112 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_3368 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_3368  hydantoinase  100 
 
 		 464 aa  863    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00437315  normal  0.282365 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1963  hydantoinase/oxoprolinase  35.62 
 
 		 516 aa  296  4e-79  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4116  Hydantoinase/oxoprolinase  42.3 
 
 		 519 aa  291  2e-77  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.665366  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2949  hydantoinase/oxoprolinase  43.44 
 
 		 519 aa  290  3e-77  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1547  hydantoinase/oxoprolinase  35.76 
 
 		 515 aa  289  8e-77  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3586  Hydantoinase/oxoprolinase  36.72 
 
 		 519 aa  282  1e-74  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  0.0167077  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0865  Hydantoinase/oxoprolinase  33.53 
 
 		 518 aa  276  8e-73  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.235208  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3366  N-methylhydantoinase A, beta-subunit (ATP- hydrolyzing)  39.24 
 
 		 507 aa  272  1e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.712496  normal  0.127548 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0095  hydantoinase/oxoprolinase  36.15 
 
 		 517 aa  247  3e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3064  Hydantoinase/oxoprolinase  34.62 
 
 		 526 aa  246  9e-64  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2141  Hydantoinase/oxoprolinase  36.52 
 
 		 519 aa  239  6.999999999999999e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0444045 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22890  N-methylhydantoinase A/acetone carboxylase, beta subunit  35.55 
 
 		 515 aa  236  1.0000000000000001e-60  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.700503 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5378  hydantoinase  33.66 
 
 		 517 aa  234  2.0000000000000002e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1851  hydantoinase/oxoprolinase  35.55 
 
 		 518 aa  230  4e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.51976  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1995  Hydantoinase/oxoprolinase  31.46 
 
 		 522 aa  229  9e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1825  hydantoinase/oxoprolinase  30.75 
 
 		 523 aa  225  1e-57  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0427  hydantoinase/oxoprolinase  33.33 
 
 		 519 aa  224  2e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0645976  normal  0.347806 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0652  Hydantoinase/oxoprolinase  33.98 
 
 		 516 aa  223  8e-57  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0481682 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2416  putative hydantoinase A  35.74 
 
 		 517 aa  222  9.999999999999999e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4112  hydantoinase/oxoprolinase  28.82 
 
 		 538 aa  215  9.999999999999999e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1727  Hydantoinase/oxoprolinase  30.8 
 
 		 522 aa  216  9.999999999999999e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.666608  n/a   
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3583  Hydantoinaseoxoprolinase domain protein  32.42 
 
 		 463 aa  209  9e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4110  Hydantoinase/oxoprolinase  35.35 
 
 		 522 aa  207  2e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.571056  normal  0.710404 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2452  Hydantoinase/oxoprolinase  28.46 
 
 		 513 aa  202  9.999999999999999e-51  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.79439  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2206  Hydantoinaseoxoprolinase domain protein  37.26 
 
 		 436 aa  194  2e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00953084  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04610  hydantoinase, putative  31.9 
 
 		 999 aa  177  4e-43  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.6497  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4196  hydantoinase/oxoprolinase  32.24 
 
 		 521 aa  162  1e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0179631  normal  0.0955603 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41374  predicted protein  27.17 
 
 		 983 aa  161  2e-38  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4083  hydantoinase/oxoprolinase  31.25 
 
 		 517 aa  160  5e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0965914  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07952  conserved hypothetical protein  27.04 
 
 		 994 aa  116  8.999999999999998e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.77272  normal  0.240542 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4041  hydantoinase  32.49 
 
 		 374 aa  99  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.711164  decreased coverage  0.0015292 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1134  hydantoinase/oxoprolinase  28.15 
 
 		 645 aa  92.4  2e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.187357  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1967  hydantoinase/oxoprolinase  27.76 
 
 		 639 aa  88.6  2e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1068  hydantoinase  26.51 
 
 		 642 aa  84.3  0.000000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0899  hydantoinase/oxoprolinase  26.25 
 
 		 643 aa  82.8  0.00000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.742994  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1734  Hydantoinase/oxoprolinase  27.72 
 
 		 658 aa  82.8  0.00000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0141  hydantoinase  26.76 
 
 		 644 aa  82.4  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.456007 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1067  hydantoinase  26.42 
 
 		 671 aa  82.4  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2491  hydantoinase  27.27 
 
 		 701 aa  75.5  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0900  hydantoinase/oxoprolinase  24.42 
 
 		 641 aa  72.4  0.00000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.409671  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3269  hydantoinase/oxoprolinase  29.55 
 
 		 667 aa  72.4  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.471232  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0817  hydantoinase/oxoprolinase  26.26 
 
 		 638 aa  71.6  0.00000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.391568  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2490  hydantoinase  26.67 
 
 		 636 aa  71.2  0.00000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2805  hydantoinase/oxoprolinase  29.08 
 
 		 668 aa  70.9  0.00000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.726576 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2442  hydantoinase/oxoprolinase  30.35 
 
 		 694 aa  66.2  0.000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3607  hypothetical protein  31.6 
 
 		 675 aa  61.6  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0475  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  30.65 
 
