More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_1547 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013412  GYMC61_3586  Hydantoinase/oxoprolinase  69.77 
 
 
519 aa  745    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  0.0167077  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0865  Hydantoinase/oxoprolinase  63.25 
 
 
518 aa  671    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.235208  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1963  hydantoinase/oxoprolinase  64.73 
 
 
516 aa  709    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1547  hydantoinase/oxoprolinase  100 
 
 
515 aa  1037    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3064  Hydantoinase/oxoprolinase  59.23 
 
 
526 aa  613  9.999999999999999e-175  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0652  Hydantoinase/oxoprolinase  55.53 
 
 
516 aa  549  1e-155  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0481682 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0427  hydantoinase/oxoprolinase  53.32 
 
 
519 aa  549  1e-155  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0645976  normal  0.347806 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0095  hydantoinase/oxoprolinase  51.66 
 
 
517 aa  527  1e-148  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2141  Hydantoinase/oxoprolinase  53.23 
 
 
519 aa  526  1e-148  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0444045 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1851  hydantoinase/oxoprolinase  51.36 
 
 
518 aa  527  1e-148  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.51976  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1995  Hydantoinase/oxoprolinase  51.46 
 
 
522 aa  525  1e-148  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5378  hydantoinase  50.58 
 
 
517 aa  522  1e-147  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1727  Hydantoinase/oxoprolinase  51.54 
 
 
522 aa  521  1e-146  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.666608  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22890  N-methylhydantoinase A/acetone carboxylase, beta subunit  50 
 
 
515 aa  508  9.999999999999999e-143  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.700503 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3366  N-methylhydantoinase A, beta-subunit (ATP- hydrolyzing)  51.76 
 
 
507 aa  497  1e-139  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.712496  normal  0.127548 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4110  Hydantoinase/oxoprolinase  50.98 
 
 
522 aa  492  9.999999999999999e-139  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.571056  normal  0.710404 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4116  Hydantoinase/oxoprolinase  47.28 
 
 
519 aa  479  1e-134  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.665366  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1825  hydantoinase/oxoprolinase  47.51 
 
 
523 aa  474  1e-132  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2416  putative hydantoinase A  47.57 
 
 
517 aa  470  1.0000000000000001e-131  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2949  hydantoinase/oxoprolinase  50.97 
 
 
519 aa  464  1e-129  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4112  hydantoinase/oxoprolinase  45.07 
 
 
538 aa  458  9.999999999999999e-129  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2452  Hydantoinase/oxoprolinase  46.25 
 
 
513 aa  430  1e-119  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.79439  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB04610  hydantoinase, putative  43.9 
 
 
999 aa  389  1e-107  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.6497  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4083  hydantoinase/oxoprolinase  44.14 
 
 
517 aa  375  1e-103  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0965914  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41374  predicted protein  40.97 
 
 
983 aa  365  1e-99  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4196  hydantoinase/oxoprolinase  41.91 
 
 
521 aa  358  1.9999999999999998e-97  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0179631  normal  0.0955603 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07952  conserved hypothetical protein  38.16 
 
 
994 aa  334  2e-90  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.77272  normal  0.240542 
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3583  Hydantoinaseoxoprolinase domain protein  34.56 
 
 
463 aa  272  1e-71  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3368  hydantoinase  35.23 
 
 
464 aa  254  3e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00437315  normal  0.282365 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2206  Hydantoinaseoxoprolinase domain protein  34.12 
 
 
436 aa  204  3e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00953084  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1134  hydantoinase/oxoprolinase  35.76 
 
 
645 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.187357  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0899  hydantoinase/oxoprolinase  34.4 
 
 
643 aa  167  4e-40  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.742994  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1967  hydantoinase/oxoprolinase  34.11 
 
 
639 aa  161  2e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1734  Hydantoinase/oxoprolinase  34.41 
 
 
658 aa  157  4e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4059  hydantoinase/oxoprolinase  26.76 
 
 
566 aa  157  4e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1068  hydantoinase  33.04 
 
 
642 aa  156  1e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2933  hydantoinase/oxoprolinase  28.74 
 
 
570 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0177705 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2933  hydantoinase/oxoprolinase  33.99 
 
 
570 aa  149  2.0000000000000003e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.714431 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1404  hydantoinase/oxoprolinase  29.2 
 
 
560 aa  149  2.0000000000000003e-34  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1067  hydantoinase  32.35 
 
 
671 aa  144  3e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2805  hydantoinase/oxoprolinase  33.33 
 
 
668 aa  144  3e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.726576 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3269  hydantoinase/oxoprolinase  35.35 
 
 
667 aa  143  7e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.471232  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2491  hydantoinase  31.01 
 
 
701 aa  142  9.999999999999999e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2126  Hydantoinase/oxoprolinase  29.3 
 
 
556 aa  140  3.9999999999999997e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.031039  normal  0.0613561 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0574  Hydantoinase/oxoprolinase  27.65 
 
