More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_2949 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_2949  hydantoinase/oxoprolinase  100 
 
 
519 aa  984    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4116  Hydantoinase/oxoprolinase  57.12 
 
 
519 aa  512  1e-144  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.665366  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1547  hydantoinase/oxoprolinase  50.68 
 
 
515 aa  498  1e-139  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1963  hydantoinase/oxoprolinase  50.87 
 
 
516 aa  486  1e-136  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3586  Hydantoinase/oxoprolinase  49.61 
 
 
519 aa  474  1e-132  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  0.0167077  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0865  Hydantoinase/oxoprolinase  47.3 
 
 
518 aa  459  9.999999999999999e-129  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.235208  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0095  hydantoinase/oxoprolinase  49.81 
 
 
517 aa  447  1.0000000000000001e-124  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3366  N-methylhydantoinase A, beta-subunit (ATP- hydrolyzing)  51.46 
 
 
507 aa  446  1.0000000000000001e-124  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.712496  normal  0.127548 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3064  Hydantoinase/oxoprolinase  48.47 
 
 
526 aa  442  1e-123  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5378  hydantoinase  47.12 
 
 
517 aa  439  9.999999999999999e-123  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22890  N-methylhydantoinase A/acetone carboxylase, beta subunit  49.32 
 
 
515 aa  439  9.999999999999999e-123  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.700503 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0427  hydantoinase/oxoprolinase  49.42 
 
 
519 aa  437  1e-121  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0645976  normal  0.347806 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0652  Hydantoinase/oxoprolinase  49.33 
 
 
516 aa  426  1e-118  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0481682 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4110  Hydantoinase/oxoprolinase  51.45 
 
 
522 aa  419  1e-116  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.571056  normal  0.710404 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2141  Hydantoinase/oxoprolinase  48.84 
 
 
519 aa  418  1e-116  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0444045 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1851  hydantoinase/oxoprolinase  47.01 
 
 
518 aa  417  9.999999999999999e-116  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.51976  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1825  hydantoinase/oxoprolinase  42.61 
 
 
523 aa  406  1.0000000000000001e-112  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2416  putative hydantoinase A  47.28 
 
 
517 aa  404  1e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1727  Hydantoinase/oxoprolinase  43.92 
 
 
522 aa  401  9.999999999999999e-111  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.666608  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1995  Hydantoinase/oxoprolinase  44.47 
 
 
522 aa  395  1e-108  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4112  hydantoinase/oxoprolinase  38.92 
 
 
538 aa  375  1e-102  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2452  Hydantoinase/oxoprolinase  40.67 
 
 
513 aa  367  1e-100  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.79439  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4196  hydantoinase/oxoprolinase  44.32 
 
 
521 aa  317  4e-85  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0179631  normal  0.0955603 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04610  hydantoinase, putative  38.82 
 
 
999 aa  314  2.9999999999999996e-84  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.6497  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4083  hydantoinase/oxoprolinase  42.83 
 
 
517 aa  313  5.999999999999999e-84  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0965914  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41374  predicted protein  36.82 
 
 
983 aa  295  1e-78  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3368  hydantoinase  43.22 
 
 
464 aa  278  2e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00437315  normal  0.282365 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07952  conserved hypothetical protein  37.12 
 
 
994 aa  276  5e-73  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.77272  normal  0.240542 
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3583  Hydantoinaseoxoprolinase domain protein  39.12 
 
 
463 aa  231  2e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2206  Hydantoinaseoxoprolinase domain protein  48.53 
 
 
436 aa  231  2e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00953084  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2126  Hydantoinase/oxoprolinase  35.37 
 
 
556 aa  163  5.0000000000000005e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.031039  normal  0.0613561 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1734  Hydantoinase/oxoprolinase  36.18 
 
 
658 aa  156  1e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1134  hydantoinase/oxoprolinase  33.84 
 
 
645 aa  150  7e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.187357  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1967  hydantoinase/oxoprolinase  33.86 
 
 
639 aa  149  9e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0899  hydantoinase/oxoprolinase  34.81 
 
 
643 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.742994  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2933  hydantoinase/oxoprolinase  30.12 
 
 
570 aa  145  1e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0177705 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2491  hydantoinase  35.15 
 
 
701 aa  143  8e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1068  hydantoinase  32.44 
 
 
642 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1067  hydantoinase  32.72 
 
 
671 aa  136  7.000000000000001e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1886  hydantoinase/oxoprolinase  29.29 
 
 
560 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1404  hydantoinase/oxoprolinase  29.77 
 
 
560 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3269  hydantoinase/oxoprolinase  37.3 
 
 
667 aa  133  6.999999999999999e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.471232  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4059  hydantoinase/oxoprolinase  32.08 
 
 
566 aa  132  1.0000000000000001e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4047  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  35.31 
 
 
676 aa  132  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0166577  decreased coverage  0.00142198 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3641  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  33.24 
 
