296 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_1727 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_1727  Hydantoinase/oxoprolinase  100 
 
 		 522 aa  1069    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.666608  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1995  Hydantoinase/oxoprolinase  92.72 
 
 		 522 aa  981    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3586  Hydantoinase/oxoprolinase  50.48 
 
 		 519 aa  542  1e-153  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  0.0167077  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1547  hydantoinase/oxoprolinase  51.54 
 
 		 515 aa  540  9.999999999999999e-153  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1963  hydantoinase/oxoprolinase  48.07 
 
 		 516 aa  511  1e-143  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0865  Hydantoinase/oxoprolinase  47.67 
 
 		 518 aa  493  9.999999999999999e-139  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.235208  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3064  Hydantoinase/oxoprolinase  46.85 
 
 		 526 aa  475  1e-133  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0427  hydantoinase/oxoprolinase  45.63 
 
 		 519 aa  464  1e-129  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0645976  normal  0.347806 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0652  Hydantoinase/oxoprolinase  46.85 
 
 		 516 aa  444  1e-123  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0481682 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22890  N-methylhydantoinase A/acetone carboxylase, beta subunit  45.07 
 
 		 515 aa  434  1e-120  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.700503 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0095  hydantoinase/oxoprolinase  44.98 
 
 		 517 aa  429  1e-119  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4110  Hydantoinase/oxoprolinase  43.41 
 
 		 522 aa  422  1e-117  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.571056  normal  0.710404 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2141  Hydantoinase/oxoprolinase  43.6 
 
 		 519 aa  419  1e-116  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0444045 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1851  hydantoinase/oxoprolinase  41.59 
 
 		 518 aa  415  1e-114  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.51976  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4112  hydantoinase/oxoprolinase  42.94 
 
 		 538 aa  410  1e-113  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5378  hydantoinase  41.12 
 
 		 517 aa  407  1.0000000000000001e-112  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3366  N-methylhydantoinase A, beta-subunit (ATP- hydrolyzing)  43.91 
 
 		 507 aa  398  1e-109  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.712496  normal  0.127548 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2949  hydantoinase/oxoprolinase  43.73 
 
 		 519 aa  391  1e-107  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4116  Hydantoinase/oxoprolinase  41.46 
 
 		 519 aa  387  1e-106  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.665366  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1825  hydantoinase/oxoprolinase  40.42 
 
 		 523 aa  383  1e-105  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2416  putative hydantoinase A  40.31 
 
 		 517 aa  369  1e-101  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2452  Hydantoinase/oxoprolinase  39.23 
 
 		 513 aa  362  9e-99  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.79439  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4083  hydantoinase/oxoprolinase  42.33 
 
 		 517 aa  355  1e-96  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0965914  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04610  hydantoinase, putative  39.02 
 
 		 999 aa  334  2e-90  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.6497  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4196  hydantoinase/oxoprolinase  42.2 
 
 		 521 aa  329  6e-89  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0179631  normal  0.0955603 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41374  predicted protein  34.42 
 
 		 983 aa  298  1e-79  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07952  conserved hypothetical protein  33.75 
 
 		 994 aa  271  2e-71  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.77272  normal  0.240542 
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3583  Hydantoinaseoxoprolinase domain protein  38.41 
 
 		 463 aa  205  1e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3368  hydantoinase  30.68 
 
 		 464 aa  173  7.999999999999999e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00437315  normal  0.282365 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2206  Hydantoinaseoxoprolinase domain protein  34.73 
 
 		 436 aa  159  1e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00953084  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1734  Hydantoinase/oxoprolinase  30.62 
 
 		 658 aa  155  2e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2933  hydantoinase/oxoprolinase  32.32 
 
 		 570 aa  149  1.0000000000000001e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.714431 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0999  Hydantoinase/oxoprolinase  28.93 
 
 		 564 aa  144  4e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2805  hydantoinase/oxoprolinase  32.25 
 
 		 668 aa  143  9e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.726576 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4059  hydantoinase/oxoprolinase  27.67 
 
 		 566 aa  142  1.9999999999999998e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2126  Hydantoinase/oxoprolinase  31.42 
 
 		 556 aa  140  3.9999999999999997e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.031039  normal  0.0613561 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1404  hydantoinase/oxoprolinase  29.83 
 
 		 560 aa  141  3.9999999999999997e-32  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0187  Hydantoinase/oxoprolinase  29.8 
 
 		 553 aa  135  1.9999999999999998e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2282  hydantoinase/oxoprolinase family protein  30.39 
 
 		 550 aa  135  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3162  hydantoinase/oxoprolinase  27.87 
 
 		 572 aa  135  1.9999999999999998e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.212808  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0092  hydantoinase/oxoprolinase family protein  29.71 
 
 		 575 aa  133  6e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1886  hydantoinase/oxoprolinase  31.69 
 
 		 560 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3269  hydantoinase/oxoprolinase  32.54 
 
 		 667 aa  131  4.0000000000000003e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.471232  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2860  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  28.84 
 