 
708 aa  140  6e-32  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000997997  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0141  hydantoinase  31.27 
 
 
644 aa  139  8.999999999999999e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.456007 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0999  Hydantoinase/oxoprolinase  27.29 
 
 
564 aa  139  1e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0187  Hydantoinase/oxoprolinase  33.14 
 
 
553 aa  138  2e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0817  hydantoinase/oxoprolinase  31.86 
 
 
638 aa  136  9e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.391568  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3162  hydantoinase/oxoprolinase  26.5 
 
 
572 aa  136  9.999999999999999e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.212808  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0900  hydantoinase/oxoprolinase  31.58 
 
 
641 aa  135  9.999999999999999e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.409671  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1886  hydantoinase/oxoprolinase  27.89 
 
 
560 aa  135  1.9999999999999998e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4047  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  31.62 
 
 
676 aa  134  3.9999999999999996e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0166577  decreased coverage  0.00142198 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0836  Hydantoinase/oxoprolinase  28.06 
 
 
583 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0997414 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0092  hydantoinase/oxoprolinase family protein  31.16 
 
 
575 aa  132  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0176  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  28.87 
 
 
682 aa  130  4.0000000000000003e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2490  hydantoinase  29.79 
 
 
636 aa  126  1e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3607  hypothetical protein  33.03 
 
 
675 aa  125  2e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3293  hydantoinase/oxoprolinase  33.03 
 
 
675 aa  125  2e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.220696  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3091  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  28.73 
 
 
681 aa  124  5e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.435048  normal  0.0725739 
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3601  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  29.97 
 
 
682 aa  122  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2734  Hydantoinase/oxoprolinase  25.9 
 
 
559 aa  120  6e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8176  hydantoin utilization protein  28.91 
 
 
681 aa  120  6e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0654  hydantoinase/oxoprolinase  26.81 
 
 
708 aa  119  9.999999999999999e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3493  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  28.11 
 
 
681 aa  119  9.999999999999999e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.875843  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2282  hydantoinase/oxoprolinase family protein  27.82 
 
 
550 aa  119  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2018  Hydantoinase/oxoprolinase  26.96 
 
 
707 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.128113  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1002  hydantoinase/oxoprolinase  26.33 
 
 
550 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.184636  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2860  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  27.82 
 
 
684 aa  114  3e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6272  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  30.48 
 
 
687 aa  115  3e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.106273 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3766  hydantoinase/oxoprolinase  26.07 
 
 
710 aa  114  4.0000000000000004e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9128  hydantoin utilization protein  29.31 
 
 
680 aa  114  4.0000000000000004e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3957  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  29.84 
 
 
674 aa  114  6e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0990  hydantoinase/oxoprolinase  26.43 
 
 
557 aa  114  6e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.454811 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22450  N-methylhydantoinase (ATP-hydrolyzing)  27.5 
 
 
579 aa  114  6e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6223  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  28.46 
 
 
690 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.220681  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0161  Hydantoinase/oxoprolinase  31.01 
 
 
715 aa  112  1.0000000000000001e-23  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3641  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  29.52 
 
 
676 aa  111  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0079  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  28.61 
 
 
687 aa  112  2.0000000000000002e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01100  hypothetical 5-oxoprolinase (Eurofung)  29.31 
 
 
1355 aa  110  5e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0381114 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0475  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  30.18 
 
 
680 aa  109  1e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2130  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  26.96 
 
 
687 aa  108  2e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0975  hydantoinase/oxoprolinase  26.78 
 
 
559 aa  107  5e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1696  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  27.63 
 
 
684 aa  106  8e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00009  hypothetical N-methylhydantoinase (Eurofung)  28.32 
 
 
1362 aa  105  2e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00000169521 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5622  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  29.31 
 
 
706 aa  105  2e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.49803 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20940  N-methylhydantoinase A/acetone carboxylase, beta subunit  28.5 
 
 
706 aa  105  2e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.796393  normal  0.0791884 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0377  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  26.46 
 
 
676 aa  105  2e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2647  hydantoinase/oxoprolinase  28.65 
 
 
678 aa  105  2e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1967  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  28.41 
 
 
683 aa  104  3e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.471219  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0422  hydantoinase/oxoprolinase  30.37 
 
 
715 aa  104  3e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0930  hydantoinase/oxoprolinase  25.69 
 
 
481 aa  104  4e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00360521  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5243  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  29.31 
 
 
765 aa  104  5e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3384  Hydantoinase/oxoprolinase  29.07 
 
 
735 aa  103  7e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.637442  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2632  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  27.37 
 
 
701 aa  102  1e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.502801 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3765  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  30.85 
 
 
690 aa  102  2e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.32896  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1032  Hydantoinase/oxoprolinase  25.28 
 
 
546 aa  102  2e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4353  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  26.79 
 
 
692 aa  102  2e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8320  hydantoin utilization protein  27.59 
 
 
676 aa  100  4e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3115  Hydantoinase/oxoprolinase  29.47 
 
 
686 aa  100  7e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>