 
676 aa  130  5.0000000000000004e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0141  hydantoinase  33.03 
 
 
644 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.456007 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2490  hydantoinase  31.76 
 
 
636 aa  129  2.0000000000000002e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0176  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  32.63 
 
 
682 aa  128  3e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3162  hydantoinase/oxoprolinase  31.46 
 
 
572 aa  128  3e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.212808  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0817  hydantoinase/oxoprolinase  31.99 
 
 
638 aa  128  3e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.391568  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22450  N-methylhydantoinase (ATP-hydrolyzing)  31.17 
 
 
579 aa  126  8.000000000000001e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2805  hydantoinase/oxoprolinase  34.78 
 
 
668 aa  125  2e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.726576 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0475  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  34.03 
 
 
680 aa  121  3.9999999999999996e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3091  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  29.84 
 
 
681 aa  120  7e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.435048  normal  0.0725739 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3293  hydantoinase/oxoprolinase  37.54 
 
 
675 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.220696  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3607  hypothetical protein  37.54 
 
 
675 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3493  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  30.1 
 
 
681 aa  119  9.999999999999999e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.875843  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3957  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  34.04 
 
 
674 aa  119  1.9999999999999998e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0900  hydantoinase/oxoprolinase  31.38 
 
 
641 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.409671  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0092  hydantoinase/oxoprolinase family protein  32.23 
 
 
575 aa  117  3.9999999999999997e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3601  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  30.97 
 
 
682 aa  117  3.9999999999999997e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2299  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  30.89 
 
 
694 aa  117  5e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.375878  normal  0.208319 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2282  hydantoinase/oxoprolinase family protein  32.12 
 
 
550 aa  117  5e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2933  hydantoinase/oxoprolinase  31.83 
 
 
570 aa  117  6.9999999999999995e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.714431 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9128  hydantoin utilization protein  30.23 
 
 
680 aa  115  1.0000000000000001e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3765  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  32.45 
 
 
690 aa  115  2.0000000000000002e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.32896  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2410  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  33.4 
 
 
658 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2209  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  33.51 
 
 
690 aa  114  3e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.454656  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5966  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  31.15 
 
 
694 aa  115  3e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.858122  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8176  hydantoin utilization protein  30.81 
 
 
681 aa  114  3e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2368  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  34.37 
 
 
680 aa  114  5e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.773275  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1245  Hydantoinase/oxoprolinase  30.25 
 
 
679 aa  113  6e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.529227  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2860  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  32.11 
 
 
684 aa  114  6e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0836  Hydantoinase/oxoprolinase  31.12 
 
 
583 aa  113  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0997414 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0975  hydantoinase/oxoprolinase  28.89 
 
 
559 aa  112  1.0000000000000001e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0187  Hydantoinase/oxoprolinase  31.25 
 
 
553 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5632  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  31.11 
 
 
698 aa  111  3e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0796839 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20940  N-methylhydantoinase A/acetone carboxylase, beta subunit  29.9 
 
 
706 aa  110  4.0000000000000004e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.796393  normal  0.0791884 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1002  hydantoinase/oxoprolinase  30.33 
 
 
550 aa  111  4.0000000000000004e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.184636  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0999  Hydantoinase/oxoprolinase  31.16 
 
 
564 aa  110  4.0000000000000004e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1967  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  27.76 
 
 
683 aa  110  8.000000000000001e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.471219  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2942  5-oxoprolinase  33.07 
 
 
669 aa  108  2e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0079  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  31.12 
 
 
687 aa  108  2e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8320  hydantoin utilization protein  30.89 
 
 
676 aa  108  3e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3307  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  30.75 
 
 
673 aa  108  3e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.593183  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5220  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  33.69 
 
 
680 aa  107  4e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.46382  normal  0.858688 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6223  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  30 
 
 
690 aa  107  6e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.220681  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2529  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  32.11 
 
 
685 aa  107  7e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.413249  normal  0.693617 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0371  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  30.79 
 
 
707 aa  107  7e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0574  Hydantoinase/oxoprolinase  25.36 
 
 
708 aa  106  1e-21  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000997997  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2130  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  32.13 
 
 
687 aa  105  1e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0691  hydantoin utilization protein A  34.66 
 
 
689 aa  105  2e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.167885  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1696  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  29.74 
 
 
684 aa  105  2e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4353  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  29.97 
 
 
692 aa  105  2e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0990  hydantoinase/oxoprolinase  29.93 
 
 
557 aa  104  4e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.454811 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6272  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  30.63 
 
 
687 aa  104  5e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.106273 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0779  Hydantoinase/oxoprolinase  27.29 
 
 
553 aa  103  8e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4193  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  32.36 
 
 
765 aa  103  8e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3664  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  28.25 
 
 
691 aa  103  1e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00438442 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6536  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  29.95 
 
 
678 aa  102  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.234426 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>