 
 		 706 aa  262  2e-68  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1059  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  34.08 
 
 		 732 aa  254  4.0000000000000004e-66  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.394879  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4508  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  34.48 
 
 		 693 aa  253  6e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0576  DNA or RNA helicase, Superfamily I family protein  30.72 
 
 		 758 aa  251  4e-65  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0841204 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09430  DNA/RNA helicase, superfamily I  36.14 
 
 		 705 aa  246  9.999999999999999e-64  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.260549 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14320  DNA/RNA helicase, superfamily I  34.19 
 
 		 758 aa  245  1.9999999999999999e-63  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00598075  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1575  UvrD/REP helicase  35.02 
 
 		 750 aa  242  2e-62  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0191582 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1438  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  33.96 
 
 		 767 aa  240  5.999999999999999e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0481652  normal  0.535977 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1900  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  33.73 
 
 		 724 aa  239  1e-61  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5818  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  43 
 
 		 766 aa  238  3e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.814611 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3630  hypothetical protein  34.44 
 
 		 705 aa  237  4e-61  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000100418 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4531  putative helicase protein  32.95 
 
 		 726 aa  235  2.0000000000000002e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5784  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  33.04 
 
 		 691 aa  234  5e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3388  hypothetical protein  35.25 
 
 		 706 aa  229  1e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.667328 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1510  ATP-dependent DNA helicase  35.44 
 
 		 742 aa  228  3e-58  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000268127 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0962  hypothetical protein  34.59 
 
 		 703 aa  225  2e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.916066  normal  0.251911 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1511  ATP-dependent DNA helicase  36.92 
 
 		 742 aa  223  9.999999999999999e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0952  putative helicase  31.8 
 
 		 829 aa  221  3e-56  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.249866 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16000  DNA/RNA helicase, superfamily I  40.98 
 
 		 813 aa  217  5e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4154  superfamily I DNA and RNA helicase  30.07 
 
 		 742 aa  217  5.9999999999999996e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.534763  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5052  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  37.74 
 
 		 733 aa  214  4.9999999999999996e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.540758  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22980  DNA/RNA helicase, superfamily I  38.24 
 
 		 741 aa  213  7e-54  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.51647  normal  0.435822 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2598  putative helicase  38.59 
 
 		 734 aa  209  1e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.75582 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10650  DNA/RNA helicase, superfamily I  32.45 
 
 		 747 aa  209  1e-52  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.85506  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2428  ATP-dependent DNA helicase  40.88 
 
 		 726 aa  207  7e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0523427  normal  0.292743 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3607  ATP-dependent DNA helicase  36.79 
 
 		 759 aa  206  1e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0408041 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1592  hypothetical protein  40.84 
 
 		 776 aa  201  3.9999999999999996e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.430325  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1262  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  38.24 
 
 		 757 aa  201  3.9999999999999996e-50  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.188499  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5583  putative helicase  37.61 
 
 		 874 aa  200  9e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2425  hypothetical protein  36.84 
 
 		 771 aa  199  1.0000000000000001e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.548064  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2150  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  35.73 
 
 		 746 aa  199  2.0000000000000003e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.491919 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0171  superfamily I DNA and RNA helicase  35.18 
 
 		 759 aa  198  2.0000000000000003e-49  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2623  uvrD/Rep helicase family protein  26.69 
 
 		 689 aa  197  5.000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000508135  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2539  UvrD/Rep helicase family protein  26.54 
 
 		 689 aa  197  5.000000000000001e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000078955  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2814  uvrD/Rep helicase family protein  26.69 
 
 		 689 aa  197  5.000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000183326  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1552  hypothetical protein  40.35 
 
 		 754 aa  195  2e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0457555  normal  0.0469841 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2469  UvrD/Rep helicase family protein  27.12 
 
 		 691 aa  195  2e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00119782  normal  0.334322 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7576  hypothetical protein  36.24 
 
 		 795 aa  195  2e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1826  superfamily I DNA and RNA helicase  30.29 
 
 		 716 aa  195  3e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.200376  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4104  AAA ATPase  43.14 
 
