54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_3646 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_3646  N-methylhydantoinase A/acetone carboxylase beta subunit-like protein  100 
 
 		 439 aa  874    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4041  hydantoinase  28.92 
 
 		 374 aa  90.1  7e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.711164  decreased coverage  0.0015292 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0427  hydantoinase/oxoprolinase  26.97 
 
 		 519 aa  72.4  0.00000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0645976  normal  0.347806 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1547  hydantoinase/oxoprolinase  25.69 
 
 		 515 aa  70.5  0.00000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0999  Hydantoinase/oxoprolinase  27.65 
 
 		 564 aa  67.8  0.0000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0095  hydantoinase/oxoprolinase  26.06 
 
 		 517 aa  67  0.0000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1825  hydantoinase/oxoprolinase  25.64 
 
 		 523 aa  65.9  0.000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2933  hydantoinase/oxoprolinase  24.91 
 
 		 570 aa  65.1  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0177705 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2452  Hydantoinase/oxoprolinase  23.55 
 
 		 513 aa  63.9  0.000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.79439  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1851  hydantoinase/oxoprolinase  26.85 
 
 		 518 aa  63.9  0.000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.51976  n/a   
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3586  Hydantoinase/oxoprolinase  27.47 
 
 		 519 aa  62.8  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  0.0167077  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2949  hydantoinase/oxoprolinase  28.48 
 
 		 519 aa  61.6  0.00000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1886  hydantoinase/oxoprolinase  26.1 
 
 		 560 aa  61.2  0.00000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1963  hydantoinase/oxoprolinase  26.92 
 
 		 516 aa  60.8  0.00000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1995  Hydantoinase/oxoprolinase  24.29 
 
 		 522 aa  60.1  0.00000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2416  putative hydantoinase A  28.41 
 
 		 517 aa  60.1  0.00000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3366  N-methylhydantoinase A, beta-subunit (ATP- hydrolyzing)  29.1 
 
 		 507 aa  59.3  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.712496  normal  0.127548 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1727  Hydantoinase/oxoprolinase  23.16 
 
 		 522 aa  58.5  0.0000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.666608  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2126  Hydantoinase/oxoprolinase  24.56 
 
 		 556 aa  57.8  0.0000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.031039  normal  0.0613561 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2491  hydantoinase  25.82 
 
 		 701 aa  57  0.0000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3583  Hydantoinaseoxoprolinase domain protein  20.83 
 
 		 463 aa  56.6  0.0000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1404  hydantoinase/oxoprolinase  23.83 
 
 		 560 aa  56.2  0.000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22890  N-methylhydantoinase A/acetone carboxylase, beta subunit  23.61 
 
 		 515 aa  56.2  0.000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.700503 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0865  Hydantoinase/oxoprolinase  25.84 
 
 		 518 aa  56.2  0.000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.235208  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4110  Hydantoinase/oxoprolinase  26.17 
 
 		 522 aa  55.5  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.571056  normal  0.710404 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4116  Hydantoinase/oxoprolinase  30.11 
 
 		 519 aa  55.5  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.665366  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3064  Hydantoinase/oxoprolinase  24.12 
 
 		 526 aa  54.3  0.000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4112  hydantoinase/oxoprolinase  20.2 
 
 		 538 aa  54.3  0.000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3162  hydantoinase/oxoprolinase  24.51 
 
 		 572 aa  54.7  0.000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.212808  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1068  hydantoinase  28.96 
 
 		 642 aa  53.9  0.000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1967  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  28.05 
 
 		 683 aa  54.3  0.000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.471219  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1734  Hydantoinase/oxoprolinase  25.91 
 
 		 658 aa  52.8  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3368  hydantoinase  24.85 
 
 		 464 aa  53.1  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00437315  normal  0.282365 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5378  hydantoinase  22.87 
 
 		 517 aa  51.6  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0817  hydantoinase/oxoprolinase  27.87 
 
 		 638 aa  50.8  0.00005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.391568  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0899  hydantoinase/oxoprolinase  24.23 
 
 		 643 aa  50.8  0.00005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.742994  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2209  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  26.9 
 
 		 690 aa  50.1  0.00007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.454656  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2647  hydantoinase/oxoprolinase  26.85 
 
 		 678 aa  49.3  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2141  Hydantoinase/oxoprolinase  22.41 
 
 		 519 aa  47.8  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0444045 
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3601  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  23.97 
 
 		 682 aa  47.8  0.0005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4196  hydantoinase/oxoprolinase  24.91 
 
 		 521 aa  47.4  0.0005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0179631  normal  0.0955603 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0652  Hydantoinase/oxoprolinase  26.53 
 
 		 516 aa  47.4  0.0005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0481682 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0836  Hydantoinase/oxoprolinase  27.04 
 
 		 583 aa  47  0.0007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0997414 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1473  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  27.17 
 
 		 687 aa  45.8  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.479042 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2282  hydantoinase/oxoprolinase family protein  23.25 
 
 		 550 aa  44.7  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1967  hydantoinase/oxoprolinase  24.86 
 
 		 639 aa  44.7  0.003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2083  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  27.46 
 
 		 712 aa  44.7  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.359641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0975  hydantoinase/oxoprolinase  23.77 
 
 		 559 aa  44.3  0.005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3091  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  24.02 
 
 		 681 aa  43.9  0.005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.435048  normal  0.0725739 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0990  hydantoinase/oxoprolinase  29.49 
 
 		 557 aa  43.5  0.007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.454811 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0141  hydantoinase  25.28 
 
 		 644 aa  43.5  0.007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.456007 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22450  N-methylhydantoinase (ATP-hydrolyzing)  25.53 
 
 		 579 aa  43.5  0.008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8176  hydantoin utilization protein  28.3 
 
 		 681 aa  43.1  0.009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4083  hydantoinase/oxoprolinase  23.55 
 
 		 517 aa  43.1  0.01  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0965914  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>