 		 684 aa  129  1.0000000000000001e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8320  hydantoin utilization protein  29.63 
 
 		 676 aa  127  6e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0176  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  29.66 
 
 		 682 aa  126  9e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1967  hydantoinase/oxoprolinase  30.32 
 
 		 639 aa  125  2e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8176  hydantoin utilization protein  29.11 
 
 		 681 aa  124  3e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0836  Hydantoinase/oxoprolinase  28.83 
 
 		 583 aa  123  6e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0997414 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0990  hydantoinase/oxoprolinase  28.85 
 
 		 557 aa  116  8.999999999999998e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.454811 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2933  hydantoinase/oxoprolinase  26.65 
 
 		 570 aa  116  1.0000000000000001e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0177705 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1002  hydantoinase/oxoprolinase  27.48 
 
 		 550 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.184636  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0899  hydantoinase/oxoprolinase  28.36 
 
 		 643 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.742994  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9148  hydantoin utilization protein  26.27 
 
 		 687 aa  114  4.0000000000000004e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3293  hydantoinase/oxoprolinase  30 
 
 		 675 aa  114  6e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.220696  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3607  hypothetical protein  30 
 
 		 675 aa  113  7.000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3601  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  26.95 
 
 		 682 aa  113  8.000000000000001e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1067  hydantoinase  28.99 
 
 		 671 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1068  hydantoinase  29.22 
 
 		 642 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22450  N-methylhydantoinase (ATP-hydrolyzing)  29.08 
 
 		 579 aa  112  1.0000000000000001e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0790  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  27.13 
 
 		 679 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.745628 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0475  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  28.95 
 
 		 680 aa  112  2.0000000000000002e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2490  hydantoinase  28.61 
 
 		 636 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1104  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  26.99 
 
 		 712 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.140171 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1696  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  28.5 
 
 		 684 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3493  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  28.09 
 
 		 681 aa  111  3e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.875843  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0141  hydantoinase  29.45 
 
 		 644 aa  110  5e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.456007 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1125  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  28.16 
 
 		 714 aa  110  6e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.875999  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3091  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  27.81 
 
 		 681 aa  110  8.000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.435048  normal  0.0725739 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9128  hydantoin utilization protein  27.58 
 
 		 680 aa  109  1e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5474  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  28.64 
 
 		 692 aa  109  1e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2177  Hydantoinase/oxoprolinase  29.53 
 
 		 665 aa  109  1e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2491  hydantoinase  28.08 
 
 		 701 aa  108  2e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1496  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  28.39 
 
 		 706 aa  108  2e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0678775  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6536  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  28.01 
 
 		 678 aa  108  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.234426 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1876  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  27.75 
 
 		 690 aa  108  3e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2260  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  28.12 
 
 		 694 aa  108  3e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5342  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  27.42 
 
 		 699 aa  108  3e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2413  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  28.65 
 
 		 694 aa  107  4e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0779  Hydantoinase/oxoprolinase  29.59 
 
 		 553 aa  107  6e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2734  Hydantoinase/oxoprolinase  28.23 
 
 		 559 aa  107  6e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3515  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  27.86 
 
 		 694 aa  106  1e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.113195  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1967  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  25.76 
 
 		 683 aa  105  2e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.471219  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0817  hydantoinase/oxoprolinase  27.59 
 
 		 638 aa  105  2e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.391568  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3115  Hydantoinase/oxoprolinase  28.98 
 
 		 686 aa  105  2e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4896  hydantoinase/oxoprolinase  25.21 
 
 		 634 aa  105  3e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.833131  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2299  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  26.33 
 
 		 694 aa  105  3e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.375878  normal  0.208319 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4047  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  27.3 
 
 		 676 aa  104  4e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0166577  decreased coverage  0.00142198 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0930  hydantoinase/oxoprolinase  27.83 
 
 		 481 aa  103  6e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00360521  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0574  Hydantoinase/oxoprolinase  27.35 
 
 		 708 aa  103  6e-21  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000997997  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8488  Hydantoinase/oxoprolinase  26.55 
 
 		 682 aa  102  1e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.593385  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2509  hydantoinase/oxoprolinase  28.89 
 
 		 637 aa  102  2e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.212275  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6272  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  27.11 
 
 		 687 aa  102  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.106273 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0161  Hydantoinase/oxoprolinase  27.25 
 
 		 715 aa  101  3e-20  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3731  hydantoinase/oxoprolinase  26.25 
 
 		 692 aa  101  3e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.863672  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0975  hydantoinase/oxoprolinase  27.45 
 
 		 559 aa  101  3e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1032  Hydantoinase/oxoprolinase  24.84 
 
 		 546 aa  100  6e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0079  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  24.07 
 
 		 687 aa  100  6e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1134  hydantoinase/oxoprolinase  26 
 
 		 645 aa  100  9e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.187357  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2412  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  27.3 
 
 		 662 aa  99.8  1e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0201127  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>