 		 680 aa  62.4  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3293  hydantoinase/oxoprolinase  31.6 
 
 		 675 aa  61.6  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.220696  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9148  hydantoin utilization protein  29.43 
 
 		 687 aa  61.6  0.00000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2632  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  30.15 
 
 		 701 aa  61.2  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.502801 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0176  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  28.25 
 
 		 682 aa  61.2  0.00000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2130  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  28.62 
 
 		 687 aa  60.8  0.00000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9128  hydantoin utilization protein  27.24 
 
 		 680 aa  60.5  0.00000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1696  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  27.22 
 
 		 684 aa  60.1  0.00000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0985  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  33.12 
 
 		 726 aa  58.5  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.623858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0222  Hydantoinase/oxoprolinase  28.29 
 
 		 557 aa  58.5  0.0000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.134992 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2933  hydantoinase/oxoprolinase  28.75 
 
 		 570 aa  57.8  0.0000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.714431 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8320  hydantoin utilization protein  27.3 
 
 		 676 aa  57.8  0.0000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0187  Hydantoinase/oxoprolinase  28.43 
 
 		 553 aa  57.8  0.0000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2529  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  30.03 
 
 		 685 aa  57.4  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.413249  normal  0.693617 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3641  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  27.48 
 
 		 676 aa  54.7  0.000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3646  N-methylhydantoinase A/acetone carboxylase beta subunit-like protein  25 
 
 		 439 aa  53.9  0.000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5632  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  26.98 
 
 		 698 aa  53.9  0.000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0796839 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2299  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  29.28 
 
 		 694 aa  53.5  0.000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.375878  normal  0.208319 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0999  Hydantoinase/oxoprolinase  31.41 
 
 		 564 aa  53.5  0.000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22450  N-methylhydantoinase (ATP-hydrolyzing)  24.05 
 
 		 579 aa  52.8  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1032  Hydantoinase/oxoprolinase  27.16 
 
 		 546 aa  52.8  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0930  hydantoinase/oxoprolinase  25 
 
 		 481 aa  52.4  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00360521  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5966  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  27.94 
 
 		 694 aa  52.4  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.858122  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2126  Hydantoinase/oxoprolinase  25.67 
 
 		 556 aa  52.4  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.031039  normal  0.0613561 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6223  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  28.53 
 
 		 690 aa  51.2  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.220681  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2282  hydantoinase/oxoprolinase family protein  27.44 
 
 		 550 aa  51.6  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3765  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  28.67 
 
 		 690 aa  51.6  0.00003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.32896  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1063  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  27.51 
 
 		 663 aa  51.2  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.39661  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3766  hydantoinase/oxoprolinase  24.4 
 
 		 710 aa  51.2  0.00004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0654  hydantoinase/oxoprolinase  29.23 
 
 		 708 aa  50.8  0.00005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1876  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  28.86 
 
 		 690 aa  50.8  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0975  hydantoinase/oxoprolinase  25.42 
 
 		 559 aa  50.4  0.00007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2933  hydantoinase/oxoprolinase  24.46 
 
 		 570 aa  50.1  0.00008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0177705 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1886  hydantoinase/oxoprolinase  27.48 
 
 		 560 aa  50.1  0.00008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4353  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  24.68 
 
 		 692 aa  49.7  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5988  N-methylhydantoinase A (Hydantoin utilization protein A)  28.25 
 
 		 685 aa  49.3  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.553202  normal  0.148202 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3493  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  24.37 
 
 		 681 aa  48.9  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.875843  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2209  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  29.47 
 
 		 690 aa  48.9  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.454656  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6272  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  26.27 
 
 		 687 aa  48.1  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.106273 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4047  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  29.45 
 
 		 676 aa  47.8  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0166577  decreased coverage  0.00142198 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2410  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  30.19 
 
 		 658 aa  47.8  0.0005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3091  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  23.94 
 
 		 681 aa  47.8  0.0005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.435048  normal  0.0725739 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0836  Hydantoinase/oxoprolinase  27.55 
 
 		 583 aa  47  0.0006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0997414 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0574  Hydantoinase/oxoprolinase  22.37 
 
 		 708 aa  47.4  0.0006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000997997  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4193  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  25.41 
 
 		 765 aa  47  0.0007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0452  Hydantoinase/oxoprolinase  30 
 
 		 693 aa  46.6  0.0009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00475089 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20940  N-methylhydantoinase A/acetone carboxylase, beta subunit  27.61 
 
 		 706 aa  46.6  0.0009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.796393  normal  0.0791884 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2644  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  29.27 
 
 		 651 aa  46.6  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4143  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  26.7 
 
 		 702 aa  46.2  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4697  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  27.16 
 
 		 692 aa  46.2  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.599265  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2734  Hydantoinase/oxoprolinase  24.03 
 
 		 559 aa  46.6  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3115  Hydantoinase/oxoprolinase  29.03 
 
 		 686 aa  46.2  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0422  hydantoinase/oxoprolinase  25.99 
 
 		 715 aa  45.4  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6536  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  25.69 
 
 		 678 aa  45.4  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.234426 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>