 		 799 aa  194  4e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.133628  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0213  superfamily I DNA and RNA helicases  30.03 
 
 		 717 aa  194  5e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2615  UvrD/Rep helicase family protein  27.52 
 
 		 691 aa  194  5e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000204354  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2861  uvrD/Rep helicase family protein  26.54 
 
 		 689 aa  191  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000106246  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2572  UvrD/Rep helicase family protein  26.2 
 
 		 689 aa  191  4e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000433537  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2821  uvrD/Rep helicase family protein  26.26 
 
 		 689 aa  190  8e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000164243 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3817  hypothetical protein  40.15 
 
 		 765 aa  190  9e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0108  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  36.32 
 
 		 804 aa  189  1e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1311  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  36.64 
 
 		 748 aa  189  1e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5266  putative helicase  37.23 
 
 		 724 aa  187  8e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5355  putative helicase  37.23 
 
 		 724 aa  187  8e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2839  uvrD/Rep helicase family protein  27.2 
 
 		 689 aa  186  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000185117  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1110  hypothetical protein  28.93 
 
 		 702 aa  186  1.0000000000000001e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.924141 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2823  UvrD/Rep helicase family protein  26.66 
 
 		 691 aa  186  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.271387  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3495  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  30.68 
 
 		 728 aa  184  6e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.471615  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5043  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  31.91 
 
 		 685 aa  183  8.000000000000001e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5645  putative helicase  36.34 
 
 		 724 aa  183  1e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.577217  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3423  superfamily I DNA helicase  25.31 
 
 		 760 aa  182  2e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000327842  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05760  DNA/RNA helicase, superfamily I  31.42 
 
 		 755 aa  181  2.9999999999999997e-44  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.594948 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0032  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  38.07 
 
 		 786 aa  179  2e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13570  DNA/RNA helicase, superfamily I  34.27 
 
 		 764 aa  176  1.9999999999999998e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.176836 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2857  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  35.99 
 
 		 788 aa  174  2.9999999999999996e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0765  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  44.94 
 
 		 832 aa  172  2e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.360581  normal  0.192195 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1591  ATP-dependent DNA helicase UvrD  23.96 
 
 		 763 aa  171  6e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.68447  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1872  ATP-dependent DNA helicase UvrD  23.82 
 
 		 763 aa  170  1e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7542  hypothetical protein  36.71 
 
 		 761 aa  168  2.9999999999999998e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.322202 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4189  hypothetical protein  37.39 
 
 		 902 aa  165  3e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.060673  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0951  ATP-dependent DNA helicase replicase  26.17 
 
 		 777 aa  163  1e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0973  UvrD/Rep family helicase  25.51 
 
 		 776 aa  162  2e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1040  UvrD/Rep family helicase  25.51 
 
 		 776 aa  162  2e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4227  helicase, UvrD/Rep family  25.07 
 
 		 778 aa  161  3e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00019989  hitchhiker  0.000557099 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0961  ATP-dependent DNA helicase replicase  25.58 
 
 		 776 aa  158  3e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1050  hypothetical protein  24.62 
 
 		 702 aa  158  3e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0457  superfamily I DNA and RNA helicase  34.17 
 
 		 710 aa  155  2e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0566  helicase, putative  24.34 
 
 		 706 aa  147  7.0000000000000006e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.712813  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2903  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  33.78 
 
 		 732 aa  147  8.000000000000001e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0195315  hitchhiker  0.0000337224 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0580  putative helicase  24.19 
 
 		 706 aa  147  9e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.937698  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3352  superfamily I DNA and RNA helicase  31.72 
 
 		 715 aa  146  1e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5180  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  31.61 
 
 		 715 aa  146  1e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00292486 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1625  superfamily I DNA/RNA helicase-like protein  25.4 
 
 		 768 aa  139  2e-31  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1963  helicase  24.46 
 
 		 748 aa  139  2e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00160  DNA/RNA helicase, superfamily I  26.92 
 
 		 706 aa  134  5e-30  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.805287 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>